UE de Biologie - Td corrigé
S 5 : Microbiologie Appliquée à l'Agro-Alimentaire. S 5 : Pathogenie et Symbiose.
S 5 : Génétique Bactérienne. S 6 : Bactéries, Virus, Défenses. S 6 : Régulation ...
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OFFRE DE FORMATION LMD : le descriptif des UE
UFR SVE 15/07/03
TABLE DES MATIERES
TOC \o "1-3" ( UE de Biologie PAGEREF _Toc46051289 \h 6
( Biochimie PAGEREF _Toc46051290 \h 6
S 2 : Biomolécules PAGEREF _Toc46051291 \h 6
S 3 : Biochimie Structurale. PAGEREF _Toc46051292 \h 8
S 3 : Métabolisme Cellulaire et Enzymologie PAGEREF _Toc46051293 \h 10
S 4 : Méthodologies Générales PAGEREF _Toc46051294 \h 12
S 4 : Biologie Moléculaire PAGEREF _Toc46051295 \h 14
S 4 : Métabolisme Cellulaire : catabolisme énergétique PAGEREF _Toc46051296 \h 16
S 5 : Méthodologies de Biochimie Analytique PAGEREF _Toc46051297 \h 18
S 5 : Voies métaboliques et leurs régulations PAGEREF _Toc46051298 \h 20
S 5 : Enzymologie PAGEREF _Toc46051299 \h 22
S 6 : Enzymologie appliquée PAGEREF _Toc46051300 \h 24
S 6 : Biochimie Alimentaire PAGEREF _Toc46051301 \h 26
S 7 : Biophysique moléculaire et cellulair PAGEREF _Toc46051302 \h 28
S 7 : Outils et Méthodes de Bio-informatique PAGEREF _Toc46051303 \h 30
S 7 : Physico-chimie des macromolécules biologiques PCMB. PAGEREF _Toc46051304 \h 33
S 8 : Biomembranes PAGEREF _Toc46051305 \h 35
( Biologie Cellulaire PAGEREF _Toc46051306 \h 37
S 1 : La Cellule et son Information Génétique PAGEREF _Toc46051307 \h 37
S 3 : Organisation Fonctionnelle de la Cellule PAGEREF _Toc46051308 \h 39
S 3 / 5 : Organisation et Dynamique Cellulaire PAGEREF _Toc46051309 \h 41
S 5 : Immunologie, Virologie et Applications PAGEREF _Toc46051310 \h 43
S 5 : Communications Cellulaires PAGEREF _Toc46051311 \h 45
S 5 ou 6 : Méthodologies de Biologie Cellulaire et Moléculaire PAGEREF _Toc46051312 \h 47
S 5 ou 6 : Cycle cellulaire, apoptose et vieillissement cellulaire PAGEREF _Toc46051313 \h 49
S 7 : Différenciation Cellulaire PAGEREF _Toc46051314 \h 51
S 7 : Génétique du Développement et Immunologie PAGEREF _Toc46051315 \h 53
S 7 : Immunologie Cellulaire et Moléculaire PAGEREF _Toc46051316 \h 55
S 7 : Biologie et Génétique du Développement PAGEREF _Toc46051317 \h 57
S 7 : Méthodes dEtude des Complexes Biologiques PAGEREF _Toc46051318 \h 59
S 8 : Cancérologie PAGEREF _Toc46051319 \h 61
( Microbiologie PAGEREF _Toc46051320 \h 63
S 3 : Bactériologie Générale PAGEREF _Toc46051321 \h 63
S 4 : Microbiologie pratique Identification des micro-organismes PAGEREF _Toc46051322 \h 66
S 5 : Microbiologie Appliquée à lAgro-Alimentaire PAGEREF _Toc46051323 \h 68
S 5 : Pathogenie et Symbiose PAGEREF _Toc46051324 \h 70
S 5 : Génétique Bactérienne PAGEREF _Toc46051325 \h 72
S 6 : Bactéries, Virus, Défenses PAGEREF _Toc46051326 \h 74
S 6 : Régulation des Gènes chez les Procaryotes PAGEREF _Toc46051327 \h 76
S 6 : Physiologie Bactérienne PAGEREF _Toc46051328 \h 78
S 7 : Interactions Bactériennes PAGEREF _Toc46051329 \h 80
S 7 : Assurance qualité, Risques microbiologiques PAGEREF _Toc46051330 \h 82
S 7 : Relations Bactérie-Hôte, Bactérie-Milieu PAGEREF _Toc46051331 \h 84
S 7 : Microbiologie Appliquée aux Fermentations PAGEREF _Toc46051332 \h 86
( Génétique PAGEREF _Toc46051333 \h 88
S 3 : Introduction à la génétique moléculaire PAGEREF _Toc46051334 \h 88
S 5 : Information Génétique de la Cellule et Génétique Evolutive PAGEREF _Toc46051335 \h 90
S 5 : Evolution moléculaire et plasticité des génomes PAGEREF _Toc46051336 \h 92
S 5 : Méthodologies de Génétique Moléculaire PAGEREF _Toc46051337 \h 94
S 5 : Génomique et Post-génomique : production et analyse des données PAGEREF _Toc46051338 \h 96
S 5 : Génétique eucaryote PAGEREF _Toc46051339 \h 98
S 6 : Contrôle de lExpression Génétique chez les Eucaryotes PAGEREF _Toc46051340 \h 100
S 7 : Structure, maintien et expression des génomes PAGEREF _Toc46051341 \h 102
S 7 : Dynamique et Evolution des Gènes et des Génomes PAGEREF _Toc46051342 \h 104
S 8 : Applications de la Génétique Moléculaire PAGEREF _Toc46051343 \h 106
S 8 : Biotechnologie et génie génétique PAGEREF _Toc46051344 \h 108
( Physiologie Végétale PAGEREF _Toc46051345 \h 110
S 3 : Bases Physiologiques de la Production Végétale PAGEREF _Toc46051346 \h 110
S 3 : Phytoressources PAGEREF _Toc46051347 \h 112
S 5 : Biologie cellulaire et moléculaire végétales PAGEREF _Toc46051348 \h 114
S 6 : Physiologie et Intérêt Biotechnologique des Eucaryotes végétaux Inférieurs PAGEREF _Toc46051349 \h 116
S 7 : Physiologie végétale : nutrition, croissance, interactions plante-milieu PAGEREF _Toc46051350 \h 118
S 7 : Technologie et Biotechnologie Végétales PAGEREF _Toc46051351 \h 120
S 7 : Intégration du métabolisme et du Développement des Plantes PAGEREF _Toc46051352 \h 122
S 8 : Physiologie Cellulaire et Moléculaire Végétales PAGEREF _Toc46051353 \h 124
( Physiologie Animale PAGEREF _Toc46051354 \h 127
S 1 :Système nerveux et comportement PAGEREF _Toc46051355 \h 127
S 3 : Communication hormonale PAGEREF _Toc46051356 \h 129
S 4 : Communication nerveuse et excitabilité PAGEREF _Toc46051357 \h 131
S5-S6 : Fonction de nutrition et de reproduction chez lhomme PAGEREF _Toc46051358 \h 133
S 6 : Biologie et Physiologie de Reproduction PAGEREF _Toc46051359 \h 135
S5 ou 6 : Endocrinologie Moléculaire PAGEREF _Toc46051360 \h 137
S 7 : Nutrition et maintien de léquilibre de lorganisme chez les animaux PAGEREF _Toc46051361 \h 141
S 8 : Neurobiologie et Cognition PAGEREF _Toc46051362 \h 143
S 8 : Neurophysiologie PAGEREF _Toc46051363 \h 145
( Ecophysiologie PAGEREF _Toc46051364 \h 147
S8 : Réponses fonctionnelles des organismes aux conditions environnementales PAGEREF _Toc46051365 \h 147
S 8 : Ecophysiologie évolutive PAGEREF _Toc46051366 \h 149
( Génétique des Populations, Evolution PAGEREF _Toc46051367 \h 151
S 5 : Génétique et Evolution des Populations. PAGEREF _Toc46051368 \h 151
S 6 : Biologie évolutive : Evolution des espèces PAGEREF _Toc46051369 \h 153
S 7 : Biologie des Populations PAGEREF _Toc46051370 \h 155
S8 : Biologie évolutive : modèles phénotypiques, adaptation, plasticité PAGEREF _Toc46051371 \h 156
( Biologie Animale PAGEREF _Toc46051372 \h 158
S 5 : Nutrition, développement post-embryonnaire. PAGEREF _Toc46051373 \h 158
S 5 : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux PAGEREF _Toc46051374 \h 160
S 5 : Plans dorganisation et diversité des animaux. PAGEREF _Toc46051375 \h 162
S 6 : Biodiversité Animale PAGEREF _Toc46051376 \h 164
S 8 : La mise en mouvement de lorganisme et son intégration au milieu PAGEREF _Toc46051377 \h 166
( Biologie vegetale et Biologie animale PAGEREF _Toc46051378 \h 168
S 1 : Bases Systématiques et Organisation du Vivant PAGEREF _Toc46051379 \h 168
S 2 :Nutrition, Reproduction PAGEREF _Toc46051380 \h 170
S 3 : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux et les spermaphytes PAGEREF _Toc46051381 \h 172
S 4 : Reproduction et développement : mise en place des structures chez les animaux et végétaux PAGEREF _Toc46051382 \h 174
( Biologie Végétale PAGEREF _Toc46051383 \h 176
S 4 : Organisation, Reproduction et Adaptations chez les Spermathytes PAGEREF _Toc46051384 \h 176
S 5 : Organisation et diversité des organismes chlorophylliens PAGEREF _Toc46051385 \h 178
S 6 : Les Embryophytes PAGEREF _Toc46051386 \h 180
S 6 : Biosystématique et Interactions Biotiques chez les Angiospermes PAGEREF _Toc46051387 \h 182
S 6 : Organisation et Phylogénie Végétale PAGEREF _Toc46051388 \h 184
S 7 : Organismes Chlorophylliens Thalloides, Champignons et Lichens, Interactions Biotiques PAGEREF _Toc46051389 \h 186
S 8 : Evolution Végétale PAGEREF _Toc46051390 \h 188
( Ecologie, Environnement PAGEREF _Toc46051391 \h 190
S 2 : Bases de lécologie PAGEREF _Toc46051392 \h 190
S 3 : Chimie et Physique de l'Environnement 1 PAGEREF _Toc46051393 \h 192
S 4 : Chimie et Physique de l'Environnement 2 PAGEREF _Toc46051394 \h 194
S 3 : Les grands problèmes décologie. PAGEREF _Toc46051395 \h 196
S 4 : Sol, eau, climat PAGEREF _Toc46051396 \h 198
S 5 : Répartition des populations et des communautés PAGEREF _Toc46051397 \h 200
S 5 : Bases Ecologiques de la Production Végétale PAGEREF _Toc46051398 \h 202
S 6 : Ecologie Générale PAGEREF _Toc46051399 \h 204
S 6 : Initiation à la pratique du diagnostic écologique PAGEREF _Toc46051400 \h 206
S 6 : Microbiologie des sols et des eaux PAGEREF _Toc46051401 \h 207
S7 : De lindividu à la population et à lécosystème PAGEREF _Toc46051402 \h 209
S 7 : Ecologie des communautés et fonctionnement des écosystèmes PAGEREF _Toc46051403 \h 212
S 8 : Ecologie du Paysage PAGEREF _Toc46051404 \h 214
S 8 : Ecologie aquatique PAGEREF _Toc46051405 \h 216
S 8 : Ecologie et Ethologie PAGEREF _Toc46051406 \h 218
S 8 : Ecologie Microbienne PAGEREF _Toc46051407 \h 220
S 8 : Ecologie de la Restauration PAGEREF _Toc46051408 \h 222
S 9 : Approche intégrée de terrain PAGEREF _Toc46051409 \h 224
S 9 : Pollution Remédiation. PAGEREF _Toc46051410 \h 226
S 9 : Hydrogéologie de terrain : du réservoir à lexploitation PAGEREF _Toc46051411 \h 228
S 9 : Systèmes d'information géographique PAGEREF _Toc46051412 \h 230
S 9 :Utilisation des ressources des bassins versants (eau et sols PAGEREF _Toc46051413 \h 232
S 9 : Restauration des écosystèmes PAGEREF _Toc46051414 \h 234
S 9 : Gestion de l'environnement à l'échelle des paysages. PAGEREF _Toc46051415 \h 236
S 9 : Projet tutoré pluri-disciplianire. PAGEREF _Toc46051416 \h 240
( Ethologie PAGEREF _Toc46051417 \h 242
S 4 : L'animal et son milieu : PAGEREF _Toc46051418 \h 242
comportement alimentaire, positionnement dans le temps et dans l'espace. PAGEREF _Toc46051419 \h 242
S 5 : Chronobiologie et pharmacologie PAGEREF _Toc46051420 \h 244
S 6 : Bases biologiques de la régulation des comportements interactifs PAGEREF _Toc46051421 \h 246
S 7 : Ethologie PAGEREF _Toc46051422 \h 248
S 8 : Adaptations éco-éthologiques aux conditions d'élevage PAGEREF _Toc46051423 \h 250
( Agronomie PAGEREF _Toc46051424 \h 252
S7 : Sciences agronomiques 1 PAGEREF _Toc46051425 \h 252
S8 : Sciences agronomiques 2 PAGEREF _Toc46051426 \h 254
( Master Sciences de la vie et de la terre PAGEREF _Toc46051427 \h 257
S8 : Enseignement pré-professionnalisant PAGEREF _Toc46051428 \h 257
S 9 : Tronc commun secteur A : PAGEREF _Toc46051429 \h 259
Biologie et physiologie cellulaires, biologie moléculaire : leur intégration au niveau des organismes PAGEREF _Toc46051430 \h 259
S 9 et 10 : Tronc commun secteur B : Biologie et physiologie des organismes et biologie des populations, en rapport avec le milieu de vie PAGEREF _Toc46051431 \h 261
S 9 et 10 : Tronc commun secteur C : Sciences de la Terre et de lUnivers, interactions entre la biosphère et la planète Terre. PAGEREF _Toc46051432 \h 263
S 10 : Stage de connaissances générales (tronc commun) PAGEREF _Toc46051433 \h 265
S 10 : Préparation aux écrits et TP du concours PAGEREF _Toc46051434 \h 267
S 9 et 10 : Programme de spécialité PAGEREF _Toc46051435 \h 268
S 9 : Stage de spécialité PAGEREF _Toc46051436 \h 269
S 9 : Projet de spécialité : communication et langue PAGEREF _Toc46051437 \h 270
(UE « Outils » proposés par les biologistes PAGEREF _Toc46051438 \h 272
Communications PAGEREF _Toc46051439 \h 272
S6 : Insertion professionnelle PAGEREF _Toc46051440 \h 272
S 6 : Mémoire Bibliographique PAGEREF _Toc46051441 \h 274
S 7 : Je Crée Mon Emploi (J.C.M.E.) PAGEREF _Toc46051442 \h 275
S 7 : Conduite de projets scientifiques PAGEREF _Toc46051443 \h 277
S 8 : Communication Scientifique PAGEREF _Toc46051444 \h 279
S 9 : Informations et Médias PAGEREF _Toc46051445 \h 281
S 9 : Scientific English and Communication PAGEREF _Toc46051446 \h 283
S 9 : Sociologie de la negociation PAGEREF _Toc46051447 \h 285
( Biologie Quantitative, outils statistiques PAGEREF _Toc46051448 \h 288
S 3 : Biologie Quantitative 1 PAGEREF _Toc46051449 \h 288
S 4 : Biologie Quantitative 2 PAGEREF _Toc46051450 \h 290
S 5 : Biologie Quantitative 3 PAGEREF _Toc46051451 \h 291
S 6 : Biologie quantitative 4 PAGEREF _Toc46051452 \h 293
S 8 : Biologie quantitative 5 PAGEREF _Toc46051453 \h 295
S 8 : Analyses spatiales en Biologie PAGEREF _Toc46051454 \h 297
Divers PAGEREF _Toc46051455 \h 299
S1 : Education aux choix professionnels PAGEREF _Toc46051456 \h 299
S2 : Outils informatiques de base pour lanalyse des données et la communication PAGEREF _Toc46051457 \h 301
S : Loutil informatique dans sa dimension réseau PAGEREF _Toc46051458 \h 303
S : Méthodes avancées de publication électronique PAGEREF _Toc46051459 \h 305
S 7 : Outils en Ecologie, Ethologie et Biologie des Populations + Langues PAGEREF _Toc46051460 \h 307
S 8 : Brevet Industriel et Innovation PAGEREF _Toc46051461 \h 309
(UE de Mathématiques PAGEREF _Toc46051462 \h 311
S 1 : Mathématiques PAGEREF _Toc46051463 \h 311
S 2 : Analyse 1 PAGEREF _Toc46051464 \h 314
S 3 : Algèbre linéaire 1 PAGEREF _Toc46051465 \h 316
S 4 : Analyse 2 PAGEREF _Toc46051466 \h 318
S 4 : Algèbre linéaire 4 PAGEREF _Toc46051467 \h 319
S 7 : Statistiques et Méthodes de Classifications PAGEREF _Toc46051468 \h 320
(UE de Chimie PAGEREF _Toc46051469 \h 322
S 2 : Chimie des Solutions et Méthodologie PAGEREF _Toc46051470 \h 322
S 3 : Chimie organique générale PAGEREF _Toc46051471 \h 324
S 4 : Physico-chimie PAGEREF _Toc46051472 \h 326
S 4 : Atomistique, liaisons chimiques & applications en chimie organique PAGEREF _Toc46051473 \h 328
S 5 : Stéréochimie et Réactivité en Chimie Organique PAGEREF _Toc46051474 \h 330
S 6 : Chimie des Composés Polyfonctionnels dinterêt Biologique PAGEREF _Toc46051475 \h 332
S 6 : Chimie Organique et Inorganique appliquée aux Productions Végétales PAGEREF _Toc46051476 \h 334
S 7 : Stratégies en synthèse organique PAGEREF _Toc46051477 \h 336
S 7 : Spectroscopie et Hétérochimie PAGEREF _Toc46051478 \h 338
S 8 : Chimie et Biochimie du médicament PAGEREF _Toc46051479 \h 340
S 8 : Agrochimie et Phytochimie PAGEREF _Toc46051480 \h 342
(UE de Physique PAGEREF _Toc46051481 \h 343
S2 : Etats de la matière et Interactions PAGEREF _Toc46051482 \h 346
S4 : La Physique pour les Sciences de la Vie PAGEREF _Toc46051483 \h 348
S3, 5, 6 : ENERGIE - Transport - Fluides PAGEREF _Toc46051484 \h 350
S3,5,7 : Ondes, signaux, particules, atomes et molécules PAGEREF _Toc46051485 \h 352
(UE de Géologie PAGEREF _Toc46051486 \h 354
S2 : Géologie 1 PAGEREF _Toc46051487 \h 354
S2 : Geologie 2 PAGEREF _Toc46051488 \h 356
S 3 : Matériaux géologiques PAGEREF _Toc46051489 \h 358
S4 : Structures géologiques PAGEREF _Toc46051490 \h 360
S4 : Temps géologique PAGEREF _Toc46051491 \h 363
S5 : Terre et Planètes PAGEREF _Toc46051492 \h 366
S5 : Géodynamique interne PAGEREF _Toc46051493 \h 368
S6 : Géogynamique externe PAGEREF _Toc46051494 \h 370
S7 : Hydrologie de surface et systèmes aquifères PAGEREF _Toc46051495 \h 372
S7 : Structure, Fonctionnement et Hydrochimie des Sols PAGEREF _Toc46051496 \h 374
S7 : Histoire de la Biosphère PAGEREF _Toc46051497 \h 376
S8 : Histoire de la Terre PAGEREF _Toc46051498 \h 378
S8 : Erosion reliefs et climats PAGEREF _Toc46051499 \h 380
S8 : Cartographie et spatialisation de linformation PAGEREF _Toc46051500 \h 382
S8 : Gestion des risques et protection des milieux PAGEREF _Toc46051501 \h 384
S7 : Cycle hydrogéochimique PAGEREF _Toc46051502 \h 386
S8 : Ressources minérales et énergétiques PAGEREF _Toc46051503 \h 388
S8 : Ressources et environnEment PAGEREF _Toc46051504 \h 389
S8 : Dynamique de la paleodiversite PAGEREF _Toc46051505 \h 391
(UE dInformatique PAGEREF _Toc46051506 \h 393
S 3 : Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation PAGEREF _Toc46051507 \h 393
S 4 : Systèmes et réseaux PAGEREF _Toc46051508 \h 395
S 5 : Bases de données et systèmes dinformation PAGEREF _Toc46051509 \h 397
S 5 : Traitement du Signal et de lImage PAGEREF _Toc46051510 \h 399
S 7 : Algorithmique : Complexité et Optimisation PAGEREF _Toc46051511 \h 401
S 8 : Algorithmique des Séquences PAGEREF _Toc46051512 \h 403
S 8 : Bases de Données et Gestion de lInformation PAGEREF _Toc46051513 \h 405
(UE de Gestion PAGEREF _Toc46051514 \h 407
S7 : Concepts de base en Marketing et Stratégie Marketing PAGEREF _Toc46051515 \h 407
S7 : Droit et Entreprise PAGEREF _Toc46051516 \h 409
S7 : Politiques de Produits et de Prix PAGEREF _Toc46051517 \h 411
S8 : Etudes de Marché PAGEREF _Toc46051518 \h 413
S8 : Comptabilité Générale et Comptabilité de Gestion PAGEREF _Toc46051519 \h 415
S9 : Distribution et Achats PAGEREF _Toc46051520 \h 417
S9 : contrôle de Gestion et Finance PAGEREF _Toc46051521 \h 419
S9 : Conduite de projet managérial : realisation dune etude de marche PAGEREF _Toc46051522 \h 421
S10 : stratégie de Communication PAGEREF _Toc46051523 \h 424
S10 : Strategie et Planification marketing PAGEREF _Toc46051524 \h 426
(UE de Langues PAGEREF _Toc46051525 \h 428
S2 : Langues vivantes etrangereS PAGEREF _Toc46051526 \h 428
S3 ET 4 : Langues vivantes etrangereS PAGEREF _Toc46051527 \h 429
S5 et 6 : Langues vivantes etrangereS PAGEREF _Toc46051528 \h 430
S7 ou S8 : Langues Vivantes Etrangères PAGEREF _Toc46051529 \h 432
S9 et S10 : Langues vivantes étrangères PAGEREF _Toc46051530 \h 434
((UE de Droit PAGEREF _Toc46051531 \h 436
S 1 : Droit communautaire II PAGEREF _Toc46051532 \h 436
S 2 : Introduction au Droit PAGEREF _Toc46051533 \h 438
S 3 : Institutions administratives PAGEREF _Toc46051534 \h 440
S 3 : Institutions européennes PAGEREF _Toc46051535 \h 441
S 5 et 6 : Droit des Obligations PAGEREF _Toc46051536 \h 443
S 7 : Droit de lenvironnement PAGEREF _Toc46051537 \h 444
S 8 : Droit économique international et communautaire PAGEREF _Toc46051538 \h 446
S 8 : Droit rural PAGEREF _Toc46051539 \h 447
S 9 : Droit de lurbanisme PAGEREF _Toc46051540 \h 448
((UE de Culture Générale PAGEREF _Toc46051541 \h 449
S 2 : Communication animale et humaine PAGEREF _Toc46051542 \h 449
S 2 :Histoire de la biologie PAGEREF _Toc46051543 \h 451
S 2 : Initiation aux Métiers de lEnseignement 1 PAGEREF _Toc46051544 \h 453
S 5 : Initiation aux Métiers de lEnseignement 2 PAGEREF _Toc46051545 \h 455
S2 : Arts culinaires 1 PAGEREF _Toc46051546 \h 457
S3 : Arts culinaires 2 PAGEREF _Toc46051547 \h 460
S4 : Arts culinaires 3 PAGEREF _Toc46051548 \h 462
( UE de Biologie
( Biochimie
S 2 : Biomolécules
Numéro de lUE : BIO 203
Intitulé de l' U E : Biomolécules
Responsable(s) : V.GUILLAUME et L.KERN
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : obligatoire pour toutes les filières
2) Parcours : 1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions, de la licence de Biochimie et Biologie moléculaire, de la licence de Sciences de la Vie et de la Terre, de la licence pluridisciplinaire
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
connaître les structures fondamentales des biomolécules,
comprendre et mettre en uvre un dosage colorimétrique.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
Cours *T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel152520-60Travail personnel15252060les cours et lesTD sont organisés par groupe de 40 étudiants (cours/TD)
Chaque enseignant assurera la totalité de lenseignement (Cours/TD et TP) du groupe quil aura pris en charge.
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
COURS / TD
LES PROTEINES ET LEURS CONFORMATIONS : (6 h Cours / 4 h TD)
Propriétés chimiques des acides aminés
Liaison peptidique
Relation structure-fonction des protéines (exemple dune protéine fibreuse et dune protéine globulaire)
LES GLUCIDES : (6 h Cours / 4 h TD)
Structure des oses simples
Liaison O-glycosidique, diholosides (maltose, lactose, saccharose)
Polysaccharides structuraux (cellulose, chitine), de réserve (amidon, glycogène)
LES LIPIDES : (4 h Cours / 4 h TD)
Lipides de stockage énergétique
Lipides structuraux des membranes
LES PROPRIETES STRUCTURALES DES ACIDES NUCLEIQUES : (4 h Cours / 2 h TD)
Nucléosides, nucléotides
Liaison phosphodiester, acides nucléiques
Propriétés structurales des acides nucléiques
TP :
TP 1 : Dosage colorimétrique, dilution, prédosage, gamme détalonnage : 4 h
TP 2 : Dosage colorimétrique de glucides réducteurs : 4 h
TP 3 : Etude cinétique dune enzyme : 4 h
TP 4 : Chromatographie déchange dions (séparation dacides aminés) : 4 h
TP 5 : Chromatographie sur couche mince de silice (lipides) : 4 h
TD danalyse des résultats de TP : 6 h
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a pour objectif de donner une vue densemble des différents aspects de la biologie, daider les étudiants à définir leur orientation. Elle a aussi été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 3 : Biochimie Structurale.
Numéro de lUE : BIO 301
Intitulé de l' U E : Biochimie Structurale
Responsable(s) : Jean-François HUBERT, Laurence KERN
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biochimie et Biologie, licence de Biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, mention biologie et informatique
2) Parcours : 2ième année de licence de biochimie et des licences de Biologie
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Etude de la structure et des propriétés fonctionnelles des macromolécules biologiques
5) Prérequis : Module Biomolécules (ou niveau équivalent)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28161660 Travail personnel30201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
PROTEINES 12 h
Structures I-II-III-IV
Relations structure-fonction. Exemples : myoglobine et hémoglobine, collagène, récepteurs, canaux ioniques, pompes, rubisCO
Modifications post traductionnelles, concept de protéome.
GLUCIDES 8 h
Glycoprotéines
Protéoglycanes
Vitamine C
LIPIDES 8 h
Glycolipides
Terpènes et dérivés
Stéroïdes
Lipoprotéines
Vitamines A, E, D, K
TD
Protéines 4 h
Glucides 4 h
Lipides 4 h
Analyse de résultats de TP 4 h
TP
Dosages comparés : Bradford, Lowry, UV 4 h
Dosage du glucose par la glucose oxydase 4 h
Dosage de lipide 4 h
Vitamine C 4 h
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire filière Biochimie
optionnel Filière Biologie
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et pratiques
12) Capacité d'accueil : sans limite
S 3 : Métabolisme Cellulaire et Enzymologie
Numéro de lUE : BIO 302
Intitulé de l' U E : Métabolisme Cellulaire et Enzymologie
Responsable(s) : F. LE CAHEREC et F. LEGAY
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence sciences de la vie et de la terre,
Licence pluridisciplinaire,
Licence biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie,
Licence biologie mention Biologie des organismes
Licence biologie mention biologie et informatique.
2) Parcours : 2ème année des licences concernées
3) Semestre n° 3
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement doit permettre à létudiant dacquérir les notions de base de la catalyse enzymatique, les principes de bioénergétique et les voies essentielles du catabolisme énergétique.
5) Prérequis : UEBIO 101 : Biomolécules ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel281616-60Travail personnel30201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
ENZYMES ET CATALYSE ENZYMATIQUE : (10 h)
Enzymes, coenzymes
Cinétique Michaelienne , cinétique allostérique
Contrôle de lactivité (modulateurs, phosphorylation)
Isoenzymes
BIOENERGETIQUE : (8 h)
« Valeur » énergétique des substrats
Variation dénergie libre dhydrolyse
Coenzymes doxydo-réduction
Synthèse dATP : photophosphorylation et oxydation phosphorylante
VOIES METABOLIQUES : (10 h)
Les grands types de réaction, anabolisme et catabolisme
Voies principales : glycolyse, glycogénolyse, glycogénogenèse, gluconéogenèse, cycle de Krebs, (-oxydation, cycle de Calvin et synthèse de lamidon, fermentation alcoolique et lactique.
Composés initiaux et terminaux, bilans, principales étapes, localisations intracellulaire et tissulaire
Régulation du débit des voies métaboliques
TD denzymologie (6 h)
TD de bioénergétique (2 h)
TD de métabolisme (4 h)
TD daide aux calculs et de correction pour les TP (4 h)
TP 1 : Séparation denzymes par gel-filtration et SDS-PAGE (4 h)
TP 2 : Cinétique enzymatique et détermination des constantes (4 h)
TP 3 : Influence du pH et de la température sur la vitesse initiale (4 h)
TP 4 : Influence dun effecteur chimique (4 h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire ( en Licence SVT, Licence pluridisciplinaire, Licence biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie,
optionnel ( en Licence biologie mention Biologie des organismes
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 4 : Méthodologies Générales
Numéro de lUE : BIO 401
Intitulé de l' U E : Méthodologies Générales
Responsable(s) : V.GUILLAUME, L.KERN et C.PIQUET-PELLORCE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et biologie moléculaire ; Biologie cellulaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
Licence de Biologie mention Biologie cellulaire et physiologie, mention biologie et informatique
2) Parcours : 2ème année des licences précitées
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
Comprendre et mettre en uvre des techniques de base de Biochimie et de Biologie Cellulaire permettant létude dun matériel biologique (végétal et animal)
5) Prérequis : Module Biomolécules ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel4124460Travail personnel10302060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
COURS (4 h)
Principales techniques de séparation de molécules : électrophorèses, chromatographies (exclusion-diffusion, échange dions, affinité), centrifugations
TD (12 h)
Illustrations des différentes techniques vues en cours, des techniques de sédimentation cellulaire et danalyse cytochimiques et histochimiques.
TP (44 h)
Extraction, séparation et analyse dacides nucléiques :
analyses cytochimiques, électrophorèse dADN sur gel dagarose de différents pourcentages
Extraction, séparation et analyse de protéines :
Analyses histochimiques
Electrophorèse de protéines sur gel de polyacrylamide de différentes densités en conditions natives
Electrophorèse de protéines sur gel de polyacrylamide en conditions dénaturantes
Chromatographie dexclusion-diffusion
Chromatographie déchange dions
Analyse dun problème biologique :
Présenté sous forme dexposés faits par les étudiants.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 4 : Biologie Moléculaire
Numéro de lUE : BIO 402
Intitulé de l' U E : BIOLOGIE MOLECULAIRE
Responsable(s) : Florence DEMAY et Florence AUBRY
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie des organismes et des populations
2) Parcours : 2ème année de la licence
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement permettra à létudiant dacquérir une vision globale des mécanismes moléculaires impliqués dans lexpression génétique.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel (partie BM)
Présentiel (partie BQ)201660Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS (20h)
Nature du matériel génétique : l'ADN (5 h)
- rappels sur la structure et les propriétés de l'ADN
- structure de la chromatine
- la réplication
La structure des gènes et des génomes (procaryote versus eucaryote, génome nucléaire versus génome cytoplasmique) (4 h)
Flux de l'information génétique (11 h)
- rappel sur la structure de l'ARN
- la transcription procaryote versus eucaryote (initiation, élongation, terminaison, notion d'opéron)
- maturation des ARN pré-messagers chez les eucaryotes (coiffage, épissage, polyadénylation
- la traduction chez les eucaryotes et les procaryotes : code génétique, initiation, élongation, terminaison
TRAVAUX DIRIGES (16H) :
Techniques de l'ADN recombinant (enzymes de restriction, enzymes de modification, clonage)
Outils moléculaires pour lanalyse du génome et lactivité des gènes (séquençage, hybridation des acides nucléiques, PCR)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Métabolisme Cellulaire : catabolisme énergétique
Numéro de lUE : BIO 403
Intitulé de l' U E : Métabolisme cellulaire : catabolisme énergétique
Responsable(s) : F. Bauché
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : 4
4) Objectifs : acquérir les notions de base de la catalyse enzymatique,
étudier les principes de la bioénergétique cellulaire,
présenter les voies essentielles du catabolisme énergétique.
5) Prérequis : UE Biomolécules ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26181660 Travail personnel30201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
( Cours magistraux :
Enzymologie (4h) : mécanismes catalytiques ; cinétique michaelienne et représentation de Lineweaver Burk ; introduction à lallostérie
Bioénergétique (10h) : rappels de thermodynamique (DðG0, DðG) ; les différents types de molécules à haut potentiel d hydrolyse ; synthèse d ATP (phosphorylation oxydative, photophosphorylation, phosphorylation au niveau du substrat)
Catabolisme énergétique (12h) : glycolyse, voie des pentoses phosphates, dégradation du fructose et du galactose, glycogénolyse, cycle de Krebs, bð-oxydation des acides gras
( TD :
enzymologie (4h) ; bioénergétique (6h) ; catabolisme énergétique (6h) ; aide aux calculs et corrections des TP (2h)
( TP :
cinétique enzymatique et détermination des constantes (4h) ; dosages enzymatiques: détermination dactivités enzymatiques, dosages de substrats (8h) ; préparation subcellulaire (4h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 5 : Méthodologies de Biochimie Analytique
Numéro de lUE : BIO 501
Intitulé de l' U E : METHODOLOGIES DE BIOCHIMIE ANALYTIQUE
Responsable(s) : Marie-Andrée ESNAULT et Sylvie FEON
Equipe(s) pédagogique(s) : BiochimieBiologie Moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, mention biologie et informatique
2) Parcours : 3ème année universitaire
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Compréhension et apprentissage de techniques utilisées dans lidentification, la quantification et la purification de molécules biologiques.
5) Prérequis : Méthodologies générales ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel6144060Travail personnel12282060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours : 6 h, TD : 14 h
Principes, paramètres et applications des techniques de :
Chromatographie phase liquide (IEC, exclusion-diffusion, affinité, interactions hydrophobes) basse et haute pression (LPLC, HPLC), phase gazeuse (CPG), sur couche mince (CCM)
Electrophorèse en conditions natives, dénaturantes, gradient de gel, bi-dimensionnelle
Transfert sur membrane et Western blotting
Précipitation et solubilisation par les sels, les solvants
Dialyse, filtration sur membrane
Extraction et centrifugation différentielle
Centrifugation (gradient de densité)
TP : 40 h
Les TP viseront à mettre en application certaines techniques vues en théorie, concernant notamment :
Lanalyse de lipides par CPG et CCM
Lanalyse de protéines de protéagineux par IEC ; identification par SDS-PAGE, immunodétection
La purification dune protéine par chromatographie daffinité (HPLC)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 5 : Voies métaboliques et leurs régulations
Numéro de lUE : BIO 502
Intitulé de l' U E : Voies métaboliques et leurs régulations
Responsable(s) : H. KERCRET
Equipe(s) pédagogique(s) :Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours :3ème année
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Apporter les notions élémentaires sur les voies métaboliques afin de permettre à létudiant davoir une vision globale des régulations de ces voies dans la cellule.
Mettre en évidence le caractère universel de ces voies.
Favoriser, notamment grâce aux travaux dirigés, la réflexion des étudiants sur linterdépendance des différents métabolismes cellulaires.
5) Prérequis : Biochimie structurale ou niveau équivalent
Métabolisme cellulaire : catabolisme énergétique
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel362460 Travail personnel303060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours magistraux
ACIDES AMINES :
Métabolisme général des acides aminés, uréogénèse, contrôle de lammoniaque.
Métabolismes particuliers des acides aminés : Acides aminés glucoformateurs, cétoformateurs, biosynthèse des amines biogènes.
NUCLEOTIDES :
Synthèse, voies « de novo » et de récupération. Catabolisme.
LIPIDES :
Biosynthèse des acides gras chez les procaryotes et les eucaryotes.
Désaturation, élongation des acides gras.
Biosynthèse des stéroïdes, des phospholipides, des triglycérides, métabolisme des lipoprotéines.
GLUCIDES :
Biosynthèse des sucres (sucres simples et polyosides), néoglucogénèse, glucogénèse, glycogénogénèse, cycle de Calvin, cycle du glyoxylate.
Régulation de la synthèse des sucres (sucres simples, amidon, glycogène)
INTEGRATION DU METABOLISME :
Métabolisme tissu-dépendant.
PORPHYRINES :
Synthèse et catabolisme de lhème.
Travaux dirigés
Voies métaboliques et leurs régulations.
8) Bibliographie :
9) Coefficient 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Enzymologie
Numéro de lUE : BIO 503
Intitulé de l' U E : Enzymologie
Responsable(s) : Sylvie Féon, Cyrille Garnier
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie Moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
A titre obligatoire en licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
A titre optionnel en licence et Master Sciences de la Vie et de lEnvironnement, Sciences de la Vie et de la Santé, toutes mentions.
2) Parcours : 3ème année universitaire
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Acquérir les notions fondamentales en enzymologie et comprendre le rôle des enzymes dans la vie cellulaire, par des approches théoriques et pratiques.
5) Prérequis :
Cinétique chimique, connaissance de la structure des macromolécules biologiques ou niveau équivalent
Biochimie Structurale niveau S3 ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460Travail personnel24241260
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Techniques de dosages enzymatiques, mesures dactivités enzymatiques.
Suivi de purification denzymes.
Nomenclature et coenzymes.
Cinétique michaélienne pour une enzyme à un substrat et représentations linéaires. (Kd, KM, kcat)
Cinétiques des enzymes à deux substrats.
Effets des inhibiteurs et des activateurs réversibles.
Effets du pH.
Effets de la température, énergie dactivation, stabilité thermique.
Enzymes allostériques.
Régulations fonctionnelles des enzymes.
Etudes de sites catalytiques, structure et fonctionnement, modifications chimiques irréversibles, mutagénèse dirigée.
TD :
Exercices dapplication du cours et exploitation des TP.
TP :
Purification de larginine kinase de muscle de homard, et étude du mécanisme à 2 substrats.
Cinétique Michaélienne et inhibitions, KM, Vmax, Ki.
8) Bibliographie : Les enzymes, catalyseurs du monde vivant, Jean Pelmont
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 6 : Enzymologie appliquée
Numéro de lUE : BIO 601
Intitulé de lUE : Enzymologie appliquée
Responsables : Bernadette Ducouret, Mohamed Jebbar
Equipe pédagogique : Biochimie Biologie Moléculaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie, Licence de Biologie mention Biologie appliquée
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours :
UE optionnelle pour Licence de Biochimie et Licence de Biologie appliquée, 3ème année.
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Illustrer limportance des enzymes dans les domaines des applications industrielles, médicales et agroalimentaires.
5) Prérequis : Connaissances de bases de lenzymologie et de la biochimie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.Projet
Eq TDStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h12h16h12h60h Travail personnel20h12h6h22h60h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
cours,TD
Préparation des enzymes industrielles.
Utilisations des enzymes solubles.
Utilisation des enzymes immobilisées.
Réacteurs à enzymes.
Biocapteurs, électrodes à enzymes.
Exemples dapplication dans le domaine médical, diagnostique et thérapeutique.
Exemple dutilisation dans lindustrie agroalimentaire, dosages, production.
TP : Immobilisation de bGalactosidase en gel dalginate, rendement dimmobilisation.
Activité de la glucose-oxydase, soluble, confinée ou immobilisée sur membrane.
8) Bibliographie :
Génie enzymatique, G. Coutouly (ed Masson),
Enzyme technology, M.F.Chaplin and C. Bucke, (ed Cambridge University Press)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement sera dispensé sous forme de cours et de TD et de TP sur le thème de lUE. Une partie importante de travail personnel est prévue. Elle consistera à préparer un dossier écrit et une présentation orale sur un sujet dactualité traitant de lutilisation dune ou de plusieurs enzymes à des fins appliquées. Lensemble des exposés sera suivi par tous les étudiants de lUE et sera utilisé comme base pour certains enseignements.
12) Capacité d'accueil : Non limitée.
S 6 : Biochimie Alimentaire
Numéro de lUE : BIO 602
Intitulé de l' U E : BIOCHIMIE ALIMENTAIRE
Responsable(s) : B.DUCOURET et V.GUILLAUME
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Biochimie et Biologie Moléculaire
Proposé à toutes les autres filières au niveau licence ou master notamment Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et gestion
2) Parcours : 3ème année des licences de Biologie pour toutes les mentions, de la licence de Biochimie et Biologie moléculaire
3) Semestre n° 6
4) Objectifs :
Les biomolécules dintérêt alimentaire : aspects structuraux, nutritionnels et diététiques, application en industrie agroalimentaire, introduction aux aspects réglementaires.
5) Prérequis :
Biomolécules ou niveau équivalent
Connaissances de base en métabolisme
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28122060Travail personnel30201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
MOLECULES ET MACROMOLECULES DINTERET ALIMENTAIRE : (22 h Cours et 4 h TD)
Leau, les glucides, les protéines, les lipides, les vitamines et les oligo-éléments :
-Structures des molécules dintérêt alimentaire, sources, rôles dans la nutrition humaine
-Rôle de certaines molécules dans les aliments élaborés (goût, texturation : gels, mousses, émulsions
)
-Transformations au cours de la cuisson et des processus de transformations dans les industries agro-alimentaires.
DIETETIQUE : (4 h Cours et 2 h TD)
COMPOSITION DES PRINCIPAUX ALIMENTS :
- Présenté sous forme dexposés par les étudiants. (4 h TD)
- Illustration : le lait (2 h cours- 2 h TD et 20 h TP)
TP : analyse des principaux constituants du lait selon les normes en vigueur.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La composition des principaux aliments sera abordée sous forme dexposés préparés par les étudiants et présentés oralement en TD.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 7 : Biophysique moléculaire et cellulaire
Numéro de lUE : BIO 701
Intitulé de l' U E : Biophysique moléculaire et cellulaire
Responsable(s) : P. BRON et C. GARNIER
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master de recherche « Biochimie et Biologie moléculaire »
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs : Connaissance des principes et des applications scientifiques des méthodes classiques et modernes détude des macromolécules biologiques isolées ou in situ.
NB Cette UE est en principe couplée avec lUE « Physico-chimie des macromolécules biologiques».
5) Prérequis : Licence de Biochimie ou Licence de Chimie (si celle-ci comporte des UE de Biochimie).
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301416--60Travail personnel--60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Méthodes hydrodynamiques (en tant que méthodes de caractérisation)
Chromatographie
Electrophorèse
Viscosimétrie
Osmométrie
Ultracentrifugation analytique
Spectroscopie
Spectroscopie dabsorption (visible, UV, IR, Raman)
Dichroïsme circulaire
Fluorescence
Résonance magnétique nucléaire (RMN)
Résonance paramagnétique électronique (RPE)
Spectrométrie de masse
Diffusion et diffraction
Diffusion et diffraction des rayons X
Diffusion de la lumière visible
Diffusion des neutrons
Méthodes microscopiques
Microscopie photonique (visible, fluorescence, polarisation
)
Microscopie électronique (TEM, cryomicroscopie
)
Microscopie de force atomique (AFM)
TD : Les TD seront consacrés à des exercices dapplication concrets concernant la structure et/ou la fonction de macomolécules biologiques. Principaux thèmes abordés :
Caractérisation dune protéine par chromatographie dexclusion stérique et ultracentrifugation analytique.
Cristallographie 2-D des protéines membranaires.
Cristallographie 3-D des protéines.
Spectrométrie de masse: détermination de la masse et séquençage des protéines.
Etude de la structure secondaire des protéines et des peptides par spectroscopie IR et dichroïsme circulaire.
Utilisation de sondes fluorescentes en spectroscopie et en microscopie.
Applications de la RMN multidimensionnelle.
TP : Les TP comprendront une partie expérimentale et des démonstrations, dans différents laboratoires, de techniques reposant sur lutilisation dappareils non disponibles en salle de TP.
8) Bibliographie :
«Méthodes biophysiques pour létude des macromolécules » (J. Janin ) (Editeur : Hermann Paris : collection méthodes ) ISBN: 2-7056-6000-3.
« Biochimie: méthodes biophysiques expérimentales » (M. Prats) (Editeur : Dunod ) ISBN: 2-10-005702-2.
« Biochimie Un modèle détude : laspartate transcarbamylase Théorie et guide dexpériences » (M. le Maire, R. Chabaud & G. Hervé) (Editeur : Masson) ISBN: 2-225-81918-1.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (Master 1 « Biochimie et Biologie moléculaire »)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cette UE méthodologique est couplée à lUE « Physico-chimie des macromolécules biologiques » et sera enseignée par des spécialistes de différentes disciplines (Biologie, Chimie et Physique). Lillustration des principes et de leurs applications se fera essentiellement dans le domaine des macromolécules biologiques et des complexes supramoléculaires.
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
S 7 : Outils et Méthodes de Bio-informatique
Numéro de lUE : BIO 702
Intitulé de l' U E : Outils et Méthodes de Bio-informatique
Responsable(s) : Christian DELAMARCHE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master de recherche de Biologie et Environnement mention bio-informatique : obligatoire
Optionnel pour le master de Biochimie et Biologie Moléculaire
2) Parcours : Première année du Master de bio-informatique
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Etude des principales méthodes utilisées pour l'analyse de séquences nucléiques et protéiques et principe des algorithmes utilisés par certains logiciels
Formation pratique aux principaux logiciels du domaine (notamment ceux qui sont en accès libre sur le web ainsi que des outils de la plate forme bio-informatique de la génopole Ouest)
Permettre une utilisation intensive et raisonnée de ces outils et répondre aux questions suivantes : que faire avec mes séquences, quel logiciel utiliser, quelle est la méthode sous-jacente, comment régler les paramètres associés aux logiciels, quelles sont les limites des méthodes, que faire avec les résultats
5) Prérequis :
Connaissances de niveau licence de biologie sur la structure, l'organisation et le fonctionnement des gènes procaryotes et eucaryotes. Connaissances en biochimie des protéines.
Connaissances des tests statistiques fondamentaux utilisés en biologie.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel201420660Travail personnel1520101560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
THEMES DES COURS : (Les noms de logiciels sont indicatifs)
LA BIO-INFORMATIQUE POUR QUOI FAIRE ?
Les domaines et enjeux de la bio-informatique
Exemples d'apport de la bio-informatique à la biologie
Exemples de thématiques de recherche en bio-informatique
BANQUES DE DONNEES
Banques de séquences primaires et de structures : GENBANK, EMBL, Swiss-Prot, InterPro, PDB
Organisation des fichiers plats de données et format des séquences
Systèmes experts d'interrogation : SRS, ENTREZ (opérateurs Booléens et expressions régulières)
Sécurité et fiabilité des données
MATRICES ET TABLES DE SCORES
Tables pour les nucléotides
Matrices PAM et BLOSUM : principe de la réalisation
Matrices de structures et autres matrices de substitutions
ANALYSE D'UNE SEQUENCE
Recherche d'ORF, de promoteurs, prédiction des introns/exons, prédiction de structures secondaires
: principes de base, illustrations et limites des méthodes
INTRODUCTION AUX ALIGNEMENTS DE SEQUENCES
Pourquoi comparer des séquences ?
Principe de l'alignement de 2 séquences : DOTPLOT, ALIGN, SSEARCH
Similarité et distance entre séquences
Pénalités de gaps et calcul du score d'un alignement
Comment choisir les paramètres optimums de gaps ?
Alignements locaux et globaux : quelle méthode, pour quoi faire ?
Algorithmes de Needelman et Wunsch, Smith et Waterman et variantes (préparation au module de S8, algorithmique des séquences)
COMPARAISONS DE SEQUENCES
BLAST : principe, paramètres des alignements, statistique des scores, différents BLAST
FASTA : principe, paramètres des alignements, statistique des scores, différents FASTA
Choisir entre BLAST ou FASTA
CLUSTAL : principe pour l'alignement multiple, paramètres de l'alignement, statistique des scores. Introduction aux arbres phylogénétiques
RECHERCHE DE MOTIFS CONNUS ET DECOUVERTE DE MOTIFS
Consensus, motifs, domaines, empreintes, familles de protéines
Expressions en langage de type PROSITE
Théorie de l'information et entropie dans les séquences
Mutations corrélées : principe et illustration par l'exemple
Extraction de motifs spécifiques à partir d'alignements multiples
Présentation de logiciels standards: Blocks, Logos, PRATT
Logiciel de visualisation et de modélisation moléculaire: RASMOL, SWISS-MODEL
THEMES DE TD
Illustration du cours par connexions web. Plate forme bio-informatique Génopole Ouest
Exercices sur les alignements par programmation dynamique, sur l'utilisation des matrices de substitution et les profils de séquences
Analyse d'articles de recherche en bio-informatique : banques de données et principe de logiciels d'analyse de séquences
Analyse d'articles de recherche en biologie basés sur l'application de méthodes d'analyses de séquences vues en cours
THEMES DE TP
Interrogation avancée dans PUBMED
Interrogations élaborées des banques par SRS et ENTREZ
Analyse d'une séquence : recherche d'ORF, gènes de tRNA, introns-exons, Dot plot, profils divers, prédiction de structures secondaires
Comparaison d'une séquence contre une banque : BLAST et FASTA
Comparaisons de 2 séquences et comparaisons multiples : ALIGN, CLUSTALW
Recherche de motifs : logos, Blocks, ScanPROSITE, MOTIF, PATTERN, PRATT
Visualisation de la structure 3D des protéines : RASMOL, SWISS-Model
Projet personnel (en binôme) autour d'un thème (mini projet de recherche, présentation d'une base de données, d'un logiciel, d'une technique de génération de données en masse
). Le projet est en partie encadré par un enseignant (discussion sur le projet, recherche de documents, conseils techniques, conseils de rédaction
). Le projet fait l'objet d'un rapport écrit sous la forme d'un article scientifique et d'une présentation orale. Le projet est noté. Certains rapports pourront être proposés pour publication dans la revue Biologos (http://biologos.univ-rennes1.fr/ )
8) Bibliographie :
Introduction à la bioinformatique. C. Gibas et P. Jambeck. Ed O'REILLY
Bioinformatique, F. Dardel et F. Képès, Ed Ecole Polytechnique
Bioinformatics, A. Baxevanis et F. Ouellette, Ed Wiley Interscience
Bioinformatics, P. Baldi et S. Brunak, MIP Press
Introduction to computational Molecular Biology, J. Sebutal and J. Meidanis, PWS Publishing Company
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (Bio Informatique)
optionnel X ( Biochimie et Biologie Moléculaire)
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Une partie de l'enseignement théorique est présentée avec vidéoprojection et connexion en temps réel sur des sites web. Une partie de l'enseignement est disponible sur le site web du Master (diaporamas de cours, TD et TP corrigés, exercices animés
)
12) Capacité d'accueil : 40
________________________________________________________________________
S 7 : Physico-chimie des macromolécules biologiques PCMB.
Numéro de lUE : BIO 703
Intitulé de l' U E : PHYSICO-CHIMIE DES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES (PCMB)
Responsable(s) : H. WROBLEWSKI
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master recherche 1 de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs : Connaissance approfondie de la structure et des relations structure-activité des macromolécules biologiques.
NB Cette UE est en principe couplée avec lUE « Biophysique moléculaire et cellulaire ».
5) Prérequis :
Licence de Biochimie ou Licence de Chimie (si celle-ci comporte des UE de Biochimie).
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301416--60Travail personnel--60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
1. Protéines : conformation, évolution et repliement.
a. Interactions entre chaîne polypeptidique et solants (eau, solvants apolaires, bicouche lipidique, interfaces) ; amphipathie et effet hydrophobe.
b. Structure secondaire et structure tertiaire : liaisons et énergie de cohésion ; domaines et motifs de repliement.
c. Structure quaternaire et modularité.
d. Repliement spontané et repliement assisté : aspects mécanistiques, thermodynamiques et cinétiques ; dénaturation ; défauts de repliement et pathologies.
e. Evolution des protéines (mécanismes ; spéciation et différenciation ; convergence et divergence).
f. Prédiction de la structure et de la fonction des protéines ; notions de protéomique.
2. Structure moléculaire et supramoléculaire des acides nucléiques.
a. Structure et conformation des acides nucléiques (structures, modifications topologiques, nucléosomes).
b. Protéines de liaison aux ADN.
c. Protéines de liaison aux ARN.
3. Structure des polysaccharides et biopolymères dérivés.
4. Mécanismes dactivité des protéines et interactions moléculaires.
a. Interactions entre protéines et ligands.
b. Bases structurales du mécanisme daction et de la fonction des protéines.
TD : Exercices sur le cours et interprétation de données expérimentales.
1. Structure primaire des protéines (détermination de la séquence des chaînes polypeptidiques ; ponts disulfures ; modifications covalentielles).
2. Analyse des structures secondaires périodiques : moment hydrophobe, diagramme dEisenberg, roue dEdmunson. Aplication aux peptides et aux protéines.
3. Stabilité conformationnelle des protéines.
4. Analyse de séquences in silico : principe du balayage paramétrique dune séquence et notion de fenêtre coulissante ; application aux profils dhydropathie et damphipathie.
5. Méthodes expérimentales de détermination de la topologie des protéines membranaires.
6. Analyse fonctionnelle de linteraction ADN-protéine.
7. Interactions protéine-ligand (spécificité et affinité ; méthodes détude et de mesure).
TP :
1. Etude spectroscopique de la dénaturation dune protéine.
2. Caractérisation structurale dune protéine in silico.
8) Bibliographie :
« Principles of protein structure » (G. E. Schulz & R. H. Schirmer) (Editeur: Springer Verlag)
ISBN : 0-387-90334-8.
« Introduction to protein structure » (C. Branden & J. Tooze) (Editeur: Garland Publishing) ISBN : 0-8153-0270-3.
«Ezymes: catalyseurs du monde vivant » (J. Pelmont) (Editeur: Presses Universitaires de grenoble: Collection Grenoble Sciences) ISBN: 2-7061-0655-7.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (Master 1 « Biochimie et Biologie moléculaire »)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
S 8 : Biomembranes
Numéro de lUE : BIO 801
Intitulé de l' U E : BIOMEMBRANES
Responsable(s) : H. WROBLEWSKI
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche 1 « Biochimie et Biologie moléculaire »
Master recherche 1 Biologie et Environnement mention « Biologie cellulaire et moléculaire et Physiologie » (toutes spécialités)
2) Parcours :
3) Semestre n° 8
4) Objectifs : (1) Maîtrise des concepts modernes concernant lorganisation moléculaire des membranes biologiques, les relations structure-fonction des protéines membranaires (notamment transport et transduction des signaux), et les mécanismes de transduction dénergie. (2) Connaissance des méthodes spécifiques utilisées en membranologie.
5) Prérequis : Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, ou Licence de Biologie cellulaire et moléculaire, et Physiologie, ou Licence de Chimie (si UE de Biochimie)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301416 --60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
1. Organisation moléculaire des biomembranes.
a) Structure et propriétés physico-chimiques des lipides.
b) Organisation latéro-transversale des lipides et des protéines ; ordre et désordre.
c) Dynamique membranaire et interactions protéines-lipides.
2. Détergents : propriétés et applications pour létudes membranes.
a) Définition et classification.
b) Propriétés physico-chimiques essentielles pour létude des membranes.
c) Action sur les membranes.
d) Action sur les protéines.
e) Applications techniques dans le domaine de la membranologie.
3. Structure des protéines membranaires.
a) Revue des différentes catégories topologiques.
b) Comparaison des protéines transmembranaires: barils alpha et barils béta.
c) Modifications covalentielles (acylation, lipoylation, glycosylation
).
4. Mécanismes de transduction dénergie et de transport.
a) Rappels de thermodynamique (énergie libre, potentiel chimique, potentiel élecrochimique, potentiel redox, loi daction de masse, équilibre, état stationnaire).
b) Pompes primaires : génération du potentiel électrochimique transmembranaire.
c) Pompe secondaire : synthèse dATP par lATPaseF0F1.
d) Transports de solutés (diffusion libre, diffusion facilitée, transport actif).
c) Canaux ioniques.
5. Mécanismes dadressage et de signalisation moléculaire.
Adressage des protéines chez les eucaryotes et les bactéries.
Mécanismes moléculaires de la transduction de signaux au niveau membranaire.
TD : Exercices sur le cours et analyse de données de la littérature. Principaux thèmes proposés :
1. Membranes artificielles, protéoliposomes et cristaux 2-D : préparation et applications.
2. Analyse critique dun protocole de purification/reconstitution de protéine membranaire.
3. Prédiction de la topologie dune protéine membranaire à partir de sa séquence et discussion de la validation expérimentale du modèle proposé.
4. Mesure du transport: méthodes et cinétiques.
5. Mesure du potentiel électrique et du "pH transmembranaires.
6. Méthodes d étude des canaux membranaires.
7. Adressage des protéines: interprétation de données expérimentales sur les séquences signal.
TP :
1. Détergents : caractérisation et utilisation (expériences de dissolution-reconstitution).
2. Etude du fonctionnement de la bactériorhodopsine, une pompe à protons activée par la lumière.
NB Une partie du travail expérimental sera réalisée, le cas échéant, au laboratoire.
8) Bibliographie :
« Biochimie et biophysique des membranes : aspects structuraux et fonctionnels » (E. Shechter & B. Rossignol) (Editeur: Masson, 2ème édition) ISBN : 2-225-83009-6.
« Biomembranes: molecular structure and function » (R. B. Gennis) (Editeur: Springer-Verlag ) ISBN : 0-387-96760-5.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
( Biologie Cellulaire
S 1 : La Cellule et son Information Génétique
Numéro de lUE : BIO 101
Intitulé de l' U E : La Cellule et son Information Génétique
Responsable(s) : F. LEGAY
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : obligatoire pour toutes les filières
2) Parcours :
1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions, de la licence de Biochimie et Biologie moléculaire, de la licence sciences de la vie et de la terre, de la licence pluridisciplinaire
3) Semestre n° 1
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement doit permettre à létudiant de comprendre les propriétés fondamentales de toutes les cellules.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel-4020-60Travail personnel501060* les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Chaque enseignant assurera la totalité de l'enseignement (Cours/TD et TP) du ou des groupes qu'il aura pris en charge.
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
INTRODUCTION (2 h )
La cellule, unité structurale et fonctionnelle des organismes vivants : Procaryotes (eubactéries et archées) et Eucaryotes.
I - Toute cellule est limitée par une membrane plasmique (10 h )
La membrane plasmique permet l'identification par rapport à l'environnement et les échanges avec cet environnement .
Des membranes biologiques internes créent des compartiments intracellulaires ayant des fonctions distinctes dans les cellules eucaryotes.
Le compartiment cytosolique (+ cytosquelette des cellules eucaryotes)
II - Toute cellule convertit de l'énergie pour son fonctionnement (6 h)
Oxydation phosphorylante de bactérie aérobie et photophosphorylation de bactérie photosynthétique.
Oxydations phosphorylantes mitochondriales et photophosphorylations chloroplastiques
Liens phylogénétiques entre bactéries, mitochondries et chloroplastes
III - Toute cellule possède de l'information génétique (14 h)
Nature de l'information génétique (ADN), (sans différencier les mécanismes moléculaires spécifiques aux procaryotes et aux eucaryotes)
Localisation cellulaire de l'information génétique
Procaryotes : chromosome et plasmides
Eucaryotes : noyau , mitochondries , chloroplastes
Expression de linformation génétique : conversion en protéines qui permettent de synthétiser les autres composants de la cellule
Exemples de biosynthèse d'une protéine soluble et d'une protéine membranaire ou sécrétée
IV - Toute cellule est produite par division d'une autre cellule (4 h)
Scission des procaryotes
Cycle cellulaire eucaryote (sans aborder les mécanismes moléculaires) avec biogenèse des mitochondries et chloroplastes
V - Les virus, perturbateurs de l'information génétique cellulaire (4 h)
Caractéristiques générales
Exemples de deux cycles de multiplication : virus à ADN et virus à ARN
20 h de TP illustreront plus particulièrement les parties I et III.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a pour objectif de donner une vue densemble des différents aspects de la biologie, daider les étudiants à définir leur orientation. Elle a aussi été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 3 : Organisation Fonctionnelle de la Cellule
Numéro de lUE : BIO 413
Intitulé de l' U E : Organisation Fonctionnelle de la Cellule
Responsable(s) : Cathy LeGoff
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie cellulaire et physiologie, licence de Biochimie et Biologie Moléculaire, licence Sciences de la Vie et de la Terre, licence Pluridisciplinaire
2) Parcours : 2ème année et 3ème année
3) Semestre n° :S3/S5
4) Objectifs :
Présenter aux étudiants lorganisation et le fonctionnement cellulaires en fonction des différents contextes biologiques (apoptose, signalisation,
).
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24162060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Dynamique cellulaire :
Cytosquelette et mouvements cellulaires
Flux de membranes
Compartimentation et routage des protéines
Cycle cellulaire, apoptose et vieillissement
Différentes phases du cylce et systèmes de contrôle
Mort cellulaire programmée
Vieillissement réplicatif et non-réplicatif
Signalisation cellulaire
Les systèmes de transduction du signal
systèmes hormones /récepteurs
récepteurs à sept domaines transmembranaires
récepteurs doués dactivité tyrosine kinase
rôles de messagers secondaires
de la membrane au noyau
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 3 / 5 : Organisation et Dynamique Cellulaire
Numéro de lUE : BIO 304
Intitulé de l' U E : Organisation et Dynamique Cellulaire
Responsable(s) : Gilles Salbert
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : 2ème et 3ème années
3) Semestre n° :S3/S5
4) Objectifs :
Présenter aux étudiants la structuration des cellules et des tissus et étudier les machines moléculaire liés à cette structuration et permettant les mouvements de matière et les flux dinformations
5) Prérequis : La cellule et son information génétique ou équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cytosquelette et moteurs moléculaires:
Actine et mouvements cellulaires (migration cellulaire, guidance axonale déplacement de vésicules/bactéries)
Microtubules interphasiques et mitotiques (positionnement des organites, duplication /migration du centrosome, ségrégation des chromosomes)
Filaments intermédiaires
Flux de membranes :
composition et structure des membranes (mosaïque fluide/liée, microdomaines, radeaux lipidiques)
contrôle des phénomènes de fusion et de fission de membranes
exocytose/endocytose et turnover membranaire (signalisation, réparation, perméabilité, systèmes de dégradation)
Compartimentation et routage des protéines :
Machineries dimportation protéique (translocon, importation/exportation nucléaire, TIM/TOM et mitochondrie, TIC/TOC et chloroplaste, système peroxysomal)
Transport vésiculaire et voies de sécrétion (systèmes COPI/COPII, maintien des protéines résidentes, contrôle qualité)
Jonctions cellulaires et Organisation des tissus
Jonctions intercellulaires
Matrice extracellulaire
Différents types de tissus
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Immunologie, Virologie et Applications
Numéro de lUE : BIO 504
Intitulé de l' U E : IMMUNOLOGIE , VIROLOGIE ET APPLICATIONS
Responsable(s) :Francis OMILLI et Claire PIQUET-PELLORCE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : 3ème année de licence Biologie
3) Semestre n° : 5 ou 6, 7 ou 8
4) Objectifs :
Donner aux étudiants :
les connaissances générales de bases en Immunologie et Virologie,
une ouverture aux applications de ces connaissances dans les domaine industriel pharmaceutique, agroalimentaire et biotechnologique.
5) Pré-requis :
UE obligatoires de Biochimie, de biologie cellulaire et de génétique de 1ère et 2ème année
6) Contenu des enseignements:
COURST. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30141660Travail personnel30141660
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS (30h):
Immunologie générale. (12h)
Introduction: définition de limmunité et de ses grands principes.
Les composants cellulaires de limmunité chez les mammifères (morphologie et origine)
Immunité innée chez les mammifères (barrières physiques, barrières cellulaires et moléculaires, inflammation).
Immunité acquise chez les mammifères (les molécules permettant la distinction du soi et du non-soi, la réponse humorale et la réponse cellulaire).
Virologie générale. (8h)
Historique, définition, caractéristiques et classification des virus (virus procaryotes, virus animaux et végétaux).
Interaction virus-cellules , cycle de multiplication virale et cycle latent (mode de pénétration, stratégies de multiplication, synthèse virale, assemblage, propagation de linfection).
Réponse de la cellule et de lorganisme à linfection virale (chez les bactéries, les végétaux et les animaux, quelques exemples de maladies virales chez lhomme).
Applications dans les domaines industriel et médical. (12h)
Production danticorps polyclonaux et monoclonaux
Vaccination et dessin de vaccins (dans le contexte médical et agroalimentaire)
Techniques de recherche dun agent infectieux chez lhôte et suivi de linfection (dans le contexte médical et agroalimentaire)
Le virus, un vecteur dinformation génétique vers les cellules eucaryotes (transgénèse et thérapie génique)
TD (14h): Exercices dapplications des concepts vus en cours et approfondissement des techniques détude du système immunitaire et des virus. Travail en groupe sur un sujet avec présentation orale.
TP (16h): Test de groupe sanguin et analyse dun frottis.
Infection dun modèle cellulaire eucaryote par un virus non pathogène avec identification dans le surnageant de culture déléments viraux et de virus (titration).
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire
optionnel(
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 5 : Communications Cellulaires
Numéro de lUE : BIO 505
Intitulé de l' U E : COMMUNICATIONS CELLULAIRES
Responsable(s) : Claire PIQUET-PELLORCE et Christian SALIGAUT
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire et Physiologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
UE Obligatoire pour la licence Biologie mention Biologie Cellulaire, Moléculaire et Physiologie
2) Parcours : 3ème année des licences
3) Semestre n° : 5, 7
4) Objectifs : Présenter aux étudiants les concepts généraux qui régissent la communication entre les cellules ainsi que la communication des cellules avec leur environnement et ce en abordant les cellules procaryotes et les cellules eucaryotes.
5) Pré-requis : UE Organisation fonctionnelle de la cellule ou Organisation et dynamique cellulaire ou Biologie cellulaire générale recommandé
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS (24h):
Comment les cellules communiquent-elles entre elles et avec leur environnement?
Ce problème sera abordé pour les cellules procaryotes et les cellules eucaryotes.
Communication directe
Molécules dadhésion
Molécules de jonctions
Echange de matériel
Communication indirecte :
Les grandes familles de ligands et leurs récepteurs
Ligands hydrophiles : hormones, facteurs de croissance, cytokines, composants de la matrice, ligands de natures biochimiques diverses impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes,.
Ligands hydrophobes : stéroïdes
Récepteurs membranaires
Récepteurs nucléaires
TD (12h):
Approfondissement des concepts vus en cours au moyen dexercices danalyse de données expérimentales visant à décrypter la communication cellulaire. Présentation des techniques détude des molécules de communications, notion de test biologique.
TP (24h):
Mise en uvre de méthodes permettant la mise en évidence des molécules de communication cellulaire.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel(
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 ou 6 : Méthodologies de Biologie Cellulaire et Moléculaire
Numéro de lUE : BIO 603
Intitulé de l' U E : Méthodologies de Biologie Cellulaire et Moléculaire
Responsable(s) : Stéphane DESCHAMPS
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours : 3ème année des licences
3) Semestre n° : S5/S6
4) Objectifs :
- Comprehension et Apprentissage de techniques nécessaires à l'étude des mécanismes de fonctionnement cellulaire
5) Prérequis : UE de biologie cellulaire et de Biochimie et méthodologies générales ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel6060 Travail personnel6060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Le module repose sur des séances de TP/TD intégrés visant à apprendre des techniques de biologie moléculaires et/ou cellulaires utilisées pour comprendre des mécanimes de fonctionnement de la cellule.
Travaux Pratiques
- Culture cellulaire (cellules adhérentes ou non)
- Transfection et transformation cellulaire
- Etude de lexpression de marqueurs phénotypiques :
- Utilisation de loutil anticorps (western, ELISA, Immunoprécipitation immunodéplétion
)
- Utilisation de sondes fluorescentes et observation en microscopie photonique et cytométrie en flux)
Ces séances seront organisées autour d'un ou deux modèles cellulaires.
Travaux dirigés
Apprentissage de la démarche scientifique : à partir dune hypothèse de travail conception de la démarche expérimentale, choix méthodologique, analyse critique de données (utilisation de loutil stastistique).
Initiation aux methodes de recherche documentaire, de communication écrite et orale.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 5 ou 6 : Cycle cellulaire, apoptose et vieillissement cellulaire
Numéro de lUE : BIO 604
Intitulé de l' U E : Cycle cellulaire, apoptose et vieillissement cellulaire
Responsable(s) : Catherine Gaillard-Le Goff
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
- licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
2) Parcours :
Troisième année de la licence de biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
3) Semestre n° 5 ou semestre 6
4) Objectifs :
Cette U.E. a pour objectif dappréhender des mécanismes du cycle cellulaire et de la mort cellulaire (vieillissement et apoptose) chez les eucaryotes. En montrant les différentes approches utilisées (génétique, biochimique, cellulaire
) cette U.E. doit permettre à l'étudiant dacquérir une bonne perception de ces mécanismes au niveau cellulaire et moléculaire.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20 h10 h30 h60 Travail personnel35 h20 h5 h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Le Cycle cellulaire
1.Les différentes phases du cycle
les phases G, la phase S de réplication de lADN et la phase M
2. Analyse génétique du cycle cellulaire chez la levure
isolement des mutants cdc
étude des interactions génétiques
3. Régulation et dérégulation du cycle cellulaire
les CDK, les cyclines
Rôle des phosphorylations dans lactivité des CDK
Rôle des CKIs dans lactivité des CDK
Rôle de la dégradation des protéines dans le contrôle du cycle
Les « checkpoints » majeurs
Notion doncogènes et de gènes suppresseurs de tumeur
La mort cellulaire
la mort cellulaire programmée
la mort cellulaire accidentelle (nécrose)
1. Analyse génétique de lapoptose chez C.elegans
2. Régulation de lapoptose
les signaux : voies intrinsèque et extrinsèque
la mitochondrie : Bcl2, t-bid, les pores de perméabilisation
les caspases et les inhibiteurs
Vieillissement cellulaire
1. Le vieillissement réplicatif
raccourcissement des télomères
ADN extrachromosomique chez la levure
2. Le vieillissement non réplicatif
Résistance au stress oxydatif
Analyse génétique du vieillissement chez C.elegans
TP :
Analyse de mutants du cycle cellulaire chez la levure S. pombe
- Etude de lapoptose dans les cellules en culture
8) Bibliographie :
Cet enseignement ne s'appuiera pas sur un livre particulier. Nombre de documents proposés aux étudiants pourront être extraits principalement de :
- Molecular Biology of the Cell par B. Alberts et al, 4ème édition, Garland Science
- Gène VII par B. Lewin, Oxford University Press
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel oui
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 7 : Différenciation Cellulaire
Numéro de lUE : BIO 704
Intitulé de l' U E : Différenciation Cellulaire
Responsable(s) : Daniel Boujard
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 recherche Biologie et Environnement mention Biologie Cellulaire, Moléculaire et Physiologie
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
La différenciation cellulaire suppose lémergence de types cellulaires ayant une identité nettement définie chez ladulte. Lobjectif de ce module est de donner aux étudiants les bases pour comprendre comment la nature et les propriétés des cellules différenciées sont déterminées par le profil dactivité des gènes et les protéines quelles synthétisent. Divers aspects des mécanismes impliqués dans la différenciation cellulaire seront abordés en cours et les séances de TD permettront aux étudiants dappréhender plus facilement les approches expérimentales dont certaines seront illustrées pendant les séances de TP.
5) Prérequis : Etre titulaire dune licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460 Travail personnel3025560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
1. Les cellules souches dans le règne animal et végétal
Chromatine et modifications héritables (Empreinte génétique, modifications épigénétiques,
)
Reprogrammation nucléaire (Clonage, transdifférenciation cellulaire
.)
Modèles de différenciation cellulaire (cellules neuronales, cellules sanguines
)
8) Bibliographie
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour filières Biologie Cellulaire
optionnel ( pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Génétique du Développement et Immunologie
Numéro de lUE : BIO 705
Intitulé de l' U E : Génétique du Développement et Immunologie
Responsable(s) : Céline RAGUENES-NICOL
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Sciences de la Vie et de la Terre, UE obligatoire
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
La biologie cellulaire et moléculaire du développement consiste à comprendre pourquoi et comment des gènes particuliers sont exprimés à des moments spécifiques de la vie d'une cellule ou d'un organisme. Dans ce module seront donc étudiés des processus tels que le développement embryonnaire, la différenciation cellulaire, la mort cellulaire programmée ou le développement de réponses immunes
5) Prérequis :
Licence SVT, licence de biologie, licence de Biochimie et Biologie Moléculaire ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30141660Travail personnel305101060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Génétique du développement 20h
La construction des organismes
Les gènes du développement et l'acquisition des plans d'organisation chez la drosophile, les amphibiens et Arabidopsis thaliana.
La communication au cours du développement précoce chez les amphibiens.
Les molécules d'adhésions pour la migration cellulaire lors de la gastrulation chez les amphibiens.
La différenciation et la dédifférenciation cellulaire : lignée érythroblastique des mammifères, éléments conducteurs des angiospermes.
Le renouvellement cellulaire : exemple des erythrocytes humains.
La mort cellulaire : développement embryonnaire et métamorphose des amphibiens, sénescence chez les angiospermes.
Immunologie 10h
Les défenses de l'organisme humain
Les cellules et molecules du système immunitaire
La reconnaissance du soi et du non-soi
La défense non spécifique
La défense spécifique
TD
Applications, illustration et approndissement du cours
TP
Analyse de mutants du développement d'Arabidopsis thaliana
Analyse et présentation d'article
8) Bibliographie :
programme du concours externe de l'agrégation STVU, B.O. n°26 du 6 juillet 2000.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( Master SVT
optionnel ( Master BBM
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 7 : Immunologie Cellulaire et Moléculaire
Numéro de lUE : BIO 706
Intitulé de l' U E : Immunologie Cellulaire et Moléculaire
Responsable(s) :Claire PIQUET-PELLORCE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master de recherche biologie et environnement mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : MASTER 1
3) Semestre n° : 7 et 8
4) Objectifs : Donner aux étudiants des connaissances approfondies des mécanismes moléculaires et cellulaires mises en uvre par le système immunitaire des mammifères. Un certains nombres de pathologies affectant le système immunitaire ou liées au dysfonctionnement de celui-ci seront traitées sans quil ne sagisse dune formation à visée médicale.
5) Pré-requis : UE Immunologie, virologie et applications recommandée
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2662860Travail personnel
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours (26h):
Le système immunitaire
Systèmes immunitaires et évolution
Les constituants du systeme immunitaire des mammifères et son organisation dans lindividu
Les molécules du systeme immunitaire
Le processus de différenciation et de production des lymphocytes fonctionnels
La réponse immunitaire
Les mécanismes de défense non-spécifiques et la réponse inflammatoire
Les réponses humorale et cellulaire et leur régulation.
La coordination des processus de défense spécifiques et non-spécifiques
La réussite des infections : importance des inter-relations hôte pathogène.
Lexemple de quelques maladies infectieuses.
La tolérance immunitaire
Principes et mécanismes.
L'immunoprivilège
La tolérance foeto-maternelle
La relation hôte-tumeur
Pathologies du système de défense immunitaire
Limmunodéficience, le cas du SIDA.
Lhypersensibilité
Les processus autoimmuns.
TD (6h): exercices dapplications des notions vues en cours.
TP (28h): Etude du sang et de ses composés cellulaires.
Numération, formule sanguine, purification des cellules mononuclées. Caractérisation par identification de marqueurs moléculaires au moyen de technique variée (test des rosettes, immunofluorescence et analyse par cytométrie en flux). Caractérisation fonctionnelle des lymphocytes T auxiliaires par la mise en uvre dune stimulation et le dosage de cytokines au moyen dun test biologique
Présentation orale dun travail personnel danalyse de publications de niveau international en immunologie.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
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S 7 : Biologie et Génétique du Développement
Numéro de lUE : BIO 707
Intitulé de l' U E : Biologie et Génétique du Développement
Responsable(s) : Isabelle Chartrain
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
master de recherche biologie et environnement mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : 1ère, 2ème et Masters
3) Semestre n° : 7 ou 8
4) Objectifs :
Donner aux étudiants les bases pour comprendre comment lactivité régulée des gènes dirige des séquences dévènements cellulaires qui conduisent à la construction dun organisme à partir dune cellule-uf. Les mécanismes essentiels impliqués dans le développement embryonnaire seront abordés en cours et les séances de TD permettront aux étudiants dappréhender plus facilement les approches expérimentales. Pendant les séances de TP, les étudiants réaliseront des expériences sur différents modèles embryonnaires pour illustrer certains mécanismes de différenciation rencontrés au cours du développement.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26102460 Travail personnel3025560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
1. Déterminisme maternel : importance des molécules dorigine maternelle pour le début du développement embryonnaire.
Etablissement des polarités embryonnaires (mise en place des gènes pair-rule, de polarité). Identité des segments : rôle des gènes homéotiques.
Conservation des mécanismes moléculaires au cours du développement.
Symétrie et asymétrie cellulaire au cours du développement.
Déterminisme sexuel dans différents modèles animaux.
Déterminisme et différenciation tissulaire (différents exemples seront étudiés : tissu musculaire, tissu nerveux, ébauches de membre
)
8) Bibliographie :
Biologie du Développement par Lewis Wolpert et al. ; Edition Dunod
Developmental Biology par Scott F. Gilbert; Edition Sinauer
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques
12) Capacité d'accueil : 50 à 60 étudiants maximum
S 7 : Méthodes dEtude des Complexes Biologiques
Numéro de lUE : BIO 708
Intitulé de l' U E : Méthodes dEtude des Complexes Biologiques
Responsable(s) : Gilles Salbert
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire et SPM
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche en Biologie et Environnement mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° :S7 ou S8
4) Objectifs :
Présenter aux étudiants les méthodologies permettant la découverte, lanalyse, et la perturbation dassemblages moléculaires biologiques.
5) Prérequis : Etre titulaire dune licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
- Recherche et analyse de partenaires constituant des complexes (Double hybride/triple hybride, Co-Immunoprécipitation couplée à la spectrométrie de masse, Couplage covalent et immunoprécipitation de la chromatine,
)
- Analyse de la dynamique des complexes par microscopie (Microscopie en champ lointain-interactions photon-matière - lumière blanche, fluorescence et transfert de fluorescence, microscopies confocale et multiphotonique ; Microscopie en champ proche, microscopie à force atomique
)
- Perturbation des assemblages (Modulateurs non peptidiques, Peptides inhibiteurs- in vitro/in vivo, phage display)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Cancérologie
Numéro de lUE : BIO 823
Intitulé de l' U E : Cancérologie
Responsable(s) : Thierry Guillaudeux
Equipe(s) pédagogique(s) :Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) Recherche Biologie et Environnement mention Biologie Cellulaire et Physiologie
2) Parcours : 4ème année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
5) Prérequis : UE Cycle cellulaire, Apoptose et Vieillissement cellulaire recommandé
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30151560Travail personnel30201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Notions de Cancérologie générale et Epidémiologie
Caractérisation des cancers :
Phénotypique
Altérations chromosomiques
Division et cycle cellulaire/apoptose
Carcinogénèse et prédispositions génétiques
Oncogènes, marqueurs tumoraux et hormones
Invasion locale, Angiogénèse, Métastases
Immunité antitumorale
Les thérapies actuelles :
Chirurgie
Radiothérapie
Chimiothérapie
Imagerie
TP :
Transformations cellulaires, identification de marqueurs, résistance à lapoptose, étude de translocations chromosomiques
TD = Minicolloque
Travail par binôme sur les voies de recherche dans les nouvelles thérapies antitumorales. Présentation orale.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Une partie des enseignements pourra éventuellement être suivie dans le cadre de la MSBM (maîtrise des sciences biologiques et médicales) sous réserve demploi du temps concordant.
12) Capacité d'accueil :
( Microbiologie
S 3 : Bactériologie Générale
Numéro de lUE : BIO 305
Intitulé de l' U E : Bactériologie Générale
Responsable(s) : Annie Trautwetter
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité microbiologie,
Obligatoire pour la spécialité biologie appliquée
Obligatoire pour la spécialité sciences végétales
Optionnel pour les autres
Licence de Biologie mention biologie des organismes
2) Parcours :
Licences de biologie 2ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 2ème année
3) Semestre n° : S3
4) Objectifs : Objectifs : Cette UE doit permettre aux étudiants de prendre conscience de la diversité du monde microbien et dacquérir les notions fondamentales nécessaires à tout approfondissement dans cette discipline.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30161460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
programme de cours
1 - Structure de la cellule procaryote
2 - Métabolisme
besoins nutritifs et types trophiques
métabolisme énergétique
auxotrophie
absorption des nutriments
adaptation du métabolisme à lenvironnement
3 Milieux de culture
définition
paramètres physico-chimiques
notion de stérilité
4 Analyse quantitative de la croissance
5 Réplication du chromosome , mutations
6 Organisation génétique et régulation de lexpression des gènes
7 Transfert de matériel génétique
transformation
transduction
conjugaison
Programme des TP
Notions de stérilité et milieux de culture
Types trophiques et respiratoires
Transfert de gènes
Analyse quantitative de la croissance
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie LM Prescott, JP Harley, DA KleinDe Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
3) Semestre n° : S3
4) Objectifs : Connaissances de base en Bactériologie
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30161460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structure cellule procaryote
Métabolisme des microorganismes
Types trophiques, métabolisme énergétique, source de carbone et d'azote. Adaptation métabolique. Milieux de culture : nature, paramètres physico-chimiques.
Croissance (notion de culture pure, notion de stérilité) Analyse quantitative de la croissance.
Bases de la génétique bactérienne
Replication du chromosome. Mutations.
Organisation en opéron. Régulation de l'expression des gènes. Transfert de matériel génétique chez les bactéries.
Travaux pratiques : Croissance (inclure les notions sur la stérilité)
Types trophiques
Transfert de gènes (conjugaison)
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie LM Prescott, JP Harley, DA KleinDe Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
S 4 : Microbiologie pratique Identification des micro-organismes
Numéro de lUE : BIO 404
Intitulé de l' U E : Microbiologie pratique Identification des micro-organismes
Responsable(s) : Catherine Fontenelle & Gwennola Ermel
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité microbiologie,
Obligatoire pour la spécialité biologie appliquée
Optionnel pour les autres
2) Parcours :
Licence de biologie 2ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 2ème année
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs :
Acquisition de bonnes pratiques en microbiologie
Compréhension de la diversité microbienne
5) Prérequis :
UE Bactériologie Générale
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel10104060Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Notion de phylogénie et de taxonomie
Bases de l'identification
Milieux de sélection,
Stérilisation, Désinfection
Développement d'une stratégie de recherche et d'identification de micro-organismes
A partir d'un mélange inconnu pour les étudiants : identification classique, identification ARN16S
Auxotrophie
Croissance avec différents facteurs
Sérotypage de bactéries de type 1
Phages avec spectres d'hôte
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie LM Prescott, JP Harley, DA KleinDe Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
S 5 : Microbiologie Appliquée à lAgro-Alimentaire
Numéro de lUE : BIO 506
Intitulé de l' U E : Microbiologie Appliquée à lAgro-Alimentaire
Responsable(s) : Gwennola Ermel
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité biologie appliquée
Optionnel pour les autres
Master professionnel biologie, environnement et santé mention biologie et gestion
2) Parcours :
Licence de biologie 3ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 3ème année
3) Semestre n° : S5
4) Objectifs : Connaissances des micro-organismes intervenant dans l'agro-alimentaire : origine, rôles et actions.
5) Prérequis :
UE Bactériologie Générale
UE Microbiologie pratique
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20103060Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structure et organisation des génomes
Les différents supports de l'information génétique : nombre, topologie, organisation
Replication (chromosome, plasmides, phages)
Les apports de la génomique
Séquençage et annotation des génomes
Nombre de gènes, notion de génome minimal
Signatures et transfert horizontal
Evolution en mosaïque des gènes et des génomes
Mécanismes impliqués dans la variabilité de structure des génomes
Recombinaison homologue, Recombinaison site spécifique, Transposition
Altérations et Réparation de l'ADN
Origine des mutations spontanées, Les agents mutagènes.
Sélection et identification des mutants
Réparation de l'ADN : photoréparation, le système UVR, le système SOS, réparation des mésappariements (SPR, LPR)
Les travaux pratiques illustreront principalement la sélection et la caractérisation de mutants par diverses approches génétiques
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie
Microbiologie Alimentaire LM Prescott, JP Harley, DA Klein
JP GuiraudDe Boeck-Wesmael
DUNOD
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 5 : Pathogenie et Symbiose
A revoir : non finalisé
Numéro de lUE : BIO 508
Intitulé de l' U E : PATHOGENIE ET SYMBIOSE
Responsable(s) :
Equipe(s) pédagogique(s) : Microbiologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : L3 spécialité Sciences végétales et spécialité Biologie appliquée
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
5) Prérequis : UE de Bactériologie général en S4
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel60Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Pathogénie
Macération des plantes et infection systémique
Pathologie animale, mécanismes dinfection et dinvasion
Résistance des pathogènes par rapport aux défenses de lhôte
Lutte contre les pathogènes
Symbioses
Commensalisme et symbiose
Endosymbiotes des animaux
Rhizobium - Légumineuses
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Génétique Bactérienne
Numéro de lUE : BIO 509
Intitulé de l' U E : Génétique Bactérienne
Responsable(s) : Annie Trautwetter
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité microbiologie,
Obligatoire pour la spécialité biologie appliquée
Optionnel pour les autres
2) Parcours :
Licence de biologie 3ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 3ème année
3) Semestre n° : S5
4) Objectifs : Connaissances des génomes bactériens, de leur diversité et des systèmes de maintenance de l'information génétique
5) Prérequis :
UE Bactériologie Générale ou équivalent
UE Microbiologie pratique ou équivalent
UE Introduction à la génétique Moléculaire ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2882460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structure et organisation des génomes
Les différents supports de l'information génétique, nombre topologie, organisation
Replication (chromosome, plasmides, phages)
Les apports de la génomique
Séquençage et annotation des génomes
Nombre de gènes, notion de génome minimal
Signatures et transfert horizontal
Evolution en mosaïque des gènes et des génomes
Mécanismes impliqués dans la variabilité de structure des génomes
Recombinaison homologue, Recombinaison site spécifique, Transposition
Altérations et Réparation de l'ADN
Origine des mutations spontanées, Les agents mutagènes.
Sélection et identification des mutants
Réparation de l'ADN
Photoréparation,, le système UVR, Le système SOS, réparation des misappariements (SPR, LPR)
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie LM Prescott, JP Harley, DA KleinDe Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
S 6 : Bactéries, Virus, Défenses
Numéro de lUE : BIO 605
Intitulé de l' U E : BACTERIES, VIRUS, DEFENSES
Responsable(s) : Laurence Poitou
Equipe(s) pédagogique(s) : microbiologie, biologie cellulaire et physiologie végétale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :Licence Sciences de la Vie et de la Terre
Licence de Biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : 3ème année de licence
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs : acquérir les connaissances correspondant aux rubriques 1-6, 1-7, 2-5 et 7-6 du programme national du CAPES et de lagrégation de SVTU.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
COURST. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26142060 Travail personnel30141660
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
I- Particularités des cellules procaryotes 14h (équipe de microbiologie)
A- La cellule bactérienne : une cellule originale
Unité et diversité structurale
Comparaison avec une cellule eucaryote
B-La diversité bactérienne
Les facteurs influençant la croissance bactérienne
Diversité des métabolismes et nutrition
C-Relations des bactéries avec leur environnement à composante positive
D-Relations des bactéries avec leur environnement à composante négative
Les pathogénies dues aux bactéries
Traitements des pathogénies bactériennes
(Plasticité génétique : résistance aux antibiotiques)
II-Les systèmes biologiques sub-cellulaires (équipe de microbiologie) 4 h
A- Les virus : originalité de leur organisation
B-Des hôtes variés
Cycles du bactériophage, virus de la mosaïque du tabac, virus du SIDA (structure, génome viral et cycle réplicatif)
III- Les principes de la défense de l'organisme (équipes de biologie cellulaire et physiologie végétale) 6 h
A-Origine des cellules de l'immunité
B-Les différents types de réponses
C-L'hypersensibilité et la résistance acquise des végétaux
IV-Lhomme face aux maladies (équipes de microbiologie et biologie cellulaire) 2h
A-Eléments relatifs à diverses affections infectieuses
Origine parasitaire, bactérienne et virale
B-Prophylaxie et thérapeutiques
Antibiothérapie, vaccinothérapie, sérothérapie, dépistage, médicaments.
TD
Bactériologie 6h
Virologie 2h
Immunologie 6h
TP
Bactériologie 12h
Virologie 4h
Hématopoïèse 4h
8) Bibliographie :
BORREL TH,. Les virus, 128 p, Coll. 128 Nathan, 1996. Collectif (Pour la science) Les maladie émergentes , 180p, Belin, 1995 CORNUET P. Eléments de virologie végétale, 206 p, INRA, 1987. GIRARD M. & coll. Virologie générale et moléculaire, 617 p, Doin, 1989. GOLDSBY RICHARD, KINDT CLe cours de Janis Kuby avec questions de révision Dunod2001 JANEWAY & TRAVERS Immunobiologie, De Boeck Université1998. PRESCOTT L. & coll. Microbiologie, 1014p, De Boeck, 1999 REGNAULT J.P. Microbiologie générale, 859 p, Vigot, 1990. REVILLARD J.P. Immunobiologie, 367 p, De Boeck Université 1994. RICHARDImmunologie, 600pDunod2001
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue)
12) Capacité d'accueil : pas de limite
________________________________________________________________________
S 6 : Régulation des Gènes chez les Procaryotes
Numéro de lUE : BIO 606
Intitulé de l' U E : Régulation des Gènes chez les Procaryotes
Responsable(s) : Carlos Blanco
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité microbiologie,
Optionnel pour les autres
2) Parcours :
Licence de biologie 3ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 3ème année
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs : Compréhension de l'expression des gènes chez les procaroytes et des mécanismes de régulation
5) Prérequis :
UE Génétique Bactérienne ou équivalent
UE Bactériologie Générale ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2882460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Hiérarchies dans l'expression des gènes
stratégies expérimentales
Méthodes globales de l'étude des micro-organismes
Principes des méthodes d'analyse : protéome, transcriptome, métabolome
Acquisition et traitement des données
Comparaison de séquences
- operon, regulon, stimulon
- perception des stimulis
- cascades de régulation
Mécanismes impliqués dans la régulation
- régulation transcriptionnelle
facteurs sigma, topologie de l'ADN et protéines histone like, familles de régulateurs
- régulation traductionnelle
protéines régulatrices, ARN anti sens, structures secondaires, stabilité de l'ARN messager,séquestration des régulateurs
- régulations post traductionnelles
- modifications post traductionnelles et stabilité des protéines
Exemples de régulations intégrées
- cycle lytique des bactériophages
- la sporulation chez Bacillus subtilis
- contrôle du métabolisme
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie LM Prescott, JP Harley, DA KleinDe Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 6 : Physiologie Bactérienne
Numéro de lUE : BIO 607
Intitulé de l' U E : Physiologie Bactérienne
Responsable(s) : Henri Wroblewski
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie mention Biologie cellulaire et moléculaire et Physiologie
Obligatoire pour la spécialité Microbiologie,
Obligatoire pour la spécialité Biologie appliquée
Optionnel pour les autres
Licence de Biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours :
Licence de biologie 3ème année
Licence de biochimie et biologie moléculaire 3ème année
3) Semestre n° 6
4) Objectifs : Connaissance du fonctionnement intégré de la cellule bactérienne.
5) Prérequis : UE Bactériologie Générale ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30141660Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS :
Organisation, fonctions et biogenèse de lenveloppe cellulaire.
Paroi bactérienne et introduction de la notion dantibiotique.
Membranes bactériennes.
Autres composants: couche S et capsule polysaccharidique.
Energétique bactérienne, acquisition des nutriments et excrétion de substances.
Fonction énergétique du catabolisme.
Métabolisme énergétique, aérobiose et anaérobiose : respiration, photosynthèse, fermentation.
Transport des nutriments.
Excrétion de métabolites et de substances toxiques.
Voie générale de sécrétion et dadressage des protéines.
Motilité bactérienne et comportement taxique.
Différents types de motilités chez les bactéries.
Structure et fonctionnement des flagelles bactériens.
Transduction des signaux et tactisme bactérien (chimiotaxie, phototaxie
).
Principales homéostasies cellulaires.
Contrôle de la charge énergétique.
Contrôle du pH intracellulaire.
Osmorégulation.
Contrôle de la fluidité membranaire.
Cycle cellulaire et phase stationnaire.
Méthodes détude.
Coordination des événements fondamentaux du cycle cellulaire.
Mécanismes dentrée et sortie de phase stationnaire.
Morphogenèse de la cellule procaryote.
TD : Les travaux dirigés seront consacrés à lanalyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.
TP : Illustration expérimentale de certains thèmes du cours.
8) Bibliographie :
« Physiologie de la cellule bactérienne : une approche moléculaire » (F. C. Neidhardt, J. L. Ingraham & M. Schaechter) (Editeur : Masson) ISBN : 2-225-84383-X ;
« Microbiologie » (Prescott, Harley & Klein) (Editeur : DeBoeck Université) ISBN : 2-8041-1591-7.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 7 : Interactions Bactériennes
Numéro de lUE : BIO 709
Intitulé de l' U E : Interactions Bactériennes
Responsable(s) : Carlos Blanco (& Gwennola Ermel)
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) recherche Biologie et Environnement mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
Obligatoire pour la spécialité microbiologie
Optionnel pour les autres
Master professionnel de Sciences agronomiques, Agroalimentaires et Vétérinaires
Obligatoire pour la spécialité maîtrise et utilisation des micro-organismes
Optionnel pour les autres
2) Parcours : Master 1ème année
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs : Compréhension des mécanismes de communication entre bactéries, les transferts d'ADN et leurs rôles dans l'évolution
5) Prérequis :
UE bactériologie générale ou niveau équivalent
UE Génétique bactérienne ou niveau équivalent
(UE Régulation de l'expression des gènes chez les procaryotes conseillé)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Ecologie microbienne
Biodiversité et Taxonomie (Taxonomie numérique, systématique moléculaire, phylogénie, cladistique, Évolution des séquences dADN. Écologie moléculaire)
Communications cellulaires
Comportement social
Interactions microbiennes
Biofilms
Comportement bactérie-hôte (symbiose, pathogénie)
Capture et transfert d'ADN
Transfert via les bactériophages
mécanismes et implications conversion lysogénique et îlots de pathogénicité
transduction restreinte
transduction généralisée
La conjugaison
Les plasmides conjugatifs, mécanismes de transfert et régulation
la mobilisation
transfert interrègne
La compétence
état de compétence et transport de l'ADN
régulation
Rôle dans l'évolution
demie vie de l'ADN dans l'environnement
capture et transfert de gènes chromosomiques
incidences évolutives et écologiques
Applications
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie
Introduction à l'analyse génétique
LM Prescott, JP Harley, DA Klein
Griffiths et al.De Boeck-Wesmael
De Boeck-WesmaelJourneaux scientifiques : Applied and Environnemntal Microbiology, Journal of Bacteriology, Molecular Microbioloy
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 7 : Assurance qualité, Risques microbiologiques
Numéro de lUE : BIO
Intitulé de l' U E : Assurance qualité, Risques microbiologiques
Responsable(s) : Gwennola Ermel (& Michel Gautier ENSAR)
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 professionnel de Sciences agronomiques, agroalimentaires et Vétérinaires
Obligatoire pour la spécialité maîtrise et utilisation des micro-organismes
Optionnel pour les autres
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Master recherche Biologie et Environnement mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie et mention sciences végétales fondamentales
2) Parcours : Master 1ème année
3) Semestre n° : S7 ou S8 ou S9
4) Objectifs : Acquérir les connaissances nécessaires de microbiologie dans un cadre appliqué à l'agro-alimentaire, et plus spécifiquement l'assurance qualité
5) Prérequis : Connaissances des bases en bactériologie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2882460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
EN FONCTION DES EMPLOIS DU TEMPS ET DES EFFECTIFS, CETTE UE POURRAIT ETRE REMPLACEE PAR 2 MODULES ENSAR "Hygiène Alimentaire" et "Management de la Qualité"
Assurance Qualité appliquée à l'Agro-alimentaire (Accréditation et normes, HACCP)
Bonnes Pratiques de Laboratoire. Contrôle qualité. HACCP. Normes.
Risques biologiques, risques bio-industriels.
Réglementation sur lutilisation des OGM. Réglementation sur la dissémination des OGM et sur létiquetage des bioproduits
Réglementation sur lexpérimentation animale.
Labels, certifications (RNE, AFAQ)
Contrôles microbiologiques : microflores et flores daltération, intoxications et toxi-infections, analyses microbiologiques.
Caractérisation et identification microbienne
Typage moleculaire (serotypage, génotypage
)
Diversité, notion de clonalité
Taxonomie numérique, systématique moléculaire, phylogénie, cladistique
Évolution des séquences dADN. Écologie moléculaire.
Microbiologie prévisionnelle
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 7 : Relations Bactérie-Hôte, Bactérie-Milieu
Numéro de lUE : BIO
Intitulé de l' U E : Relations Bactérie-Hôte, Bactérie-Milieu
Responsable(s) : Henri Wroblewski
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) de Biologie et Environnement mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
Obligatoire pour la spécialité Microbiologie
Optionnel pour les autres
Master professionnel de Sciences agronomiques, Agroalimentaires et Vétérinaires
Obligatoire pour la spécialité Maîtrise et utilisation des micro-organismes
Optionnel pour les autres
2) Parcours : Master 1ème année
3) Semestre n° : S7 ou S8
4) Objectifs : Comprendre les modalités cellulaires et moléculaires des interactions des bactéries soit avec l'hôte, soit avec le milieu environnant.
5) Prérequis : UE de Physiologie bactérienne ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30141660Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS :
Origine évolutive des interactions bactérie-hôte
Rappel des principales théories de lévolution des procaryotes et des eucaryotes.
Endosymbiontes : origine bactérienne des mitochondries et des chloroplastes.
Importance de la notion de co-évolution.
Pathogénie
Diversité des bactéries pathogènes et incidences sociales et économiques des maladies infectieuses.
Facteurs de virulence (adhésines, sidérophores , endotoxines, exotoxines, hydrolases, superantigènes, modulines, autres).
Mécanismes de résistance des bactéries aux défenses de lhôte (variabilité de surface, localisation intracellulaire, comportement pro- ou anti-apoptotique).
Etude approfondie de quelques exemples de bactéries pathogènes (Bacillus anthracis ; Mycobacterium ; Agrobacterium
).
Symbioses
Revue des principales symbioses entre bactéries et animaux, végétaux ou champignons.
Etude approfondie du modèle rhizobium/légumineuse.
4. Antibiotiques
Principales familles dantibiotiques.
Mécanismes daction des antibiotiques.
Mécanismes de résistance des bactéries ; régulation et coordination.
Modulation des interactions bactérie/hôte par les antibiotiques.
5. Adaptation aux contraintes environnementales
Microorganismes et environnement
Notion de cultivabilité
Mise en place de stratégie de survie
TD : Les travaux dirigés seront consacrés à lanalyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.
TP : Illustration expérimentale de certains thèmes du cours.
8) Bibliographie :
« Microbiologie » (Prescott, Harley & Klein) (Editeur : DeBoeck Université) ISBN : 2-8041-1591-7.
« Antibiotiques, agents antibactériens et antifongiques » (A. Bryskier) (Editeur : Ellipses Edition Marketing) ISBN : 2-7298-4712-X.
« Introduction à la nouvelle classification bactérienne » (J.-P. Larpent) (Editeur : Editions Technique & Documentation) ISBN : 2-7430-0417-7.
« Bactéries et Environnement » (J. Pelmont) (Editeur : Presses Universitaires de Grenoble)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée.
S 7 : Microbiologie Appliquée aux Fermentations
Numéro de lUE : BIO 710
Intitulé de l' U E : Microbiologie Appliquée aux Fermentations
Responsable(s) : Gwennola Ermel (& Michel Gautier ENSAR)
Equipe(s) pédagogique(s) : MICROBIOLOGIE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master-professionnel de Sciences agronomiques, Agroalimentaires et Vétérinaires
Obligatoire pour la spécialité maîtrise et utilisation des micro-organismes
Optionnel pour les autres
Master-professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
2) Parcours : Master 1ème année
3) Semestre n° : S7 ou S8 ou S9
4) Objectifs : Acquérir les connaissances nécessaires de microbiologie dans un cadre appliqué à l'agro-alimentaire, et plus spécifiquement liées aux biotechnologies
5) Prérequis : Connaissances des bases en bactériologie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2882460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
EN FONCTION DES EMPLOIS DU TEMPS ET DES EFFECTIFS, CETTE UE POURRAIT ETRE REMPLACEE PAR 2 MODULES ENSAR "Microbiologie des produits fermentés" et " Génie des séparations"
Génie fermentaire
Génie fermentaire et enzymatique : types de culture, les bioréacteurs, les paramètres de la fermentation, capteurs et régulation, extraction et purification de métabolites, microorganismes et enzymes immobilisés
Technologie d'extraction, de fractionnement et de purification (ultracentrifugation, dialyse, chromatographie (partage échangeuse d'ions, exclusion moléculaire, affinité
), electrophorèse et methodes dérivées)
Production d'aliments fermentés. Fermentations en agro-alimentaire : laits fermentés et fromages, boissons fermentées.
Production industrielle de biomasse
Etudes des techniques de récolte (filtration, centrifugation), de formulation et de conservation de la biomasse microbienne.
Etude de faisabilité des procédés à l'échelle pilote
Constitution et gestion de collection de micro-organismes. Base de données, entretien et vérification de souches constituant la collection
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
( Génétique
S 3 : Introduction à la génétique moléculaire
Numéro de lUE : BIO 306
Intitulé de l' U E : Introduction à la Génétique Moléculaire
Responsable(s) : Serge HARDY
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
- Licence de biochimie et de biologie moléculaire
- Licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
2) Parcours :
Deuxième année de la licence de biochimie et de biologie moléculaire et deuxième année de la licence de biologie mention biologie cellulaire et moléculaire et physiologie
3) Semestre n° 3
4) Objectifs :
Cette U.E. a pour objectif de donner une vue générale du fonctionnement des gènes chez les eucaryotes et les procaryotes et de rendre l'étudiant familier avec le concept de gène décliné d'un point de vue moléculaire. Cette U.E. doit également conduire l'étudiant à une bonne maîtrise des principales techniques de la biologie moléculaire.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
COURST. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30 h14 h16 h60 Travail personnnel35 h20 h5 h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Nature du matériel génétique : l'ADN (5 h)
rappels sur la structure et les propriétés de l'ADN
interaction de l'ADN avec les protéines
compaction de l'ADN
biosynthèse de l'ADN : la réplication
La structure des gènes et des génomes (2 h)
Techniques de la biologie moléculaire (8 h)
Techniques de l'ADN recombinant (enzymes de restrictions, enzymes de modification, clonage)
Outils moléculaires pour étudier les gènes et l'activité des gènes Northern blot, Southern blot, PCR, séquençage
Flux de l'information génétique (15 h)
rappel sur la structure de l'ARN
la transcription chez les procaryotes : initiation, élongation, terminaison, notion d'opéron (2 h)
la transcription chez les eucaryotes : différentes classes de gènes et d'ARN polymérases (4h)
la maturation des ARN : maturation des ARN ribosomaux et des ARN de transfert chez les procaryotes et les eucaryotes; maturation des ARN pré-messagers chez les eucaryotes (coiffage, épissage, polyadénylation) (3 h)
l'exportation et la stabilité des ARN (2 h)
la traduction chez les eucaryotes et les procaryotes : code génétique, initiation, élongation, terminaison (4 h)
- TP :
préparation et analyse des différentes classes d'ARN
préparation de plasmides et réalisation de cartes de restriction
8) Bibliographie :
Cet enseignement ne s'appuiera pas sur un livre particulier. Les documents proposés aux étudiants seront extraits principalement de :
- Molecular Biology of the Cell par B. Alberts et al, 4ème édition, Garland Science
- Gène VII par B. Lewin, Oxford University Press
- Molecular Biology par R.F Weaver, 2ème édition, Mc GrawHill Higher Education
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 5 : Information Génétique de la Cellule et Génétique Evolutive
Numéro de lUE : BIO 507
Intitulé de l' U E : Information Génétique de la Cellule et Génétique Evolutive
Responsable(s) : Sylvie Bonnassie
Equipe(s) pédagogique(s) : Microbiologie, Biologie cellulaire, Biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence Sciences de la Vie et de la Terre : Obligatoire
2) Parcours : Licence 3ème année
3) Semestre n° : S5 ou S6
4) Objectifs : Donner les bases théoriques et pratiques indispensables à la compréhension des techniques et de génétique nécessaire à la préparation aux concours CAPES et Agrégation
5) Prérequis : Modules obligatoires de la filière SVT
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28201260Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS TD
Le support de linformation génétique 4H
- lADN support de linformation génétique
- lADN dans la cellule
- le gène, unité dinformation génétique
- organisation générale des génomes eucaryotes et procaryotes
- la réplication de lADN
Dynamique et variabilité de linformation génétique 8H 6H
- les mutations (spontanées, agents mutagènes, éléments génétiques mobiles)
réparation des mutations
- Réarrangement des gènes
- Les transferts génétiques chez les bactéries
Lexpression des gènes et son contrôle chez les eucaryotes et les procaryotes 8H 6H
- transcription et maturation des ARNm
- traduction et maturation des protéines
- régulation de lexpression des gènes
Bases de la génétique des populations 8H 6H
- Introduction: place et objectifs de la Génétique des pop - Polymorphismes - Structure génétique d'une population: loi de Hardy-Weinberg, gènes liés au sexe - Ecarts à la panmixie: consanguinité , homogamie
- Mécanismes modifiant les séquences allèliques
- mutation, dérive génétique
- migration (flux de gènes)
- sélection sur caractères qualitatifs et quantitatifs
8) Bibliographie :
TitreAuteurs EditeursMicrobiologie
Introduction à l'analyse génétique LM Prescott, JP Harley, DA Klein
Griffiths et al.De Boeck-Wesmael
De Boeck-Wesmael
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 5 : Evolution moléculaire et plasticité des génomes
Numéro de lUE : BIO 510
Intitulé de l' U E : Evolution moléculaire et plasticité des génomes
Responsable(s) : Malika Ainouche
Equipe(s) pédagogique(s): Biologie Végétale, Biologie Cellulaire, IFSIC
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et Informatique
Et autres mentions
2) Parcours : Deuxième ou Troisième année
3) Semestre n° : 4 ou 5
4) Objectifs : Appréhender les processus évolutifs affectant les génomes.
5) Prérequis :
Génétique moléculaire (structure, réplication et fonctionnement du matériel génétique).
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30h10h20h60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Cours :
Evolution structurale des génomes nucléaires et cytoplasmiques chez les Eucaryotes (synténie versus restructuration, évolution de la taille des génomes),
Eléments transposables et plasticité des génomes,
Duplication des gènes et des génomes
Evolution moléculaire et phylogénie.
Travaux pratiques et dirigés :
Analyses de séquences, taux de diversité nucléotidique (substitutions synonymes et non-synonymes), divergence moléculaire, reconstruction phylogénétique.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Méthodologies de Génétique Moléculaire
Numéro de lUE : BIO 511
Intitulé de l' U E : Méthodologies de Génétique Moléculaire
Responsable(s) : Florence AUBRY et Pascale LE GOFF
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire,
Licence de Biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Optionnel pour les 2 licences
2) Parcours : L3
3) Semestre n° : S5
4) Objectifs : Cette Unité dEnseignement va permettre à létudiant de maîtriser les techniques fondamentales du génie génétique.
5) Prérequis : UE Introduction à la Génétique Moléculaire ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel204060Travail personnel303060
Crédit total de lUE : 7 .
7) Programme des enseignements :
TRAVAUX DIRIGES (20 h)
Vecteurs de clonage et systèmes dexpression
Constructions virtuelles de plasmides recombinants
Alignement et comparaison de séquences
Analyse et interprétation des résultats de TP
TRAVAUX PRATIQUES (40 h)
Construction dun vecteur dexpression, production et purification de la protéine recombinante correspondante :
Clonage dun ADNc dintérêt (préparation de plasmide, ligation, transformation)
Analyse du plasmide recombinant par digestion enzymatique et par PCR (à partir de Taq polymérase purifiée en TP)
Production de la protéine recombinante et purification par chromatographie daffinité
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 5 : Génomique et Post-génomique : production et analyse des données
Numéro de lUE : BIO 512
Intitulé de l' U E : Génomique et Post-génomique : production et analyse des données
Responsable(s) : Thierry Guillaudeux, Michel Philippe
Equipe(s) pédagogique(s) :Biologie Cellulaire et IFSIC
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et informatique et autres mentions
2) Parcours : 3ème année
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Donner les connaissances de base sur ce qui se fait dans le domaine de la génomique et post-génomique, en insistant sur une formation pratique forte pour ces étudiants dont certains seront destinés au marché du travail.
5) Prérequis : De Biologie et dInformatique enseignés les années précédentes
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20103060Travail personnel30102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
1- Séquençage des génomes : (6h)
Cartographie génétique et physique
Séquençage des génomes entiers, des ESTs, technique SAGE
2-Génotypage : (2h)
3-Puces à ADN, PCR Quantitative en temps réel (5h)
4-Protéome et puces à protéines (5h)
5-Micro et nanotechnologies (2h)
TD :
Exercices dinitiation sur les logiciels de référence en bio-informatique et analyse des séquences.
TP :
Un accent fort sera mis sur les TP dans cette UE en insistant sur la qualité de la préparation des échantillons biologiques. Les modèles levures, lignées cellulaires animales, tissus animaux et végétaux seront utilisés dans ces séances. Une analyse des données bioinformatiques et la validation biostatistiques des expériences seront réalisées au cours de ces TP.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40 ?
S 5 : Génétique eucaryote
Numéro de lUE : BIO 513
Intitulé de l' U E : Génétique eucaryote
Responsable(s) : Isabelle Pellerin
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences biologie (toutes mentions) et Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : 1ère année et 2ième des licences de Biologie pour toutes les mentions et de la licence de biochimie et biologie moléculaire
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Donner aux étudiants des bases théoriques solides de génétique classique et moléculaire et laptitude à raisonner sur des problèmes de génétique. A cette fin, de nombreux exercices seront proposés aux étudiants au cours des séances de TD pour leur apprendre à appliquer les principes de la génétique aux données expérimentales. Les étudiants apprendront au cours des séances de TP à réaliser et à interpréter des expériences de génétique sur le modèle de la levure.
5) Prérequis : UE introduction à la génétique moléculaire ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24162060 Travail personnel3025560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
La structure et la nature des génomes
La transmission des gènes (rappels de génétique mendélienne, la liaison génétique, cartes génétiques
)
L'interaction des gènes (notions d'épistasie et de suppression, notions de pénétrance et d'expressivité)
Les mutations géniques et chromosomiques (fondements moléculaires des mutations, conséquences des mutations)
La Dynamique et la variabilité des génomes (éléments génétiques mobiles, réarrangement des gènes)
Modèles génétiques (levure, drosophile, Caenorhabditis elegans
)
Introduction à la génétique humaine
8) Bibliographie :
Analyse génétique moderne par Griffiths, Gelbart, Miller et Lewontin, édition DeBoeck Université
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et pratiques
12) Capacité d'accueil : sans limite
S 6 : Contrôle de lExpression Génétique chez les Eucaryotes
Numéro de lUE : BIO 608
Intitulé de l' U E : CONTROLE DE LEXPRESSION GENETIQUE CHEZ LES EUCARYOTES
Responsable(s) : Florence DEMAY et Yves LE DREAN
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Obligatoire pour la Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
Optionnel pour Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie
2) Parcours : L3
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement est le complément de lUnité denseignement « Introduction à la génétique moléculaire » vue en S3. Son objectif est de permettre à létudiant dappréhender les 4 niveaux de régulations de lexpression génétique : transcriptionnel, post-transcriptionnel, traductionnel et post-traductionnel.
5) Prérequis : UE Introduction à la Génétique Moléculaire ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26181660Travail personnel25201560
Crédit total de lUE : 7 .
7) Programme des enseignements :
COURS (26h)
Régulation de linitiation de la transcription (6 h)
- séquences régulatrices
- facteurs de transcription : les domaines de liaison à lADN, les domaines dactivations, modes dactions illustrés avec quelques exemples.
Régulation de la maturation des ARN pré-messagers : lépissage alternatif et la polyadénylation alternative (6 h)
- séquences régulatrices introniques et exoniques
- facteurs dépissage : les domaines de liaison à lARN, modes daction illustrés avec quelques exemples.
Contrôle de lexportation des ARNm et de la régulation de la stabilité des ARNm (2 h)
Contrôle de la traduction (6 h)
- traductibilité des ARNm
- régulation de l'initiation de la traduction
Modifications post-traductionnelles (6 h)
Conséquences sur ladressage, lactivité et la demie-vie des protéines.
TRAVAUX DIRIGES (18 h)
- Exercices dapplication directe du cours.
TRAVAUX PRATIQUES (16 h)
- Etude de l'activité transcriptionnelle dans la levure (cas des récepteurs nucléaires et des facteurs de chocs thermiques )(8 h)
- Etude des interactions ADN protéines (technique de gel retard) (8 h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (licence de biochimie et de biologie moléculaire)
optionnel ( (Licence de biologie cellulaire, moléculaire et physiologie)
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 7 : Structure, maintien et expression des génomes
Numéro de lUE : BIO 724
Intitulé de l' U E : Structure, maintien et expression des génomes
Responsable(s) : Yves Le Dréan
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Optionnel pour le Master de Biochimie et Biologie Moléculaire
Optionnel pour le Master 1 de recherche de Biologie et Environnement mention Biologie Cellulaire et Physiologie.
2) Parcours : Master 1
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Lobjectif de cette Unité dEnseignement est de permettre à létudiant dappréhender les processus opposés permettant la conservation ou la variabilité des génomes. Une étude globale des niveaux d'expression responsables de la lecture différentielle du génome, dans la différenciation et la réponse au variations de l'environnement, sera également abordée. Cette dernière partie est le complément de lUnité denseignement « Contrôle de lexpression génétique chez les eucaryotes » vue en S6.
5) Prérequis :
Module "Contrôle de l'expression génétique chez les eucaryotes" ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel36141060 Travail personnel30102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Mécanismes et machineries de la réplication de l'ADN. Régulation
Mécanismes et machineries de la recombinaison de l'ADN - Recombinaisons ponctuelles,
homologues, fonctions connues.
Mécanismes et machineries de la réparation de l'ADN - Systèmes conservateurs et fautifs,
incidences évolutives et pathologiques.
Structure-fonction des différentes classes d'ADN - Centromères, télomères, MARs, isochores, ADN
non-B, gènes.
Modifications épigénétiques des génomes- leurs différents rôles connus
Intégration des niveaux de régulation de l'expression génétique - Organisation intégrée des
mécanismes vus les années précédentes, détail de mécanismes particuliers, réponse aux stimuli
extérieurs.
TD
Illustrations concrètes des cours par des exercices. Préparation à l'examen.
TP
Analyse in silico de promoteur, recherche d'éléments "cis"
Enroulement de l'ADN analyse de lactivité des Topoisomérases
Travail personnel: Rédaction d'un rapport sur des analyses d'articles.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X (Master de Biochimie et Biologie Moléculaire et Master de Biologie Cellulaire et Physiologie).
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 7 : Dynamique et Evolution des Gènes et des Génomes
Numéro de lUE : BIO 711
Intitulé de l' U E : DYNAMIQUE ET EVOLUTION DES GENES ET DES GENOMES
Responsable(s) : Abdelhak El Amrani
Equipe(s) pédagogique(s) :Biologie végétale et Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1recherche de Biologie et Environnement mention bio-informatique, mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Dans une formation de Master Bio-Informatique, où il est question danalyse des données obtenues par séquençage massif des génomes, il est nécessaire daborder un certain nombre de notions sur la dynamique et lévolution des gènes et des génomes Dans ce module seront abordés les mécanismes évolutifs et la plasticité des gènes et des génomes et la notion de comparaison à léchelle de génomes entiers
5) Prérequis :
- Notions de base de la nature du matériel génétique
- Notions de base de la structure et expression de gènes (promoteur, cadre de lecture ouvert, transcription ...)
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T.D.T.P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel20202060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Chapitre I : Rappels concernant lorganisation des génomes
- Structure répétitive du génome Eucaryote
- Localisation des gènes, génomique comparative et synténie,
origine des introns
- Composition en GC, organisation du génome des Angiospermes et des Vertébrés, origine des isochores
- Mécanismes augmentant ou réduisant la taille du génome
- Génome lié au sexe
- Origines du génome des mitochondries et des chloroplastes
- Diversité des génomes eucaryotes
Chapitre II Mécanismes évolutifs de la régulation de lexpression des gènes
- Gènes homéotiques
- Innovation évolutive par combinatoire de domaines conservés. Exemple des facteurs de transcription
RNomique: ARNs non codants, petits ARNs de régulation
Mécanismes de co-évolution au niveau génique
- Pseudogènes
Chapitre III : Eléments transposables - Rôle dans lévolution des gènes et de la taille des génomes:
- Notions générales sur les éléments transposables (ETs)
- Les ETs et les virus
- Transposition et ses conséquences
- Notion déléments de contrôle
- Conséquences de la transposition sur la taille et la structure des gènes et des génomes
- Variation de la taille des génomes et « paradoxe de la valeur C ».
- Transferts horizontaux et évolution des génomes
Chapitre IV : Duplication des gènes et des génomes
- Duplication des gènes, familles multigéniques et acquisition de nouvelles fonctions, évolution concertée, orthologie et paralogie des gènes.
- Redondance fonctionnelle et pseudogénisation.
- Dynamique des génomes polyploïdes
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours/TD par groupe de 40 étudiants maxi, enseignement diffusé par le web
12) Capacité d'accueil : 40 étudiants maximum
________________________________________________________________________
S 8 : Applications de la Génétique Moléculaire
Numéro de lUE : BIO 802
Intitulé de l' U E : Applications de la Génétique Moléculaire
Responsable(s) :Denis Michel
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et biologie moléculaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master de recherche de biochimie et biologie moléculaire
Master professionnel Biologie, Environnement et Santé mention Biologie et gestion
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs :
Module destiné aux étudiants tournés vers la recherche ou le développement bioindustriel. Vision du potentiel de la génétique moléculaire sous ses aspects expérimentaux et inventifs.
5) Prérequis : Titulaire d'une licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20122860Travail personnel30201060 ou 16
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours.
Technologies de génétique moléculaire (8H)
Différentes techniques et applications de : mutagenèse, transfert génétique, détections moléculaires, recherches de ligands, stratégies d'inhibition de programmes cellulaires, productions de polypeptides naturels ou artificiels.
Evolution des stratégies exploratoires (8H)
De la protéine au gène
Identification directe de gènes (à partir de critères fonctionnels, par complémentation, par perturbations aléatoires)
Approches "post-génomiques"
Du gène à la fonction (Dérégulations expérimentales)
TD.
Illustrations concrètes des cours. Etude de quelques retombées de la génétique moléculaire valorisée en terme d'outils biotechnologiques et médicaux. Préparation à l'examen.
TP.
Synthèse et utilisation d'un vecteur de transfert protéique eucaryote; vérification de sa fonctionnalité (ce travail inclut du clonage et de la mutagenèse simple)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : Selon les disponibilités en salles et équipements de TP.
S 8 : Biotechnologie et génie génétique
Numéro de lUE : BIO 803
Intitulé de l' U E : Biotechnologie et génie génétique
Responsable(s) : Isabelle pellerin
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie cellulaire, microbiologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours : Master Sciences de la Vie et de la Terre 1ère année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Donner les bases théoriques et pratiques des techniques de génie génétique et de biotechnologies indispensables à la préparation aux concours CAPES et agrégation.
Au cours dun TP, les étudiants appliqueront une technique de génie génétique en réalisant lexpression de protéines recombinantes.
5) Prérequis : Modules obligatoires de la filière Sciences de la Vie et de la Terre ou équivalents
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2262048Travail personnel3014448
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
1-Bases scientifiques des biotechnologies (6H)
- Le génie génétique
- La génomique
- Les cultures in vitro (Cultures de cellules animales et végétales)
2-Biotechnologie des plantes et des animaux (8H)
- Méthodes de clonage; conservation de la structure génétique
- Induction dune variabilité génétique
- Mutagenèse artificielle
- Les biotechnologies de lembryon
- Les transformations génétiques (exemple-modèle, éléments sur les applications agronomiques, industrielles, médicales)
3- Les produits biologiques, matières premières de lindustrie (2H)
4-Utilisation des micro-organismes dans lindustrie (6H)
- Utilisation des micro- organismes dans la production de biomasse
- Application des métabolismes microbiens (micro-organismes dans les transformations industrielles)
- Les substances dintérêt issues des micro-organismes (utilisation des enzymes microbiennes, production de métabolites naturels, production de molécules recombinantes)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
( Physiologie Végétale
S 3 : Bases Physiologiques de la Production Végétale
Numéro de lUE : BIO 307
Intitulé de l' U E : Bases Physiologiques de la Production Végétale
Responsable(s) : L. Leport
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention BCMP et mention Biologie des Organismes, licence sciences de la vie et de la terre, licence pluridisciplinaire
2) Parcours : L2 spécialité « Sciences végétales »
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Acquisition des bases fonctionnelles de la production de biomasse végétale.
5) Prérequis :
Bases de biologie et de biochimie enseignées en L1 ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20102010-60 Travail personnel20102010-60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
NM2 :- Relations hydriques de la plante entière.
- Absorption minérale à partir de la solution du sol.
- Photosynthèse et échanges gazeux au niveau foliaire.
- Métabolismes carbonés photosynthétiques.
CD2 : - Implication des phytohormones dans les processus de développement.
Embryogenèse et morphogenèse.
Mouvements et tropismes.
8) Bibliographie :
Ouvrages classiques de Physiologie :Mazliak, Morh
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Conduite de lenseignement et moyens : Une attention particulière sera portée à la découverte des filières majeures de la production végétale et des organismes para-agricoles en amont et en aval de ces productions. Ceci donnera lieu à des travaux denquêtes et à des exposés.
12) Capacité d'accueil :
S 3 : Phytoressources
Numéro de lUE : BIO 308
Intitulé de l' U E : PHYTORESSOURCES
Responsable(s) : A. Bouchereau
Equipe(s) pédagogique(s) :Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
Licence de Biologie, mention Biologie des Organismes.
2) Parcours : L2 spécialité Sciences végétales et spécialité Biologie appliquée
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Identification des ressources végétales de la biosphère et des agrosystèmes et de leurs intérêts environnementaux, alimentaires et bioindustriels.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20102010-60 Travail personnel20102010-60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique :
Inventaire et typologie des productions végétales et des agrosystèmes
Productions végétales dintérêt agronomiques (exemples)
Matières premières dorigine végétale : propriétés et intérêts pour lhomme
Valorisation bioindustrielle de quelques productions végétales (exemple)
Notion de qualité des produits végétaux
Bases de la physiologie des organes végétaux après récolte
8) Bibliographie :
Documentation abondante récente au SCD de létablissement
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
ou selon spécialité
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Conduite de lenseignement et moyens : Dans le cadre des travaux personnels, les étudiants seront amenés à préparer de courtes monographies relatives aux productions ciblées pour létude
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Biologie cellulaire et moléculaire végétales
Numéro de lUE : BIO 514
Intitulé de l' U E : Biologie cellulaire et moléculaire végétales
Responsable(s) :F. Cabello-Hurtado
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : L3 en spécialité Sciences végétales et spécialité Biologie appliquée
de la mention BCMP
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Objectif général : Appréhender la complexité structurale et fonctionnnelle de la cellule végétale eucaryote via létude de ses génomes, des compartiments cellulaires, leur structure membranaire, leur fonction et leur coopération fonctionnelle.
5) Prérequis :
Bases de la biologie, de la biochimie et de la physiologie végétale enseignées en L1 et en L2 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20102010-60Travail personnel205105-60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique
Compartement nucléaire
Organisation et expression des génomes végétaux
Compartiments et systèmes membranaires (transporteurs)
Membranes végétales transductrices dénergie
8) Bibliographie :
Ouvrages classiques de Physiologie végétale (SCD)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Conduite de lenseignement et moyens : Chacun des compartiments spécifiques de la cellule végétale donnera lieu à un travail documentaire et à des exposés individuels (chloroplaste, peroxysome, glyoxysome, vacuole, paroi..)
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Physiologie et Intérêt Biotechnologique des Eucaryotes végétaux Inférieurs
Numéro de lUE : BIO 609
Intitulé de l' U E : Physiologie et Intérêt Biotechnologique des Eucaryotes végétaux Inférieurs
Responsable(s) : C. Deleu
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
2) Parcours : L3 spécialité Sciences végétales et spécialité biologie appliquée de la mention BCMP
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Acquérir les connaissances de bases relatives à la biologie et à la physiologie des eucaryotes végétaux inférieurs et identifier leur intérêt technologique ou biotechnologique.
5) Prérequis : Bases de physiologie végétale acquises au niveau L2 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2010201060Travail personnel2010201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique
Bases de la biologie, de la physiologie et de la biochimie des algues :
- Eléments de taxonomie
Algues marines
Micro-algues et cyanobactéries
On insistera sur les originalités des systèmes photosynthétiques et les processus de lautotrophie pour le carbone et sur les capacités biosynthétiques originales de ces organismes
Bases de la biologie, de la physiologie et de la biochimie des systèmes fongiques :
Eléments de taxonomie fongique
Particularités de la biologie et de la reproduction des champignons
Relations champignons-environnement (réponses à la déshydratation, à lanoxie, à la lumière, aux conditions extrèmes)
Utilisations technologiques et biotechnologiques de ces organismes
Algues
Eléments de domestication, de culture et de valorisation des algues marines
Exploitation des gènes dintérêt des cyanobactéries
Production de biométabolites, de toxines et de composés bioactifs
Algues extrêmophiles et applications bioindustrielles
Champignons
Culture des comestibles
Relations mycorhiziennes
Valorisation de leurs aptitudes à la dégradation et au parasitisme
Processus fermentaires
Technologies enzymatiques
Problèmes de santé publique
8) Bibliographie :
Documentation récente au SCD
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Conduite de lenseignement et moyens : des travaux personnels seront dédiés à des visites dentreprises bio-industrielles valorisant lun ou lautre des organismes étudiés pour lélaboration de produits dintérêt pour lhomme ( ces visites donneront lieu à des CR validés par les entreprises daccueil)
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Physiologie végétale : nutrition, croissance, interactions plante-milieu
Numéro de lUE : BIO 712
Intitulé de l' U E : Physiologie végétale : nutrition, croissance, interactions plante-milieu
Responsable(s) : Ivan Couée
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Sciences et Vie de la Terre 1ère année
2) Parcours : Master Sciences et Vie de la Terre 1ère année
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Donner les connaissances scientifiques solides de physiologie végétale qui seront mises en pratique dans la préparation aux concours CAPES et agrégation (année Master Sciences et Vie de la Terre 2)
Favoriser la réflexion intégrative des différents niveaux d'approche (plante entière, métabolisme, biochimie, fonctionnement du génome) et la comparaison des différentes disciplines (physiologie végétale, physiologie animale, biologie cellulaire et moléculaire, biologie évolutive)
Développer les capacités de rigueur scientifique (expérimentation), de clarté et de synthèse rédactionnelles (sujets écrits de réflexion et de synthèse), et de prise de parole (exposés)
5) Prérequis : Modules obligatoires de la Licence Sciences et Vie de la Terre ou équivalents
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2882460Travail personnel20103060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
- Nutrition : nutrition carbonée et azotée, chaîne photosynthétique et photophosphorylation acyclique, cycle de Calvin, synthèse de l'amidon, parenchyme palissadique foliaire, échanges gazeux (fonctionnement des stomates), nature, synthèse et utilisation des réserves
- Croissance et développement : la plante-modèle Arabidopsis thaliana , développement végétatif post-embryonnaire, appareil racinaire des plantes, rhizogenèse, croissance en longueur (méristèmes primaires) et en épaisseur (cambiums), étude d'une cellule méristématique caulinaire, les plasmodesmes, ramification, port des végétaux, métabolisme, action et rôles des phytohormones, la paroi cellulaire
- Interactions plante-milieu : contrôle du développement par les facteurs de l'environnement, réponses aux stress environnementaux, problèmes de l'eau en milieu terrestre, absorption de l'eau, phototropisme et gravitropisme, perception et transduction des signaux
8) Bibliographie : exemples
- Alberts et al. Biologie Moléculaire de la Cellule, Flammarion
- Buchanan B, Gruissem W, Jones R (2000) Biochemistry and molecular biology of plants. ASPP
- R. Heller et al. Physiologie Végétale, (1) Nutrition, (2) Développement
- Hans Mohr, Peter Schopfer (1995) Plant Physiology. Springer
- Tagu D, Principes des techniques de biologie moléculaire, INRA
- Peter Westhoff et al. (1998) Molecular plant development: from gene to plant. Oxford University Press
- Lewis Wolpert et al. (2000) Biologie du développement, les grands principes. Dunod
- Journal PLANT PHYSIOLOGY http://www.plantphysiol.org/ ACCES online sauf année en cours
- Journal PLANT CELL http://www.plantcell.org/ ACCES online sauf année en cours
- Base de données bibliographiques Medline http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/index.html
- Base de données bibliographiques Agricola http://www.nal.usda.gov/ag98/ag98.html
- Série TRENDS http://www.trends.com/ ACCES online BU Sciences
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours magistraux, travaux dirigés d'application (étude de documents scientifiques, analyse de données, recherches bibliographiques), travaux pratiques d'approche scientifique expérimentale et d'illustration expérimentale pédagogique, travail personnel individuel (projet écrit basé sur les travaux pratiques) et en petit groupe (préparation d'exposé court)
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 7 : Technologie et Biotechnologie Végétales
Numéro de lUE : BIO 713
Intitulé de l' U E : Technologie et Biotechnologie Végétales
Responsable(s) : Marie Françoise Niogret
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 recherche en Biologie et Environnement
Mention : Sciences végétales fondamentales
Master professionnel en Sciences agronomiques et agroalimentaires
Mention : Sciences et productions végétales
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
2) Parcours : M1 recherche ou M1 professionnel (domaine végétal)
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Examiner les principales vitrométhodes utilisables en recherche et développement pour la multiplication, la transformation et lamélioration génétique, la création variétale ainsi que la conservation des ressources génétiques dintérêt agronomique.
5) Prérequis :
Bases de biochimie et de biologie moléculaire. Notions de base en physiologie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h10h20h10h60 h Travail personnel20h10h20h10h60 h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique :
Totipotence chez le végétal : signification et limites
Mise en culture : vitroculture et vitrométhodes
Cultures cellulaires végétales, production de biométabolites
Micropropagation et multiplication conforme
Bases de la transformation génétique et de lagrotransformation
Biotechnologies végétales : leurs applications en amélioration génétique et en phytoprotection
Planticorps et autres applications pharmacologiques
Applications en phytorémédiation
8) Bibliographie : Documentation abondante récente au SCD
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les travaux personnels viseront à effectuer des travaux denquêtes et de documentation auprès dorganismes utilisateurs des méthodologies concernées et auprès des centres documentaires disponibles (CR et exposés individuels).
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Intégration du métabolisme et du Développement des Plantes
Numéro de lUE : BIO 804
Intitulé de l' U E : Intégration du métabolisme et du Développement des Plantes
Responsable(s) : A. Bouchereau
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) recherche en Biologie et Environnement
Mention : Sciences végétales fondamentales
Master professionnel en Sciences agronomiques et agroalimentaires
Mention : Sciences et productions végétales
2) Parcours : M1 recherche ou M1 professionnel (domaine végétal)
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Approche détaillée des mécanismes de la construction des biomolécules, de leur gestion, de leur répartition et de leur utilisation contrôlée aux différentes phases du développement.
5) Prérequis : UE de Physiologie végétale en L2 et L3 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h10h20h10h60 h Travail personnel20h10h20h10h60 h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique :
NM3 : - Absorption, réduction et métabolisation des éléments N,S et P
Bioénergétique de lorganisme photoautotrophe et de lorganisme hétérotrophe
Translocation, répartition et valorisation des photoassimilats
Adaptations physiologiques aux contraintes environnementales
CD3 : - Biochimie, modes et mécanismes daction des phytohormones
Photopériodisme et chronobiologie
Bases des biotechnologies végétales
8) Bibliographie : Documentation abondante récente au SCD
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les travaux seront orientés vers la découverte des structures de recherche fondamentale et des structures de recherche et développement dans le domaine des sciences végétales et de leurs applications agroalimentaires et industrielles.
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Physiologie Cellulaire et Moléculaire Végétales
Numéro de lUE : BIO 825
Intitulé de l' U E : PHYSIOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE VEGETALES
Responsable(s) : Marie Françoise Niogret
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 recherche en Sciences de la Vie et de lEnvironnement
Mention : Sciences végétales fondamentales
Master professionnel en Sciences agronomiques et agroalimentaires
Mention : Sciences et productions végétales
2) Parcours : M1 recherche
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Identifier les spécificités structurales et fonctionnelles de la cellule végétale et les mécanismes de perception et de transduction par la plante de signaux internes ou externes affectant le métabolisme et le développement.
5) Prérequis :
Bases de biochimie et de biologie moléculaire. Notions de base en physiologie.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h10h20h10h60 h Travail personnel20h10h20h10h60 h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
A- Interactions des 3 génomes végétaux
B- Compartimentation des structures et des fonctions dans la cellule végétale
C- Perception et transduction de signaux par la cellule végétale
Signaux lumineux (phytochromes, cryptochromes, phytotropines)
Signaux hormonaux
D- Réponses moléculaires aux contraintes environmentales
8) Bibliographie : Documentation récente au SCD
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les étudiants répartis par binômes réaliseront un court mémoire bibliographique ciblé sur lorganisation temporelle des évènements biochimiques se produisant dans la plante depuis la perception du message jusquà lexpression dune réponse adaptative mesurable (ces mémoires seront validés et feront lobjet de soutenance)
12) Capacité d'accueil :
( Physiologie Animale
S 1 :Système nerveux et comportement
Numéro de lUE : BIO 103
Intitulé de l' U E : Système nerveux et comportement
Responsable(s) : Marie-Annick Richard et Colette Vaillant-Capitaine
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie et Physiologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : 1ère année de la licence de Biologie (pour toutes les mentions) et de la licence de Biochimie et de Biologie moléculaire
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : S1
4) Objectifs : Cette unité d'enseignement doit donner à l'étudiant des bases sur le comportement de l'individu et sur son système nerveux. Cela doit permettre de comprendre comment l'individu prend l'information dans le milieu, de quelles structures il dispose pour traiter cette information et comment il va agir et exploiter son milieu
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel15252060 Travail personnel15252060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours/TD
Buts et méthodes de léthologie (4h)
Prise dinformations sur le milieu (6h)
Apprentissage et conditionnement (6h)
Le système nerveux central, structure et fonctions (6h)
Information sensorielle (6h)
Motricité réflexe et volontaire (4h)
Régulation de la vie végétative (4h)
Exploitation du milieu (4h)
TP
Anatomie du système nerveux (4h)
- Intégration sensorielle et réponse motrice (4h)
Temps de réaction (4h)
Perception - sélection ditems chez les oiseaux (4h)
Apprentissage (4h)
8) Bibliographie :
Ethologie (J.C. Guyomarc'h - Edition Masson - 1995)
Neurosciences : A la découverte du cerveau (M.F. Bear, B.W. Connors, M.A. Paradiso - Edition Pradel)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a pour objectif de donner une vue d'ensemble des différents aspects de la biologie, d'aider les étudiants à définir leur orientation. Elle a aussi été conçue de manière à favoriser l'insertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre l'échec.
L'enseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 3 : Communication hormonale
Numéro de lUE : BIO 309
Intitulé de l' U E : Communication hormonale
Responsable(s) : Colette Vaillant-Capitaine / Elisabeth Pellegrini
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire, Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours :2ème année de la licence
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Donner aux étudiants des connaissances fondamentales sur le système endocrinien et les mécanismes daction des hormones sur leurs tissus cibles.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel32h6h10h48 Travail personnel48
Crédit total de lUE : ?
7) Programme des enseignements :
Cours (32h)
Introduction
Différents types de communications cellulaires (communication nerveuse, communication hormonale et communication dans les mécanismes immunitaires)
Systèmes endocriniens et hormones
caractéristiques générales
Transductions des signaux hormonaux
Les récepteurs :
Récepteurs membranaires couplés aux protéines G (AC, AMPc, PKA, PLC, IP3, DAG, PKC, Ca2+, Phosphorylation..)
Récepteurs membranaires couplés aux tyrosine kinase
Récepteurs nucléaires
Les cibles :
Expression génomique (denzymes, de transporteurs
.)
Echanges transmembranaires (membrane plasmique, membrane des organites cellulaires
..)
Quelques exemples de mécanismes de transduction de signaux hormonaux
Adrénaline et vasomotricité (récepteurs RCPG b2 et a1 au niveau de la paroi vasculaire)
Vasopressine et volémie (récepteur RCPG et aquaporine au niveau rénal)
Insuline et son implication dans la régulation de la glycémie (récepteur couplé à une tyrosine kinase et transporteurs du glucose).
Hormones thyroïdiennes (récepteurs nucléaires)
TP (10h)
Régulation nerveuses et hormonales du diamètre de laorte
Histologie des glandes
TD (6h)
Histologie des glandes (4h)
Régulation nerveuses et hormonales du diamètre de laorte (2h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire X
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 4 : Communication nerveuse et excitabilité
Numéro de lUE : BIO 405
Intitulé de l' U E : Communication nerveuse et excitabilité
Responsable(s) : F. TIAHO
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, Licence Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours :
3) Semestre n° : 4 Licence biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie ou 8 licence Sciences de la Vie et de la Terre
4) Objectifs :
Cet enseignement concerne la physiologie de la cellule excitable. Un accent sera mis sur la transduction et le codage de linformation sensorielle abordée dès le semestre S1.
5) Prérequis :
Système nerveux et comportement du semestre 1 ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Programme des cours :
A. Bio-électricité communes à toutes les cellules excitables
Mécanismes ioniques de genèse du potentiel de repos membranaire et du potentiel daction.
B. Propriétés structurale et fonctionnelle des neurones
-Structure : neurites, cytosquelette, classification, synapses.
-Influx nerveux : caractéristique, origine, propagation, électroneurogramme, électrophysiologie et pharmacologie des canaux ioniques du potentiel daction (canaux sodique et potassique).
-La transmission synaptique :potentiels synaptiques, intégration spatio-temporelle, propriétés fonctionnelles de certains récepteurs de neuromédiateurs.
C. Les cellules musculaires
Les grandes caractéristiques générales (excitabilité et contractilité : myofilaments, etc...)
Classification : en fonction de leurs caractéristiques morphologiques et fonctionnelles
- Les fibres striées squelettiques : jonction neuro-musculaire, couplage excitation-contraction)
- Les fibres striées cardiaques :automatisme et régulation nerveuse
- Les fibres lisses : automatisme et régulation nerveuse
D Les cellules sécrétrices :Couplage excitation-sécrétion
E Cellules sensorielles et transduction des signaux : spécificités de la transduction, potentiel récepteur , codage et transmission des signaux
Programme des TD :
- Préparation aux études expérimentales abordées dans le cadre des travaux pratiques
Programme des TP :
Activité nerveuse et transmission synaptique.
Jonction neuro-musculaire.
Rôle des ions et régulation de lactivité Cur perfusé par les neurotransmetteurs.
Histologie des organes sensoriels
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire X
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S5-S6 : Fonction de nutrition et de reproduction chez lhomme
Numéro de lUE : BIO
Intitulé de l' U E : Fonctions de nutrition et de reproduction chez lhomme
Responsable(s) :Cécile Lecomte
Equipe(s) pédagogique(s) :Physiologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :Licence pluridisciplinaire mention biologie
2) Parcours :3ème année de licence
3) Semestre n° : 5 ou 6
4) Objectifs :Cet enseignement de physiologie humaine apporte une vision synthétique des grandes fonctions de reproduction et de nutrition à destination des étudiants préparant les concours du professorat des écoles.
5) Prérequis :
UE Nutrition et Reproduction S2
ou un enseignement équivalent présentant les modalités de prise alimentaire et les étapes de la digestion (sans la régulation)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel32h10h18h60Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Chap 1 Fonctions de nutrition 30h
1-Nutrition à léchelle de lorganisme 6h
2- Nutrition à léchelle cellulaire 5h
3- Excrétion 5h
TD Respiration 2h
Alimentation 2h
TP ESAO respiration humaine
Histologie tube digestif et poumon
Chap 2 Fonction de reproduction 30h
Fonctions ovariennes et régulations 4h
Fonctions testiculaires et régulations 4h
Fécondation 2h
Gestation, parturition, lactation 4h
TD Contraception 2h
Procréation médicalement assistée 2h
Puberté,ménopause 2h
TP Histo ovogenèse, spermatogenèse
Fécondation
8) Bibliographie :
Anatomie et physiologie humaines , Marieb, De Boeck Université
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Biologie et Physiologie de Reproduction
Numéro de lUE : BIO 610
Intitulé de l' U E : Biologie et Physiologie de Reproduction
Responsable(s) : Norredine BOUJRAD (co-responsable C. VAILLANT)
Equipe(s) pédagogique(s) : Equipe pédagogique de Physiologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie, Licence Sciences de la Vie et de la Terre.
Licence de Biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : 1ère année du master, 2ème et 3ème année de la licence
3) Semestre n° : 6 LSVT , 4 ou 6 pour la Licence
4) Objectifs :
Cet enseignement concerne la biologie et la physiologie de laxe hypothalamo-hypophyso-gonadique. Un accent sera mis sur la production des gamètes, des stéroïdes et dautres hormones ainsi que leur rôle dans la préparation de la femelle, après la fécondation, à porter lembryon, pendant la grossesse (Vivipares) et à le nourrir après la naissance.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel32101860 Travaux personnels60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Programme du cours :
Déterminisme du sexe (2h)
Chromosome Y
Gène SRY
Développement et Différenciation sexuelle de lappareil génital (2h)
Gonades et tractus génitaux
Laxe hypothalamo-hypophyso-gonadique (4h)
Complexe hypothalamo-hypophysire et pulsatilité
Stéroïdogenèse et rétrocontrôle gonadique
Structure et fonctions du testicule (4h)
Anatomie
Spermatogenèse
Cellules de Sertoli, cellules de Leydig
Régulation de la fonction testiculaire
Lépididyme et les glandes annexes (2h)
Fonctions ovariennes (5h)
Folliculogenèse et ovulation
Croissance et maturation de lovocyte in vivo et in vitro
Corps jaune cyclique et lutéolyse
Cycles menstruels et oestriens
Voies génitales
Fécondation (2h)
Capacitation, reconnaissance-fixation spz-ovocyte
Fusion des membranes plasmiques
Activation de l'uf
Pathologie des gamètes et de la fécondation
Gestation (3h)
Corps jaune gestatif : évolution morphologique et fonctionnelle
Physiologie et endocrinologie placentaire
Immunologie de la gestation
Parturition (2h)
Caractéristiques de la contraction du myomètre
Régulation de l'activité contractile du myomètre : endocrine et paracrine
Lactation (3h)
Anatomie de la glande mammaire
Mammogenèse
Lactogenèse
Lactation
Puberté et ménopause (2h)
Programme des TD :
Les muscles lisses
Analyse des dosages des gonadotropines
La procréation médicalement assistée
Un exemple de réflexe neuroendocrinien : la tétée
Programme des TD :
Ovogenèse et voies génitales femelles
Spermatogenèse et voies génitales males
Fécondation
Dosage ELISA des gonadotropines
Mobilité Utérine
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire X
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S5 ou 6 : Endocrinologie Moléculaire
Numéro de lUE : BIO
Intitulé de l' U E : Endocrinologie Moléculaire
Responsable(s) :Elisabeth Pellegrini / Isabelle Anglade
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
2) Parcours :
3) Semestre n° : 5 ou 6
4) Objectifs :
Donner aux étudiants des connaissances fondamentales mais surtout des supports de réflexion sur les mécanismes moléculaires impliqués dans les régulations endocriniennes de lorganisme.
5) Prérequis : UE de communication cellulaire ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28h6h26h60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS (28h)
I Introduction
Les hormones sont des molécules signal, leur production, leur action
La communication hormonale : paracrinie, autocrinie
Hormones VS neurotransmetteurs
II La démarche expérimentale en endocrinologie et ses limites
Rappel historique de la découverte, des méthodes utilisées
Les principales hormones et la notion de rythmicité (la reproduction et la pulsatilité)
III Production et sécrétion des hormones
Synthèse
Maturation
Régulation de la sécrétion
IV Distribution et métabolisme des hormones
Transport dans le sang
Clearance métabolique et demi-vie
Endocrinologie des métabolites
V Rétrocontrôles
Stéroïdiens
Non stéroïdiens
VI Quelques exemples choisis
Endocrinologie de la croissance
Les hormones corticotropes
Langiotensine
VII Aspect physiopathologiques
Altération des sécrétions hormonales
Cancer hormono-dépendants
VIII Perspectives
Hormones, facteurs de croissance et oncogènes
Neurostéroïdes
TP (26h)
Régulation par lestradiol de lexpression de laromatase cérébrale chez lembryon de zebrafish : étude par hybridation in toto.
TD (6h)
Principe de la technique dhybridation in toto (2h)
Exploitation des résultats de TP et discussion sur leur signification physiologique (2h)
Analyse darticle (2h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire X
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil S 7 : Perception et Transduction des Signaux
Numéro de lUE : BIO 715
Intitulé de l' U E : PERCEPTION ET TRANSDUCTION DES SIGNAUX
Responsable(s) : F. Ferrière (co-responsable G. Salbert)
Equipe(s) pédagogique(s) : Equipes pédagogiques de physiologie animale et de biologie cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) de Recherche de Rennes (UE obligatoire pour la mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie ; optionnelle pour les autres mentions) ;
Masters professionnels (UE optionnelle)
2) Parcours : master1
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Lapproche conceptuelle et expérimentale de cette UE sera basée sur létude des processus cellulaires et moléculaires à la base de la reconnaissance et de la transduction des signaux (structure-fonction des récepteurs) et du fonctionnement des canaux et transporteurs sensibles aux modifications environnementales. Les exemples traités seront pris aussi bien dans les systèmes procaryotes queucaryotes animaux et végétaux.
5) Prérequis :
UE Communications Cellulaires (semestre 5 de la filière BCMP) ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Programme des cours :
- Perméabilité à leau et aux solutés non électrolytes
- Canaux ioniques et transporteurs
- Récepteurs membranaires couplés aux protéines G
- Récepteurs membranaires couplés à une activité protéolytique
- Récepteurs membranaires à activité kinase directe ou indirecte
- Récepteurs nucléaires (stéroïdes, vitamines,
)
- Photorécepteurs, leucin-rich-repeat récepteurs-kinases et récepteurs His-Asp-kinases des cellules végétales
Programme des TD :
- Approfondissement des concepts vus en cours au moyen danalyses de données expérimentales
- Préparation aux études expérimentales abordées dans le cadre des travaux pratiques
Programme des TP :
TP de physiologie cellulaire (les modèles choisis concerneront la cellule animale et viseront à la compréhension du rôle de canaux ioniques, transporteurs et récepteurs membranaires, ainsi quà lintégration des réponses dans les couplages excitation-contraction de cellules musculaires lisses ou myocardiques)
Il est important ici de préciser la complémentarité et la logique dans la progression de lacquisition des connaissances existant entre lUE « Communications Cellulaires » (semestre 5) et lUE « Perception et transduction du signal ».
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel x
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Nutrition et maintien de léquilibre de lorganisme chez les animaux
Numéro de lUE : BIO 716
Intitulé de l' U E : Nutrition et maintien de léquilibre de lorganisme chez les animaux
Responsable(s) :Cécile Lecomte et Patrick Jego
Equipe(s) pédagogique(s) :Physiologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Obligatoire en Master Sciences de la Vie et de la Terre
Optionnel dans les licences de Biologie mention Biologie cellulaire et moléculaire, mention Biologie des Organismes
2) Parcours : master 1ère année en SVT et 3ème année de licence pour les autres filières
3) Semestre n° : S 7 en SVT et S 5 pour les autres filières
4) Objectifs :
A partir dun enseignement intégré sous forme de Cours Magistraux, de Travaux dirigés et de Travaux Pratiques cette unité denseignement donne une vision synthétique de lensemble des fonctions de nutrition et de leurs régulations chez les Mammifères ainsi du maintien de léquilibre des principaux paramètres de lorganisme.
5) Prérequis :UE Nutrition et Reproduction S2
ou un enseignement équivalent présentant les modalités de prise alimentaire et les étapes de la digestion (sans la régulation)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel32h10h18h60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Chapitre1 : Nutrition à léchelle de lorganisme
Digestion et absorption et leurs régulations
B- Distribution des nutriments dans lorganisme
- circulation
- ventilation
Chapitre2 : Nutrition à léchelle cellulaire
Echanges gazeux
Devenir des nutriments :mise en réserve, ajustement des voies métaboliques entre les repas (le détail des voies métaboliques napparaît pas dans cette présentation)
Chapitre 3 : Excrétion
Anatomie fonctionnelle de lappareil excréteur
Physiologie rénale : diurèse, filtration glomérulaire,circulation rénale ,phénomènes de résorption, excrétion, sécrétion,concentration de lurine.
Elimination des substances exogènes (détoxication)
Chapitre 4 : Le milieu intérieur et sa constance : homéostasie et systèmes de régulations.
le milieu intérieur
Régulation du pH
Régulation de la glycémie
Thermorégulation
Homéostasie calcique.
Travaux Dirigés
- Circulation,effort, stress
- Pression artérielle
- Régulation de lactivité cardiaque
- Régulation nerveuse et hormonale de la sécrétion damylase pancréatique
- Respiration
- Physiologie rénale
Travaux Pratiques
-Respiration humaine( ESAO )
- Régulation nerveuse et hormonale de la sécrétion damylase pancréatique
- Régulation de lactivité cardiaque chez la grenouille
8) Bibliographie :
Anatomie et physiologie humaines , Marieb, De Boeck Université
Physiologie humaine , Ph. Meyer, Flammarion Medecine-Sciences
Biochimie , Harper, Mc Graw Hill
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( en SVT
optionnel ( autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cet unité se déroulera sous forme denseignements présentiels répartis en cours magistraux , travaux dirigés et travaux pratiques. On attend des étudiants un investissement personnel dans cette discipline, indispensable pour acquérir lautonomie nécessaire en travaux pratiques (applications des notions de cours et de travaux dirigés).
12) Capacité d'accueil : non limitatif
S 8 : Neurobiologie et Cognition
Numéro de lUE : BIO 805
Intitulé de l' U E : NEUROBIOLOGIE ET COGNITION
Responsable(s) : Laure Debure et François Tiaho
Equipe(s) pédagogique(s) : Physiologie animale, éthologie et intervenants extérieurs médecins
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) de recherche en Biologie et Environnement
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : S7 ou S8
4) Objectifs :
Cette UE est complémentaire de lUE Neurophysiologie (master de recherche en biologie). Elle a pour objectif daborder létude du cerveau en présentant plusieurs fonctions cérébrales et des dysfonctionnements existant dans des pathologies comme lépilepsie ou les démences de type Alzheimer. Les mécanismes cellulaires à lorigine du fonctionnement du cerveau seront abordés mais il sera fait une grande place à laspect intégré du fonctionnement cérébral notamment pour comprendre comment se mettent en place certaines tâches dîtes cognitives.
5) Prérequis :
UE Communication nerveuse et cellules excitables ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3282060Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Quatre grands thèmes seront abordés.
I-(8 h) Lépilepsie : cest la maladie du cerveau la plus fréquente. Elle sera présentée ainsi que les méthodes dexploration du système nerveux et leur application dans le cas de l'épilepsie (Imagerie statique et fonctionnelle, Scanner, IRM, EEG,...). Les modèles animaux permettant de comprendre lépilepsie seront présentés ainsi que les bases fondamentales des traitements de la maladie.
II-(8 h) Neuropsychologie ou les bases cérébrales du comportement humain. On abordera les conséquences des lésions cérébrales rencontrées dans des maladies de type Alzheimer, sur le comportement humain et les modèles que l'on peut en tirer sur le fonctionnement cognitif normal.
III-(8 h) Mécanismes neurobiologiques de la mémoire. L'objet du cours sera de définir les différentes formes de mémoire, d'étudier certaines pathologies humaines affectant le stockage de l'information, de comprendre le fonctionnement de circuits nerveux impliqués dans certains apprentissages à partir de comportements simples chez des animaux modèles.
IV-(8 h) Lateralisation du cerveau et dimorphisme sexuel.
TP/TD :
Lobjectif des TP et des TD sera de compléter les connaissances acquises en cours.
TP 1- (5 h) Rappels sur lanatomie fonctionnelle du SNC : utilisation dun CD-ROM, maquette, planches.
TP 2- (5 h) Travail sur des images cérébrales de patients épileptiques (Scanner, IRM, EEG
.), le but sera de corréler les anomalies visualisées avec les symptômes et les troubles décrits chez ces personnes.
TP 3- (5 h) Présentation de tests neuropsychologiques utilisés pour connaitre les troubles cognitifs rencontrés chez des patients notamment dans les maladies neurodégénératives. Présentations de vidéos montrant des troubles cognitifs chez des patients.
TP 4- (5 h) Dimorphisme sexuel dans le cerveau
Les TD permettront dapprofondir certaines connaissances, entre autre par une étude bibliographique. Si leffectif des étudiants le permet, des heures TD serviront (1) à encadrer les étudiants dans une recherche sur un thème de leur choix touchant le fonctionnement cérébral et (2) à leur permettre de présenter oralement le résultat de leur recherche.
8) Bibliographie :
Neurosciences, à la découverte du cerveau, Editions Pradel, 1997.
Mark F. BEAR, Barry W. CONNORS et Michael A. PARADISO
Neurosciences, DeBoeck Université, 1999.
D. PURVES, G.J. AUGUSTINE, D. FITZPATRICK, L.C. KATZ, A.S. LAMANTIA, J.O. McNAMARA
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Neurophysiologie
Numéro de lUE : BIO 806
Intitulé de l' U E : Neurophysiologie
Responsable(s) : F. TIAHO (co-responsable C. SALIGAUT)
Equipe(s) pédagogique(s) : Equipe pédagogique de physiologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnment mention Biologie cellulaire et Physiologie spécialité Physiologie Animale (UE obligatoire), optionnelle pour les autres spécialités ;
Master professionnel Sciences agronomiques, agroalimentaires et vétérinaires (UE optionnelle)
2) Parcours : master 1ère année
3) Semestre n° :7 ou 8
4) Objectifs :
Il sagit dun enseignement de neurophysiologie cellulaire qui prolonge et complète des connaissances abordées antérieurement.
5) Prérequis :
Communication nerveuse et cellules excitables ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28122060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Programme des cours :
--le cerveau et son environnement
- Nutrition, protection, compartimentalisation
- Les cellules constitutives du SNC : neurones et cellules gliales
-dynamique neuronale, neurochimie
-Médiateurs classiques et neuropeptides :synthèse, maturation, libération, inactivation contrôle de certaines fonctions.
-les pathologies du SNC
- Ischémie, maladies neurodégénératives (Parkinson, Alzheimer, Prion)
- Modèles animaux et cellulaires en recherche (avantages et inconvénients)
-développement du système nerveux
- migrations neuronales et croissance axonale par guidage du cône de croissance
- survie neuronale et synaptogenèse
- remodellement synaptique dépendant de lactivité nerveuse et de lexpérience sensorielle (exemple de la vision)
-prolifération et migration neuronales chez ladulte : un espoir thérapeutique ?
Programme des TD :
- Approfondissement des concepts vus en cours au moyen danalyses de données expérimentales
- Préparation aux études expérimentales abordées dans le cadre des travaux pratiques
Programme des TP :
Etudes ex-vivo et in vitro permettant daborder des aspects de neurobiologie axés sur les mécanismes de différenciation ou de survie neuronale ou sur la caractérisation biochimique de médiateurs cérébraux.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
( Ecophysiologie
S8 : Réponses fonctionnelles des organismes aux conditions environnementales
Numéro de lUE : BIO 807
Intitulé de l' U E : Réponses fonctionnelles des organismes aux conditions environnementales
Responsable(s) : Luc Madec
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie animales, Biologie et écologie végétales
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours :
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
En plus dune approche descriptive de lécophysiologie (cf. programme des enseignements), cette UE propose aux étudiants un travail fondé sur lobservation et sur lexpérimentation pratiquée dans cette discipline : ils devront réaliser une expérimentation personnelle (de la mise en place de lexpérience jusquau traitement des données) sur des thèmes imposés (cf. contenu des TP) qui conduira à la rédaction dun rapport dont le format sera celui dun article scientifique.
5) Prérequis : Biologie quantitative : notions de plan dexpérience et danalyse de variance conseillé ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel28102260 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Introduction (1h)
Contrainte abiotique et réponses des organismes
- Vie et environnement physique : flux environnement-organismes ; forme et fonction / taille et allométrie (2h)
- Notion de stress et réponses au stress (hors réponses comportementales), (1h)
- Mécanismes physiologiques et biochimiques ; (4h)
- Plasticité du développement ; asymétrie fluctuante (2h)
- Réponses aux environnements changeants : (i) importance du grain de la variation, (ii) , notion dhoméostasie, (iii) cycles saisonniers, diapause-migration (2h)
- Illustrations : adaptations à quelques milieux extrêmes (milieux aride-polaire ; milieu souterrain ; stress salins) (6h)
Contrainte biotique et adaptations
- Dans le cadre de relations (i) plante-animal, (ii) hôte-parasite/parasitoïde ; (4h)
- La réponse immunitaire (2h)
Contrainte environnementale et structuration des communautés (4h)
TD
- Régulation de la température corporelle (2h)
- Salinité et organisation spatiale des communautés végétales (2h)
- Systèmes anhydrobiotiques : pollen, semences, plantes, lichens, mousses xérophytes (2h)
- Interactions biotiques (relation plantes/insectes, insectes/insectes, champignon/plante) (2h)
- Réponses aux stress xénobiotiques / polluants (2h)
TP
- Sortie « Mt St Michel » : description et caractérisation des sols halomorphes ; adaptations morphologiques et physiologiques des halophytes. Analyse selon le gradient de salinité (i) du microphytobenthos et des micro-algues épiphytes, (ii) de l'organisation spatiale des communautés végétales (6h)
- Survie en conditions extrêmes : température et jeûne (6h)
- Relation température-respiration chez un ectotherme (6h)
- Consommation et taille de lorganisme (4h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : limitée ; 20 minimum en fonction du potentiel enseignant, en raison du projet de recherche encadré
S 8 : Ecophysiologie évolutive
Numéro de lUE : BIO 808
Intitulé de l' U E : Ecophysiologie évolutive
Responsable(s) : Luc Madec
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie animale, Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours :
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs : Cette UE est centrée sur le concept dadaptation. Elle intègre dans un contexte évolutif les mécanismes physiologiques à lorigine des réponses des organismes aux variations du milieu. Les cours définiront les contributions de la génétique, de la biologie des populations, de la biologie évolutive et de la phylogénie à notre compréhension de la diversité de ces mécanismes. Les TP seront pour une large part fondés sur lexpérimentation (manipulations de phénotypes, manipulations environnementales)
5) Prérequis :
Biologie quantitative : notions de plan dexpérience et danalyse de variance ; génétique quantitative conseillés
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Introduction : problématique de lEcophysiologie évolutive (1h)
Réponse adaptative à une variation environnementale (10h)
- Pressions sélectives : nature, variabilité spatiale et temporelle
- Plasticité phénotypique vs. spécialisation ; plasticité, canalisation et stabilité du développement
- Evolution des caractères à effet de seuil
- Trade-off physiologique et trade-off microévolutif
- Variation génétique et sélection naturelle en environnement extrême
Modèles dévolution des gènes à effet majeur : résistance aux pathogènes (4h)
Reconnaître ladaptation : (9h)
- manipulations phénotypiques, manipulations environnementales
- manipulations génétiques
- méthode comparative
Modèles de DDP sous contrainte abiotique (6h)
- modélisation sous contrainte de la température (vitesses de développement variables, - modélisation de diapauses, arrêts de développement)
Illustration : modèles du refuge sous contrainte et de la colonisation active des eaux souterraines
TD
Evolution du trade-off âge-taille à maturité sous contraintes abiotiques (température, alimentation) (2h)
Polyphénisme (3h)
Evolution de la résistance aux xénobiotiques (3h)
Adaptations au milieu souterrain (2h)
TP
Température et mélanisation/polychromatisme (6h)
Utilisation de lanalyse comparative (4h)
Insecticides organophosphorés et évolution des fréquences alléliques des estérases chez la drosophile. Comparaison de la fitness de lignées exposées ou non (10h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : limitée (20 ?)=> projet de recherche encadré
( Génétique des Populations, Evolution
S 5 : Génétique et Evolution des Populations.
Numéro de lUE : BIO 515
Intitulé de l' U E : GENETIQUE ET EVOLUTION DES POPULATIONS
Responsable(s) : Malika Ainouche & Eric Petit
Equipe(s) pédagogique(s): Biologie-Ecologie Végétale, Biologie Ecologie Animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : Troisième année
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs: Dispenser les bases de Génétique des Populations et dEvolution.
5) Prérequis :
Génétique Générale (structure, réplication et fonctionnement du matériel génétique, lois de lHérédité) ; statistique élémentaire (lois de probabilités, tests statistiques) ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h10h30h60 Travail personnel30
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Histoire des idées sur lévolution, Notion de variation et de polymorphisme dans les populations naturelles, Equilibre de Hardy-Weinberg, déséquilibres de liaison, écarts à la panmixie, facteurs évolutifs (mutations, sélection, dérive, migrations). Exercices dapplication, simulations sur ordinateurs, travaux pratiques concernant les outils moléculaires danalyse des polymorphismes.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
optionnel X
obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Biologie évolutive : Evolution des espèces
Numéro de lUE : BIO 621
Intitulé de l' U E : BIOLOGIE EVOLUTIVE : EVOLUTION DES ESPECES
Responsable(s) : Joan van Baaren
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : 3ème année de la licence
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Donner aux étudiants les connaissances indispensables à lévolution des espèces et à la reconstruction phylogénétique.
5) Prérequis :
Le module de Génétique des populations et évolution (semestre 5) ou niveau équivalent est fortement conseillé, mais non obligatoire.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26h12h22h60 Travail personnel25h10h25h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
La spéciation : 15 h cours
Les concepts de lespèce et leurs limites
Les mécanismes de la spéciation allopatrique et sympatrique
Histoire des espèces et phylogénie
Coévolution : 4h cours
Evolution de la communication : 4h cours + 2h TD + 3h TP
Evolution de lhomme : 3h cours + 3h TP
Phylogénie : méthodes de reconstruction des arbres phylogénétiques : 8h TD + 16h TP
Reconstruction de scénarios macroévolutifs : 2h TD.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 7 : Biologie des Populations
Numéro de lUE : BIO 717
Intitulé de l' U E : Biologie des Populations
Responsable(s) : Denis Poinsot
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie végétale, Biologie et écologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) Recherche Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs : Acquérir les bases théoriques nécessaires à l'étude d'une population, et les mettre en pratique en particulier dans l'analyse des résultats d'une sortie d'échantillonnage sur un estran rocheux, rédigée sous la forme d'un article scientifique (par groupe de 5 étudiants).
5) Prérequis : licence de biologie mention Biologie des Organismes ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel281214660Travail personnel281214660
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structure et dynamique des populations (16 cours, 4h TD, 6h TP, 6h sortie)
Stratégies démographiques (4h cours, 4h TD, 8 h TP)
Génétique des populations (8h cours, 4h TD)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours, TD et TP ainsi qu'une sortie d'échantillonnage sur le terrain (estran rocheux). La notation repose en partie sur un travail réalisé par groupes de 5 étudiants (échantillonnage de terrain et rédaction d'un rapport sous la forme d'un article scientifique).
12) Capacité d'accueil : sans limitation.
S8 : Biologie évolutive : modèles phénotypiques, adaptation, plasticité
Numéro de lUE : BIO 809
Intitulé de l' U E : BIOLOGIE EVOLUTIVE : MODELES PHENOTYPIQUES, ADAPTATION, PLASTICITE
Responsable(s) : Jean-Sébastien Pierre
Equipe(s) pédagogique(s) :Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnement mention Biologie des organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Compléments de biologie évolutive consacrés principalement à lévolution des phénotypes (théorie des jeux, traits dhistoire de vie
).
5) Prérequis : Les unités précédentes de biologie évolutive (Génétique des populations et évolution (semestre 5) et biologie évolutive : évolution des espèces (semestre 6) sont conseillées
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26h14h4h16h60 Travail personnel2010h10h20h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Théorie des jeux et évolution : notion de stratégie évolutivement stable. : 4h cours + 4h TD + 4h TP
Evolution des traits dhistoire de vie : contraintes, trade-offs
: 6h cours + 2h TD
Ecologie comportementale : théorie de loptimal foraging, investissement parental, sélection sexuelle
6h cours + 2h TD
Théories expliquant la conservation de la sexualité. : 6h cours + 2h TD
Evolution de la socialité : sélection de parentèle, valeur adaptative inclusive
: 4h cours + 4h TD + 16h Stage sur le terrain (station de Paimpont) sur la socialité chez les fourmis.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
( Biologie Animale
S 5 : Nutrition, développement post-embryonnaire.
Numéro de lUE : BIO 516
Intitulé de l' U E : Nutrition, développement post-embryonnaire
Responsable(s) : Maryvonne Charrier
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie animales
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie, mention biologie des organismes
2) Parcours : 3ème année de la licence de biologie
3) Semestre n° 5
4) Objectifs :
Cette unité denseignement a pour but daborder des fonctions de nutrition (alimentation) et de reproduction (développement post-embryonnaire) sur des modèles biologiques classiques pris parmi les mollusques, les arthropodes et les vertébrés. Il sagira de mettre en relation des structures morpho-anatomiques avec leur fonction de nutrition et daborder le développement post-embryonnaire par létude de quelques modèles de croissance et des facteurs exogènes et endogènes qui le contrôlent.
5) Prérequis : UE de reproduction et développement, UE sur les plans dorganisation et adaptations ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
I : Nutrition : Structures morpho-anatomiques impliquées dans la nutrition et leur fonctionnement (12h)
1) mollusques
2) arthropodes
3) mammifères
II : Développement post-embryonnaire : (18h)
1) Modèles de croissance : arthropodes et mammifères
2) Différenciations morpho-anatomiques : arthropodes et batraciens
3) Facteurs de contrôle : arthropodes, batraciens
TD
I : Construction de modèles de croissance (4h)
II : Formation de différents outils de préhension et leur intérêt dans la détermination du régime alimentaire : radulas de mollusques, pièces buccales dinsectes, dents de mammifères (6h)
TP
I : Prise alimentaire chez les mollusques, insectes et mammifères (9h)
II : Modes de développement larvaire chez les insectes et types de larves (3h)
III : Etapes du développement larvaire des batraciens (3h)
IV : Traitement de données permettant détablir des modèles de croissance (5h)
8) Bibliographie :
Barone, R. 1986, Anatomie comparée des mammifères domestiques. T1 : Ostéologie, Ed. Vigot
Turquier, Y. 1989, Les fonctions de nutrition. Ed. Doin
Hourdry et al. 1995, Métamorphoses animales. Ed. Hermann
Collenot, A. et Signoret, J. 2000, Lorganisme en développement. Ed. Hermann
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement non présentiel inclura lanalyse darticles scientifiques, au moins un dans laxe « nutrition » et un dans laxe « développement post-embryonnaire ». Ces articles seront intégrés aux connaissances exigées dans les épreuves écrites dexamen.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
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S 5 : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux
Numéro de lUE : BIO 517
Intitulé de l' U E : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux
Responsable(s) : Luc Madec
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours :
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Cette UE complète les connaissances acquises lors des semestres précédents sur les principaux plans dorganisation mis en évidence chez les animaux. Elle prolonge ces connaissances en développant une approche fonctionnelle des structures morphologiques et anatomiques mises en place chez les différents taxons (cf. programme des enseignements) et en accordant une place importante aux phénomènes évolutifs majeurs quelles ont subis.
5) Prérequis : S3. Plans dorganisation et adaptations chez les animaux et les spermaphytes ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel221721660 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Spongiaires + Eumétazoaires 1 10h
Eumétozoaires 2 : Arthropodes 10h
Vertébrés 2h
TD
Annélides (Polychètes) 1h
Mollusques (Gastéropodes) 1h
Crustacés 1h
Insectes-Bases morphologiques de la classification 2h
Insectes- Développement 1h
Insectes-Pièces buccales 1h
Poissons 2h
Oiseaux 2h
Amphibiens-« Reptiles » 2h
Mammifères 2h
Bilan sortie marine 2h
TP
Annélides (Polychètes) 3h
Mollusques (Gastéropodes) 3h
Crustacés 3h
Insectes- Développement 3h
Insectes-Pièces buccales 3h
Sortie marine 6h
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
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S 5 : Plans dorganisation et diversité des animaux.
Numéro de lUE : BIO 518
Intitulé de l' U E : Plans dorganisation et diversité des animaux.
Responsable(s) :Russo Jacqueline
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence Pluridisciplinaire, option biologie.
2) Parcours :3ème année de la licence pluridisciplinaire
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Létudiant se forge des connaissances par lobservation danimaux dans les différents milieux lors de sortie dans lenvironnement proche (sortie marine), ou bien à partir danimaux délevage (Apiculture, conchyliculture ect). Par ailleurs, létudiant acquière une approche des grandes fonctions du vivant (locomotion, nutrition, reproduction).
5) Prérequis :
Bio 102 du S1,S3 plan dorganisation et adaptation chez les animaux et les spermaphytes ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel221218860 Travail personnel181222860
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Les étudiants inscrits en Licence Pluridisciplinaire, ont, dans la presque totalité dentre eux, défini leur orientation, à savoir devenir professeur des écoles. Pour répondre «aux besoins et objectifs des étudiants»,ce programme est conçu de manière à faciliter leur cursus. LIUFM les prépare aux modalités du concours mais la licence pluridisciplinaire vise à leur donner les acquis indispensables à cette épreuve.
Le programme porte sur les groupes danimaux les plus représentatifs pour les enfants que les professeurs des écoles auront à éduquer.
Protozoaires impliqués dans les grandes endémies humaine (paludisme).
Vers parasites ( Taenias, Douves, Schistosomes, oxyures, Ascaris, Ankylostomes).
Annélides
Bivalves, Gastéropodes, Crustacés ( trouvés sur lestran ou commercialisés)
Insectes et leurs larves
Vertébrés, Poissons, amphibiens, Reptiles, Oiseaux, Mammifères).
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les cours magistraux, appuyés par les TP et TD en effectifs plus réduit, ont pour but lacquisition de connaissances scientifiques tout autant que le développement du savoir faire. Létudiant doit acquérir une idée claire des notions scientifiques visées grâce à :
des dessins dobservation.
des compte-rendus écrits et des communications orales
savoir utiliser les clefs de détermination.
Travail autonome et bilan.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 6 : Biodiversité Animale
Numéro de lUE : BIO 611
Intitulé de l' U E : Biodiversité Animale
Responsable(s) : Frédéric Ysnel
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et Ecologie animales
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie, mention Biologie des Organismes
2) Parcours : 3ème année de la licence de Biologie
3) Semestre n° : S 6
4) Objectifs : Cette UE donne les bases nécessaires pour la connaissance de la « biodiversité » animale des habitats terrestres et dulcicoles. Cette unité denseignement présente les outils déchantillonnages, les systèmes de classification systématiques et dévaluation de la diversité animale à léchelle spécifique.
5) Prérequis (non obligatoire)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel217141860 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Les différents systèmes de classification de la diversité animale (2H00)
Les bases morpho-anatomiques de la classification des espèces animales terrestres et dulcicoles (16H00)
III)La perception et lévaluation de la biodiversité (animale) à léchelle spécifique (3H00)
Travaux dirigés : (7H00)
Eléments de classification
( Arthropodes terrestres et dulcicoles ; Vertébrés)
Travaux pratiques : (7 séances de 2 heures)
Structures morpho-anatomiques clés pour lidentification des espèces
(Arthropodes terrestres et dulcicoles ; Vertébrés)
Stages de terrain : (18 heures)
Thème : Approche comparative de la Biodiversité dhabitats terrestres et dulcicoles
Techniques déchantillonnage
Inventaire des espèces
Bilan comparatif.
8) Bibliographie :
. Classification Phylogénétique du Vivant , Belin, 2001 (Le Cointre G. & Le Guyader G)
- Animal Diversity , WCB, 1995 (Hickman C.P.& Roberts L.S.)
- Invertebrate Biodiversity as bioindicators of sustainable Landscapes , Elsevier (Paoletti, ed.), 1999
- Rarity. Population and Community biology series 13 (Gaston, K.J. 1994 ) ( M.B.Usher, D.L. DeAngelis & R.L. Kitching eds), Chapman & Hall,201 p.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel X
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement non présentiel inclura la remise dun rapport de stage.
12) Capacité d'accueil : nombre de places illimitées
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S 8 : La mise en mouvement de lorganisme et son intégration au milieu
Numéro de lUE : BIO 810
Intitulé de l' U E : La mise en mouvement de lorganisme et son intégration au milieu
Responsable(s) : Maryvonne CHARRIER
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et Ecologie animales
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master (maîtrise) de Sciences de la Vie et de la Terre
Obligatoire pour la filière
2) Parcours : 1ère année de master
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs : Connaissance du programme général de secteur B au niveau de lorganisme : (i) sa construction au cours du développement post-embryonnaire, (ii) sa perception du milieu.
5) Prérequis : UE de paléontologie du S5 , UE de biologie animale en S5, UE de reproduction et développement en S4, ou niveau équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel16102248Travail personnel28
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
I DEVELOPPEMENT (6h cours, 1h TD, 7h TP)
Déterminisme neuro-endocrinien des métamorphoses. Modèles = insectes et batraciens.
II SYSTEME NERVEUX (4h cours, 1h TD, 3h TP)
Les différents types de systèmes nerveux chez les invertébrés et les processus de cérébralisation.
III- OSTEOLOGIE (6h cours, 8h TD, 12h TP)
La croissance de los et lévolution du squelette chez les vertébrés, lignée humaine incluse.
8) Bibliographie :
Barone, R. 1986. Anatomie comparée des mammifères domestiques. T1 : Ostéologie, Ed. Vigot.
Collectif, 1997. Lévolution. Dossier Pour La Science.
Collectif, 2002. los. Médecine-Sciences.
Gilbert, . 1995. Biologie du développement. Ed. De Boeck Université
Marieb, E.N. 1993. Anatomie et physiologie humaines. Ed. De Boeck Université.
Richard, D. et al. 1998. Physiologie des animaux. T.2. Ed. Nathan université
Wolpert, . 1999. Biologie du développement. Ed. Dunod
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement non présentiel inclura lobservation des collections du musée de zoologie. Lenseignement présentiel comprendra une préparation à un écrit et un entretien oral de type CAPES.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
( Biologie vegetale et Biologie animale
S 1 : Bases Systématiques et Organisation du Vivant
Numéro de lUE : BIO 102
Intitulé de l' U E : BASES SYSTEMATIQUES ET ORGANISATION DU VIVANT
Responsable(s) : M.T. MISSET et D. Poinsot
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale et Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : obligatoire pour toutes les filières de biologie
2) Parcours : 1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions, de la licence de Biochimie et Biologie moléculaire, licence Sciences de la Vie et de la Terre, licence pluridisciplinaire
3) Semestre n° 1
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement doit permettre à létudiant (i) de prendre conscience de la systématique comme essentielle pour comprendre la biologie des organismes dont la diversité actuelle est le résultat de lévolution, (ii) de faire lapprentissage des principaux critères didentification des grands groupes.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements :
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel122218-860Travail personnel10201015560* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
I SORTIE EN FORET : les organismes dans leur milieu (8h)
II INTRODUCTION (2h)
Le vivant = Biodiversité, résultat de lévolution des organismes. Relations avec la diversité du milieu; besoin de le classer (en biologie et paléontologie) pour létudier, lutiliser et le conserver.
Ordonner le monde vivant : la Systématique :
Définition ; caractérisation et classification des organismes ; nomenclature
Quest-ce quune espèce ?
Historique des classifications : approches phénétique et phylogénétique
Les apports de la Systématique phylogénétique à la compréhension de lévolution est lorganisation du monde vivant : présentation des grands domaines de lArbre de laVie
III EUBACTERIES ET ARCHEES (10h C et 6h TP)
définitions et diversité des Procaryotes
classification phénotypique
classification phylogénétique
IV - PROTISTES ET METAZOAIRES (12h C, 6h TP dexploitation de la sortie en forêt), poster (15h travail personnel)
les grandes étapes de lévolution des Métazoaires :
acquisition du mésoderme
acquisition du coelome
passage à la vie terrestre
acquisition de la chorde
V CHAMPIGNONS, ALGUES BRUNES ET LIGNEE VERTE (10hC, 6hTP dexploitation de la sortie)
les traits biologiques caractéristiques des grands groupes
endosymbiose et lignée verte
passage à la vie terrestre : du thalle aux organes spécialisés, acquisition des stomates et de la cuticule
acquisition de la lignine
VI VIRUS (2hC)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a pour objectif de donner une vue densemble des différents aspects de la biologie, daider les étudiants à définir leur orientation. Elle a aussi été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
A la suite dune sortie en forêt destinée à voir les organismes dans leur milieu, les enseignements seront répartis en cours et travaux pratiques. Un travail personnel (évalué à 15 h) sous forme dun poster, permettra aux étudiants de se familiariser avec une recherche bibliographique sur un thème précis, avec restitution orale.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
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S 2 :Nutrition, Reproduction
Numéro de lUE : BIO 202
Intitulé de l' U E : NUTRITION - REPRODUCTION
Responsable(s) : MT MISSET, AM CORTESERO
Equipe(s) pédagogique(s) :Physiologie, Biologie animale et Biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie toutes mentions, Licence de Sciences de la Vie et de la terre, Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, licence pluridisciplinaire
obligatoire pour toutes les filières
2) Parcours :
1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions, de la licence de Biochimie et Biologie moléculaire
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Cette UE traite de deux grandes fonctions communes à tous les organismes vivants, nutrition et reproduction. Cet enseignement a pour but de faire comprendre (i) la complémentarité entre végétaux autotrophes et animaux hétérotrophes, (ii) lévolution des systèmes digestifs et des systèmes reproducteurs ainsi que des modalités de reproduction chez les animaux et les végétaux.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursCours / TDT. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel-3218-60 Travail personnel352560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
I - Nutrition
Introduction générale : autotrophie - hétérotrophie (2h)
Nutrition végétale: de la nutrition à la production (14h)
Les plantes absorbent et utilisent l'eau
Les plantes absorbent et utilisent des nutriments minéraux
Les plantes exploitent l'énergie solaire et la lumière
Quelques aspects de la nutrition carbonée et azotée des plantes
TP- TD Sensibilisation des étudiants à la mesure de processus physiologiques au travers de 2 exemples : mesure de l'intensité photosynthétique et mesure de l'absorption de l'eau.
Nutrition animale : de la prise alimentaire à l'excretion (14h)
Les principales catégories daliments
Nutrition énergétique , nutrition azotée , oligoéléments , vitamines
Les principales méthodes de prise alimentaire (des protozooaires aux vertébrés)
Description de quelques appareils digestifs
Digestion et absorption des principaux aliments
Régulation hormonale de la digestion
TP-TD communs entre nutrition et reproduction animales
II- Reproduction
Introduction générale 2hC:
reproduction conforme de linformation génétique et transmission à la descendance : mitose et reproduction asexuée ; notion de clone
brassage de linformation génétique, cellules spécialisées dans sa transmission (gamètes) : méiose et reproduction sexuée
fécondation
Reproduction chez les animaux (14h)
Reproduction asexuée (Gemmulation, Bourgeonnement, Strobilation, Régénération et Parthénogénèse)
Reproduction sexuée (Gonades, Gamétogénèse, Gamètes, Fécondation, Phéromones et Rapprochement des partenaires, Gonochorisme, Hermaphrodisme, Formation de lappareil uro-génital des Vertébrés)
Cycles de Reproduction .
TP sur matériel commun avec la nutrition
Reproduction chez les végétaux (14h)
Reproduction asexuée ( Plantes clonales, multiplication végétative)
Reproduction sexuée : notion d'alternance de générations ; répartition des sexes ; de la simple à la double fécondation
adaptation à la vie terrestre : de la cryptogamie à la phanérogamie
TP- TD : comparaison entre le développement dune plante sans fleur et dune plante à fleur (matériel commun avec nutrition végétale si possible)
8) Bibliographie :
- La reproduction. POUXVIELC D. Eds Nathan, 1996
- La reproduction des Invertébrés. CASSIER et Col Eds Masson, 1997
- Les grandes fonctions - HEUSSER S. Eds Dunod, 2000
- Les fonctions de nutrition (Tome 1) Turquier Y. Eds Doin, 1989
- En bref ... Physiologie de SCHMIDT. Eds De Boeck - Université
- Anatomie et Physiologie Humaines de MARIEB. Eds De Boeck - Université
- Botanique. Lüttge, Kluge, Bauer. Eds Lavoisier
Atlas de Biologie Végétale T.1 Organisation des plantes sans fleurs. Roland et Roland. Eds Masson
ABV T. 2 Organisation des plantes à fleurs. Roland et Vian. Eds Masson
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire ( pour toutes les filières
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 3 : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux et les spermaphytes
Numéro de lUE : BIO 310
Intitulé de l' U E : Plans dorganisation et adaptations chez les animaux et les spermaphytes
Responsable(s) : Liliane KRESPI (zoologie) et Kader AINOUCHE (botanique)
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale et Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie des Organismes, mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Licence pluridisciplinaire,
Licence Sciences et Vie de la Terre.
2) Parcours :Deuxième année de licence
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs : Cet enseignement doit amener létudiant (i) à connaître les structures mises en place au cours de lévolution, (ii) à faire le lien entre structures et fonctions (étudiées par ailleurs), et (iii) à comprendre comment les organismes sadaptent à leur milieu
5) Prérequis : UE BIO 102 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel21122760 Travail personnel20103060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
I Les animaux :
Cours : 9h - Les grands plans d'organisation chez divers groupes d'animaux : Annélides, Arthropodes, Mollusques et Echinodermes : Adaptations et différents modes de vie chez ces animaux
TD : 6h - Plans d'organisation et Adaptations chez les Annélides, Crustacés, Insectes, Mollusques et Echinodermes
Introduction à l'étude des Vertébrés
TP : 15h - Plans d'organisation et adaptations chez les Annélides, Crustacés, Insectes, Mollusques et Echinodermes, 12.5h
- Introduction à l'étude des Vertébrés, 2.5h
II Les Spermaphytes :
Cours : 12h - les méristèmes , organogenèse : tige, racine, feuille (histogenèse, cambium)
Croissance, architecture des plantes. Diversité des structures morphologiques, relations structures-fonctions, adaptations
TD 6h -TP 12h: Anatomie des Angiospermes
structures primaires et secondaires
diversité des structures anatomiques
8) Bibliographie :
Biologie végétale. Raven, Eichhorn, Evert. Eds de Boeck
Structure des plantes. Bowes.Eds INRA
Biologie animale:
Les plans dorganisation du règne animal GINET R. et ROUX A.L. Doin (ed) 1986
Biologie animale (Tomes 1 et 2) Des Protozoaires aux Métazoaires épithélioneuriens BEAUMONT A. et CASSIER P. Dunod université 1987
Biologie animale Les Cordés, Anatomie comparée des Vertébrés BEAUMONT A. et CASSIER P. Dunod université 1987
Travaux Pratiques de Biologie animale BEAUMONT A. et CASSIER P. Dunod
Principes de Zoologie CHAPRON C. Dunod 1989
Biologie animale (Tome 1) Les grands plans dorganisation HEUSSER S. et DUPUY H.G. Dunod 1998
Invertabrates BRUSCA R.C. et BRUSCA G.J. Sinauer Associates, Sunderland 1990
Classification phylogénétique du vivant LECOINTRE G et LEGUYADER H. Belin 2001
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour la licence de Biologie, mentions Biologie des organismes et SVT, licence pluridisciplinaire
optionnel ( pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques : : pour une meilleure compréhension, laccent est mis sur les enseignements pratiques soutenus par les TD. Outre le matériel étudié en TP, films et visite de la serre pédagogique seront proposés pour illustrer lenseignement théorique.
12) Capacité d'accueil : non limitée
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S 4 : Reproduction et développement : mise en place des structures chez les animaux et végétaux
Numéro de lUE : BIO 406
Intitulé de l' U E : REPRODUCTION ET DEVELOPPEMENT : mise en place des structures chez les animaux et végétaux
Responsable(s) : M.TARAYRE, C. GERARD
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale, Biologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention biologie des organismes, mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Licence pluridisciplinaire,
Licence Sciences de la Vie et de la Terre.
2) Parcours : 2ème année de licence
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
Cet enseignement, faisant suite aux plans dorganisation des organismes, est destiné à faire comprendre leur mise en place chez les vertébrés et les plantes à graines. En lien avec le développement, laccent est mis, notamment chez les plantes, sur les interactions plantes-insectes à lorigine dune grande diversité des structures liées au transfert du pollen dune part et à la dispersion des semences dautre part.
5) Prérequis : UE BIO 107 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursTDT. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26112360 Travail personnel35101560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
I- Embryologie descriptive et expérimentale chez les Vertébrés 14h C
TD :
- Embryologie des Amphibiens et des Oiseaux, 3h
- Reproduction et développement chez les Mammifères (ex : la souris), 1h
- Reproduction et développement chez les Insectes, 1h
TP
- Embryologie des Amphibiens et des Oiseaux, 6h
- Reproduction et développement chez les Mammifères (ex : la souris), 3h
- Reproduction et développement chez les Insectes, 2h
II Appareils reproducteurs chez les Spermaphytes 12h C
Cycle de reproduction chez les Coniférophytes (Ginkgo et Pin)
Les Angiospermes : fleurs et inflorescences, androcée, gynécée, pollinisation et fécondation, graines et fruits, dispersion
TD 6h TP 12h
- cycle de reproduction du Pin
- fleurs et inflorescences
- graines et fruits
8) Bibliographie :
Biologie végétale. Raven, Eichhorn, Evert. Eds de Boeck
Atlas de Biologie végétale 2 Organisation des plantes à fleurs. Roland et Vian. Eds Masson
Biologie animale :
Beaumont A., Hourdry J., Vernier J.-M. & Wegnez M., 1994. Développement. Ed. Dunod, 282 pages.
De Vos L. & Van Gansen P., 1980. Atlas dembryologie des Vertébrés. Ed. Masson, 94 pages.
Dollander A. & Fenart R. Eléments dembryologie. Embryologie générale 1. Ed Flammarion, 394 pages.
Franquinet R. & Foucrier J., 1998. Atlas dembryologie descriptive. Ed. Dunod, 147 pages.
Freeman W. H. & Bracegirdle. Atlas dembryologie. Ed. Dunod, 100 pages.
Gallien L., 1976. Luf et les stades initiaux de lontogénèse. Le Biologiste, Ed. Presses Universitaires Françaises, 324 pages.
Houillon C., 1967. Embryologie. Ed Hermann Paris, 183 pages.
Le Moigne A., 1989. Biologie du développement. Collection Abrégés, Ed. Masson, 243 pages.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour licence de biologie et licence pluridisciplinaire
optionnel ( pour autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cet enseignement est dispensé sous forme de cours TD et TP avec dissections et observations en microscopie photonique. La pollinisation et reproduction végétale sera également illustrée par la projection de documents filmés.
12) Capacité d'accueil : non limitée
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( Biologie Végétale
S 4 : Organisation, Reproduction et Adaptations chez les Spermathytes
Numéro de lUE : BIO 407
Intitulé de l' U E : Organisation, Reproduction et Adaptations chez les Spermathytes
Responsable(s) : M-T MISSET
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, Module obligatoire pour les spécialités « Sciences Végétales » et « Biologie appliquée » .
Parcours :
2ème année de licence de Biologie.
Semestre n° 4
Les 30h consacrées aux structures reproductrices, à la pollinisation et reproduction sexuée sera commune avec la partie végétale de l'UE ' Reproduction et développement: mise en place des structures chez les animaux et les végétaux'
4) Objectifs :
Cet enseignement doit amener létudiant (i) à comprendre la mise en place des structures au cours de lontogenèse de la plante, (ii) à faire le lien entre structures et fonctions (étudiées par ailleurs), (iii) à comprendre comment les organismes sadaptent à leur milieu abiotique et biotique et (iv) comment les Spermaphytes se reproduisent et colonisent leur environnement. Ces notions sont fondamentales pour des étudiants souhaitant orienter leur parcours vers les biotechnologies végétales ou l'amélioration des plantes
5) Prérequis : UE BIO 102 et UE BIO 107
6) Contenu des enseignements:
CoursTDT. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel241224-60 Travail personnel30102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Cours :
I - Appareil végétatif des Spermaphytes
introduction
de la plantule à la plante : organogenèse, morphogenèse
architecture de la plante : croissance monopodiale et sympodiale
les organes : morphologie, relations structures - fonctions et adaptations
II - Appareil reproducteur
du cône à la fleur : aspects évolutifs et conséquences
ontogenèse du gamétophyte mâle (le pollen) et du gamétophyte femelle (endosperme et sac embryonnaire)
pollinisation
fécondation et formation de la graine
les fruits et la dispersion des diaspores
incidence des mécanismes de dipersion (pollen et diaspores) sur les flux de gènes
et les capacités colonisatrices
TD-TP :
anatomie : structures primaires, secondaires et adaptations des différents organes
analyse florale
le pollen : ontogenèse et germination
graines et fruits ; adaptations à la dispersion
8) Bibliographie :
Biologie végétale. Raven, Eichhorn, Evert. Eds de Boeck Université
Atlas de Biologie végétale 2 Organisation des plantes à fleurs. Roland et Vian. Eds Masson
Structure et développement de la plante : morphogenèse et biologie de la reproduction. Vallade. Eds Dunod
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour la licence de Biologie mention Sciences Végétales
optionnel ( pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Pour une meilleure compréhension, laccent est mis sur les enseignements pratiques soutenus par les TD. Outre le matériel étudié en TP, films et visite de la serre pédagogique seront proposés pour illustrer lenseignement théorique.
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 5 : Organisation et diversité des organismes chlorophylliens
Numéro de lUE : BIO 519
Intitulé de l' U E : Organisation et diversité des organismes chlorophylliens
Responsable(s) :Agnès Schermann
Equipe(s) pédagogique(s) :biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence pluridisciplinaire mention biologie
2) Parcours : 3 ème année de licence pluridisciplinaire de biologie
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
A partir de lobservation dexemples disponibles localement (collections du campus, forêts voisines, côte), permettre aux étudiants de découvrir la diversité des formes, des modes de vie et de reproduction des plantes. Apporter des connaissances sur lévolution de ces groupes. Exercer les compétences de transmission orale en petit et grand groupe, ainsi que la rédaction de compte-rendus dobservation.
5) Prérequis : BIO1, BIO2 , BIO5 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel221218860 Travail personnel152017860
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
CM : Diversité des appareils végétatifs et de la reproduction chez les végétaux et les algues, tendances évolutives, rappel de la phylogénie.
TP et TD : séances comprenant létude détaillée dun ou deux exemples et une présentation de la diversité du groupe. Algues, Mousses et hépatiques, Ptéridophytes, Gymnospermes, Angiospermes : morphologie végétative, morphologie florale et reproduction, adaptation morphologique et anatomique.
8) Bibliographie :
Biologie végétale / Peter H. Raven, Ray F. Evert, Susan E. Eichhorn ; traduction de la 6e édition américaine par Jules Bouharmont ; avec la collaboration scientifique de Charles-Marie Evrard. Biology of Plants. Paris : De Boeck Université, 2000
Botanique / Ulrich Lüttge, Manfred Kluge, Gabriela Bauer ; trad. et adapt. par Véronique et André Sieffert. Paris : Tec & doc-Lavoisier, 2002
Larousse de la nature : encyclopédie du monde vivant / responsable d'édition Michel Zelvelder ; edition : Thierry Olivaux assisté de Vanina Pialot, Noémie Deutsch. Paris : Larousse, 2000
Dictionnaire de la botanique / Collection Encyclopaedia universalis
9) Coefficient : 3
10) Statut
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
En TP et en TD, les étudiants devront examiner à lavance pour chaque séance une série de questions leur permettant de cerner et réactualiser leurs connaissances. Un travail par petits groupes permettra à ceux qui ont davantage de connaissances de sexercer à les transmettre, il sera suivi dune restitution orale, constituant en même temps une récapitulation pour lensemble du groupe, et un exercice doral. Lenseignant présentera ensuite les exemples et les étudiants procèdent à des manipulations et des observations accompagnées de la rédaction dun compte-rendu.
12) Capacité d'accueil : illimitée
S 6 : Les Embryophytes
Numéro de lUE : BIO 612
Intitulé de l' U E : Les Embryophytes
Responsable(s) : M.T. MISSET
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours : 3ème année de licence, obligatoire
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Cette unité denseignement permet dacquérir les connaissances exigées pour la préparation aux concours CAPES et Agrégation. Elle concerne les plantes ayant colonisé le milieu terrestre à partir du Dévonien en insistant sur lindépendance progressive de la reproduction vis à vis de leau, associée à une protection croissante des organes reproducteurs comme de lembryon. Les aspects évolutifs basés sur les fossiles et les espèces actuelles feront le lien avec lenseignement dispensé par les collègues géologues.
Le regroupement des organes mâles et femelles au sein dune même fleur chez la majorité des Angiospermes rend possible divers régimes de reproduction sexuée qui permettront daborder les notions d'auto / allogamie, de compatibilité / incompatibilité, y compris des points de vue cellulaires et moléculaires.
5) Prérequis : UE BIO 102, UE BIO 107, Plans dorganisation et adaptations chez les animaux et les Spermaphytes (UE BIO 2 ) et Reproduction et Développement (UE BIO 2 ) ou équivalents
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h14h26h60Travail personnel25h10h25h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS :
Phylogénie des Embryophytes : classification des Archégoniates et des Angiospermes.
Biologie et cycles de reproduction des différents clades, adaptation de la reproduction au milieu aérien chez les Archégoniates
Les grandes étapes évolutives : apparition de lovule (Cycadophytes), apparition de la graine (Coniférophytes), mise en place de la double fécondation (Gnétophytes), apparition de la fleur et du fruit (Angiospermes).
Les régimes de reproduction sexuée (auto- / allogamie), mécanismes dallogamisation, aspects cellulaires et moléculaires des incompatibilités sporophytique et gamétophytique, stérilités mâles
TD-TP :
Morpho-anatomie des Embryophytes
Principales familles dAngiospermes et analyses florales.
8) Bibliographie : Morphologie des végétaux vasculaires. Camefort. Ed. Doin
Reproduction et Biologie des végétaux supérieurs. Camefort. Ed. Doin
Les végétaux : organisation et diversité biologique. Ozenda. Ed. Dunod
Biologie végétale. Tome 2 : organisation végétative. Robert , Catesson
Tome 3 : la reproduction. Robert, Dumas, Bajon. Eds Doin
Biologie végétale. Raven, Eichhorn, Evert. Eds de Boeck Université
Atlas de biologie végétale Tomes 1 et 2. Roland. Eds Masson
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire q pour la mention SVT
optionnel q pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cet enseignement est délivré sous forme de cours, TD et TP. Comme pour les modules précédents, laccent est mis sur les séances dobservation. Il sera demandé aux étudiants de réaliser des compte-rendus de TP enrichis par des recherches personnelles.
12) Capacité d'accueil : non limitée
S 6 : Biosystématique et Interactions Biotiques chez les Angiospermes
Numéro de lUE : BIO 613
Intitulé de l' U E : Biosystématique et Interactions Biotiques chez les Angiospermes
Responsable(s) : MT. Misset
Equipe(s) pédagogique(s) : Botanique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
2) Parcours : L3 spécialité Sciences végétales et spécialité Biologie appliquée
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Sur la base de létude de familles dintérêt économique, renforcer les connaissances relatives aux systèmes de reproduction sexuée et asexuée et aux interactions symbiotiques ou parasitaires.
5) Prérequis : BIO 102 , BIO 107
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060Travail personnel2010161460
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
A Cours
Rappel de la Phylogénie des Angiospermes
A travers quelques grandes familles dintérêt économique (Poaceae, Fabaceae, Solanaceae, Brassicaceae
) seront développés les traits biologiques suivants :
Origine et domestication, rôle de la polyploïdie
Biologie de la reproduction sexuée et asexuée ( incompatibilités, stérilités, apomixie
)
Nature et origine des réserves
Symbioses ( fixation dazote : formation des nodules à Rhizobium et Frankia, relations structures fonctions ; ecto- et endomycorhizes)
Parasitisme (relations hôte - parasite) ; laccent sera mis sur les Angiospermes parasites
B- TP - TD
Analyses morpho - anatomiques des familles choisies, organes de réserve, graines, types de réserve
Incompatibilités et stérilités mâles
Symbioses
Parasitisme
Présentation orale des thèmes choisis
8) Bibliographie :
Biologie végétale. Tome3 : la reproduction Dumas, Robert, Bajon , Eds Doin
Symbioses. MA Selosse Eds V. Vibert
Nodulation in legumes. J. Sprent. Eds RBG Kew
Articles scientifiques
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les étudiants seront amenés à réaliser un petit dossier sur un thème donné à partir darticles proposés et complétés par une recherche personnelle quils présenteront oralement devant le groupe.
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Organisation et Phylogénie Végétale
Numéro de lUE : BIO 614
Intitulé de l' U E : Organisation et Phylogénie Végétale
Responsable(s) : Abdelkader Aïnouche
Equipe(s) pédagogique(s): Biologie Végétale Botanique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : Troisième année
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Approfondir les bases de la systématique végétale à la lumière des approches phylogénétiques afin de comprendre et ordonner la biodiversité végétale. Ces notions permettront aux étudiants se destinant aux filières dEcologie et de Biologie Evolutive dappréhender dans une perspective historique les processus évolutifs et adaptatifs ayant affecté les végétaux.
5) Pré-requis :
Plans dorganisation et adaptation des plantes ou niveau équivalent
Reproduction et développement des Spermaphytes ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h12h20h8h60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Seront traités dans cet enseignement, lorganisation, la diversité, les cycles de développement / reproduction, la phylogénie et la systématique des différents groupes de la lignée verte (Chlorobiota) : des algues vertes aux plantes à fleurs. Un intérêt particulier sera accordé à la compréhension des traits et processus évolutifs fondamentaux ayant conduit les plantes vasculaires (les Trachéophytes), et plus spécialement les Angiospermes, à occuper une position dominante dans la plupart des écosystèmes terrestres.
Les bases théoriques et méthodologiques de la systématique dispensées en cours, seront développées à travers des travaux dirigés et pratiques danatomie, de morphologie, danalyse florale, et de taxonomie: caractérisation, principes de classification, identification, utilisation des flores, excursion botanique et confection dun herbier.
8) Bibliographie :
Judd, Campbell, Kellog, Stevens (2002) . Botanique systématique. Une perspective phylogénétique. DeBoeck Université.
Guignard. Abrégé de botanique. Ed Masson.
Spichiger, Savolainen, Figeat (2000). Botanique systématique des plantes à fleurs. Presses Polytechniques et Universitaires Romandes, Lausane.
Raven, Evert, Eichorn (2000). Biologie végétale. DeBoeck Université.
Blamey M., C. Grey-Wilson. Flore dEurope occidentale. Ed. Arthau.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
optionnel X
obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Organismes Chlorophylliens Thalloides, Champignons et Lichens, Interactions Biotiques
Numéro de lUE : BIO 718
Intitulé de l' U E : Organismes Chlorophylliens Thalloides, Champignons et Lichens, Interactions Biotiques
Responsable(s) : Rozene GUESNE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Sciences de la Vie et de la Terre ; préparation aux concours du CAPES et de lAGREGATION
2) Parcours : 4ème année, Master 1
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Cette UE apporte une connaissance de groupes dont la position phylogénétique a été récemment bouleversée : les algues, organismes chlorophylliens essentiellement marins et les champignons, organismes non chlorophylliens essentiellement terrestres. En milieux terrestres, ces deux groupes ont de plus développé des interactions biotiques originales dune importance capitale dun point de vue biologique et écologique, les mycorhizes et les lichens. Dautres interactions biotiques de type symbioses seront abordées à cette occasion. Létude des champignons permettra de dégager la notion de parasitisme comme mode de nutrition.
5) Prérequis : UE BIO 102 Bases systématiques et organisation du vivant
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h8h12h8h48Travail personnel22h5h15h6h48
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
Cours :
La structuration de larbre des Eucaryotes : discussion de la notion de champignon et dalgue.
rappel de lorigine endosymbiotique de la cellule eucaryote (exemple de lorigine des plastes dans la lignée verte)
Biologie des principaux groupes dalgues et leurs cycles de reproduction (Fucus, Ulve
)
Importance du phytoplancton et valorisation des algues
Biologie des champignons et leurs cycles de reproduction (Mildiou, coprin..)
Importance des processus de saprophytisme, de parasitisme et de mycorhization dans le monde végétal
Biologie des lichens et importance de la symbiose lichénique
La notion de symbiose sera élargie aux symbioses fixatrices dazote.
TD-TP :
Excursion sur le littoral et constitution dun alguier de référence. Etude des principaux facteurs régissant la répartition des algues sur le littoral.
Morphologie et cycles de reproduction des algues vertes, brunes et rouges.
Morphologie et cycles de reproduction des principaux de groupes de champignons.
Endo et ecto-mycorhizes
Morpho-anatomie des lichens
Organismes symbiotiques et fixation de lazote atmosphérique (dont lichens et associations plantes/procaryotes)
8) Bibliographie :
Les champignons : mycologie fondamentale et appliquée. Bouchet, Guignard et Villard. Eds Masson ; Abrégés
Biologie et phylogénie des Algues. B. de Reviers T1 et T2. Eds Belin
Les Algues. Gayral Eds Doin
Organisation et biologie des Champignons. Boiron et Perilleux. Eds Nathan
Les symbioses. MA Selosse. Eds Vuibert
Guide des Lichens. Van Haluwyn et Lerond. Eds Lechevalier
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour la préparation aux concours
optionnel ( pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Outre les cours, TD et TP, les étudiants auront à réaliser un alguier à lissue de lexcursion et des compte-rendus de TP enrichis déventuelles recherches personnelles.
S 8 : Evolution Végétale
Numéro de lUE : BIO 811
Intitulé de l' U E : Evolution Végétale
Responsable(s) : Malika AINOUCHE
Equipe(s) pédagogique(s):Biologie Végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 de recherche Biologie et Environnement mention Sciences Végétales
Master professionnel de Sciences agronomiques, agroalimentaires et vétérinaires mention Productions végétales
2) Parcours : première année de Master
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Cette UE devrait permettre aux étudiants dappréhender les processus évolutifs affectant les plantes à léchelle du gène, du génome, et des populations. Ces notions, prenant appui sur une bonne connaissance des systèmes végétaux et en particulier de la biologie de la reproduction, sont indispensables aux étudiants souhaitant sorienter vers lamélioration génétique des plantes, la production végétale, la gestion des cultures ou des forêts
5) Prérequis :
Biologie cellulaire et Moléculaire ou niveau équivalent
Organisation, reproduction et adaptations des Spermaphytes ou niveau équivalent
Biosystématique et interactions biologiques chez les Angiospermes ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20h10h30h60 Travail personnel25102560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Evolution comparée des génomes nucléaires et cytoplasmiques des plantes, dynamique des gènes dans les populations, flux géniques (semences versus pollen), évolution réticulée (par hybridation) et diversité génétique, spéciation et phylogénie.
8) Bibliographie (sous réserve de mise à jour):
Variation and Evolution in Plants and Micro-organisms : Toward a new synthesis 50 years after Stebbins. F. Ayala, W. Fitch & M. Clegg (Eds) 2000 National Academy Press. Washington.
Evolution Biologique. Ridley 1997 De Boeck Université.
Les avatars du gène. P-H Gouyon, J-P Henry, J. Arnould 1997 Belin
Reconstruction Phylogénétique : Concepts et méthodes. P. Darlu et P.Tassy 1993 Masson.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour le master 1 Recherche en Sciences végétales
optionnel ( pour les autres filières
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement sera diffusé sous forme denseignement théorique, de travaux dirigés (exercices ou exposés thématiques) et travaux pratiques (cytogénétique, polymorphismes, reconstructions phylogénétiques).
12) Capacité d'accueil : non limitée
( Ecologie, Environnement
S 2 : Bases de lécologie
Numéro de lUE : BIO 201
Intitulé de l' U E : Bases de lEcologie
Responsable(s) : Anne Marie Cortesero et Françoise Forgeard
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie écologie animale et Biologie écologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie, mention biologie des organismes
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs :
Les étudiants arrivent à luniversité ayant entendu parlé décologie politique ou décologie médiatisée. Cet enseignement a pour objectif de resituer les problématiques et la démarche scientifique des problèmes écologiques de notre temps en leur donnant les notions de bases indispensables à lapproche scientifique de lécologie. Cette approche se fera à partir dexemples concrets se basant sur des excursions ( forêt, ruisseau
) et sur des cas actuels ( changements climatiques, développement durable
)
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301014660 Travail personnel30151560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS (20h)
- Introduction : problématiques et démarches en Ecologie
Niveaux d'organisation des systèmes (Biome, écosystèmes et grands processus écologiques ( production, prédation, décomposition))
Fonctionnement des écosystèmes ( exemples :forêt, ruisseau,
)
Organismes et facteurs abiotiques (Sol -Climat-Eau)
Applications aux problèmes environnementaux (Changements climatiques, Biologie de la Conservation, Développement durable)
TD (10h)
- Fonctionnement bio-géochimique des écosystèmes
Interactions biotiques (relation plantes/insectes, insectes/insectes, champignon/plante)
Relation caractéristiques du milieu-réponses des organismes (gradient de température, écophysiologie,
)
Relation caractéristiques du milieu- composition des communautés (gradients écologiques, cartographies écologiques)
TP (20h)
Sortie en forêts, prairies, zone humide, ruisseau
Recyclage de la MO et fonctionnement des humus
Adaptations et Structures des peuplements de la faune du sol
Biodiversité et bio-indicateurs (ex. des mousses)
Hétérogénéité interne et biodiversité (Analyse d'une système ruisseau, Rôle des interfaces)
Gradient et structures des communautés (Forêt, prairies, zone humide)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 3 : Chimie et Physique de l'Environnement 1
Numéro de lUE : BIO 311
Intitulé de lUE : Chimie et Physique de l'Environnement 1
Responsable(s) : Yvan LAGADEUC & Daniel CLUZEAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie végétale (écologie) & Biologie animale (écologie)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Optionnel Licence de biologie mention Biologie des organismes
Optionnel Licence de biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie spécialité sciences végétale
Conseillé pour une entrée en master Sciences de la Vie et la Santé mention Environnement
2) Parcours : 2ème année de la licence
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Acquisitions des bases de physiques et chimie nécessaires aux études environnementales
Ecologie quantitative BIOQUANT S3 12 H
5) Prérequis :
Bases de lEcologie, Ecologie 1 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26181660Travail personnel102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Chimie : Chimie des solutions + méthodologie responsables : S. Dérien, M. Hissler : 8hC 6hTD 10TP
Equilibres acido-basiques (Définitions, acidité et pH)
Equilibres de complexation (complexes métalliques, stabilité, complexes et acidité)
Equilibres de solubilité (solubilité et produit de solubilité, séparation des ions, solubilité et pH, compétition solubilité-complexation)
Oxydoréduction (Nombre doxydation, équilibres rédox, échelle de potentiels, modification des propriétés oxydoréductrices)
Travaux pratiques : Dosages colorimétriques et potentiométriques.
Physique : Responsable V. Vié :24 H : 18 h cours/TD et 6hTP
Transport Fluide et Particules : diffusion, viscosité, sédimentation, percolation Atomes et molécules : particules et radioactivité, structure des atomes
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Chimie et Physique de l'Environnement 2
Numéro de lUE : BIO 408
Intitulé de lUE : Chimie et Physique de l'Environnement 2
Responsable(s) : Daniel CLUZEAU & Yvan LAGADEUC
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie animale (écologie) & Biologie végétale (écologie)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Optionnel Licence de biologie mention Biologie des organismes
Optionnel Licence de biologie mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie spécialité sciences végétale
Conseillé pour une entrée en master Environnement
2) Parcours :
3) Semestre n° : S 4
4) Objectifs :
5) Prérequis :
Bases de lEcologie, Ecologie 1, Ecologie 2, Chimie et Physique de lEnvironnement 1, Sol-Eau-Climat ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel181224660Travail personnel20202060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
Physique des sols caractérisation physique des sols de léchelle du profil à celle des versants - variabilité spatio-temporelle) 6h
Chimie et Physique des eaux : acquisition des caractéristiques globales dune eau, les nutriments dissous et leur estimation 6h
Rôles des organismes sur la chimie et la physique de lenvironnement 6h
TD
Qualité des compartiments de lenvironnement (travaux sur documents) :
Les sols agricoles : Impact des activités agricoles 6h
Les eaux douces : qualité et évaluation des eaux 6h
TP
Sortie sur un transect agricole (versant, zone de bas-fond, ruisseau) 6h
Méthodes et techniques en physique des sols (état de surface, profil-tarière, densité, porosité de surface, infiltrométrie) 6h
Méthodes et techniques en hydro-géo-chimie (mesures des caractéristiques fondamentales dune eau (pH, alcalinité, conductivité électrique, teneurs en ions majeurs, salinité,
)) 6h
Exploitation des résultats en salle et mise en forme des résultats (inventaire, diagnostic) avec réalisation de cartes numériques 9h
Synthèse des approches physico-chimiques Restitution discussion 3h
Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 3 : Les grands problèmes décologie.
Numéro de lUE : BIO 312
Intitulé de l' U E : LES GRANDS PROBLEMES DECOLOGIE
Responsable(s) : F. ROZE, AJ. FRANCEZ
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale ; Ecologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie spécialité sciences végétales et spécialité Biologie appliquée , Licence de biologie mention biologie des organismes
2) Parcours :
L2 pour les spécialités Sciences végétales et Biologie appliquée
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
De lourdes menaces pèsent sur lavenir du fait de la dilapidation des ressources naturelles, de la dégradation des grands biomes, des pollutions, de la disparition de nombreuses espèces et du changement climatique. Il est important danalyser les facteurs de la dégradation de la biosphère, de faire un diagnostic des dégradations dans une démarche conservatoire.
5) Prérequis :
Bases de Biologie et décologie enseignées en L1 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301014660 Travail personnel2010102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
A Cours
Les grands problèmes planétaires (changements globaux, désertification, déforestation, érosion
) en liaison avec des aspects biogéographiques. Flux dénergie (14h)
Cycle de leau et risques
Cycle du carbone et effet de serre
Cycle de l Azote et du Phosphore ( fertilisation, eutrophisation)
Dynamique de la Biodiversité (12h)
Les aspects biogéographiques
Le fonctionnement des écosystèmes
La biologie de la conservation
B TD
Cycles des nutriments et traitements de leau (2h)
Changements globaux et gaz à effet de serre (production, stockage et relargage de lAzote et du Carbone) (2h)
Cartographie appliquée aux problèmes de la désertification et des crues
Ressources forestières et déforestation (biomasse et productivité) (4h)
C TP
Sortie « Station dépuration » (2h)
Processus biologiques et traitement de leau (3h)
Biodiversité, gestion des espèces rares et cadre juridique (6h)
Paléoécologie et changement climatique (3h)
8) Bibliographie :
Ramade, 1995 : Eléments dEcologie appliquée ; FAO UNESCO, 1994 : Stratégie mondiale de la biodiversité
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Sol, eau, climat
Numéro de lUE : BIO 409
Intitulé de l' U E : Sol , eau, climat
Responsable(s) : Daniel Cluzeau et Françoise Forgeard
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie animale et Ecologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie, mention biologie des organismes
2) Parcours : 2ème année de la licence
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs :
Comprendre et analyser le rôle des facteurs abiotiques dans le fonctionnement des écosystèmes.
Mettre en relation les caractéristiques des sols et du climat avec la répartition et le fonctionnement des organismes vivants.
5) Prérequis : UE bases de lécologie (S2) Ecologie 1 (S3) ou niveau équivalent
Chimie et Physique de lEnvironnement 1 (S3) ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301014660 Travail personnel30151560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS ( 30h)
Pédologie : origine, pédogénèse, propriétés physiques, chimiques et biologiques des sols, typologie des sols et des humus
Climatologie : les échelles en climatologie, les facteurs climatiques, les grands types de climat, lévolution des climats
Relation facteurs du milieu et organismes (édaphologie) : relations naturelles sol-climat-végétation-humus (interactions entre les MOS, le pédoclimat et les activités biologiques).
Hydrobiologie (dynamique, fonctionnement)
TD (10h)
Méthodes d analyses en pédologie - Interprétation des données pédologiques
Etude des cartes climatologiques - Analyse des indices climatiques
Analyse dexemples de relations sol - végétation
Réservoirs et lacs: stratification, production primaire, eutrophisation
Les fleuves: hétérogénéité et fonctionnement
TP et excursion (30h)
Méthodes de description et danalyse des sols
Méthodes de description des relations naturelles sol-eau-climat-végétation-humus
Sortie : "sols peu anthropisés sur granit et sur schiste"
Exploitation des données de la sortie (typologie des sols, toposéquences, phytoécologie
Un système aquatique lentique : gradient de la bordure à la zone pellagique
Un systèmes aquatique lotique : du chenal à la ripisylve, habitats, faune et flore
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 5 : Répartition des populations et des communautés
Numéro de lUE : BIO 520
Intitulé de l' U E : Répartition des populations et des communautés
Responsable(s) : B. Clément et F. Ysnel
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale et Ecologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie, mention Biologie des Organismes (Obligatoire)
2) Parcours : 3ème année
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Comprendre les mécanismes de réponse des organismes, des populations et des communautés biologiques aux contraintes environnementales et aux changements globaux (changements climatiques et dutilisation des terres)
5) Prérequis : UE de systématique et décologie ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel201062460Travail personnel1212122460
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structure et organisation spatiale des organismes et des populations à différentes échelles géographiques, du site au biome.
Hétérogénéité des systèmes étiologiques ; flux es organismes et des propagules ; modes de dispersion et conséquences pour la gestion des habitats et des paysages
Structure et dynamique des écosystèmes ; gradients et écoclines ; successions écologiques ; phytosociologie et groupes écologiques.
Applications à la biologie de la conservation
TD : méthodes déchantillonnage en écologie et traitements des données.
TP et stages :
analyses spatio-temporelles :
contraintes en zone inter-tidale
contraintes en zone palustre
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite deffectif
S 5 : Bases Ecologiques de la Production Végétale
Numéro de lUE : BIO 521
Intitulé de l' U E : Bases Ecologiques de la Production Végétale
Responsable(s) : F. ROZE
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie
Licence de Biologie mention biologie des Organismes
2) Parcours : L3 pour les spécialités Sciences végétales et Biologie appliquée LBCMP et pour la LBO
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Il est de plus en plus essentiel de situer les différentes productions dans un contexte environnemental. Les notions de conservation des sols et des paysages seront abordées en relation avec les facteurs écologiques de production (qualité de la production, fertilité et durabilité). A léchelle du paysage, les interactions agrosystème-paysage seront détaillées. Un travail sur les méthodes danalyse, dévaluation et de conservation sera effectué de manière théorique et pratique.
5) Prérequis : UE d écologie en S4
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel251019660Travail personnel2010102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
A Cours
Biomasse, production et productivité et facteurs de production (6h)
Contrôle des facteurs de production, qualité de la production, fertilité, développement durable (7h)
Interactions agrosystèmes et paysages et indice de qualité des paysages (7h)
Lutte biologique (5h)
B- TD
Réhabilitation des sols agricoles (2h)
Fonction de protection et production de sols (2h)
Facteurs de production (2h)
Désertification (2h)
Contrôle des facteurs de production (2h)
C TP
Sortie : un paysage rural (6h)
Analyse de la structure et de la dynamique dun paysage (agro-sylvo-pastoral) (3h)
Dégradation restauration des sols (amélioration des humus) (3h)
Biomasse et productivité (3h)
Evaluation des paysages et rôle de la biodiversité (analyse comparative) (4h)
Enrichissement organique des sols (3h)
8) Bibliographie :
Soltner 1987 : Les bases de la production végétale ; Gobat et al., 1995 : Le sol vivant ; Alard et al., 2002 : A le recherche dune agriculture durable
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire X
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Ecologie Générale
Numéro de lUE : BIO 615
Intitulé de l' U E : Ecologie générale
Responsable(s) : Françoise Rozé
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale et Ecologie animale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours : 3ème année de la licence
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs : Préparer aux concours de lenseignement secondaire et au métier denseignant. Les supports théoriques seront complétés par des excusions et stages de terrain
5) Prérequis : bases de lécologie ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2283060Travail personnel2283060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours 24h
Analyse des populations (tables de survie, paramètres, dérives , équation de Euler-Lotka, dynamique des pop modèles à 1espèce en temps continu et en temps discret et modèles à deux espèces )
Relations trophiques dans les biocénoses, compétition, modèle prédateur proie
Flux dénergie, cycles de leau, du carbone et de lazote
Le sol et ses composants
Analyse des communautés : concepts de niche écologique, partage des ressources, traits dhistoire de vie, groupes écologiques, espèce clé, attributs vitaux, capital biologique, bio-geographie( les grands biomes), biodiversité
.
La succession écologique
TD 6h
Flux de matière dans un écosystème
Interactions durables entre le sol et la végétation
La dune (écosystème paysage et succession : différentiation spatiale)
Stage décologie végétale 2,5 j à Paimpont :
Colonisation, et succession en suivant la relation végétation sol sur un transect analyse des contraintes écologiques.
Lhomme et les landes.
Le sol et la végétation dans les écosystèmes forestiers.
Zonations de bordure détang
2,5 J décologie animale
8) Bibliographie :
Barbault
Fischesser
Gobat
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Initiation à la pratique du diagnostic écologique
Numéro de lUE : BIO 616
Intitulé de l' U E : Initiation à la pratique du diagnostic écologique
Responsable(s) : Agnès Schermann, Bernard Clément et André-Jean Francez,
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie végétale, Biologie et écologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biologie, mention biologie des organismes
2) Parcours : 3ème année des licences
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs :
Beaucoup doffres de stages et demplois potentiels ( bureau détude en environnement ) concernent lapplication des normes européennes (habitat Natura 2000,
) nécessitent des compétences pratiques en vue détudes de terrain (flore, faune, milieu ). Lobjectif de cette UE est de former les étudiants à ces pratiques de terrain et à poser un diagnostic à partir des informations recueillies sur le terrain.
5) Prérequis : Ecologie 2 (S4), Sol-Eau-Climat (S4) ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel416162460 Travail personnel515152560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours (4h)
Cours introductif 2h
Gestion de lenvironnement (législation, Natura 2000, normes, schémas directeurs) 2h
TD (16h)
Techniques de reconnaissance de la diversité du monde vivant 10h
Travaux sur documents (normes et législation sur leau, le sol et la biodiversité) 6h
TP et excursion (40h)
Sortie : Reconnaissance et analyse des végétaux et des animaux (3j) 24h
Analyse des principales adaptations morpho-anatomiques aux conditions du milieu 6h
Notion dindicateurs écologiques 10h
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 32
S 6 : Microbiologie des sols et des eaux
Numéro de lUE : BIO 617
Intitulé de l' U E : Microbiologie des sols et des eaux
Responsable(s) : André-Jean FRANCEZ et Daniel CLUZEAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale et Ecologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Optionnel Licence de biologie mention Biologie des organismes
2) Parcours : Bac +3
Conseillé pour une entrée en master Environnement
3) Semestre 6
4) Objectifs :
Montrer limportance de la diversité des micro-organismes aquatiques et terrestres et leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes (flux de matières). Illustration sur la gestion de la ressource EAU.
5) Prérequis :
Bactériologie générale (S4), Sol Eau Climat (S4), Ecologie 2 (S5) ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel201027360Travail personnel1071030360
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
1 Microorganismes : diversité des fonctions
Dynamique des micro-organismes dans les milieux aquatiques et sédimentaires 6 h
Micro-organismes : types trophiques et habitats;
Dynamique de croissance des populations de micro-organismes;
Facteurs physico-chimiques; compétition pour la ressource
Microorganismes du sol et microhabitats 4h
Stratégies nutritionnelles des microorganismes dans le sol ;
Rôles des principaux groupes de microorganismes dans le sol ;
Facteurs abiotiques et réponse des microorganismes aux facteurs du milieu ;
Quels liens entre aspects taxonomiques, physiologiques et fonctionnels ?
Synthèse : Les groupes trophiques microbiens et les cycles biogéochimiques 4 h
2 - Microbiologie et gestion des risques 6h
Rôle des micro-organismes dans la dégradation et la restauration de la ressource EAU
Les phénomènes de pathogénie : contamination et santé humaine, cyanobactéries toxiques;
Protection de lenvironnement : Lépuration des eaux pour lalimentation humaine
TD
Exercices sur limplication des microorganismes dans le fonctionnement des écosystèmes 4h
Exercices sur les cycles biogéochimiques et les flux 4h
Fonctionnement dune station dépuration et gestion des risques sanitaire 2h
TP
Visite de station dépuration (Excursion) 3h
Les micro-organismes aquatiques: mesures de biomasse et dactivité 3h
Communautés zooplanctoniques 3h
Dynamique des communautés algales dun milieu naturel (bioessais)
et modélisation de cette production primaire 9h
Rôle des micro-organismes dans le fonctionnement des sols (ex : Minéralisation C et N, activité globale et spécifique,
12h
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Le travail personnel comprendra un bilan dexcursion sur le rôle des microorganismes sur le recyclage des eaux.
12) Capacité d'accueil :
S7 : De lindividu à la population et à lécosystème
Numéro de lUE : BIO 719
Intitulé de l' U E : De lindividu à la population et à lécosystème
Responsable(s) : Françoise Rozé
Equipe (s) pédagogiques (s) : Biologie et écologie végétale, Biologie et écologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Droit et Environnement
2) Parcours :
1re année des deux masters
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs : UE introductive aux problématiques du master qui présente les différentes interventions et doit permettre aux enseignants de cadrer les travaux en fonction des différentes origines des étudiants.
5) Prérequis :
bases de lécologie ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel121224Travail personnel6612
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
TD
Individus :les comportements, rappels des buts de léthologie et synthèse.
Population : structure dune population
Ecosystème et paysages : structures et fonctions
TP
Stage de 2 jours ou 2 excursions
-observations comportementales
-étude dune population
-Forêt étang et agrosystèmes
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
________________________________________________________________________
S 7 : Ecologie des communautés et fonctionnement des écosystèmes
Numéro de lUE : BIO 725
Intitulé de l' U E : Ecologie des communautés et fonctionnement des écosystèmes
Responsable(s) : Jan-Bernard Bouzillé
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale ; Ecologie animale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master de recherche Biologie et Environnement mention « Biologie des organismes, des Populations et des Ecosystèmes
Master Professionnel Biologie, Environnement, Santé mention « Environnement »
2) Parcours : 1ère année de Master
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs:
Cette UE sattachera à létude de la structure et de la dynamique des communautés en réponse aux contraintes et perturbations dorigine naturelle ou anthropique. Les mécanismes écologiques intervenant dans la dynamique des communautés et le rôle des espèces dans le fonctionnement des écosystèmes seront développés dans le cadre de la dynamique de la biodiversité.
5) Prérequis :
Conseillé : Ecologie1(S3); Sol, Eau, climat (S4) ; Ecologie2 (S6) ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel26h10h18h6h60 Travail personnel10h6h6h8h30
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
COURS
- Réponses aux perturbations (groupes fonctionnels, hétérogénéité, espèces-clés
). Microperturbations, macroperturbations, variabilité et traits de vie.
-Biodiversité : hypothèses du Temps-Stabilité et de la Perturbation dIntensité Moyenne. Approche expérimentale de la biodiversité.
-Rôle des espèces dans le fonctionnement des écosystèmes.
Organismes ingénieurs.
- Les structures des communautés : facteurs abiotiques et interactions biologiques (compétition, relations prédateurs-proies
).
TD
- Groupes fonctionnels et les organismes ingénieurs
- Descripteurs de fonctionnement, attributs vitaux
- Espèces invasives
- Perturbations expérimentales, résistance et résilience
TP
- Sortie pâturage et hétérogénéité
- Analyse des résultats de la sortie : impact des perturbations
- Réponse des sols et des humus aux perturbations
- Indices biologiques et groupes fonctionnels en eau douce
- Groupes de réponses, traits de vie.
8) Bibliographie :
Ecologie : de lécosystème à la biosphère . Lévèque (Dunot)
Ecosystèmes : structure, fonctionnement, évolution ; Frontier, Pichod-viale (Masson)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Ecologie du Paysage
Numéro de lUE : BIO 812
Intitulé de l' U E : Ecologie du Paysage
Responsable(s) : Pierre MARMONIER
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie animale et Ecologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) de Recherche Biologie et Environnement,
mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours : Master 1ère année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs: Spécialisation en Ecologie du Paysage, analyse des systèmes hétérogènes et des paysages, dynamique et régulation des flux de nutriments et d'organismes.
5) Prérequis : Licence de Biologie des Organismes
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel25 h10 h25 h60Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Cours : Hétérogénéité et structuration spatiale des paysages, variabilité temporelle et échelles de perception, rôle des activités humaines dans la dynamique des paysages, relation populations paysage
Travaux Dirigés : Analyse des paysages (du terrain à la cartographie), connectivité et fragmentation, systèmes arborescents (exemple des grands fleuves), flux de gènes et d'individus
Travaux Pratiques : analyse des relations entre zone agricole et zone humide (sortie de terrain), le bocage (sortie sur le terrain), rôle des interfaces et des écotones (exemple d'un cours d'eau).
8) Bibliographie : Ecologie du Paysage (2001) Burel & Baudry.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnelle (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE :
Enseignements sous forme de cours, TD et TP ainsi que deux sorties d'échantillonnage sur le terrain (zone agricole-zone humide et bocage). Notation basée sur un travail de groupe (3 à 5 étudiants) de rédaction d'un rapport sous la forme d'un article scientifique.
12) Capacité d'accueil : sans limitation
S 8 : Ecologie aquatique
Numéro de lUE : BIO 813
Intitulé de l' U E : Ecologie aquatique
Responsable(s) : Yvan LAGADEUC
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie animale et végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours : 1ère année master
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs :
Acquisition de connaissances théoriques sur le fonctionnement des milieux aquatiques.
5) Prérequis : Modules décologie et de chimie et de physique de lenvironnement ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24102660 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Les enseignement magistraux seront organisés autour de concepts clés du fonctionnement des écosystèmes aquatiques :
Le contrôle physique dans les écosystèmes aquatiques (énergie auxiliaire et ergocline)
La boucle microbienne en systèmes aquatiques et le recyclage de la matière
Relation top-down et bottom-up
Continuité et discontinuité en système courant
Le spiralling concept
Eutrophisation
TD
Méthodes de mesures de biomasse et de production
Les indices de qualité
Les modèles décosystème aquatique
Mise en place des stratégies déchantillonnage et interprétations des données issus des sorties
Travaux Pratiques
Sortie : rivière, lac, bordure tourbeuse. Ces séances seront basés sur des analyses de terrain permettant de mettre en uvre les concepts introduits en cours. Elles feront largement appel aux initiatives des étudiants.
Analyses des caractéristiques chimiques de l'eau (nutriments)
Analyse des caractéristiques biotiques des eaux du lac (plancton, chlorophylle, production primaire)
Analyse des communautés de la rivière (benthos, périphyton, activités microbiennes hétérotrophes)
Les communautés de la zone tourbeuse (micro-organismes, respiration, activité microbiennes)
Modélisation en systèmes aquatiques
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
Les UE qui sont pas dans des listes doptions mais peuvent être proposées en UE libres apparaîtront ici en optionnel.
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Ecologie et Ethologie
Numéro de lUE : BIO 814
Intitulé de l' U E : Ecologie et Ethologie
Responsable(s) :Marie Annick Richard, Françoise Rozé
Equipe(s) pédagogique(s) :Ethologie, Ecologie végétale et Ecologie animale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Maîtrise Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours : bac+4
3) Semestre n° S8
4) Objectifs :
Préparation aux concours de lenseignement et au métier de professeur.
Cet enseignement donne les bases théoriques, il sappuie également sur une connaissance des milieux naturels sur le terrain.
5) Prérequis : Bases en écologie, écologie ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24822660 Travail personnel3081260
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Facteurs environnementaux abiotiques, psychologiques et reproduction 4h
Socialité et évolution des structures sociales 4h
Développement des comportements (expérience, maturation, empreinte) 4h
Ecophysiologie, réponse aux contraintes et stratégies adaptatives 3h
Ecologie évolutive (notion de trait dhistoire de vie, génétique quantitative et sélection naturelle) 3h
Ecologie des perturbations et biologie de la conservation ( concepts de résistance résilience et tolérance, invasions biologiques) 3h
Biodiversité et gestion durable 3h
TD
Méthodes dévaluation et de quantification des comportements 4h
Les invasions biologiques 2h
Les écosystèmes et le feu 2h
TP 22h
Construction de répertoires dans le cadre de comportements sociaux et parentaux
Analyse de processus (mobilité embryonnaire, apprentissages)
Comparaison dun agrosystème et de la forêt
Cartographie et analyse de la dynamique de la végétation (à partir de la sortie sur le terrain)
Excursion
De lagrosystème à la forêt tempérée anthropisation des écosystèmes et des paysages 6h
8) Bibliographie :
Ramade
Barbault
Fischesser
Gobat
9) Coefficient 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil
S 8 : Ecologie Microbienne
Numéro de lUE : BIO 815
Intitulé de l' U E : Ecologie microbienne
Responsable(s) : Daniel CLUZEAU et André-Jean FRANCEZ
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie animale et Ecologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) de Recherche Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
et Master 1 (maîtrise) Professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement
2) Parcours : Bac +4
3) Semestre 8
4) Objectifs :
Maitriser les concepts de lécologie microbienne. Comprendre les implications des micro-organismes aquatiques et terrestres dans les flux de matières et appréhender les phénomènes dinteraction et de transfert intégrant la dimension spatio temporelle des processus sous jacents.
Illustrer ces concepts par le recyclage des déchets et la bioremédiation des sols contaminés par des xénobiotiques.
5) Prérequis :
Microbiologie des eaux et des sols, Chimie et Physique de lEnvironnement 2 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20103060 Travail personnel1010202060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Introduction : Histoire et concepts de lécologie microbienne 2h
Biodiversité microbienne fonctionnelle 2h
Rôles des interactions microbiennes au sein des sphères dactivités préférentielles du sol, laggrégatosphère, la rhizosphère, la drilosphère, la détritosphère 6h
Rôles des interactions microbiennes dans les émissions de gaz à effet de serre (processus aérobie vs anaérobie dans les cycles C, N) 4h
Illustrations :
Compostage et gestion des matières déchettaires (rôles de la microflore dans les processus de compostage ; devenir des microorganismes pathogènes,
) 3 h
Bioremédiation des sols contaminés par des composés organiques naturels et xénobiotiques
3 h
TD
Interactions micro-organismes / aggrégatosphère et drilosphère 2h
Les champignons décomposeurs (ex. dinteractions au sein de la détritosphère) 4h
Lécologie microbienne au service de la gestion des risques environnementaux 4h
TP
Techniques danalyse de la diversité et activités spécifiques microbiennes 6h
Méthodes détude des interactions microbiennes en milieux aquatiques 6h
Méthodes détude des interactions microbiennes à linterface eau/sol 6h
Méthodes détude des interactions microbiennes dans le sol (rhizosphère,...) 6h
Restitutions sous forme dexposés 6h
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Le travail personnel et par petits groupes comprendra la rédaction de rapports (approches fondamentale, méthodologique et appliquée) et la préparation de la restitution orale associée.
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Ecologie de la Restauration
Numéro de lUE : BIO 816
Intitulé de l' U E : Ecologie de la Restauration
Responsable(s) : F. ROZE
Equipe(s) pédagogique(s) : ECOLOGIE VEGETALE
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) recherche 1 en Biologie et Environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
Mention : Sciences végétales fondamentales
Master 1 (maîtrise) professionnel en Sciences agronomiques et agroalimentaires
Mention : Sciences et productions végétales
Master Biologie, Environnemnt, Santé mention Droit et Environnement
Parcours : M1 recherche ou M1 professionnel (domaine végétal)
3) Semestre n° 8
4) Objectifs :
Prérequis : Enseignements décologie en L2 et L3 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2662860Travail personnel2662860
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Contextes juridiques, acteurs, concepts, les systèmes de références, restauration naturelle et restauration par lhomme
Restauration de bassins versants
Restauration de zones humides, utilisation de pâturage
Restauration des cours deau
Restauration dhabitats littoraux ( dunes, falaises, landes)
TD
Recréation de landes
Espèces invasives
Biorémédiation
TP
Stage de terrain
Natura 2000, Sortie de cartographie
Utilisation des SIG pour la gestion des bassins versants
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 9 : Approche intégrée de terrain
Numéro de lUE : BIO 915
Intitulé de l' U E : Approche intégrée de terrain
Responsable(s) : Jan-Bernard Bouzillé
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie végétale ; Biologie et écologie animale ; Géosciences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement . « Gestion intégrée des bassins versants »
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
Cette UE consistera en un stage pluridisciplinaire de 5 jours au cours duquel les étudiants mettront en uvre sur le terrain les méthodes et les techniques danalyse et dévaluation présentées dans les différentes UE du semestre.
5) Prérequis : UE de S9
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30h30hTravail personnel15h15h
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Analyse de la structure dun paysage
Réalisation de divers diagnostics (phyto-écologiques, pédo-biologiques, hydrobiologiques
) et interprétation des résultats
Gestion des rejets dans le sol et l'eau
- décontamination des sols pollués
- stockage de déchets
- bioremédiation
Utilisation du SIG
Synthèse dans le cadre de la mise en uvre dune gestion intégrée
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Stage de terrain
12) Capacité d'accueil : 15 à 20 étudiants
S 9 : Pollution Remédiation.
Numéro de lUE : BIO 901
Intitulé de l' U E : Pollution Remédiation
Responsable(s) : Davranche M. et Le Rouzic B.
Equipe(s) pédagogique(s) : Geosciences/Ecobio
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement : « Gestion et restauration des bassins versants »
2) Parcours : Master 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
Décrire les phénomènes mise en jeu dans les processus de pollution des différents compartiments de lenvironnement.
Appréhender les principales atteintes qualitatives des écosystèmes
Décrire les méthodes détudes des phénomènes
Maîtriser et résoudre les impacts des pollutions
5) Prérequis :
Master 1 biologie des organismes, des population et des écosystèmes ou équivalent
Master 1 Pro Environnement conseillé
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel14 h10 h0 h24Travail personnel6612
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
ContenuVolumeEquipe
PédagogiqueCoursPollutions :
Types : diffuse, ponctuelles, accidentelles, Mécanismes de mobilité
Cibles : eau, sédiments, sols
Sources :
Inorganique, organique
Biologique
7Geosciences/EcobioRemèdiation :
Autoépuration
Méthodes de remediation :
physique,
chimique,
bioremediation,
Applicabilité et choix
Conception de sites contrôlés7Geosciences/EcobioTD:Etudes de cas Décharges : Déchets ménagers
Déchets industriels
2
2GeosciencesSites miniers2GeosciencesEutrophisation, pollution biologique4Ecobio
8) Bibliographie :
Appelo C. A. J. , Postma D. (1999) Geochemistry, groundwater and pollution. Balkema
Bededient P. B., Rifai H. S., Newell C. J. (1999) Groundwater contaminant : transport and remediation, Prentice Hall.
Hamby, D. M. (1996) Site remediation techniques supporting environnemental restoration activities, a review, The Science of the Total environment, 191, 203-224.
Lecomte P. (1998) Les sites pollués : traitements des sols et des eaux souterraines, Technique et Documentation.
HYPERLINK "http://www.lavoisier.fr/fr/livres/detail.asp?texte=3779&action=new&select=auteur" LEHR J., HYPERLINK "http://www.lavoisier.fr/fr/livres/detail.asp?texte=3780&action=new&select=auteur" HYMAN M., HYPERLINK "http://www.lavoisier.fr/fr/livres/detail.asp?texte=3781&action=new&select=auteur" GASS T., HYPERLINK "http://www.lavoisier.fr/fr/livres/detail.asp?texte=3782&action=new&select=auteur" SEEVERS W. J. (2001) Handbook of complex environmental remediation problems, McGraw Hill.
Liu D. H. F., Liptak B. G., Bouis P. A. (2000) Groundwater and surface water pollution, CRC press.
Nordstrom D. K., Alpers C. N. (1999) Geochemistry of acid mine waters. In the environnemental geochemistry of Mineral Deposits. Rev. Econ. Geol., 6A, Soc. Econ. Geol., Littleton, CO.
Valdes J. J. (2000) Bioremediation, Kluwer.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) : La partie pratique de cette UE pourra être réalisée en relation avec les UE Projets tutorés et Approche Intégrée de terrain.
12) Capacité d'accueil : 15-20 étudiants
S 9 : Hydrogéologie de terrain : du réservoir à lexploitation
Numéro de lUE : BIO 911
Intitulé de l' U E : Hydrogéologie de terrain : du réservoir à lexploitation
Responsable(s) : C. Tarits et Y. Quété
Equipe(s) pédagogique(s) : C. Tarits (Domaines Océanqiues-UBO), Y. Quété, L. Aquilina (Géosciences), J. Molénat (INRA-SAS)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement
"Gestion Intégrée des Bassins Versants"
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
Aborder les méthodes de lhydrogéologie et lhydrochimie pour la caractérisation des ressources en eau
5) Prérequis : Hydrogéologie et hydrochimie conseillés
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel8 h6 h9 h24Travail personnel1616
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
ContenuVolumeEquipe
pédagogiqueCoursLa notion de réservoir2TaritsCaractérisation des réservoirs et propriétés hydrauliques2QuétéInteractions ressources en eau et ressources minérales2BallèvreInteraction entre ressources en eau et activités biologiques2TaritsTDExploitation des ressources : recharge et bilans3QuétéBiogéochimie des milieux à faible perméabilité (zones humides) 3AquilinaBilans hydrochimiques à léchelle des bassins versants3TaritsTPCaractérisation hydrologique Essais de pompages3QuétéCaractérisation hydrologique Débits3QuétéCaractérisation hydrochimique3Tarits
8) Bibliographie :
Hydrogéologie Quantitative De Marsily Ed Dunod
Leau dans lespace rural Neveau Ed INRA
Leau tomes I et II Grosclaude Ed INRA
Vie microbienne et production végétale Davet Ed INRA
Agriculture intensive et qualité des eaux Cheverry Ed INRA
Introduction à la Géochimie et ses applications Hagemann & Treuil - Ed CNRS
Géologie de lenvironnement Tarits Ed Dunod
Lenvironnement et France IFEN
Biogeochemistry of small catchments Moldan & Cerny Ed Wiley
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire X
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : non limité
S 9 : Systèmes d'information géographique
Numéro de lUE : BIO 902
Intitulé de l' U E : Systèmes d'information géographique
Responsable(s) : Alain BELLIDO & Yves QUETE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie animale et SPM
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Professionnel Biologie, Environnement, Santé, Mention Environnement Spécialité "Gestion Intégrée des Bassins Versants"et spécialité Droit et Environnement
2) Parcours : Master 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs: Acquisitions de compétences pratiques dans les systèmes de gestion de données géoréférencées.
5) Prérequis : Conseillé S8 : UE "Analyses spatiales" ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel6 h0 h18h24Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Cours
Méthodes de cartographie et d'analyses spatiales
Présentation dune approche-projet dans la mise en uvre dun SIG
TP
Distribution morpho-fonctionnelle des sols et de l'eau 3h
Méthodes de cartographie diagnostic 3h
Analyse d'images aériennes 3h
Réalisation d'un projet SIG sur l'analyse d'un bassin versant, 9h
en relation avec l'UE " Gestion de l'environnement à l'échelle des paysages
ou/et lUE «Evaluation de la qualité des Ecosystèmes»
ou/et lUE « Restauration des écosystèmes»
(ex. de diagnostic sur la relation agriculture-environnement)
8) Bibliographie.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE :
La partie pratique de cette UE sera associée aux contenus des UE "Projet Tutoré" et "Approche Intégrée de Terrain"
12) Capacité d'accueil :
S 9 :Utilisation des ressources des bassins versants (eau et sols
Numéro de lUE : BIO 903
Intitulé de l' U E : Utilisation des ressources des bassins versants (eau et sols)
Responsable(s) : L. Aquilina et D. Cluzeau
Equipe(s) pédagogique(s) :L. Aquilina (Géosciences), D. Cluzeau (Ecobio), C. Walter (INRA-SAS), Y. Quété (Géosciences), S. Bonnet (Géosciences), J. Molénat (INRA-SAS)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement spécialité « Gestion Intégrée des Bassins Versants » et spécialité Droit et Environnement
2) Parcours : 2ème année du master
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
Appréhender dans sa globalité le bassin versant en tant que ressource : ses différentes composantes et leur interaction, notamment en matière de flux.
5) Prérequis :
Master 1 Pro Environnement ou équivalent conseillé
Pédologie et hydrologie, notions de géologie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel10 h4 h9 h24Travail personnel1212
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
ContenuVolumeEquipe
pédagogiqueCoursLes différentes unités des bassins versants2AquilinaLes différentes unités du sol des bassins versants et leurs fonctions2CluzeauLa formation et les propriétés des altérites2AquilinaRôle de la macrofaune dans les transferts2CluzeauRessources utilisables du sol2WalterTDRessources utilisables en eau (solutions de surface et solutions souterraines)2AquilinaLes différentes unités du sol des bassins versants et leurs fonctions2CluzeauTPUnités géomorphologiques et fonctionnelles3Bonnet-MolénatProtection de la ressource en eau3QuétéProtection de la ressource en sols3Walter
8) Bibliographie :
Leau dans lespace rural Neveau Ed INRA
Leau tomes I et II Grosclaude Ed INRA
Vie microbienne et production végétale Davet Ed INRA
Agriculture intensive et qualité des eaux Cheverry Ed INRA
Introduction à la Géochimie et ses applications Hagemann & Treuil - Ed CNRS
Géologie de lenvironnement Tarits Ed Dunod
Lenvironnement et France IFEN
Biogeochemistry of small catchments Moldan & Cerny Ed Wiley
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire X
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Une partie pratique de cette UE pourra être réalisée en relation avec les UE "Projet Tutoré" et "Approche Intégrée de Terrain"
12) Capacité d'accueil : 15 à 20 étudiants
S 9 : Restauration des écosystèmes
Numéro de lUE : BIO 904
Intitulé de l' U E :Restauration des écosystèmes
Responsable(s) : Françoise Rozé
Equipe(s) pédagogique(s) :Ecologie végétale et Ecologie animale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention environnement « Gestion intégrée des Bassins Versants »
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs :
Grâce à de nombreuses interventions extérieures et à un support théorique orrespondant il est souhaité faire le point sur la restauration des écosystèmes et la réintégration des paysages tant du point de vue des trajectoires choisies que de la faisabilité et des techniques en usage.
Le travail sera organisé autour de travaux sur le terrain avec des gestionnaires despaces plus ou moins anthropisés.
5) Prérequis : Ecologie de la restauration conseillé ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel14h10h 24Travail personnel8h8h16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
COURS
Les concepts de lécologie de la restauration : restauration des habitats, gestion des espèces, réintégration des paysages
Les différents contextes de restauration (des politiques locales aux politiques mondiales).
Biodiversité et développement durable.
TD
Exemples de restauration de systèmes dégradés (écosystèmes au choix)
Gestion et restauration en régions agricoles ; action des fédérations de pêche.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Participation dintervenants extérieurs : responsables de lONF, conservatoires, DIREN, Projet Life, grands Sites, Natura 2000.
La partie pratique de cette UE sera réalisée dans le cadre des UE : "Approche Intégrée de Terrain" et "Projet Tutoré"
12) Capacité d'accueil : 15 à 20 étudiants
S 9 : Gestion de l'environnement à l'échelle des paysages.
Numéro de lUE : BIO 905
Intitulé de l' U E : Gestion de l'environnement à l'échelle des paysages
Responsable(s) : Pierre MARMONIER et Luc AQUILINA
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie animale, Ecologie végétale, Géosciences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Environnement
"Gestion Intégrée des Bassins Versants"
2) Parcours : Master 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
Acquisitions de compétences pratiques en Ecologie du Paysage, évaluation, gestion et restauration des systèmes complexes.
5) Prérequis :
Master 1 de Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes ou équivalent conseillé
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel14 h10 h24Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Cours : Structures spatiales, hétérogénéité, fragmentation, connexions. Liens paysages et activités agricoles. Structures linéaires, flux de nutriments et flux d'espèces.
Travaux Dirigés : Pratiques agricoles et environnement. Diagnostic, analyse et bilan de bassins versants.
8) Bibliographie : Ecologie du Paysage (2001) Burel & Baudry.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE :
Enseignements sous forme de cours et de conférences de professionnels de la gestion des bassins versants (animateurs de bassins, Conseil Supérieur de la Pêche, ONF)
La partie pratique de cette UE sera réalisée au sein des UE "Systèmes d'Information Géographique", "Projet Tutoré" et "Approche Intégrée de Terrain"
12) Capacité d'accueil : de 15 à 20 étudiants S 9 : Evaluation de la qualité des écosystèmes
Numéro de lUE : BIO 906
Intitulé de l' U E : Evaluation de la qualité des écosystèmes
Responsable(s) : Jan-Bernard Bouzillé
Equipe(s) pédagogique(s) : Ecologie végétale ; Ecologie animale
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention « Environnement ». Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : S9
4) Objectifs:
Lobjectif de cette UE est la possession et la pratique dune large gamme doutils et de techniques dévaluation des qualités du milieu et des communautés dorganismes qui sy développent. Savoir évaluer la valeur patrimoniale des espèces et des habitats et développer une politique de la conservation. Savoir replacer le système à gérer dans une typologie afin de pouvoir établir des diagnostics de sa sensibilité, de sa vulnérabilité, de son état actuel et de sa possible évolution.
5) Prérequis :
Ecologie1(S3); Sol, Eau, Climat (S4) ; Ecologie2 (S6) ; Ecologie des communautés et fonctionnement des écosystèmes (S7).
Master 1 biologie des organismes, des population et des écosystèmes
Master 1 Pro Environnement
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel14h10h24Travail personnel8h8h16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
COURS
Evaluer des systèmes écologiques : bases théoriques (indicateurs, descripteurs, indices, grilles de qualité et échelles).
Typologie des systèmes et des habitats, successions et évolution des écosystèmes.
Méthodologies dévaluation : stratégies déchantillonnage et traitement des données.
TD
Interprétation détudes de qualité et de diagnostics
Diagnostics phyto-écologiques (forêts, landes, prairies
)
Indicateurs de qualité des sols
Diagnostics fonctionnels sur les haies
Diagnostic en zones humides (continentales et littorales)
Les indices de la qualité des eaux
8) Bibliographie :
Ecologie : de lécosystème à la biosphère . Lévèque (Dunot)
Ecosystèmes : structure, fonctionnement, évolution ; Frontier, Pichod-viale (Masson)
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La partie pratique de cette UE sera réalisée dans le cadre des UE : Approche Intégrée de Terrain et Projet Tutoré
12) Capacité d'accueil : 15à 20 étudiants
S 9 : Projet tutoré pluri-disciplianire.
Numéro de lUE : BIO 915
Intitulé de l' U E : Projet tutoré pluri-disciplianire
Responsable(s) : Jan-Bernard Bouzillé
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et écologie végétale ; Biologie et écologie animale ; Géosciences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Environnement :Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : 2éme année
3) Semestre n° : 10
4) Objectifs:
Les étudiants auront à mener à bien une étude complète de gestion de lenvironnement émanant dune entreprise ou dun organisme. Ce projet aura pour objectif de permettre aux étudiants dappréhender la nature fondamentalement pluri-disciplinaire dune gestion intégrée des écosystèmes.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentielTravail personnel40h40h
Crédit total de lUE : 7 ?
7) Programme des enseignements:
Recherche et choix du projet, recherche de documentations administratives, juridiques et techniques.
Suivi pluri-disciplinaire
Rendus réguliers de létat davancement du projet et rendu final
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3 ?
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les stages en milieu professionnel se dérouleront au second semestre, ils auront une durée de 5 mois, de Mars à Juillet. Ils donneront lieu à la rédaction d'un mémoire écrit et à une présentation orale résumant le travail exécuté. Des soutenances pourront également être réalisées en Septembre dans le cas où le stagiaire n'aurait pu mener à bien son rapport écrit pour le mois de Juin.
12) Capacité d'accueil : 15 à 20 étudiants
( Ethologie
S 4 : L'animal et son milieu :
comportement alimentaire, positionnement dans le temps et dans l'espace.
Numéro de lUE : BIO 410
Intitulé de l' U E : L'animal et son milieu : comportement alimentaire, positionnement dans le temps et dans l'espace.
Responsable(s) : Catherine Blois-Heulin et Sophie Lumineau
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie :
obligatoire mention Biologie des Organismes
2) Parcours : 2e année
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs :
Cette unité d'enseignement doit permettre à l'étudiant de comprendre au mieux les relations entre l'organisme et son milieu. On insistera plus particulièrement sur l'organisation spatiale et temporelle des activités de l'individu et sur l'analyse de son comportement alimentaire.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel30102060 Travail personnel30102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Comportement alimentaire : ontogenèse, déterminismes et fonctions (10h)
Lindividu et le temps : les rythmes biologiques des comportements (8h)
Lindividu et lespace : lorientation et les migrations animale (12h)
TD
Illustrations du cours
Analyse des résultats des travaux pratiques
TP
Comportement alimentaire chez les oiseaux (4h)
- Influence de la nouveauté sur le choix alimentaire et loccupation de lespace chez la souris (4h)
- Influence de la répartition des proies sur les comportements de recherche alimentaire (4h)
Organisation temporelle des comportements et synchronisation dans un groupe de cailleteaux (4h)
- Orientation et déplacement chez lasticot en fonction de facteurs abiotiques (4h)
8) Bibliographie :
- Les rythmes du vivant (J. Boissin et B. Carguilhem) Ed. Nathan - Paris - 1998.
- Ethologie. Approche systémique du comportement (R. Campan et F. Scapini) Ed. DeBoeck Université - 2002.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Organisation des TP en TP tournants
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 5 : Chronobiologie et pharmacologie
Numéro de lUE : BIO 522
Intitulé de l' U E : Chronobiologie et pharmacologie
Responsable(s) : Sophie Lumineau et Hugo Cousillas
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie : mention Biologie des organismes
2) Parcours : 3ème année
3) Semestre n° : S5
4) Objectifs :
Cette unité d'enseignement a pour objectif de donner à l'étudiant des bases de psychopharmacologie expérimentale et de chronobiologie ouvrant ainsi sur deux domaines d'applications des connaissances en éthologie.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3062460 Travail personnel30102060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Les rythmes circadiens, ultradiens, infradiens les horloges biologiques (5h)
Le cycle veille / sommeil (4h)
La chronobiologie appliquée (6h)
La neurotransmission (5h)
Dopamine, sérotonine, acétylcholine et comportements (5h)
Psychopharmacalogie expérimentale : modèles animaux et comportements (5h)
TD (6h)
Les TD illustreront par des exercices et applications (travaux sur documents) les cours de psychopharmacologie et de chronobiologie.
TP (24h)
- Notion de barrière hémato-encéphalique
- Traitement pharmacologique et comportement chez un rongeur dans un labyrinthe en croix surélevé.
- Médiateurs et structures nerveuses impliqués dans le comportement de fuite chez la blatte.
- Modèle éco-éthologique de lanxiété chez un rongeur.
- Rythme ultradien
- Rythme circadien
- Désorganisation du rythme suite à un stress
8) Bibliographie :
- Pharmacologie intégrée (C.P. Page, M.J. Curtis, M.C. Sutter, M.J. Walker et B.B. Hoffman) - Ed. DeBoeck - 1999.
- Le sommeil humain. Bases expérimentales, physiologiques et physiopathologiques. (O. Beroit et J. Foret) - Ed. Masson
Une bibliographie actualisée sera conseillée aux étudiants pour certains aspects particuliers.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Certains TP seront obligatoires ; d'autres au choix
Travail personnel sur analyses d'articles
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 6 : Bases biologiques de la régulation des comportements interactifs
Numéro de lUE : BIO 618
Intitulé de l' U E : Bases biologiques de la régulation des comportements interactifs
Responsable(s) : Marie-Annick Richard
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie mention Biologie des organismes
Mention Biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
2) Parcours : 3ème année pour la licence de biologie (mention biologie des organismes)
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs :
Cette unité d'enseignement a pour objectif d'étudier les déterminismes et les fonctions des comportements utilisés dans le cadre des interactions entre individus de la même espèce (relations intraspécifique, signaux de communication, comportements sexuels, comportements parentaux)
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel221418660 Travail personnel2010201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Les relations intraspécifiques, les structures sociales, l'organisation sociale (6h)
Déterminismes et fonctions des comportements sexuels (6h)
Déterminismes et fonctions des comportements parentaux (10h)
TD (6h)
Présentation générale (1h30)
Déterminisme du sexe et effets organisationnels des hormones (2h30)
Communication mère - jeunes chez les Rongeurs (2h)
Méthodes d'étude des parades sexuelles (1h30)
Préparation des manipulations de terrain (2h30)
Initiation à la construction de protocoles expérimentaux (2h30)
Exploitation des résultats en salle (2h)
TP (24h)
- Hiérarchie et relations sociales (poules) (3h)
- Etude des parades sexuelles (cailles) (3h)
- Etude du comportement parental (souris) (6h)
- Importance des acquisitions individuelles (3h)
- Variabilité individuelle, différences liées au sexe (3h)
- 2 TP au choix (terrain ou labo)
. Le chant des Oiseaux : communication - territorialité (3h)
. Comportement sexuel chez les Blattes (3h)
. Fonctionnement de groupes sociaux structurés (3h)
. Choix du site de ponte chez quelques insectes (3h)
8) Bibliographie :
- Reproduction chez les Mammifères et l'Homme (C. Thibault et M.C. Levasseur) - INRA Ellipse 1991
- Encyclopaedia Universalis (article Sociétés animales)
Une bibliographie actualisée sera conseillée aux étudiants pour certains aspects particuliers.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (2 parmi les 3)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
TP tournants au laboratoire et TP au choix (terrain et labo). Ces travaux pratiques permettent à l'étudiant d'observer, de quantifier et d'analyser les comportements. Les séances au choix ont pour objectif de permettre des initiations particulières et un apprentissage à la construction de protocoles expérimentaux.
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 7 : Ethologie
Numéro de lUE : BIO 720
Intitulé de l' U E : Ethologie
Responsable(s) : Marie-Annick Richard et Catherine Blois-Heulin
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et environnement
mention biologie des organismes, des populations et des écosystèmes : obligatoire
2) Parcours : 1ère année du master
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs :
Cette unité d'enseignement a 2 objectifs : 1) permettre à l'étudiant de découvrir quels sont les processus de l'ontogenèse comportementale de l'individu (phase pré et post natale). 2) d'étudier les modes d'organisations sociales en insistant sur l'étude du fonctionnement des sociétés complexes (en particulier chez les insectes).
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel221121660 Travail personnel201025560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
Socialité : De linter-attractivité aux sociétés animales complexes (8h)
Ontogenèse : Embryologie comportementale et ontogenèse postnatale (14h)
TD (11h)
Préparation des TP et du stage
Exploitation des résultats en salle
TP (27h)
- Développement de la motilité embryonnaire
- Reconnaissance de parentèle chez le rat
- Ontogénèse des vocalisations
- Etude de la grégarité chez les Blattes
- Mise en place du comportement de picorage chez le poussin
- Empreinte chez les Oiseaux nidifuges
- Reconnaissance de l'espèce et de la colonie chez les Fourmis
- Affinités sociales chez les Primates
8) Bibliographie :
- Le comportement animal : Développement comportemental, Evolution (R.A. Hinde)
- Ethologie : approche systémique du comportement (R. Campan et F. Scapini) 2002 - De Boeck Université
Une bibliographie actualisée sera conseillée aux étudiants.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Certains TP seront obligatoires, d'autres seront organisés sous formes de mini-stages au choix pour l'étudiant
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 8 : Adaptations éco-éthologiques aux conditions d'élevage
Numéro de lUE : BIO 817
Intitulé de l' U E : Adaptations éco-éthologiques aux conditions d'élevage
Responsable(s) : Marie-Annick Richard
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Biologie et environnement
mention biologie des organismes, des populations et des écosystèmes : optionnelle
2) Parcours : 4e année
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs :
L'objectif de cette unité d'enseignement du second semestre est d'analyser comment les animaux peuvent s'adpater à des conditions crées par l'Homme et de mesurer les limites de ces adaptations. L'UE propose en outre une ouverture au monde économique et législatif (bien-être). Elle prépare à des entrées dans des formations de 3e cycle mais donne également une ouverture possible sur le monde professionnel.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel241218660 Travail personnel2010201060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours
La domestication (4h)
Les contraintes temporelles et spatiales liées aux conditions délevage (7h)
Stress et émotion (neuro-endocrinologie de la réponse au stress ; situations inductrices ; émotivité et facteurs de contrôle) (8h)
Amélioration de l'ajustement aux conditions d'élevage (sélection génétique; exploitation des expériences précoces) (5h)
TD
Notion de bien-être chez l'animal : (4h)
. définitions , méthodes d'appréciation (2,5 h)
. aspect législatif : les normes (1,5 h)
Les contraintes liées aux interactions avec d'autres espèces : l'exemple des Coccidies (1,5h)
Conservation du patrimoine biologique (4h)
Préparation de la sortie (1h)
Exploitation des résultats (1,5)
TP
Mesure de l'émotivité (Oiseaux) (3h)
Qualité de l'environnement (riche/pauvre) et expression de comportements exploratoires (Mammifères) (3h)
Mode d'élevage (isolement / groupement) et comportements sociaux (Mammifères) (3h)
Réponses émotionnelles chez les cailles : influence des variables spécifiques et individuelles (3h)
Les nématodes zooparasites (3h)
Arthropodes parasites nuisibles pour les animaux délevage (3h)
Sortie : gestion et fonctionnement dun zoo (6h)
8) Bibliographie :
L'Ethologie appliquée aujourd'hui (Cl. Baudoin - Editions ED - 2003)
Volume I : Bien-être, élevages et expérimentation
Volume II : Gestion des espèces et des habitats
Une bibliographie actualisée sera conseillée aux étudiants pour certains aspects particuliers.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Organisation d'une sortie avec mise en situation et rédaction d'un rapport.
Possible intervention d'intervenants extérieurs spécialistes des questions traitées.
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
( Agronomie
S7 : Sciences agronomiques 1
Numéro de lUE : BIO 721
Intitulé de l' U E : Sciences agronomiques 1
Responsable(s) :P. Leterme, J.M. Rivière
Equipe(s) pédagogique(s) : Sciences végétales, Sciences du sol, Département statistiques
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche (I) en biologie et environnement, mention Sciences végétales fondamentales
Master professionnel (I) en Sciences agronomiques et agro-alimentaires,
mention Sciences et Productions Végétales.
Parcours : « Filières végétales »
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs : Faire lapprentissage des connaissances de bases en sciences du sol, en écophysiologie et en amélioration génétique des plantes cultivées.
5) Prérequis :
Bases de physiologie et de biologie végétales acquises en L1, L2, L3
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentielA suivre à lENSAde Rennes84hTravail personnel- - --Mini-projet14h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
I Bases scientifiques de létudes des plantes et des peuplements végétaux (28h): les fondements scientifiques de lélaboration de la production végétale.
1 Amélioration des plantes : modelage génétique de la plante cultivée,
Progrès génétiques et enjeux de lamélioration des plantes
Principales méthodes de la sélection variétale
2 Ecophysiologie
Bases théoriques
Notion de modèle Modélisation de la croissance
Exemples dapplication de ces modèles
II Science du sol (28)
1 Morphologie, constitution et organisation des sols
2 Sol et coexistence de 3 phases
3 - Organique de lazote dans le sol
4 Géographie des sols
III Statistiques générales (28h)
Etude dune variable, qualitative ou quantitative : graphiques, indicateurs.
Population et échantillon ; problèmes simples destimation (ponctuelle par intervalle).
Comparaison entre deux moyennes : test de Student.
Comparaison entre plusieurs moyennes (liaison entre une variable quantitative et une variable qualitative) : analyse de variance à un facteur. Modèle. Test global. Test de chaque coefficient.
Analyse de variances à deux facteurs sans répétitions. Plan complet ; modèle croisé. Test global dun facteur. Test de chaque coefficient.
Liaison entre deux variable quantitatives : corrélation, régression simple.
IV Mini-projet
Intervenants J.M. Rivière, C. Walter, A. Jaffrezic, P. Leterme, G. Thomas, D. Poulain, C. Bissuel, J. Pages, D. Causseur, E. Perinel et F. Husson (tous enseignants-chercheurs à lENSA de Rennes
8) Bibliographie : Moyens documentaires de lENSA (Sciences végétales et Sciences du sol)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Tous les enseignements seront dispensés à lENSA, les étudiants universitaires se joignent aux élèves ingénieurs.
12) Capacité d'accueil :
S8 : Sciences agronomiques 2
Numéro de lUE : BIO 821
Intitulé de l' U E : Sciences agronomiques 2
Responsable(s) :C. Bissuel, D. Barloy, D. Poulain
Equipe(s) pédagogique(s) : Sciences végétales(ENSA Rennes),
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche (I) en Biologie et Environnement, Mention : Sciences végétales fondamentales
Master professionnel (I) en Sciences agronomiques et agro-alimentaires,
Mention Sciences et Productions Végétales.
Parcours : « Filières végétales »
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs : Familiariser les étudiants avec les grandes productions végétales françaises, limplication forte du fonctionnement du continuum sol-plante-atmosphère et du progrès génétique dans le mécanisme et le niveau de production. .
5) Prérequis :
Module SA1 (S7)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentielA suivre à lENSAde Rennes84hTravail personnel- - --Mini-projet14h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
I Connaissance des plantes cultivées (28h)
Panorama de la production végétale française : situation actuelle et évolution récente
Les graminées
Céréales (avec un développement sur le blé et le maïs)
Fourrages (avec un développement particulier sur les modes de récolte et de conservation)
Les légumineuses :
A graines (avec un développement particulier sur le pois protéagineux)
Fourrages
Les crucifères (avec un développement particulier sur le colza)
Les autres plantes cultivées (cas particulier du tournesol, de la betterave et de la pomme de terre)
II Eau sol - plante (28h)
- Eau et comportement des sols :
Cohésion et adhésivité
Stabilité et activité structurale
- Eau et disponibilité des éléments dans le sol :
Potentiel de leau, transferts hydriques dans le sol
Transferts de solutés, mobilité et biodisponibilité des éléments minéraux
- Eau et alimentation hydrique des plantes
Evapotranspiration, bilan hydrique
Déficit hydrique
- Eau et agriculture dans le monde
III Biotechnologie végétale (28h)
De nombreuses opérations biologiques réalisées par lhomme pour transformer ou modifier les caractéristiques des plantes représentent les biotechnologies végétales. Ces méthodes faisant appel aux cultures in vitro et aux manipulations génétiques permettent de notables progrès, notamment en amélioration des plantes.
Ce module au choix cherche à intégrer ces biotechnologies tant sur leur présentation théorique que sur linitiation pratique à certaines techniques (culture in vitro) associées à la visite de laboratoires orientés vers les biotechnologies. Les thèmes abordés couvrent la multiplication conforme (micropropagation, régénération, embryogenèse somatique, haploïdie) la création de variabilité génétique nouvelle ( mutagenèses, fusion de protoplastes, transformation génétique..) les outils danalyse de polymorphisme enzymatique et moléculaire et les méthodologies danalyse de la variabilité génétique et de ressources génétiques.
IV Mini-projet
Intervenants : J.M. Rivière, C. Walter, A. Jaffrezic, P. Leterme, G. Thomas, D. Poulain, C. Bissuel, J. Pages, D. Causseur, E. Perinel et F. Husson (tous enseignants-chercheurs à lENSA de Rennes)
8) Bibliographie : Moyens documentaires de lENSA (Sciences végétales et Sciences du sol)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour Master PRO (I)
optionnel ( pour Master recherche (I)
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Tous les enseignements seront dispensés à lENSA, les étudiants universitaires se joignent aux élèves ingénieurs.
12) Capacité d'accueil :
( Master Sciences de la vie et de la terre
S8 : Enseignement pré-professionnalisant
Numéro de lUE :
Intitulé de l' U E : Enseignement préprofessionnalisant aux épreuves écrites et orales des concours Capes et agrégation de SVT.
Responsable(s) : Laurence Poitou et Jacques Bouffette
Equipe(s) pédagogique(s) : toutes
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :master professionnel SVT
2) Parcours : 1ère année de master
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :préparer les étudiants aux épreuves écrites et orales des concours de recrutement capes et agrégation SVTU.
5) Prérequis : licence SVT
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel481260 Travail personnel481260
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Conférences sur les questions dactualité en biologie et géologie du programme de lagrégation (révisées annuellement).
Préparation aux épreuves écrites sous forme de :
- séquences de préparation à la technique de lécrit des concours capes et agrégation.
- écrits blancs pour le capes et les trois secteurs de lagrégation.
C) Préparation aux épreuves orales sous formes de leçons capes, agrégation option et contre-option.
8) Bibliographie :
Réussir le CAPES de Bardinzeff et Le Vot
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue)
12) Capacité d'accueil : 80
S 9 : Tronc commun secteur A :
Biologie et physiologie cellulaires, biologie moléculaire : leur intégration au niveau des organismes
Numéro de lUE : BIO 907
Intitulé de lU E : Tronc commun secteur A : Biologie et physiologie cellulaires, biologie moléculaire ; leur intégration au niveau des organismes
Responsable(s) :Laurence Poitou
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9 et S10
4) Objectifs : Compléter les connaissances du programme général de secteur A
5) Prérequis : master 1 SVT ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel701442126Travail personnel120
Crédit total de lUE : 14
7) Programme des enseignements :
Cf. programme officiel paru au JO N°175 du 31/07/99 : Programme de connaissances générales. Il est réparti en 7 UE de biologie, dont lUE 7 commune aux secteurs A et B. Les titres de ces UE sont indiqués ci-dessous. Les parties du programme qui seront enseignées en master 2 seront complémentaires des enseignements dispensés en licence et master 1 de la filière SVT.
I) M1 La cellule, unité structurale et fonctionnelle du vivant (CM20h, TD 4h, TP 12h)
II) M2 Lorganisme, une société de cellules (CM20h, TD 4h, TP 12h)
III) M3 Lutilisation du vivant et ses biotechnologies (CM20h, TD 4h, TP 12h)
IV) M7 Eléments de biologie et de physiologie dans lespèce humaine (CM10h, TD 2h, TP 6h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 6
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement présentiel se fera sous forme de cours largement illustrés. Des documents polycopiés donneront aux étudiants les éléments de base à lapprofondissement du sujet par une recherche bibliographique personnelle.
12) Capacité d'accueil :
S 9 et 10 : Tronc commun secteur B : Biologie et physiologie des organismes et biologie des populations, en rapport avec le milieu de vie
Numéro de lUE : BIO 908
Intitulé de lU E : Tronc commun secteur B : Biologie et physiologie des organismes et biologie des populations, en rapport avec le milieu de vie
Responsable(s) : Claudia Gérard et Rozène Guesné
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9 et S10
4) Objectifs : Compléter les connaissances du programme général de secteur B
5) Prérequis : master 1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel701442126Travail personnel120
Crédit total de lUE : 14
7) Programme des enseignements :
Cf. programme officiel paru au JO N°175 du 31/07/99 : Programme de connaissances générales. Il est réparti en 7 UE de biologie, dont lUE 7 commune aux secteurs A et B. Les titres de ces UE sont indiqués ci-dessous. Les parties du programme qui seront enseignées en master 2 seront complémentaires des enseignements dispensés en licence et master 1 de la filière SVT.
I) M4 Plans dorganisation du vivant. Phylogénie (CM20h, TD 4h, TP 12h)
II) M5 Lorganisme dans son milieu (CM20h, TD 4h, TP 12h)
III) M6 Biodiversité, écologie, éthologie, évolution (CM20h, TD 4h, TP 12h)
IV) M7 Eléments de biologie et de physiologie dans lespèce humaine (CM10h, TD 2h, TP 6h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 6
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement présentiel se fera sous forme de cours largement illustrés. Des documents polycopiés donneront aux étudiants les éléments de base à lapprofondissement du sujet par une recherche bibliographique personnelle.
12) Capacité d'accueil :
S 9 et 10 : Tronc commun secteur C : Sciences de la Terre et de lUnivers, interactions entre la biosphère et la planète Terre.
Numéro de lUE : BIO 909
Intitulé de l U E : Tronc commun secteur C : Sciences de la Terre et de lUnivers, interactions entre la biosphère et la planète Terre.
Responsable(s) :Jacques Bouffette
Equipe(s) pédagogique(s) : Géologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9 et S10
4) Objectifs : Compléter les connaissances du programme général de secteur C
5) Prérequis : master 1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel5268120Travail personnel120
Crédit total de lUE : 14
7) Programme des enseignements :
Cf. programme officiel paru au JO N°175 du 31/07/99 : Programme de connaissances générales. Le tronc commun est ici réparti en 3 UE dont les titres sont indiqués ci-dessous. Les parties du programme qui seront enseignées en master 2 seront complémentaires des enseignements dispensés en licence et master 1 de la filière SVT.
I) M1 Le système Terre : dynamique et transfert (CM 20h, TP 28h)
II) M2 La Terre : temps et évolution (CM 20h, TP 28h)
III) M3 Evolution et gestion de lenvironnement (CM 12h, TP 12h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 6
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement présentiel se fera sous forme de cours largement illustrés. Des documents polycopiés donneront aux étudiants les éléments de base à lapprofondissement du sujet par une recherche bibliographique personnelle.
12) Capacité d'accueil :
S 10 : Stage de connaissances générales (tronc commun)
Numéro de lUE : BIO 1003
Intitulé de l' U E : STAGE DE CONNAISSANCES GENERALES (tronc commun)
Responsable(s) : Jacques Bouffette, Maryvonne Charrier, Bernard Clément, Laurence Poitou
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S10
4) Objectifs :
La filière Sciences de la vie et de la terre requiert de la part des candidats une excellente pratique expérimentale. Ils pourront développer des compétences techniques et une approche naturaliste dans les secteurs de contre-option, sur le terrain (secteurs écologie et géologie) et en laboratoire (secteur biologie cellulaire, biochimie).
5) Prérequis : master 1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel7272Travail personnel72
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Le stage se fera dans des stations biologiques qui accueilleront les étudiants sur un total de 9 jours dans lannée. A partir de ces sites, des excursions seront proposées à la journée et lexploitation du matériel (quand il y aura des récoltes) sera faite en soirée en salle de travaux pratiques. Des expérimentations simples seront aussi proposées ayant trait au programme général du secteur A.
I) Exploitation de milieux de la région Bretagne : géologie armoricaine, milieux marin, dunaire et forestier.
II) Pratiques expérimentales en laboratoire à la station daccueil
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Un compte-rendu dobservation, de manipulation, dexploitation du matériel sera demandé dans le cadre dun travail personnel réalisé sur le site daccueil. Ce compte-rendu pourra se faire sous la forme dun bref exposé oral de fin de stage.
12) Capacité d'accueil
S 10 : Préparation aux écrits et TP du concours
Numéro de lUE : BIO 1004
Intitulé de l' U E : PREPARATION AUX ECRITS ET TP DU CONCOURS
Responsable(s): Jacques Bouffette, X, X, Laurence Poitou
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S10
4) Objectifs :
Entraînement des candidats aux épreuves écrites et de travaux pratiques. Ils auront des sujets blancs dans les temps impartis lors du concours.
5) Prérequis : master 1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2424Travail personnel27
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Cf. Les rapports de jury des concours précédents. Il sagira de préparer les étudiants au styles dépreuves qui sont exigés, puis de donner des corrigés détaillés des sujets blancs.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Le travail personnel sera celui du candidat devant sa copie pour rédiger le sujet qui lui est proposé. Les durées des épreuves sont les suivantes : écrit doption 7h ; 2 écrits de contre-option de 5h chacun ; TP doption 6h ; TP de contre-option 4h.
12) Capacité d'accueil :
S 9 et 10 : Programme de spécialité
Numéro de lUE : BIO 910
Intitulé de l' U E : PROGRAMME DE SPECIALITE
Responsable(s) : Jacques Bouffette, Maryvonne Charrier, Laurence Poitou
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9 et S10
4) Objectifs :
Donner aux candidats des compléments de cours sous forme de synthèses dans loption de leur choix et mettre en pratique les connaissances par la présentation orale de leçons de spécialité basées sur des démarches expérimentales (50 min dexposé + 30 min de discussion).
5) Prérequis : master 1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel481260 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cf. programme de lagrégation paru au JO N°175 du 31 juillet 1999. Le programme est revu chaque année et réactualisé si nécessaire, par parution au BO.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La préparation aux leçons exigera des candidats un fort investissement personnel, à la fois bibliographique, expérimental et pédagogique.
12) Capacité d'accueil
S 9 : Stage de spécialité
Numéro de lUE :
Intitulé de l' U E : STAGE DE SPECIALITE
Responsable(s) : Jacques Bouffette, Laurence Poitou, Frédéric Ysnel
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9
4) Objectifs :
La filière Sciences de la vie et de la terre requiert de la part des candidats une excellente pratique expérimentale. Ils pourront lacquérir dans le cadre de cette UE de spécialité, soit sur le terrain (secteurs B et C) soit en laboratoire (secteur A), selon loption choisie pour le concours.
5) Prérequis : master1
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel4848Travail personnel48
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
I) Secteur A : stage sous forme de travaux pratiques (séances de 4h à 6 heures) de biologie cellulaire, microbiologie, biochimie et immunologie.
II) Secteur B : stage décologie animale et végétale en milieu terrestre, dulcicole ou marin selon les disponibilités dans les stations daccueil.
III) Secteur C : stage de géologie dans le Massif Central et les Alpes.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Dans le cadre du travail personnel, il sera demandé aux candidats un compte-rendu de stage, sous forme dun bref exposé oral.
12) Capacité d'accueil :
S 9 : Projet de spécialité : communication et langue
Numéro de lUE : BIO 911
Intitulé de l' U E : PROJET DE SPÉCIALITÉ Communication et langue
Responsable(s) : Denis Poinsot et Scelva
Equipe(s) pédagogique(s) : Toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : master professionnel de lagrégation SVT
2) Parcours : master 2
3) Semestre n° : S9
4) Objectifs :
La validation dun master au niveau européen suppose lapprentissage dune langue étrangère. Lintégration dans un établissement universitaire exige une initiation à la recherche. Des acquis antérieurs en langues (TOEFL, CLES) et en recherche (stage) seront encouragés dès la licence.
5) Prérequis : UE de langues en S5 et S7.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel242448Travail personnel48
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
I) Initiation à la recherche : Cette partie dUE pourra être acquise au sein dUE présentes dans loffre des formations à la recherche des UFR SVE et SPM.
Ex : UE communication scientifique du master 1 de biologie des organismes, des populations et des écosystèmes de lUFR SVE, UE communication et langue du master professionnel 2 spécialité environnement des UFR SPM et SVE.
II) Communication scientifique en langue étrangère : Le projet de recherche servira de charpente à la préparation dun poster utilisant des connaissances linguistiques de base.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 2
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Lenseignement personnel inclura une recherche bibliographique, une réflexion méthodologique et une analyse informatique de données. Les TP permettront de maîtriser les supports de la communication scientifique, à savoir : lutilisation de transparents, de présentations assistées par ordinateur (logiciel PowerPoint), une évaluation filmée de la démarche pédagogique.
12) Capacité d'accueil :
(UE « Outils » proposés par les biologistes
Communications
S6 : Insertion professionnelle
Numéro de lUE : BIO 622
Intitulé de l' U E : INSERTION PROFESSIONNELLE
Responsable(s) : Claire Piquet-Pellorce
Equipe(s) pédagogique(s) : équipe de formation de LBCMP mention Biologie Appliquée (incluant des enseignants des équipes pédagogiques impliquées dans cette formation c'est-à-dire les équipes de Biologie Cellulaire, Microbiologie, Physiologie végétale
ainsi que les personnels des services de luniversité dédiés à cette mission)
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention biologie cellulaire, moléculaire et physiologie, mention biologie et informatique
2) Parcours : UE obligatoire pour la licence BCMP mention Biologie
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs : Favoriser linsertion professionnelle des étudiants dans le secteur industriel par une meilleure connaissance de la structure des entreprises des secteurs dactivités agro-alimentaire, pharmaceutique et biotechnologique.
5) Prérequis : sengager à faire un stage quil soit à caractère obligatoire (LCBMP mention biologie appliquée) ou optionnel (LCBMP autres mentions ou autres Licences BBM, Biologie et Informatique)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel204060Travail personnel204060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours :
Présentation de la structure et du fonctionnement de différentes entreprises des secteurs dactivités agro-alimentaire, pharmaceutique et biotechnologique par le biais de conférences par les professionnels de ces secteurs. Clarification de leurs objectifs et de leurs activités en terme de production autant de que de recherche et développement.
Présentation dun certains nombres doutils facilitant la recherche dun stage/emploi en entreprise
TP : un travail denquête de cas sera menée en binôme par les étudiants sur au moins 2 aspects : - la structure et les activités dune entreprise des secteurs dintérêt dans le grand
ouest,
- lapplication et/ou industrialisation dune méthode de génie biologique.
Chacun de ses travaux donnera lieu à un mémoire et une présentation orale devant lensemble de la promotion détudiants.
De plus, les étudiants travailleront en groupe avec un encadrement adéquat sur les outils de linsertion professionnelle tels que la formulation des savoirs et compétences, la rédaction dun CV et dune lettre de motivation, la préparation dun entretien
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Le succès de cet enseignement nécessite un grand niveau dimplication des étudiants et un gros travail personnel.
12) Capacité d'accueil : Lencadrement rapproché des étudiants dans cette formation nous obligera éventuellement à limiter le nombre détudiants sur la base du caractère obligatoire de lUE dans la filière choisei et du nombre de crédit déjà obtenu (50 soit au moins 3 semestres détudes validés) .
S 6 : Mémoire Bibliographique
Numéro de lUE : BIO 619
Intitulé de l' UE : Mémoire Bibliographique
Responsable(s) : Laurence KERN
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie-Biologie Moléculaire et autres
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
A titre obligatoire en licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
A titre optionnel en licence de Biologie toutes mentions
2) Parcours : 3ème année universitaire
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs : Rechercher des documents sur un thème scientifique choisi, en faire lanalyse et la synthèse sous la forme dun rapport écrit, suivi dune présentation orale.
5) Prérequis : niveau 2ème année universitaire
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.Projet heures TPStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2 h6 h16 h24 hTravail personnel16 h16 h
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Présentation des consignes de rédaction, présentation des ressources pédagogiques (BU) et informatiques, exploration et recherche de documents sur le Web, analyse détaillée darticles scientifiques en anglais.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire ( Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire
optionnel ( Licence de Biologie toutes mentions
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 7 : Je Crée Mon Emploi (J.C.M.E.)
Numéro de lUE : BIO 722
Intitulé de l' U E : Je Crée Mon Emploi (J.C.M.E.)
Responsable(s) : Jean-Michel Guiraud
Equipe(s) pédagogique(s) : Biochimie et biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie Gestion : Obligatoire
Libre pour les autres Masters
2) Parcours : 1ère année du Master 1 Biologie Gestion
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs : Proposer des outils en vue de lintégration professionnelle à partir dun projet professionnel qui sapparente à un projet de « vie ».
5) Prérequis : avoir une licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2424Travail personnel1616
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Il sagit de déterminer son Marché et son Bilan Professionnel. Cela se met en place à partir doutils proposés et dactions ciblées :
Formulation des savoirs et compétences
Revue de presse collective et analyse médiatique
Simulations dentretiens
CV et lettre de motivation
Management de groupe
Lapproche de lentreprise (veille technologique)
Création collective dun événement
Le but final est de formuler individuellement son projet professionnel. La communication sera privilégiée ainsi que la réalisation dune action collective.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire ( pour le master1 biologie gestion
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les exercices proposés permettent une meilleur définition de son projet professionnel en regard du Marché public ou privé. Cela va dans le sens dune meilleure employabilité
12) Capacité d'accueil :
Le suivi personnalisé oblige à travailler avec un nombre limité détudiants.
48 étudiants (soit 3 groupes de 16 étudiants)
S 7 : Conduite de projets scientifiques
Numéro de lUE : BIO 723
Intitulé de l' U E : Conduite de projets scientifiques
Responsable(s) : Marie-Andrée Esnault et Jean-Michel Guiraud
Equipe(s) pédagogique(s) : toutes les équipes pédagogiques de SVE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Sciences de la Vie et de la Santé mention Biologie et Gestion (obligatoire)
Autres filières (optionnel) dans la limite des places disponibles
2) Parcours : Master 1ère année
3) Semestre n° 7
4) Objectifs : Lobjectif de ce module est dapprendre aux étudiants à établir un projet scientifique, le mettre en uvre en tenant compte des limites techniques, rédiger et présenter les résultats et objectifs atteints.
5) Prérequis : aucun, seul un grade de licence dans le secteur de la biologie est nécessaire
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.Projet
eq TDStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel204060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Sur un thème proposé ou libre, létudiant devra élaborer un protocole de manipulation pour vérifier des hypothèses, affiner des travaux publiés
Pour cela, il aura à sa disposition des documents bibliographiques quil pourra compléter. Il devra proposer un protocole danalyse en tenant compte des possibilités techniques. Un ensemble de 5 journées de travaux pratiques lui permettra de mettre en uvre le protocole (regroupées sous forme de mini-stage, par exemple une semaine lorsque le sujet sy prête ou 1 journée déchantillonnage suivie de 4 journées de traitement de données). Un bilan journalier devant le groupe détudiants lentraînera à présenter ses résultats et le conduira à faire évoluer ses travaux.
Les résultats obtenus feront lobjet de la rédaction dun document écrit sous forme dune publication scientifique et dun exposé devant lensemble du groupe détudiants.
Les thèmes scientifiques abordés pourront concerner les secteurs de la biochimie, physiologie, microbiologie, biologie des organismes, environnement en fonction du potentiel et des spécialités des enseignants et de lorigine des étudiants (différentes spécialités de biologie).
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( pour le master Biologie et Gestion
optionnel ( pour les autres masters
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Il sagira dun travail par groupe de 3 à 4 étudiants (apprentissage de la gestion du travail en groupe)
12) Capacité d'accueil : 32 minimun
Ce nombre pourra être augmenté en fonction du potentiel et des spécialités des encadrants
________________________________________________________________________
S 8 : Communication Scientifique
Numéro de lUE : BIO 818
Intitulé de l' U E : Communication Scientifique
Responsable(s) : Denis Poinsot
Equipe(s) pédagogique(s) : toutes les équipes pédagogiques
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Recherche Sciences de la Vie et Environnement
2) Parcours : Master Recherche Biologie et Environnement
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs : Apprendre par la pratique à présenter des résultats scientifiques à l'écrit et à l'oral en respectant les standards professionnels utilisés dans le monde de la recherche. Cette UE constitue donc en particulier un entraînement à la rédaction et la soutenance d'un rapport de Master recherche ou professionnel.
5) Prérequis : aucun.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel16824Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
L'UE est structurée en 8 séances de 2h de TP suivies de 2 séances "projet" de 4h au cours desquelles les étudiants préparent le poster et la présentation PowerPoint finale sur laquelle ils seront notés. Les séances dont le titre est en gras se déroulent en salle informatique.
1Méthodes de collecte d'information : recherche biblio et normes biblio.
Application : effectuer une recherche bibliographique en ligne, à mettre en forme de manière correcte pour la séance suivante.
2Les écrits scientifiques. Structure détaillée et conventions à respecter.
Application : examen détaillé d'articles primaires, de « review », de vulgarisation, de posters, sur un même sujet pour bien identifier le caractère de chaque type de document.
3Ecrit 1. Titre, résumé, introduction, matériel et méthodes
Application : jugement de plusieurs exemples. Pour la séance suivante : rédaction d'un rapport de « referee » sur un ensemble titre + intro + matériel et méthodes (base : une synthèse des erreurs les plus courantes chez les étudiants).
4Ecrit 2. Résultats : créer des figures et tableaux professionnels
Application : production de tableaux et figures sous Word et Excel à partir de données brutes, à rendre lors de la séance suivante..
5Ecrit 3. Discussion.
Application : Examen d'exemples professionnels. Rédaction d'un rapport critique sur une discussion présentant des défauts.. Pour la séance suivante : rédaction d'une discussion à partir de données fournies et analysées.
6Oral 1. Technique de l'exposé oral : utilisation des transparents
Application : jugement de plusieurs exemples. Création de transparents sous PowerPoint
7Oral 2. Technique de l'exposé oral : utilisation d'animations PowerPoint
Application : jugement de plusieurs exemples. Création de diapos sous PowerPoint.
8Oral 3. Pratique : Exposés d'entraînement courts (3 minutes), filmés en vidéo, pour que l'étudiant puisse ensuite chez lui observer sa prestation pour l'améliorer.
9Atelier 1 : mise en forme du poster et de l'exposé final
10Atelier 2 : mise en forme du poster et de l'exposé final
8) Bibliographie :
Day R., 1998. How to write and publish a scientific paper. Oryx Press; 5th edition, 296p. ISBN: 1573561657.
Instructions aux auteurs et articles du site Biologos (http://biologos.univ-rennes1.fr)
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cette UE utilise exclusivement une approche d'apprentissage par la pratique : examen, jugement puis production de supports de communication scientifique : articles, transparents, posters et présentations PowerPoint, exposés (filmés en vidéo pour permettre une auto-évaluation postérieure). La notation est basée sur la préparation d'un poster et d'une présentation orale PowerPoint).
12) Capacité d'accueil : Groupe(s) de 16 personnes (contraintes de la salle informatique : 1 poste par étudiant). Le nombre de groupes sera déterminé chaque année en fonction du potentiel d'encadrement disponible.
-
S 9 : Informations et Médias
Numéro de lUE : BIO 912
Intitulé de l' U E : Informations et Médias
Responsable(s) : Jean-Michel Guiraud
Equipe(s) pédagogique(s) : Professionnels
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Sciences de la Vie et de la Santé mention Biologie et Gestion : Obligatoire
Libre pour les autres Master
2) Parcours : 2ème année du master biologie et gestion
3) Semestre n° : S9
4) Objectifs :
Aujourdhui, à tort ou à raison, information et communication sont deux concepts étroitement, presque intimement liés. Il est devenu impossible dinformer sans communiquer et une communication un tant soi peu crédible contient un minimum dinformation. Dans ces conditions, il nous paraît important de réfléchir au concept dinformation dans un système économique et politique qui tend à faire de La Nouvelle une marchandise à forte valeur ajoutée. Il sagira damener létudiant-citoyen à se positionner par rapport à une information en recherchant la vérité par lobservation et lanalyse systématique des faits et le recoupement des témoignages.
5) Prérequis : avoir une licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel81624Travail personnel41216
Crédit total de lUE : 2
Programme des enseignements :
Enseignement assuré par M. Philippe Pichon, journaliste et réalisateur de documentaire TV (A2 - TF1).
Connaissance des médias : presse écrite, radio, télévision. Analyse de la fabrication dun journal. Si possible : visite par petits groupes dune salle de rédaction et si autorisation, possibilité dassister aux conférences de rédaction et au montage des sujets. Mise en pratique de la visite par une revue de presse. Exposé des différentes revues de presse.
Quand la presse semballe... Leffet Boule de neige : Analyse de lexemple Buffalo Grill . Le préjudice et la réparation. La contre-attaque par la communication. Travail sur lobjectivité et léquilibre de la parole.
Désinformation et manipulation : De la rumeur à la propagande. Quand la presse se fait le relais dune rumeur populaire, économique, politique...
Être à la source de linformation : Mise en pratique par la constitution dun dossier de presse. Comment attirer lattention sur un évènement. Choisir ce que lon dit, ce que lon montre. Vendre son projet. Accepter de sexposer à la critique. Travail par petits groupes.
Nous sommes tour à tour émetteurs et récepteurs dinformations. Il nous faut donc pouvoir être responsables des informations que lon diffuse et savoir appréhender avec discernement les informations que lon reçoit. Ne pas trahir la réalité dans un cas, ne pas se laisser envahir par lémotion dans lautre
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire ( pour master 2 Biologie Gestion
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Matériel nécessaire : un magnétoscope (VHS) et un moniteur.
12) Capacité d'accueil : Disponibilité du professionnel assurant ce module limitée : 48 étudiants
S 9 : Scientific English and Communication
Numéro de lUE : BIO 913
Intitulé de l' U E : Scientific English and Communication
Responsable(s) : Denis Poinsot
Equipe(s) pédagogique(s) : aucune en particulier, SCELVA
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Recherche Sciences de la Vie et Environnement et master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé
2) Parcours : Master Recherche Sciences de la Vie et Environnement
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs : Maîtriser les bases indispensables de l'anglais scientifique et apprendre par la pratique à les utiliser pour présenter des résultats scientifiques dans cette langue à l'écrit comme à l'oral. Cette UE constitue en particulier un entraînement à la consultation régulière de la littérature scientifique et à la participation à une réunion de travail/conférence internationale (poster ou présentation orale).
5) Prérequis : Première année de Master.
Remarque : la présente UE se concentrera spécifiquement sur l'usage pratique de la langue anglaise, dans la communication scientifique. Les aspects de forme scientifique eux-mêmes (comment présenter un tableau ou une figure, que mettre dans un matériel et méthodes... etc.) seront supposés connus. Ils sont abordés en détails (et en français) dans l'UE "communication scientifique" de première année du Master Recherche SVE, et peuvent être abordés par l'étude de la bibliographie sur le sujet (voir plus bas l'ouvrage de R. Day, ou les instructions aux auteurs du site du journal étudiant Biologos http://biologos.univ-rennes1.fr).
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel208836Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
( Acquisition du vocabulaire scientifique par l'analyse et le commentaire de textes professionnels.
( Entraînement pratique à l'expression orale (mini-exposés de 3 minutes, filmés en vidéo)
( Entraînement à l'expression écrite en anglais scientifique (rédaction de textes courts)
( Projet : réalisation d'une (mini) étude bibliographique sur des articles internationaux donnant lieu à un exposé final de 10 minutes en Anglais et la réalisation d'un poster (du type "communication à une conférence internationale").
8) Bibliographie :
Defourneaux, M. 1980. Do You Speak Science ? Comment s'exprimer en Anglais scientifique. Gauthier - Villars
Upjohn J., S. Blattes & V. Jans, 1991. Minimum competence in scientific English, PUG.
Day R., 1998. How to write and publish a scientific paper. Oryx Press; 5th edition, 296p. ISBN: 1573561657.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La notation de la partie "communication" de l'UE est basée sur la préparation d'un poster et d'une présentation orale PowerPoint). Idéalement, la notation de la partie "Langues" reposerait sur un test de type TOEFL qui donnerait aux étudiants une idée de leur niveau relativement à un standard international reconnu.
12) Capacité d'accueil : Groupe(s) de 16 personnes en TP (contraintes de la salle informatique : 1 poste par étudiant, et nécessité d'une participation orale maximum). Le nombre de groupes sera déterminé chaque année en fonction du potentiel d'encadrement disponible.
S 9 : Sociologie de la negociation
Numéro de lUE : BIO 914
Intitulé de l' U E : Sociologie de la négociation
Responsable(s) : Véronique Van Tilbeurgh
Equipe(s) pédagogique(s) : Sociologie Rennes2
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel. Spécialité « Environnement ». Gestion intégrée des bassins versants
Master Environnement-Droit
2) Parcours : 2ème année
3) Semestre n° : 9
4) Objectifs:
UE permettant de poser les bases de la sociologie de la négociation dans une double perspective, à la fois, générale et appliquée aux controverses environnementales. Dans un premier temps, ce sont les bases de la sociologie de la négociation qui seront abordées, puis, la seconde partie sera centrée sur les caractéristiques des contextes sociaux des négociations spécifiques à lenvironnement.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24hhh 24Travail personnel12h12
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
La sociologie de la négociation
Laction collective
Les processus de négociation
Contextes et règles de la négociation
La négociation interpersonnelle, intra-organisationnelle et interorganisationnelle
Les contextes sociaux de la négociation dans le champ environnemental
Les acteurs sociaux
Les savoirs et représentations de lenvironnement
Les lieux de négociation
La négociation de lincertitude : le risque naturel
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnelle
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Enseignement dispensé par des intervenants extérieurs
12) Capacité d'accueil : 15 à 25 étudiants
( Biologie Quantitative, outils statistiques
S 3 : Biologie Quantitative 1
Numéro de lUE : BIO 313
Intitulé de l' U E : Biologie quantitative 1
Responsable(s) :Yvan LAGADEUC & Claude BOISSEAU
Equipe(s) pédagogique(s) :Ecologie animale et végétale, Bio et informatique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie toutes mentions, Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours :
3) Semestre n° : S3
4) Objectifs :
Premières bases des analyses des données en biologie. Utilisations des acquis de première année en proba-stat pour introduire les statistiques descriptives et les tests statistiques
5) Prérequis : UE proba S2
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel121224Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Cours et TD illustrant le cours
Statistiques descriptives :
Les données : V.A. quantitatives et qualitatives,
La représentation graphique des variables et des distributions
Les paramètres destimation des échantillons, des populations
Statistiques inférentielles :
Test dhypothèse et risques
Comparaison de moyenne et de proportions, Khi2, Corrélation et régression
8) Bibliographie :
Frontier, Davoult, Gentilhomme et Lagadeuc,2001. Statistiques pour les sciences de la vie et de lenvironnement
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours et TD venant illustrer le cours
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Biologie Quantitative 2
Numéro de lUE : BIO 411
Intitulé de l' U E : Bio quantitative 2 plan dexpérience et ANOVA
Responsable(s) : Eric PETIT, Luc MADEC
Equipe(s) pédagogique(s) :
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie toutes mentions, Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : 2ème année de la licence
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs : Donner les bases statistiques de la mise en place des plans dexpériences.
5) Prérequis : Autres UE de math ou de Bioquant des semestres précédents
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel681024Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
analyse de variance
test post hoc
plan dexpérience et déchantillonnage
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
fonction du parc informatique
S 5 : Biologie Quantitative 3
Numéro de lUE : BIO 523
Intitulé de l' U E : Biologie quantitative 3
Responsable(s) :Jean-Sébastien PIERRE, Eric PETIT
Equipe(s) pédagogique(s) :Ecologie animale et végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie toutes mentions, Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours :
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
Introduction à la modélisation : pourquoi des modèles en biologie, et quel types de modèles ?
Statistiques inférentielles non-paramétriques
Méthodes de rééchantillonnage
5) Prérequis :
UE math en S1, S2 et S3 (ou niveau équivalent)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel121224Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Introduction à la modélisation 8 h cours, 4 h TD :
Présentation de différents type de modèles :
Croissance de populations
Modèle linéaire à compartiment
Modèle enzymatique (michaelis-menten), modèle de monod
Statistiques inférentielles non-paramétriques 3h cours 3h TD :
Test des signes, statistiques de rangs
Méthodes de rééchantillonnage 2h cours 4h TP : jackknife, bootstrap, permutations
8) Bibliographie :
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Biologie quantitative 4
Numéro de lUE : BIO 620
Intitulé de l' U E : Biologie quantitative 4 (Outils)
Responsable(s) :MA Coutellec et A. Bellido
Equipe(s) pédagogique(s) :Ecologie animale et végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie toutes mentions, Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : 3ème année de la licence
3) Semestre n° : S6
4) Objectifs : Initiation aux analyses multivariées : ACP, AFC, ACM et classification
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel661224Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Bases de calcul matriciel, ACP, AFC, ACM, méthodes de classification : les indices utilisés en écologie et les algorithmes de groupement
Après une présentation des principes en cours et une description des méthodes en TD, les étudiants utiliseront en particulier le logiciel Calmat pour décomposer les étapes des calculs et traiter des matrices de grandes tailles.
8) Bibliographie :
Escofier B. et Pagès J., (1988).- Analyses factorielles simples et multiples. Objectifs, méthodes et interprétation. Dunod, Paris.
Lebart, L., Morineau, A. & Piron, M. (1995) - Statistique exploratoire multidimensionnelle. Dunod Paris.
Legendre L. et Legendre P., (1984).- Ecologie numérique. 1 & 2. MASSON éd., Paris. 2° éd.
Volle, Fenelon
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les cours consisteront en une introduction et une présentation des principes (bases communes aux analyses multivariées).
La partie pratique utilisera si possible des données collectées sur le terrain par les étudiants dans d'autres UE (Ecologie)
Pour une meilleure efficacité, il est souhaitable de grouper les enseignements (TD et TP en alternance) sur une ou deux semaines.
12) Capacité d'accueil : fonction du parc informatique
S 8 : Biologie quantitative 5
Numéro de lUE : BIO 819
Intitulé de l' U E : Biologie quantitative 5
Responsable(s) : Yvan LAGADEUC & Jean Sébastien PIERRE
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Animale, Ethologie, Biologie végétale
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Optionnelle
Master 1(maîtrise) recherche biologie et environnement mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Acquisition des concepts et méthodes relatives à la modélisation en écologie et en éthologie
5) Prérequis : S4 : Biologie quantitative ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel18h16h26h60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Modèles dynamiques (populations, écosystèmes)
en temps continu : équations différentielles
en temps discret : développement des modèles matriciels
Application à la dynamique des populations, des communautés et des systèmes (modèles "stocks et flux" cf logiciel Stella ©)
Méthodes statistiques avancées
Analyses multi-tableaux (co-inertie, AFM, etc.)
Analyses de séries temporelles
Statistiques Bayésiennes, Maximum de vraisemblance, EM-algorithme
Réseaux neuronaux
Fractals
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : fonction du parc informatique
S 8 : Analyses spatiales en Biologie
Numéro de lUE : BIO 820
Intitulé de l' U E : Analyses spatiales en Biologie
Responsable(s) : Alain Bellido
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Animale (Ecologie) et Biologie Végétale (Ecologie)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Optionnel.
Master 1 (maîtrise) recherche Biologie et Environnement mention Biologie des organismes, des populations et des écosystèmes
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
L'objectif de cette UE est de présenter les bases communes à toutes les approches des processus et des patterns spatiaux en Ecologie, et de permettre aux étudiants d'acquérir une maîtrise des outils statistiques et de spatialisation de l'information.
5) Prérequis : S5 Statistiques paramétriques
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20103060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS
L'utilisation de l'espace par les organismes
Systèmes d'Information Géographique et bases de données géoréférencées
Statistiques spatiales (autocorrélation, géostatistiques
)
Indices de dispersion
Loi de puissance (Taylor)
Blocs contigus, transects
K-fonctions (Ripley)
Autocorrélation, Géostatistiques.
TD
Réflexion méthodologique à partir de documents sur table
Interprétation de documents cartographiques
Photointerprétation
TP
Pratique d'un SIG et d'un SGBD
Pratique de logiciels de statistiques spatiales (PASSAGE, GS+
)
Trois exemples d'analyses spatiales en écologie
Biologie des populations : Habitat suitability : analyse de la distribution d'une espèce (analyse des données de terrain avec Biomapper)
Eco-éthologie : cartographie d'un territoire
Ecologie appliquée Ecologie du paysage : étude d'un bassin versant
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
Divers
S1 : Education aux choix professionnels
Numéro de lUE : BIO 104
Intitulé de l' U E : Education aux choix professionnels
Responsable(s) : Cécile Lecomte
Equipe(s) pédagogique(s) : toutes les équipes
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
licences de biologie, licence de biochimie et biologie moléculaire, licence pluridisciplinaire, licence sciences de la vie et de la terre
2) Parcours :
1ère année
3) Semestre n° : S1
4) Objectifs :
Ce travail doit permettre à létudiant de confronter son projet personnel avec les réalités professionnelles pour construire son parcours dorientation.
5) Prérequis :
aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel1212Travail personnel2424
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Lors dune première séance de présentation générale les étudiants devrons faire le choix du thème de leur projet professionnel en indiquant sur une fiche soit :
- une profession, un domaine dactivité ou une discipline.
Le travail est effectué au sein dun groupe de TD regroupant des sous-groupes de 4 ou 5 étudiants ayant des projets voisins ou complémentaires. Ce groupe est encadré par un enseignant dont le rôle est de les guider pour :
- Effectuer des recherches documentaires
- Rencontrer des professionnels et réaliser des interviews.
- Rédiger un rapport présentant une vision critique et synthétique des informations recueillies.
- La dernière séance consiste en une présentation orale en temps limitée avec pour support un poster réalisé au sein dun sous-groupe travaillant sur le même thème.
Le choix du thème ne prédétermine pas le cursus mais ce travail doit engager létudiant dans une démarche active face à son orientation.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S2 : Outils informatiques de base pour lanalyse des données et la communication
Numéro de lUE : BIO 207
Intitulé de l' U E : Outils informatiques de base pour lanalyse des données et la communication
Responsables : M. GARREAU, C. BOISSEAU
Equipe pédagogique : Biologie et informatique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de biologie (obligatoire pour toutes les mentions), Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire mention Biologie
2) Parcours :
1ère année 2ème semestre
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs :
Apprentissage raisonné des bases de lutilisation dun ordinateur (système dexploitation, gestion de fichiers) et des logiciels à usage général (traitement de texte , tableur, logiciel de présentation, navigateur).
5) Pré-requis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel1041024Travail personnel61016
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Généralités sur le matériel.
Les composants logiciels :
fonctions fondamentales du système d'exploitation.
gestion du système de fichiers
en ligne de commande.
au moyen de l'interface graphique.
les grandes catégories de logiciels d'application.
Connaissance de logiciels à usage général :
le traitement de texte et la maîtrise de l'écrit.
le tableur et les feuilles de calcul.
le logiciel de présentation et la création de diaporamas.
l'échange et la fusion d'informations entre applications.
Bases de la recherche et de la gestion dinformations sur le web
8) Bibliographie :
Les documents originaux nécessaires sont fournis en cours
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours, TD et TP distincts. Réalisation du projet pro-parte en autonomie.
12) Capacité d'accueil :
S : Loutil informatique dans sa dimension réseau
Numéro de lUE : BIO 4 ? ? ou BIO 5 ? ? ou BIO 6 ? ?
Intitulé de l' U E : Loutil informatique dans sa dimension réseau
Responsable(s) : M.GARREAU, C.BOISSEAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et Informatique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence Biochimie et Biologie Moléculaire
2) Parcours :
2ème année (S4) ou 3ème année (S5 ou S6)
3) Semestre n° : 4, 5 ou 6
4) Objectifs : prise en main de lenvironnement réseau des systèmes informatiques ; initiation à la publication sur le web.
5) Pré-requis :
Outils informatiques de base pour lanalyse des données et la communication (1ère année, S2) ou équivalence.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel841224Travail personnel6612
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
La dimension réseau des systèmes informatiques.
Le web, système d'information hypertexte distribué.
Bases de l'écriture de pages web; le langage HTML.
création de pages web simples et avec cadres.
réalisation d'un projet (mini-site web).
Utilisation approfondie des navigateurs web.
Utilisation des autres applications basées sur Internet.
8) Bibliographie :
Les documents originaux sont fournis en cours.
Voir aussi : www.bioinfo.univ-rennes1.fr
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Cours, TD et TP distincts. Réalisation du projet pro-parte en autonomie.
12) Capacité d'accueil : /
________________________________________________________________________
S : Méthodes avancées de publication électronique
Numéro de lUE : BIO
Intitulé de l' U E : Méthodes avancées de publication électronique
Responsable : C.BOISSEAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie et Informatique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours :
3éme ou 4ème année?
3) Semestre n° : 5, 6 ou plus ?
4) Objectifs :
Approfondissement des méthodes de publication électronique (principalement sur le web) : modularité, personnalisation, interactivité, sécurisation, contenus dynamiques et enrichis.
5) Prérequis :
Loutil informatique dans sa dimension réseau (ou équivalence)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24122460Travail personnel1261230
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
HTML avancé :
feuilles de style ; formulaires; couches (layers).
méthodes de génération semi-automatique de pages web.
interfaçage de la messagerie avec les pages web. Paramétrage des "applets" Java.
Standard XHTML et validation des pages web.
Interactivité côté navigateur (JavaScript)
manipulation des formulaires HTML
génération dynamique de pages personnalisées
création d'applications en ligne.
Interactivité côté serveur (PHP)
accès dynamique au système de fichiers
traitement sécurisé des formulaires
gestion de bases de données relationnelles de type SQL en ligne.
accès aux bases de données MySQL à partir de formulaires et de PHP.
génération d'images dynamiques avec la bibliothèque GD.
Initiation au développement d'applets en Java
Lapplication des concepts enseignés se fera dans le cadre de la réalisation progressive dun projet complet
8) Bibliographie :
Les documents originaux sont fournis en cours. La recherche dinformations techniques sur le web sera largement mise à contribution
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE.
Cours, TD et TP distincts mais fortement inter-dépendants. Travail personnel important.
12) Capacité d'accueil : 36 (deux groupes de TP)
________________________________________________________________________
S 7 : Outils en Ecologie, Ethologie et Biologie des Populations + Langues
Numéro de lUE : BIO 714
Intitulé de l' U E : Outils en Ecologie, Ethologie et Biologie des Populations + Langues
Responsable(s) : M.-A. Coutellec, J.-B. Bouzillé, M.-A. Richard
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Animale, Ethologie, Biologie végétale, Scelva
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Obligatoire
Master 1 (maîtrise) de recherche de Sciences de la vie et de lenvironnement
mention Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes
Master 1 (maîtrise) Professionnel de Sciences de la Vie et de la Santé mention Environnement
2) Parcours : Master 1ère année
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Présentation et mise en uvre de méthodes d'analyse des données relatives aux disciplines enseignées dans les UE de ce semestre . Pratique de langues dusage scientifique international.
5) Prérequis :
S5 Statistiques paramétriques (ou niveau équivalent)
S6 Analyses multivariées (ou niveau équivalent)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel6h6h48h60Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cours et Travaux Dirigés (12h)
Présentation et pratique des méthodes danalyse des données applicables et de modèles spécifiques aux trois disciplines enseignées dans lUE :
Analyse des comportements (3h) : méthodologie et traitement des données (statistiques non paramétriques)
Analyse des populations (6h) : dynamique des populations, mesures des paramètres démographiques, modèles de croissance en temps continu / discontinu.
Analyse des communautés (3h) : relevés phytosociologiques, relevés faunistiques et méthodes d'analyse structurelle et fonctionnelle des communautés (analyse multivariées, analyses sous contraintes, analyses de co-inertie, processus markoviens).
Initiation aux Systèmes d'Information Géographique
Travaux pratiques
Partie commune : trois exemples
étude de comportement : établissement de répertoires comportementaux, budget-temps
étude de population :distribution dâges / stades, tables de survie (dynamiques, statiques), tables de fécondité, courbes de survie
étude dun assemblage despèces.
Spécialisation : deux domaines au choix
étude de comportements : analyse de sons, actographie, trajectométrie
structure de populations : structure dâge, taux daccroissement. Modèles de croissance en temps discret / continu, modèles sans / avec limitation de ressources.
analyse de communautés : traitement des données (lignes et placettes permanentes, plan d'échantillonnage par quadrats)
Langues en tant quoutil scientifique : mise en uvre par analyse et présentation écrite ou orale :
darticles scientifiques issus douvrages internationaux
de travaux personnels ou de résultats acquis dans le cadre des TP de lUE.
8) Bibliographie :
Legendre L. & Legendre P. 1984. Ecologie numérique. 2 - la structure des données écologiques. Masson éd., Paris. 2ème édition. 335 P.
Caswell H. 1989. Matrix population models. Sinauer, Sunderland, MA.
Begon M., Harper J. L. &Townsend C. R. 1996. Ecology. Individuals, populations and communities. 3ème édition. Blackwell Science.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Brevet Industriel et Innovation
Numéro de lUE : BIO 821
Intitulé de l' U E : Brevet Industriel et Innovation
Responsable(s) : Jean-Michel Guiraud Marie-Andrée Esnault
Equipe(s) pédagogique(s) : professionnels
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master 1 (maîtrise) Sciences de la Vie et de la Santé mention Biologie Gestion : Obligatoire
UE Libre pour les autres Masters
2) Parcours : 1ère année du Master 1 Biologie Gestion
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs : - Le brevet : Connaître les procédures de dépôt
- Institut de la Protection Industrielle : INPI
- La protection industrielle internationale par le brevet
- Le Brevet : arme stratégique
- L Innovation : lincontournable (pour la plupart) des entreprises
5) Prérequis : Avoir une licence de Biologie / Biochimie
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel16824Travail personnel12416
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
1° partie : Cours et TP sur Site de lINPI sur le Brevet ; assurés par lINPI de Rennes et son directeur Mr René LEBLANC
2° partie : Cours sur lInnovation assurée par Créativ , cellule Innovation Européenne de la Chambre de Commerce et dIndustrie de Rennes, et son directeur Mr Jean-Luc Hannequin.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire ( pour Master Biologie Gestion
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Les étudiants travailleront sur des cas concrets afin de disposer dun outil professionnel directement utilisable dans lentreprise
12) Capacité d'accueil : Limitée par la capacité daccueil de lINPI : 32 étudiants
________________________________________________________________________
(UE de Mathématiques
S 1 : Mathématiques
Numéro de lUE : MATH 10
Intitulé de l' U E : Mathématiques
(demi-UE complémentaire de lE.C.P.)
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistique pour la biologie
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours : 1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions
3) Semestre n° 1
4) Objectifs :
Donner les bases danalyse des fonctions dune variable, nécessaires pour les enseignements de physique, chimie et biologie
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel-24-24Travail personnel2424* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE :
7) Programme des enseignements:
Limites et continuité
Dérivées et primitives
Fonctions usuelles : trigonométriques, logarithme, exponentielle et puissances
Développements limités et formule de Taylor
Equations différentielles linéaires du 1er et du 2nd ordre
8) Bibliographie :
Y Allain A Dorange J Langlois « Mathématiques pour les sciences de la vie 1 analyse »
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 2 : Analyse 1
Numéro de lUE : MATH 20
Intitulé de l' U E : Analyse 1
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistique pour la biologie
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours : 1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Donner les bases danalyse des fonctions de deux variables, nécessaires pour les enseignements de physique, chimie et biologie.
5) Prérequis : mathématiques S1
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel-24-24Travail personnel2424* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE :
7) Programme des enseignements:
Fonctions de deux variables
Dérivées partielles et notion de différentielle
Formule de Taylor et applications
Intégrales doubles, calcul daires et de volumes
8) Bibliographie :
Y Allain A Dorange J Langlois « Mathématiques pour les sciences de la vie 1 analyse »
J.D. Murray « Mathematical biology »
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 3 : Algèbre linéaire 1
Numéro de lUE : MATH 21
Intitulé de l' U E : Algèbre linéaire 1
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistique pour la biologie
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours : 1ère année des licences de Biologie pour toutes les mentions
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Donner les bases du calcul vectoriel et matriciel nécessaires pour les enseignements de physique, chimie et biologie avec application à la régression
5) Prérequis : mathématiques S1
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel-24-24Travail personnel1616* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE :
7) Programme des enseignements:
Calcul vectoriel et interprétation géométrique
Régression affine simple et multiple, interprétation géométrique
Utilisation du calcul matriciel et autres applications
8) Bibliographie :
B. Falissard « Comprendre et utiliser les statistiques dans les sciences de la vie »
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
La première année des licences a été conçue de manière à favoriser linsertion des néo-bacheliers dans le système universitaire et lutter contre léchec.
Lenseignement théorique dispensé en cours/TD par groupe de 40 fait partie de ce dispositif.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 4 : Analyse 2
Numéro de lUE : MATH 40
Intitulé de l' U E : Analyse 2
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistique pour la biologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licences de biologie
2) Parcours : 2ème année des licences de Biologie pour toutes les mentions
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
Donner des compléments danalyse utiles pour les enseignements de physique, chimie et biologie et indispensables pour la troisième année de licence de bio-informatique.
5) Prérequis : mathématiques S1 et analyse S2 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
Cours T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel1212-24Travail personnel8816* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Convergence de suites et de séries.
Séries entières et séries de Fourier
Filtrage linéaire à temps discret et à temps continu.
Transformée de Fourier rapide.
8) Bibliographie :
Y Allain A Dorange J Langlois « Mathématiques pour les sciences de la vie 1 analyse »
J.D. Murray « Mathematical biology »
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 4 : Algèbre linéaire 4
Numéro de lUE : MATH 41
Intitulé de l' U E : Algèbre linéaire 2
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistique pour la biologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licences de biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours : 2ème semestre
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
Donner des compléments du calcul vectoriel et matriciel nécessaires pour les enseignements de physique, chimie, biologie et biostatistique avec application à lanalyse de variance.
5) Prérequis : mathématiques S1 et algèbre linéaire S2
6) Contenu des enseignements:
Cours T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel1212-24Travail personnel8816
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Calcul matriciel ; produit de matrices
Matrices de covariance ; matrices orthogonales , inverse dune matrice, diagonalisation
Utilisation du calcul matriciel en analyse de variance et autres applications (transformée de Fourier rapide
)
8) Bibliographie :
B. Falissard ?
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 7 : Statistiques et Méthodes de Classifications
Numéro de lUE : MATH 70
Intitulé de l' U E : Statistiques et Méthodes de Classifications
Responsable(s) : J. DESHAYES
Equipe(s) pédagogique(s) : Mathématiques et statistiques pour la biologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Biologie et Environnement mention Bio-Informatique
2) Parcours : 1ère année de master
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs : Donner aux étudiants une formation de base sur les outils mathématiques, modèles probabilistes et méthodes statistiques utilisés en biologie et en particulier en génomique dans les domaines d'intérêt du master.
5) Prérequis :
- introduction aux probabilités-statistiques et connaisance des tests statistiques les plus usuels, - module de biologie évolutive ou équivalent.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24241260Travail personnel18241860
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Définition de problèmes biologiques motivant l'introduction des outils - Données dépendantes et modèles de chaînes de Markov - Calcul matriciel : vecteurs et opérations sur les vecteurs, interprétation géométrique matrices, produit de matrices, matrices particulières : matrices stochastiques, matrices de covariances, matrices orthogonales ; matrice inverse ; diagonalisation de matrices et interprétation - Estimation et tests statistiques méthode du maximum de vraisemblance ; statistique bayésienne - Applications aux modèles suivants : régression multiple et analyse de variance - Chaines de Markov : simulation d'évolutions dans le cas stationnaire ou non (exemple des processus de branchement), estimation paramétrique - Analyse de données introduction aux méthodes factorielles (ACP, analyse discriminante,AFC) méthodes de classification et clustering
TD et TP d'applications générales et en génomique, à mettre au point en collaboration avec les biologistes. logiciels statistiques et logiciels de simulation à préciser
8) Bibliographie :
S. Frontier D. Davoult V. Gentilhomme Y. Lagadeuc « Statistique pour les sciences de la vie et de lenvironnement »
M.S. Waterman « Introduction to computational biology »
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40
(UE de Chimie
S 2 : Chimie des Solutions et Méthodologie
Numéro de lUE : CHIM 20
Intitulé de l' U E : Chimie des Solutions et Méthodologie
Responsable(s) : M. Hissler et S. Dérien
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Toutes les licences du domaine Sciences de la Vie
2) Parcours : lUE sera enseignée en première année (L1)
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs : Munis des résultats de la thermodynamique, essentiellement de la loi des équilibres, létude de quelques types particuliers déquilibres vont être abordés.
Nous étudierons ainsi successivement les équilibres entre acides et bases, entre oxydant et réducteurs en solutions aqueuses.
Pour les équilibres acido-basiques, les définitions fondamentales seront données : basicité, acidité, couple acido-basique, force des acides et des bases ; les propriétés acido-basiques de leau seront décrites et la notion de pH sera définie.
Pour les équilibres rédox, les notions de base seront introduites : oxydant , réducteur, oxydation et réduction, réaction doxydoréduction, nombre doxydation ; la notion de potentiel doxydoréduction sera définie et appliquée aux piles électrochimiques.
5) Prérequis : CHIM 1 : notions de thermodynamique sur les équilibres chimiques et sur les
déplacements des équilibres chimiques.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel888--24Travail personnel754--16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Electrolytes
Rôle du solvant, Constante d équilibre
Equilibres acido-basiques
Diagrammes de prédominance
Acidité et pH, solutions tampons
Réactions rédox
Nombre doxydation
Ecriture des réactions rédox
Etude de Piles électrochimiques
Potentiel délectrode et de Nernst
Méthodologie
Travaux pratiques : atomistique / thermodynamique / réactions acides-bases.
8) Bibliographie : Paul Arnaud « Cours de Chimie Physique » Dunod
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) : -
12) Capacité d'accueil : -
S 3 : Chimie organique générale
Numéro de lUE : CHIM 30
Intitulé de l' U E : Chimie organique générale
Responsable(s) : Pascal PELLON
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
2) Parcours : 2ème année de la licence
3) Semestre n° : S3
4) Objectifs : Appréhender les bases de la chimie organique : réactivité, structure, groupement fonctionnel.
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2420160060Travail personnel2424120060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Cinétique chimique
Ordre, molécularité, vitesse dune réaction.
Lois cinétiques de réactions simples.
Introduction générale à la chimie organique
Nomenclature, isoméries.
Effets électroniques (inductif, mésomérie, moment dipolaire).
Chimie organique descriptive
Alcènes, Alcynes, dérivés halogénés aliphatiques.
Organomagnésiens
Alcools, thiols, amines.
Dérivés carbonylés, acides et dérivés.
8) Bibliographie :
Cours de chimie organique, Paul Arnaud, Editions Dunod
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Physico-chimie
Numéro de lUE : CHIM 40
Intitulé de l' U E : Physico-chimie
Responsable(s) : Sylvie Dérien, Muriel Hissler
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : L2 Licence de biochimie et biologie moléculaire
3) Semestre n° : S4
4) Objectifs :
Comprendre lévolution de divers systèmes en équilibre en solution aqueuse. Acquérir des notions de base en spectroscopies pour analyser des molécules organiques.
5) Prérequis :
UE CHIM 1 et CHIM 2 (ou un niveau équivalent en chimie générale)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24241260 Travail personnel2430660
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Chimie générale
Equilibres de complexation (complexes métalliques, stabilité, complexes et acidité)
Equilibres de solubilité (solubilité et produit de solubilité, séparation des ions, solubilité et pH, compétition solubilité-complexation)
Oxydoréduction (rappels, échelle de potentiels, types délectrodes, modification des propriétés oxydoréductrices)
Liaison chimique (rappels sur le modèle de Lewis, hybridation)
Notions de chimie de coordination (tableau périodique des métaux de transition, géométrie des complexes)
Notions de chimie minérale (diagrammes de phase, champ cristallin)
Etude spectroscopique des molécules organiques
Bases de spectroscopies IR, UV, RMN et spectrométrie de masse.
8) Bibliographie :
Cours de chimie-physique, Paul Arnaud, Editions Dunod. Analyse chimique, F. et A. Rouessac, Editions Masson.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 4 : Atomistique, liaisons chimiques & applications en chimie organique
Numéro de lUE : CHIM 41
Intitulé de l' U E : Atomistique, liaisons chimiques & applications en chimie organique
Responsable(s) : O. MONGIN
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire, moléculaire et Physiologie spécialité Sciences Végétales et spécialité Biologie appliquée
2) Parcours : L2 pour les spécialités Sciences végétales et Biologie appliquée
3) Semestre n° : 4
4) Objectifs :
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique :
Atomistique et liaisons chimiques (24 h)
Notions dorbitales atomiques et moléculaires : liaisons chimiques
Diagrammes dorbitales
Effets inductifs et mésomères
Applications en chimie organique (24h)
Stéréochimie
Entités réactives et mécanismes
Cinétiques des réactions simples et thermodynamique (12h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 : Stéréochimie et Réactivité en Chimie Organique
Numéro de lUE : CHIM 51
Intitulé de l' U E : Stéréochimie et Réactivité en Chimie Organique
Responsable(s) : JF Carpentier
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie & Biologie Moléculaire
2) Parcours :
L3 de Licence "Biochimie & Biologie Moléculaire"
ouvre vers:
Master Recherche "Biochimie & Biologie Moléculaire"
Master "Chimie du Vivant"
3) Semestre n° : S5
4) Objectifs :
Compléments de chimie organique permettant d'appréhender des processus biologiques fondamentaux et la réactivité de molécules naturelles.
5) Prérequis :
CHIM 3: "Chimie organique fondamentale" ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel222216--60Travail personnel27276--60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Stéréochimie fondamentale (éléments de symétrie, chiralité, prochiralité
.)
Equilibres conformationnels en série cyclique
Mécanismes et intermédiaires réactionnels: réactivité, aspects thermodynamiques et cinétiques ; Applications à la chimie des polymères
Alcanes et processus radicalaires; dégradation oxydante des lipides, processus redox
Hydrocarbures et hétérocycles aromatiques, phénols: Aromaticité, substitution électrophile ; Applications en synthèse de médicaments
8) Bibliographie :
Volhardt, "Chimie Organique"
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : illimitée (dans la mesure des possibilités en TP)
S 6 : Chimie des Composés Polyfonctionnels dinterêt Biologique
Numéro de lUE : CHIM 60
Intitulé de l' U E : Chimie des Composés Polyfonctionnels dinterêt Biologique
Responsable(s) : F. Berrée ; J. Vidal
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie et de Biologie Moléculaire
2) Parcours : L3 Licence de Biochimie et de Biologie Moléculaire
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
Ce cours développe les outils nécessaires à la compréhension de la réactivité des molécules biochimiques. Il explore la synthèse par voie chimique de ces molécules et danalogues non-naturels ainsi que leurs applications en chimie.
5) Prérequis :
UE pré-requises : CHIMIE ORGANIQUE GÉNÉRALE (CHIM 3) ; STÉRÉOCHIMIE ET RÉACTIVITÉ EN CHIMIE ORGANIQUE (CHIM 5)
niveau équivalent en cas de mobilité : réactivité des fonctions de base en chimie organique, mécanismes réactionnels, stéréochimie.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel22h18h20h60 Travail personnel30h20h10h60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
- Acides aminés et Peptides.
Structure, propriétés acido-basiques (rappels).
Introduction à la préparation des acides aminés par voie chimique : dédoublement, synthèse asymétrique. Acides aminés non-naturels.
Liaison peptidique.
Introduction à la synthèse peptidique : protection, activation et couplage.
Détermination chimique de la séquence des peptides.
- Sucres.
Stéréchimie, mutarotation (rappels).
Réactivité des monosaccharides. Protection et glycosidation.
Structure de quelques disaccharides, applications industrielles.
Introduction à la synthèse des oligosaccharides.
Sucres en synthèse asymétrique.
- Hétérocycles azotés et oxygénés dintérêt biologique.
Structure, propriétés, synthèse et dérivés naturels dhétérocycles
(aziridine, indole, quinoléine, isoquinoléine, pyrimidines, purines).
- Terpènes et Stéroïdes.
Structure et intérêt industriel.
Transpositions des carbocations.
Exemples dhémisynthèses et de synthèses totales de terpénoïdes.
Synthèse de polycycles condensés.
8) Bibliographie :
VOLLHARDT K. P. C. ; SCHORE N. E. Organic Chemistry: Structure and Function ; W. H. Freeman ; 2002. (Traduction française : Traité de chimie organique ; De Boeck ; 1999)
CLAYDEN J ; GREEVES N. ; WARREN S. ; WOTHERS P. Organic chemistry ; Oxford University Press ; 2001. (Traduction française : Chimie organique ; De Boeck ; 2003)
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 6 : Chimie Organique et Inorganique appliquée aux Productions Végétales
Numéro de lUE : CHIM 61
Intitulé de l' U E : Chimie Organique et Inorganique appliquée aux Productions Végétales
Responsable(s) : J.P. Bazureau
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biologie, mention BCMP spécialité Sciences Végétales
Licence de Biologie, spécialité Biologie appliquée
2) Parcours : L3 spécialité « Sciences végétales » et Biologie appliquée de la mention BCMP
3) Semestre n° : 6
4) Objectifs :
5) Prérequis : UE de Chimie en S4 ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Groupements fonctionnels (CM/TD : 26h)
Alcools, thiols
Amines
Aldéhydes, cétones
Phénols
Hétérocycles aromatiques
Acides carboxyliques et dérivés (amides, nitriles, esters).
(*) à chaque chapitre, des exemples de composés organiques issus du monde végétal seront traités
Propriétés chimiques des éléments N, P, K, O et S (CM/TD : 12h)
Chimie des éléments de transition Mn, Fe, Mg, Co, Cu, Mo (CM/TD : 8h)
Cinétique des réactions complexes et enzymatiques ( CM/TD : 14h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Stratégies en synthèse organique
Numéro de lUE : CHIM 70
Intitulé de l' U E : STRATÉGIE EN SYNTHÈSE ORGANIQUE
Responsable(s) : Joëlle VIDAL ; Sylvie DÉRIEN
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
master chimie du vivant
master biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : M1, master biochimie et biologie moléculaire
3) Semestre S7
4) Objectifs :
Ce cours développe différents outils permettant la création de la liaison carbone carbone en chimie organique. Il introduit les notions de base de la rétrosynthèse et de la synthèse asymétrique. La réactivité des énolates et dérivés, une introduction aux réactions péricycliques et à la catalyse organométallique seront développées dans ce but.
5) Prérequis :
UE pré-requises : CHIM 3, CHIMIE ORGANIQUE GÉNÉRALE ; CHIM 5, STÉRÉOCHIMIE ET RÉACTIVITÉ EN CHIMIE ORGANIQUE.
niveau équivalent en cas de mobilité : réactivité des fonctions de base en chimie organique, mécanismes réactionnels, stéréochimie.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel24201660 Travail personnel3220860
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Introduction à la rétrosynthèse : disconnexion et synthon
Enolates et organolithiens : structure et préparation, C-alkylation et O-silylation des énolates, stéréosélectivité de laddition des lithiens sur le carbonyle (Felkin-Anh), addition1,2 et 1,4 aux énones, aldolisation (mixte, intramoléculaire, aldolisation de Mukayama), réactions apparentées à laldolisation, énolates et réactions stéréosélectives, notions de synthèse asymétrique, carbanions stabilisés par le soufre et « umpolung ».
Réactions péricycliques : réactions permises et réactions interdites (aspect expérimental), cycloaddition : régiosélectivité et stéréosélectivité de la réaction de Diels-Alder, interprétation de la réaction de Diels Alder à laide des orbitales frontières, transposition de Cope et de Claisen, réactions de transfert de groupe.
Catalyse organométallique pour la synthèse : caractéristiques des complexes et réactions fondamentales, liaisons métal-molécule, métalloporphyrines, couplage carbone-carbone (réactions de couplage mixte, de Heck et d'activation allylique), métaux-carbènes.
Étude de quelques synthèses.
8) Bibliographie :
VOLLHARDT K. P. C. ; SCHORE N. E. Organic Chemistry: Structure and Function ;4th Ed ; W. H. Freeman ; 2002. (Traduction française : Traité de chimie organique ; De Boeck ; 1999)
CLAYDEN J ; GREEVES N. ; WARREN S. ; WOTHERS P. Organic chemistry ; Oxford University Press ; 2001. (Traduction française : Chimie organique ; De Boeck ; 2003)
CAREY F. A. ; SUNDBERG R.J. Advanced Organic Chemistry, 4th Ed ; Part B : reactions and synthesis ; Kluwer Academic/Plenum Publishers ; 2001 (Traduction française : Chimie organique avancée ; Tome 2 ; De Boeck ; 1997)
ASTRUC D. Chimie organométallique ; EDP Sciences ; 2000.
MATHEY F. ; SEVIN A. Introduction à la chimie moléculaire des éléments de transition ; Ellipses ; 1991.
9) Coefficient 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Spectroscopie et Hétérochimie
Numéro de lUE : CHIM 71
Intitulé de l' U E : Spectroscopie et Hétérochimie
Responsable(s) : Pascal PELLON, Régis REAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master Biologie et Biochimie Moléculaire, Master Chimie du Vivant
2) Parcours : M1 Première année de Master Recherche
3) Semestre n° : S7
4) Objectifs :
Etude spectroscopique des molécules organiques, appréhender la relation entre structure chimique et propriétés spectroscopiques.
Etablir des relations structures-propriétés pour les dérivés organophosphorés et organosoufrés. Donner des méthodes modernes daménagements fonctionnels utilisant ces dérivés.
5) Prérequis :
CHIM 3 :Chimie Organique générale
CHIM 4 :Physico-chimie
CHIM 5 :Stéréochimie et réactivité en chimie organique
CHIM 5 :Chimie des composés polyfonctionnels dintérêt biologique
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2424120060Travail personnel361860060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Spectroscopie
Spectres UV/visible : Chromophores, application de la spectroscopie UV/visible, méthodes chiroptiques
Spectres infrarouges, spectres Raman, IRFT.
Spectres de résonance magnétique nucléaire : RMN et structure moléculaire, RMN multinoyaux, RMN 2D spectres de corrélations H-H et C-H, DEPT.
Spectres de masse : Procédés dionisation, détecteur et analyseurs, fragmentation de composés organiques, distribution isotopique.
Hétérochimie :
Concepts généraux sur la chimie des hétéroéléments (analogies et différences avec les éléments de la deuxième période : C/Si, N/P, O/S)
Outils pour laménagement fonctionnel de molécules organiques (oxydation, réduction, synthons, inversion de polarité
)
Chimie des composés organiques du phosphore et soufre (fonctions, applications, molécules bio-actives
)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Chimie et Biochimie du médicament
Numéro de lUE : CHIM 80
Intitulé de l' U E : Chimie et Biochimie du médicament
Responsable(s) : Olivier MONGIN
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie + Biochimie et Biologie moléculaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master Biochimie et Biologie moléculaire et Master Chimie du vivant
2) Parcours : Master Biochimie et Biologie moléculaire 1ère année
3) Semestre n° : S8
4) Objectifs : Connaissances fondamentales sur la chimie (structures, propriétés, synthèses) et sur la biochimie (mécanismes daction, biosynthèses) du médicament, ainsi que sur les mécanismes de résistance des agents pathogènes.
5) Prérequis : Notions de Chimie Organique niveau Licence et notions de Biochimie niveau Licence
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel32141460Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
COURS : 32 heures
1. Chimie du médicament (19 heures)
a) Structures, propriétés chimiques, synthèses et hémisynthèses des molécules des principales familles de médicaments (13 heures):
- Antibiotiques et anti-infectieux
- Anticancéreux
- Médicaments du système nerveux
- Médicaments du système cardiovasculaire
- Médicaments du système endocrinien
b) De la molécule à lagent thérapeutique : lexemple des peptides (6 heures):
- Recherche de molécules tête de série
- Modifications chimiques du squelette
- Notions de peptidomimétique peptidique et non peptidique
- Vectorisation de lagent exogène
- Applications dans les traitements anti-HIV
2. Biochimie du médicament (13 heures)
a) Mécanismes daction des principales catégories dantibiotiques
b) Mécanismes de résistance des agents pathogènes aux antibiotiques
c) Mécanismes daction de médicaments agissant sur des récepteurs protéiques du corps humain
d) Biosynthèses des antibiotiques
TD : 14 heures
Exercices portant sur le programme du cours : 8 h pour la partie Chimie et 6 h pour la partie Biochimie.
TP : 14 heures
Deux étapes de la synthèse dun médicament (8 h)
Réalisation dun antibiogramme et étude de laction dune bêta-lactamine sur une bactérie (6 h).
8) Bibliographie :
« Guide de Chimie Thérapeutique » (S. Kirkiacharian) (Editeur : Ellipses) ISBN = 2-7298-4667-0
« Antibiotiques, agents antibactériens et antifongiques » (A. Bryskier) (Editeur : Ellipses)
ISBN = 2-7298-4712-X
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE.
12) Capacité d'accueil : sans limite.
S 8 : Agrochimie et Phytochimie
Numéro de lUE : CHIM 81
Intitulé de l' U E : Agrochimie et Phytochimie
Responsable(s) : P. LEGREL, JP BAZUREAU
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master recherche 1 en Biologie et Environnement
Mention : Sciences végétales fondamentales
Master professionnel 1 en Sciences agronomiques et agroalimentaires
Mention : Sciences et productions végétales
2) Parcours : M1 recherche ou M1 professionnel (domaine végétal)
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Acquérir les bases de chimie minérale et agrochimie et de spectroscopie permettant daborder létude de la nutrition minérale, de la composition et de la qualité de la matière végétale.
5) Prérequis : Enseignements de chimie de la filière végétale en L2 et L3
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel48h12h60 h Travail personnel40h20h60 h
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Contenu pédagogique :
Chimie des pesticides et des régulateurs de croissance (20h)
Phytochimie et Chimie des substances naturelles végétales (15h)
Introduction aux méthodes spectroscopiques (25h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
(UE de Physique
CHIMIE-PHYSIQUE
Numéro de lUE : CHIM-PHYS
Intitulé de l' U E : CHIMIE, PHYSIQUE
Responsable(s) : Stéphane Golhen, Véronique Vie
Equipe(s) pédagogique(s) : Chimie + Physique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Toutes les Licences du domaine Biologie.
2) Parcours :
L1 licences biologie.
3) Semestre n° : 1
4) Objectifs :
Acquisition des bases de chimie générale (atomistique, liaison chimique et thermodynamique chimique)
Illustration du rôle de la physique en biologie
5) Prérequis : Baccalauréat scientifique
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2725860Travail personnel25 35 60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
CHIMIE
ATOMISTIQUE
Le spectre de latome dhydrogène
Introduction au modèle quantique de latome
Application à latome polyélectronique
Le tableau périodique
La liaison chimique
La liaison covalente
La géométrie moléculaire
Les autres liaisons fortes (métallique, ionique) Les interactions intermoléculaires
Thermodynamique CHIMIQUE
Le premier principe de la thermodynamique
Applications du premier principe de la thermodynamique
Le second principe de la thermodynamique
La fonction enthalpie libre G, les équilibres chimiques, déplacement des équilibres chimiques
PHYSIQUE APPLIQUEE A LA BIOLOGIE
Premier thème : « Suivi de lévolution dune population de bactéries »
TP : évolution dune population de bactéries avec mesures de densité optique.
Cours-TD : lois exponentielles, notions de constante de temps, durée de vie.
Deuxième thème : « Quest-ce que le son ? »
TP : mesure le seuil daudibilité de loreille humaine. Utilisation : multimètre, oscilloscope.
Cours -TD : notions sur la nature et la propagation du son (ondes acoustiques, vitesse du son), audibilité (en fréquence et en amplitude, comparaison avec dautres espèces).
Troisième thème : « Correction optique des défauts de lil, instruments oculaires »
TP : modélisation du cristallin et la rétine dun il par une lentille convergente et un écran, défauts de lil.
Cours-TD : lentilles, construction géométrique de rayons lumineux, fonctionnement dinstruments oculaires simples ou composés (loupe, microscope,
), notions dobjectif, doculaire, de grossissement et de grandissement.
Quatrième thème : « Lénergie dans la matière »
TP : série dexpériences illustrant diverses notions ou phénomènes où intervient lénergie: tension de surface, capillarité, changement détat (liquide-vapeur), etc.
Cours-TD : notion dénergie, liaisons dans la matière (gaz, liquide, solide), rôle dans les changements détats, et dans tous les phénomènes vus en TP.
8) Bibliographie :
Chimie : Cours de chimie physique, Paul Arnaud, Editions Dunod.
Physique : A. Bouyssy, M. Davier, B. Gatty : Physique pour les sciences de la vie, 3 tomes
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S2 : Etats de la matière et Interactions
Numéro de lUE : PHYS 20
Intitulé de l' U E : Etats de la matière et Interactions
Responsable(s) : S. Le Picard
Equipe(s) pédagogique(s) : Physique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
Licences de Biologie
2) Parcours : 1ère année
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs :
Description des états de la matière, changement de phase.
Présentation des forces et interactions existantes dans la matière
5) Prérequis :
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel121224Travail personnel24
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Etats de la matière : gaz-liquide-solide, changements de phase (ex : lipides).
Forces, interactions, dipôle (ex : électrophorèse).
8) Bibliographie :
A. Bouyssy, M. Davier, B. Gatty : « Physique pour les sciences de la vie », tome 2.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
S4 : La Physique pour les Sciences de la Vie
Numéro de lUE : PHYS 40
Intitulé de l' U E : La Physique pour les Sciences de la Vie
Responsable(s) : S. Carles
Equipe(s) pédagogique(s) : Physique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire
Licences de Biologie
2) Parcours :
3) Semestre n° : 4
4) Objectifs :
Acquisition des notions nécessaires pour comprendre (1) les principes physiques qui gouvernent les structures et les fonctions du vivant et (2) les méthodes physiques utilisées en Biochimie et Biologie.
5) Prérequis : 1ère année S1, S2.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3022860Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Thermodynamique :
-Température, énergie, osmose, pression de surface, désordre et spontanéité, mouvement brownien.
Transport - Fluides :
- Diffusion (membrane), viscosité, sédimentation, ultracentrifugation.
- Dynamique des fluides.
Ondes et signaux :
- Diffraction, interférences, polarisation, instruments danalyse (spectro
).
- Analyses de signaux, signaux périodiques, non périodiques (audition, vision, imagerie).
Particules, Atomes et Molécules :
- Particules et radioactivité.
- Notions sur la structure des atomes et des molécules utiles à la compréhension de la RMN, la spectroscopie et la fluorescence.
8) Bibliographie :
A. Bouyssy, M. Davier, B. Gatty : « Physique pour les sciences de la vie », tomes 2 et 3.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
S3, 5, 6 : ENERGIE - Transport - Fluides
Numéro de lUE : PHYS 30
Intitulé de l' U E : Energie - Transport - Fluides
Responsable(s) : V. Vié
Equipe(s) pédagogique(s) : Physique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
- Licences de biologie
- Licence de Biochimie et Biologie moléculaire (sauf pour les étudiants ayant choisi lUE de Physique en option de S4).
2) Parcours :
3) Semestres n° : 3, 5 ou 6
4) Objectifs :
Comprendre les principes physiques qui gouvernent la structure et le fonctionnement de la matière vivante à ses différents niveaux dorganisation.
5) Prérequis : 1ère année S1, S2 ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301848Travail personnel48
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
- Température, énergie, osmose, pression de surface, désordre et spontanéité, mouvement brownien.
- Diffusion (membrane), viscosité, sédimentation, ultracentrifugation.
- Dynamique des fluides.
8) Bibliographie :
A. Bouyssy, M. Davier, B. Gatty : « Physique pour les sciences de la vie », tome 2.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel
libre : (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
S3,5,7 : Ondes, signaux, particules, atomes et molécules
Numéro de lUE : PHYS 31
Intitulé de l' U E : Ondes, signaux, particules, atomes et molécules
Responsable(s) : S. Le Picard, V. Vié
Equipe(s) pédagogique(s) : Physique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
- Licences de biologie
- Licence de Biochimie et Biologie moléculaire (sauf pour les étudiants ayant choisi lUE de Physique en option de S4).
2) Parcours :
3) Semestre n° : 3, 5 ou 6
4) Objectifs :
Acquisition des notions nécessaires pour comprendre (1) les principes physiques qui gouvernent les structures et les fonctions du vivant et (2) les méthodes physiques utilisées en Biochimie et Biologie.
5) Prérequis : 1ère année S1, S2.
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301848Travail personnel48
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements :
- Diffraction, interférences, polarisation, instruments danalyse (spectro
).
- Analyses de signaux, signaux périodiques ou non périodiques (audition, vision, imagerie).
- Particules et radioactivité.
- Notions sur la structure des atomes et des molécules utiles à la compréhension de la RMN, la spectroscopie et la fluorescence
8) Bibliographie :
A. Bouyssy, M. Davier, B. Gatty : « Physique pour les sciences de la vie », tome 3.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel
libre (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : pas de limite.
(UE de Géologie
S2 : Géologie 1
Numéro de lUE : GEOL 20
Intitulé de l' U E : GEOLOGIE 1
Responsable(s) : J. van den DRIESSCHE
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de Biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, licence de Sciences de la Vie et de la Terre, licence pluridisciplinaire
2) Parcours :
U.E. fortement conseillée aux futurs étudiants biologistes se destinant aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Les étudiants doivent acquérir à travers ce module une vision moderne des Sciences de la Terre, qui mettra laccent sur le fonctionnement interne de la Terre. Lidée est de partir dun événement médiatique récent (tremblement de terre, etc) pour montrer comment (et avec quelles limites) la science décrit, modélise puis prédit.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2424Travail personnel10
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S2 : Geologie 2
Numéro de lUE : GEOL 21
Intitulé de l' U E : GEOLOGIE 2
Responsable(s) : L. AQUILINA
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licences de Biologie, licence de Biochimie et Biologie moléculaire, licence de Sciences de la Vie et de la Terre, licence pluridisciplinaire
2) Parcours :
U.E. fortement conseillée aux futurs étudiants biologistes se destinant aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Les étudiants doivent acquérir à travers ce module une vision moderne des Sciences de la Terre, qui mettra laccent sur le fonctionnement externe de la Terre. Lidée est de partir dun événement médiatique récent (inondation, pollution, etc) pour montrer comment (et avec quelles limites) la science décrit, modélise puis prédit.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2424Travail personnel10
Crédit total de lUE : 2
Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S 3 : Matériaux géologiques
Numéro de lUE : GEOL 30
Intitulé de l' U E : MATERIAUX GEOLOGIQUES
Responsable(s) : E. HALLOT
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; S. Blais, P. Boulvais, M.-P. Dabard, E. Hallot, P. Pitra
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
Licence de Sciences et Technologies
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT, comprenant les deux jours de terrain.
3) Semestre n° 3
4) Objectifs :
Devront être acquises les compétences suivantes :
- identifier les principales textures et familles de roches sur macro-échantillons ;
- identifier les principales familles de minéraux au microscope et sur macro-échantillons ;
- faire le lien entre processus et produits.
5) Prérequis :
néant
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel204242 jours soit 12h60Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Les minéraux :
- nucléation et croissance cristalline (2h CM)
- cristallographie géométrique (2h CM + 2h TD)
- propriétés physiques des minéraux et optique cristalline (4h CM + 4h TP)
- principales familles de minéraux et compositions chimiques (8h CM + 8h TP)
Les roches :
- De la texture au mode de formation des roches (3h CM et 2h TD)
- Propriétés physiques des roches (densité, porosité, perméabilité) (1h CM)
- Roches magmatiques (4h TP)
- Roches sédimentaires (4h TP)
- Roches métamorphiques (4h TP)
8) Bibliographie :
Baronnet A. (1988). Minéralogie. Dunod ed. Paris
Bonin B. (1999). La pétrologie. Nathan Université, Paris, 128p.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel ( (prérequis pour pousuivre vers la mention
Sci. de la Terre de la Licence Sci. et Technologies)
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S4 : Structures géologiques
Numéro de lUE : GEOL 40
Intitulé de l' U E : STRUCTURES GEOLOGIQUES
Responsable(s) : P. GAUTIER
Equipe(s) pédagogique(s) :SPM ; P. Gautier, E. Hallot
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
Licence de Sciences et Technologies
2) Parcours :
U.E. dont lessentiel du contenu est mutualisé sur deux parcours :
- dans le parcours Sciences et Technologies, U.E. préparatoire à la mention Sciences de la Terre de la Licence, comprenant deux jours de terrain,
- dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT, ne comprenant pas les deux jours de terrain.
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
A lissue de cet enseignement, létudiant doit savoir :
- identifier et interpréter les principaux types de structures géologiques, en particulier celles liées à la déformation des roches, depuis léchelle de léchantillon macroscopique jusquà celle de la carte (ainsi quà travers une brève initiation sur le terrain, dans le parcours Sciences et Technologies),
- analyser et restituer ces structures dans les trois dimensions de lespace, en particulier à travers la lecture de cartes topographiques et géologiques et la déduction de coupes à léchelle 1/50000, et via une initiation à lutilisation des diagrammes stéréographiques,
- interpréter ces structures en terme de chronologie relative des événements.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2420162 jours soit 12h72 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
- Cadre général : notion de plaque tectonique et de mouvement relatif entre plaques (CM 2h)
- Structures liées à la déformation :
terminologie illustrée (translation, rotation rigide, distortion, axes principaux, forme de lellipsoïde, déf. homogène/hétérogène, continue/discontinue, etc
) (CM 3h)
notions de comportement rhéologique (élastique, fragile, ductile) en fonction des conditions (pression, température, nature de la roche,
) à travers la description dexpériences (CM 3h)
les structures de la déformation discontinue (les différents types de faille et leur interprétation tectonique, fentes de tension, stylolithes) (CM 4h)
les structures de la déformation continue (fabrique homogène : types de schistosité, linéations ; déformation hétérogène : plis, boudins, zones de cisaillement) (CM 6h)
analyse de structures à partir de photos (vues aériennes, paysages, affleurements, vues au microscope) et déchantillons macroscopiques (TD 6h)
- Structures liées au magmatisme (édifices volcaniques, types dintrusions,
) (CM 3h + TD 1h)
- Chronologie relative (relations de recoupement, discordances, critères de polarité, déformations superposées, interactions avec le magmatisme) (CM 3h +TD 3h)
- Analyse de cartes géologiques à léchelle 1/50000 (analyse de la topographie, lecture de la légende, orientation des surfaces, établissement de coupes, principe du schéma structural) (TD 4h + TP 16h)
- Initiation à lutilisation des diagrammes stéréographiques (TD 6h)
- Analyse de structures sur le terrain -parcours Sciences et Technologie uniquement-, combinée à lidentification des types de roche, et application des principes de chronologie relative (2 jours /12h TD)
Les sorties sur le terrain font lobjet dun rapport de quelques pages, où létudiant rend compte de ses observations personnelles et de leur interprétation.
8) Bibliographie :
Park R.G. (1997). Fundamentals of structural geology (3rd edition). Chapman and Hall, london, 202p.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel prérequis pour poursuivre vers la mention
Sciences de la Terre de la Licence Sci. et Technologies
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S4 : Temps géologique
Numéro de lUE : GEOL 41
Intitulé de l' U E : TEMPS GEOLOGIQUE
Responsable(s) : D. NERAUDEAU
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; P. Boulvais, A. Chauvin, P. Courville, S. Fourcade, F. Guillocheau, D. Néraudeau
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
Licence de Sciences et Technologies
2) Parcours :
U.E. dont lessentiel du contenu est mutualisé sur deux parcours :
- dans le parcours Sciences et Technologies, U.E. préparatoire à la mention Sciences de la Terre de la Licence, comprenant deux jours de terrain,
- dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT, ne comprenant pas les deux jours de terrain.
3) Semestre n° 4
4) Objectifs :
Il sagira de définir la notion de temps géologique à différentes échelles de résolution, ainsi que les différentes méthodes, relatives ou absolues, de mesure des vitesses et des durées en géologie. Seront également abordées les précautions dutilisation des différents types de datation, leur congruence, leurs différences et leurs principales applications.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
- Cours : 40h
I - Temps paléontologique (P. Courville, D. Néraudeau, 8h) :
- Les grandes crises et extinctions de masse et leur utilisation dans le découpage
des grands systèmes géologiques,
- Principes et méthodes de la biostratigraphie,
II - Temps lithologique (F. Guillocheau, A. Chauvin, 10h) :
- Cyclostratigraphie et relations espace-temps-sédiments,
- Chimiostratigraphie,
- Magnétostratigraphie,
III - Géochronologie (P. Boulvais, S. Fourcade, 16h) :
- Stabilité et instabilité des nucléides, lois de destruction et production,
- Les concepts mis en jeu au niveau des datations dites « absolues »,
- Les méthodologies (longues et courtes périodes) mises en oeuvre pour dater :
° les événements magmatiques,
° les vitesses daccumulation (ex: sédiments, glaces),
° les temps de résidence (transferts, expositions),
° la déformation,
IV Synthèse (F. Guillocheau, 6h) :
construction, harmonisation et validité de léchelle chronostratigraphique ;
nature et signification de léchelle des temps géologiques, calendrier climatique, calendrier tectonique
- TP/TD : 20h (10 séances de 2h)
I - Principaux fossiles utilisés dans les datations géologiques (P. Courville, 10h)
- marqueurs paléozoïques (2 séances)
- marqueurs mésozoïques (2 séances)
- marqueurs cénozoïques (1 séance)
II - Datations et corrélations radiochronologiques (P. Boulvais, S. Fourcade, 4h)
III - Relations espace/temps en sédimentologie, Diagrammes de Wheeler (F. Guillocheau, 6h)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour la filière SVT)
optionnel ( (pour la filière Sciences et Technologies)
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
En parallèle avec les enseignements présentiels seront proposés aux étudiants du LMD, dune part, et aux enseignants du secondaire et du primaire dans le cadre de la Formation Continue, dautre part, un cycle de conférences annoncé en début dannée.
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S5 : Terre et Planètes
Numéro de lUE : GEOL 50
Intitulé de l' U E : TERRE ET PLANETES
Responsable(s) : A. CHAUVIN
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; A. Chauvin, J. van den Driessche, S. Fourcade
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terrre
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 5
4) Objectifs :
Devront être compris les données suivantes :
- genèse et évolution du système solaire ;
- structures internes des planètes telluriques ;
- fonctionnement de la Terre ;
- différentiation géochimique de la planète Terre.
5) Prérequis :
UE GEOL 401, 402 et 403 de la Licence ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel301848Travail personnel101020
Crédit total de lUE : 5
7) Programme des enseignements :
LUnivers : une brève description (2h CM, 2h TD, S. Fourcade)
- Constitution de lunivers
- Nucléosynthèse
Le système solaire (2h CM, 2h TD, A. Chauvin) :
- Méthodes dexploration ;
- Mécanique du sytème solaire
- Nature et fonctionnement dune étoile : le Soleil ;
- Caractères généraux des planètes
Les planètes telluriques (et la Lune) (2h CM, 2h TD, A. Chauvin) :
- Constitution physique et organisation interne
- Astéroïdes et météorites
La Terre (18h CM, 18h TD)
- Données géophysiques sur la structure interne (A. Chauvin) ;
- Tectonique des plaques (J. van den Driessche) ;
- Mécanismes de différentiation (S. Fourcade).
8) Bibliographie :
Allègre C. (1985). De la pierre à létoile. Fayard ed. Paris, 300p.
Allègre C. (1986). Lécume de la Terre. Fayard ed, Paris, 250p.
Brahic A. (1999). Planètes et satellites. Vuyibert ed, Paris, 360p.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil pour les cours, en groupes de 40 pour les TD.
S5 : Géodynamique interne
Numéro de lUE : GEOL 51
Intitulé de l' U E : GEODYNAMIQUE INTERNE
Responsable(s) : S. BLAIS
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; M. Ballèvre, S. Blais, E. Hallot, P. Pitra, J. van den Driessche
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 5
4) Objectifs :
Devront être assimilées les conséquences de la tectonique des plaques quant à la déformation des matériaux, ainsi quà la genèse des roches magmatiques et métamorphiques.
5) Prérequis :
UE GEOL 401, 402 et 403 de la Licence de Sciences de la Vie et de la Terre ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel303060Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Déformation aux limites de plaques (14h CM, 14h TP, J. van den Driessche)
- Zones de divergence : rifts océaniques et marges passives ;
- Zones de subduction ;
- Zones de collision.
Magmatisme (12h CM, 12h TP, S. Blais, E. Hallot)
- Modalités de la fusion en fonction des sites géodynamiques ;
- Magmatisme océanique (diversité des basaltes) ;
- Magmatisme des zones de subduction ;
- Magmatisme des zones de collison (diversité des granites).
Métamorphisme (4hCM, 4h TP, M. Ballèvre, P. Pitra))
- Gradient géothermique
- Perturbations du gradient géothermique
- Sites géodynamiques du métamorphisme
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil pour les cours, en groupes de 22 pour les TP.
S6 : Géogynamique externe
Numéro de lUE : GEOL 60
Intitulé de l' U E : GEODYNAMIQUE EXTERNE
Responsable(s) : M.-P. DABARD
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; M.-P. Dabard, F. Guillocheau
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 6
4) Objectifs :
Devront être assimilées les processus de genèse des roches sédimentaires, ainsi que les mécanismes dévolution des bassins sédimentaires.
5) Prérequis :
UE 401, 402 et 403 de la Licence Sciences de la Vie et de la Terre ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel303060Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Climat et érosion
Bassins sédimentaires
Interactions hydrosphère-atmosphère
Cycles biogéochimiques
Paléoclimats et paléoenvironnements
- Méthodes de reconstitution ;
- Exemples classiques
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S7 : Hydrologie de surface et systèmes aquifères
Numéro de lUE : GEOL 70
Intitulé de lUE : Hydrologie de surface et systèmes aquifères
Responsable : L. Aquilina
Equipe pédagogique : SPM
Diplôme (s) dont l'UE fait partie :
Master Biologie, Environnement, Santé mention Environnement
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement -
2) Parcours : Master 1ère année
3) Semestre : S7
4) Objectifs :
Comprendre le fonctionnement physique et bio-chimique des hydrosystèmes. Analyser les écoulements et les méthodes d'exploitation et de gestion des aquifères.
5) Prérequis : Connaissance du cycle de l'eau et bases de chimie de l'eau.
Contenu des enseignements :
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Stage
TotalPrésentiel36121260Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements
Ens.CMTPTDCycle de l'eau et hydrologieL.A.2 Hydrogéologie appliquéeO.B.12 46Exploitation et gestion des aquifèresY.Q.8 Hydrogéologie chimique et isotopiqueL.A., MC1086Traitement et pollution des aquifèresM.D.4
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : Obligatoire
9) Modalités pédagogiques° : TP réalisés sur le terrain (site expérimental hydrogéologique de Beaulieu)
10) Capacité d'accueil : illimitée
S7 : Structure, Fonctionnement et Hydrochimie des Sols
Numéro de lUE : GEOL 70
Intitulé de lUE : Structure, fonctionnement et hydrochimie des sols
Responsable : M. Davranche
Equipe pédagogique : SPM
Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Biologie, Environnement, Santé mention Environnement
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement
2) Parcours : Master 1ère année
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
Comprendre le fonctionnement physique et bio-géochimique des sols.
5) Prérequis : Connaissance du cycle de l'eau et bases de chimie de l'eau.
6) Contenu des enseignements :
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Stage/ excursion
TotalPrésentiel2824860Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements
Ens.CMTPTDStructure et évolution des solsM.D.,M.P.D.6 12Rôle des organismes dans les solsD.C.4 44Exploitation et gestion des solsY.Q.4 2Chimie de leau dans les sols et en zone non saturéeM.D.1044Traitement et pollution des solsM.D.42
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : Obligatoire
11) Modalités pédagogiques° : Une sortie de terrain sur létude des sols.
12) Capacité d'accueil : illimitée
S7 : Histoire de la Biosphère
Numéro de lUE : GEOL 72
Intitulé de lUE : Hydrologie de surface et systèmes aquifères
Responsable :
Equipe pédagogique : SPM
1) Diplôme dont l'UE fait partie : Master 1 Sciences de la Vie, de la Terre et de lUnivers (SVTU)
2) Parcours : UE Mutualisée avec la filière SVTU, à lexception du stage de terrain de 2 jours qui est propre aux géologues.
3) Semestre n° : 7
4) Intitulé de l' U E : Histoire de la Biosphère
5) Objectifs : Il sagira de suivre les principales étapes de lévolution de la biosphère depuis la sortie des eaux, jusquà lhominisation en passant par le passage reptiles mammifères, la conquête du milieu aérien et le retour à leau des mammifères.
6) Prérequis : Pour les étudiants inscrits en L2 à Rennes I, il est demandé quils aient suivi lUE Temps Géologique (de L2) pour accéder à lUE Histoire de la Biosphère de L3. Pour les étudiants issus dautres universités, leur inscription dans ce module de L3 seront examinées au cas par cas, sur dossier, par la commission ad hoc.
7) Contenu des enseignements:
60h denseignement dont 48 en salle et 2 jours de terrain
Cours: 20h00 (D. Néraudeau)
Le passage poissons-amphibiens et la conquête du milieu terrestre
Le passage reptiles-mammifères
Le passage dinosaures-oiseaux et la conquête du milieu aérien
Le retour à leau des mammifères.
Lhominisation
TP: 28h00 (P. Courville & D. Néraudeau)
I - Taxonomie, paléoécologie et paléobiogéographie des pricnipaux groupes dinvertébrés (P. Courville)
1 - les Macrofossiles (8 séances)
- les mollusques céphalopodes
- les mollusques gastéropodes
- les mollusques bivalves
- les brachiopodes
- les échinodermes
2 - Les microfossiles (4 séances)
- les foraminifères (2 séances)
- les ostracodes (1 séance)
- le nannoplancton, les diatomées, les radiolaires (1 séance)
II - Evolution des morphologies dentaires et des régimes alimentaires chez les mammifères:
- le cas des Equidés (1 séance)
- le cas des Proboscidiens (1 séance)
TD: 12h00
2 journées de terrain sur les écosystèmes des faluns (en Anjou), des bioconstructions à coraux jurassiques et de la Craie campanienne (en Charentes).
8) Bibliographie :
Une liste douvrages, darticles et dadresses web sera proposée lors du premier cours, pour donner aux étudiants matière à préparer et à compléter les enseignements.
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Stage
CréditsPrésentiel
20h0012h0028h006Travail personnel
9) Coefficient :
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en F. C.) :
En parallèle avec les enseignements présentiels seront proposés aux étudiants du LMD, dune part, et aux enseignants du secondaire et du primaire dans le cadre de la F.C., dautre part, un cycle de conférences annoncé en début dannée. A destination de la F.C., des résumés de cours seront mis à disposition de lAPBG qui sera chargée de diffuser ces document auprès des enseignants du secondaire en SVT.
12) Capacité d'accueil :
Le flux du module Stratigraphie-Paléontologie actuel est de lordre de 120 étudiants en moyenne (de 90 à 150).
Sur ces bases, même si le module Histoire de la Biosphère proposé dans le semestre 7 de la future Licence est en partie différent du Module Histoire de la Biosphère de lactuel Licence BGSTU, le nombre détudiants attendu est:
- en fourchette basse: de 80 à 120;
- en fourchette haute:de 100 à 140.
S8 : Histoire de la Terre
Numéro de lUE : GEOL 80
Intitulé de l' U E : HISTOIRE DE LA TERRE
Responsable(s) : M. BALLEVRE
Equipe(s) pédagogique(s) : SPM ; M. Ballèvre, J. Bouffette, F. Gueydan, F. Guillocheau
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master de Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 8
4) Objectifs :
Devront être comprises les grandes étapes de lhistoire de la Terre, avec une référence particulière à lévolution de la France. Laccent est mis sur une approche pluridisciplinaire à travers lanalyse de documents variés.
5) Prérequis :
UE 501, 502 et 601 de la Licence Sciences de la Vie et de la Terre
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel242448Travail personnel201030
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Le fonctionnement de la Terre :
- La Terre primitive : lArchéen et le Protérozoïque dInde (2h CM, 2h TD : M. Ballèvre)
- La Terre moderne : la chaîne himalayenne (4h CM, 4h TD : M. Ballèvre, F. Gueydan)
Lévolution de la France :
- La chaîne hercynienne en Europe occidentale (2h CM, 2hTD : M. Ballèvre)
- Le Mésozoïque : ouvertures océaniques et bassins continentaux (4h CM, 4h TD : M. Ballèvre, F. Guillocheau)
- La chaîne alpine (4h CM, 4h TD : M. Ballèvre, J. Bouffette)
- Le rifting oligocène (2h CM, 2hTD : M. Ballèvre, J. Bouffette)
- Le puzzle méditerranéen (2H CM, 2h TD : M. Ballèvre, J. Bouffette)
Climat et tectonique au Quaternaire (4hCM, 4h TD : M. Ballèvre)
8) Bibliographie :
Jolivet L.
Dercourt J.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S8 : Erosion reliefs et climats
1) Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement - Resp. : L. Aquilina
UE commune aux spécialités Sciences de la terre et Environnement du Master 1
2) Parcours : Master Pro 1
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E :
Erosion reliefs et climats Resp. S. Bonnet
5) Objectifs :
A l'issue de ce module, devront être acquis:
- les méthodes et techniques d'analyse des reliefs,
- les notions nécessaires à la compréhension du fonctionnement des systèmes géomorphologiques et à l'interprétation des reliefs,
- le rôle de l'érosion dans les processus géodynamiques internes et externes.
6) Prérequis :
7) Contenu des enseignements :
Ens.CMTPTDIntroduction (géodynamique, reliefs, flux)4Objets et marqueurs géomorphologiques510Processus, lois et vitesses dérosion52Dynamique des reliefs682Paléoclimats, paléoreliefs et paléoflux6
8) Bibliographie :
Burbank, D., W., and Anderson, R. S., Tectonic Geomorphology, Blackwell Science, 274 p., 2001. Summerfield, M. A., Global geomorphology, An introduction to the study of landforms, Longman Scientific Technical, Essex, England, 537 p., 1991.
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Terrain
(Eq TD)
CréditsPrésentiel268865Travail personnel202
9) Coefficient :
10) Statut : Optionnel
11) Modalités pédagogiques° :
Outre les enseignements en salle, ce module inclus:
- 1 journée de terrain permettant de familiariser les étudiants avec la réalité des objets naturels,
- 1 journée de TP (8h) de modélisation expérimentale de l'érosion,
- Un projet personnel qui permettra de se familiariser aux méthodes et aux techniques de la géomorphologie par l'analyse du relief d'une région, au choix de l'étudiant. Ce projet inclura la recherche de données, bibliographiques mais surtout via internet (MNT, images satellites, ...), une description morphologique de la région, et une quantification des formes du relief par l'utilisation de logiciels de morphométrie (RiverTools, GridVisual, ...) et de SIG. Ce projet permettra l'application des techniques acquises dans l'UE "Cartographie et spatialisation de l'information" un et pourra éventuellement être complémentaire d'un projet personnel réalisé dans le cadre d'un autre module (UE "Stage Pro" par exemple).
12) Capacité d'accueil : illimitée
S8 : Cartographie et spatialisation de linformation
Code UE : GEOL 83
1) Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement - Resp. : L. Aquilina
UE commune aux spécialités Sciences de la terre et Environnement du Master 1
Master Biologie, Environnement, Santé mention Environnement, Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : Master Pro 1
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E :
Cartographie et spatialisation de linformation Resp. F. Guillocheau
5) Objectifs :
Lobjectif de ce module est de familiariser les étudiants avec les différentes techniques de traitements de linformation géologique pour la restituer en 2D (cartes) ou en 3D (géomodeleurs). Ces différentes techniques (MNT, Télédétection, Bases de données, SIG, Géomodeleurs) seront appliquées sur deux cas afin de sensibliser les étudiants (1) aux croisements de méthodes et (2) à lobligation de traiter des données hétérogènes.
6) Prérequis :
7) Contenu des enseignements :
Ens.CMTPTDAnalyse 3D de la topographie terrestre (terre et mer) - MNT42Télédétection64Notions de base de données et SIG8Les géomodeleurs42Etudes de cas216Application sur le terrain12
8) Bibliographie :
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Terrain
(Eq TD)
CréditsPrésentiel24244127Travail personnel16
9) Coefficient :
10) Statut : Optionnel
11) Modalités pédagogiques° :
12) Capacité d'accueil : illimitée
S8 : Gestion des risques et protection des milieux
Code UE : GEOL 84
1) Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement - Resp. : L. Aquilina
UE Proposée par SPM, optionnelle dans le Master Pro Biologie mention Environnement
Master Biologie, Environnement, Santé mention Environnement, Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : Master Pro 1
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E :
Gestion des risques et protection des milieux Resp. O. Bour
5) Objectifs :
Appréhender la notion de risques et linteraction entre homme et milieux dans les domaines des ressources (eau, sols, matières premières et organismes) et des risques naturels.
6) Prérequis : Pas de prérequis
7) Contenu des enseignements :
Ens.CMTPTDTNotions de statistiquesO. B.4 6 Notions de risques, de modèle prédictifO.B.4Le risque sismique, volcanique, glissements de terrainA.C, JBA, VDD 8 44 Les ressources (eau, sols, minéraux)L.A. S.F. M.B.4Les inondations, gestion de laléa hydrologiqueL.A., O.B.430,5Site de stockage et gestion des déchetsS.F., O.B.42Restauration des sites, des habitatsF.R.430,5
8) Bibliographie :
Chamley, H., Environnements géologiques et activités humaines, Vuibert, 2002. Lundgren, L.W., 1999, Environmental geology, Prentice Hall, 1999
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Terrain
(Eq TD)
CréditsPrésentiel30141067Travail personnel20102
9) Coefficient :
10) Statut : Optionnel
11) Modalités pédagogiques° : Une sortie de terrain.
12) Capacité d'accueil : illimitée
S7 : Cycle hydrogéochimique
Code UE : GEOL 85
1) Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement - Resp. : L. Aquilina
UE Proposée par SPM, optionnelle dans le Master Pro Biologie mention Environnement
Module réalisé en échange avec le Master 1 de Brest (module cycles biogéochimiques océaniques)
Master Biologie, Environnement, Santé mention Environnement, Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : Master Recherche et professionnel 1
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E :
Cycles hydro-biogéochimiques Resp. L. Aquilina et P. Marmonier
5) Objectifs :
Initiation au fonctionnement bio-géochimique des écosystèmes en relation avec le fonctionnement hydrologique et les activités biologiques.
6) Prérequis : Pas de prérequis
7) Contenu des enseignements :
Ens.CMTPTDFonctionnement hydrologique des systèmes naturels souterrains et superficiels et structuration biogéochimiques.L.A., P.M.48Processus microbiens dans les sols et les aquifères.P.M.4Contrôles physico-chimiques et biologiques des cycles biogéochimiques (carbone, azote, phosphore, souffre, oxygène).A.J.F.88Outils géochimiques et isotopiques.C.M.8Etudes de terrain (deux sorties de 6h) sur le fonctionnement biogéochimique des zones humides et des aquifères.12Oxygénation, hypoxie et anoxie en milieu naturels.8
8) Bibliographie : INRA "Qualité des eaux en milieu agricole". Levêques "Ecologie"
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Stage
CréditsPrésentiel2412247Travail personnel10
9) Coefficient :
10) Statut : Optionnel
11) Modalités pédagogiques° : TD sous la forme de deux sorties de terrain. Compte-rendu de sortie de terrain sous forme de projet.
12) Capacité d'accueil : illimitée
S8 : Ressources minérales et énergétiques
1) Diplôme dont l'UE fait partie :
Master Sciences et Technologies - Mention Environnement - Resp. : L. Aquilina
UE commune aux spécialités Sciences de la terre et Environnement du Master 1
Master Biologie, Environnement et Santé mention Environnement, Gestion intégrée des bassins versants
2) Parcours : Master Pro 1
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E :
Ressources minérales et énergétiques Resp. S. Fourcade
5) Objectifs :
Donner aux étudiants une vision « économique » des Sciences de la Terre. Fournir des connaissances de base dans les domaines de la géologie économique : matériaux utiles, gîtes métallifères, combustibles fossiles, prospection (dont méthodes géophysiques). Introduire les étudiants au monde de lentreprise
6) Prérequis : Modules du S7 Sci. de la Terre
7) Contenu des enseignements :
Ens.CMTPTDMétallogénie : notion de gisement et mécanismes de concentration4Les grands types de minéralisation (processus magmatiques, hydrothermaux, sédimentaires)97Matériaux (évaporites, argiles, combustibles fossiles)115Geophysique dexploration42Terrain18
8) Bibliographie :
Evans A.M. (1993) Ore geology and industrial minerals : introduction. Blackwell, Oxford. Pélissonnier H. (2001) Reflexions sur la métallogénie. Industrie minérale.
Cours
T. D.
T. P.
Projet
Terrain
(Eq TD)
CréditsPrésentiel2814187Travail personnel
9) Coefficient :
10) Statut : Optionnel
11) Modalités pédagogiques° :
12) Capacité d'accueil : illimitée
S8 : Ressources et environnEment
Numéro de lUE : GEOL 87
Intitulé de l' U E : Ressources et environnement
Responsable(s) : O. BOUR
Equipe(s) pédagogique(s) : O. Bour, J. Bouffette, M. Ballèvre, C. Robin, S. Fourcade
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master de Sciences de la Vie et de la terre
2) Parcours :
Dans le parcours Sciences de la Vie et de la Terre, U.E. préparatoire aux concours Capes et Agrégation de SVT.
3) Semestre n° 8
4) Objectifs :
Lobjectif prioritaire est de fournir une vision synthétique de toutes les applications des Sciences de la Terre, depuis la prospection et lexploitation des ressources minérales, énergétiques et en eau, jusquà la gestion des problèmes environnementaux liés à ces exploitations.
5) Prérequis :
UE géodynamique externe et Géodynamique interne de la Licence de Biologie, mention Sciences de la Vie et de la Terre
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel303060Travail personnel201030
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Ressources minérales : (15 heures)
Conditions de formation des concentrations dintérêt économique,
méthodes de prospection et dexploitation.
Ressources énergétiques : (15 heures)
matière organique fossile,
géothermie,
minerais radioactifs.
Ressources en eau : (15 heures)
Notions dhydrologie,
Eaux souterraines (aquifères).
Exploitation et protection des resources en eau,
Exemples de pollution.
Gestion des sites et environnement : (6h)
Prévision et prévention des risques naturels (exemple du risque sismique) : (5h)
Grands ouvrages et matériaux de construction : (4h)
8) Bibliographie :
Chamley, H., 2002, Environnements géologiques et activités humaines, Vuibert.
Pélissonnier, H., 2001, Réflexions sur la métallogénie, Les ouvrages de lindustrie minérale.
Biju-Duval, B. 1999, Géologie sédimentaire : bassins, environnements de dépôts, formation du pétrole, Technip.
BODELLE J. & MARGAT J., 1980, L'eau souterraine en France, 216 p, Masson.
CASTANY G., 1982, Principes et méthodes de l'hydrogéologie, 236 p, Dunod.
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire ( (pour le parcours Sciences de la Vie et de la Terre)
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
néant
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil.
S8 : Dynamique de la paleodiversite
Numéro de lUE : GEOL 88
Intitulé de l' U E : Dynamique de la paléobiodiversité
Responsable(s) : O. BOUR
Equipe(s) pédagogique(s) : O. Bour, J. Bouffette, M. Ballèvre, C. Robin, S. Fourcade
Diplôme dont l'UE fait partie : Master 1 Sciences & Technologie, Mention Sciences de la Terre et master Sciences de la Vie et de la Terre
2) Parcours : UE Mutualisée entre deux parcours (Sciences et Techniques et Sciences de la Vie ete de la terre)
3) Semestre n° : 8
4) Intitulé de l' U E : Dynamique de la paléobiodiversité
5) Objectifs : Donner les principes et méthodes danalyse de la paléobiodiversité, tant sur le plan des processus évolutifs que sur le plan des structures paléoécologiques des écosystèmes anciens
6) Prérequis : Des étudiants dhorizons bien différents pourront suivre ce module en Master 1; aucun prérequis précis nest donc obligatoire pour y accéder. A titre de rappel, les 3 filières de Rennes I les plus adaptées pour lintégration de ce module dans le parcours menant au Master Paleo 3 sont: la filière Biologie, la filière enseignement SVT et la filière Sciences & Technologies. Pour les étudiants de ces deux dernières filières, il leur est recommandé, dans loptique du parcours Paleo 3, davoir suivi le Module de L2 intitulé « Temps géologique » (mutualisé entre SVT et S&T) et le module de M1 intitulé « Histoire de la Biosphère » (proposé par la filière SVT).
7) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel303060Travail personnel303060
Crédit total de lUE : 7
30h denseignement en salle plus 5 jours de terrain
Cours: 30h00
Processus évolutifs chez les échinodermes (D. Néraudeau)
Processus évolutifs ches les mollusques (P. Courville)
Processus évolutifs chez les microfossiles et les vertébrés (ATER)
Reconstruction des paléoenvironnements à partir des échinodermes (D. Néraudeau)
Reconstruction des paléoenvironnements à partir des mollusques (P. Courville)
TD: 30h00
5 journées de terrain
8) Bibliographie :
Tous les ouvrages de Steven J. Gould et de Jean Chaline.
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire pour le parcours menant au Master 2 Paleo 3
optionnel pour les autres parcours
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en F. C.) :
En dehors des enseignements présentiels obligatoires (30h en salle et 5 jours sur le terrain), les étudiants seront incités à suivre les conférences relevant des spécialités du parcours Paleo 3 données à Rennes (sur et hors campus), à savoir tout ce qui relève de lévolution, de la climatologie et plus largement des paléoenvironnements.
Le cycle de conférences organiqé annuellement sera proposé en concertation avec les demandes émanant des responsables de la formation continue. Afin de faciliter laccès des enseignants du primaire et du secondaire à ces conférences, elles seront majoritairement organisées le mercerdi après-midi.
12) Capacité d'accueil :
Depuis 3 ans, le flux du module Biodiversité de Maîtrise STU est de lordre de 6 à 9 étudiants. Louverture de ce module aux filières BGSTU et BOP est restée jusquà présent minimale (et quasi confidentielle) car les étudiants devaient payer 2 inscriptions jusquen 2002, ce qui dissuadait plusieurs dentre eux. Ce ne sera plus le cas dans le futur et lorsque linformation sera communiquée aux étudiants, il est clair que le nombre de candidats à ce module dépassera la dizaine, avec un flux maximal dune quinzaine détudiants.
(UE dInformatique
S 3 : Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation
Numéro de lUE : INFO 30
Intitulé de l' U E : Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation
Responsable(s) : Michel Le Borgne
Equipe(s) pédagogique(s) : IFSIC, Biologie Cellulaire
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et Informatique
2) Parcours : 2ème Année
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
Lobjectif est dintroduire les méthodes de conception dalgorithmes et de programmation quil est nécessaire de mettre en uvre dans la conception de logiciels professionnels . Laccent doit être mis sur la correction des algorithmes, la réutilisation des programmes,
. Ceci implique une introduction aux techniques danalyse des problèmes, à larchitecture logicielle.
5) Prérequis : Outils Informatiques ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/
T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Structures de contrôle
Informatique, machine et algorithmes
Programmation fonctionnelle
Analyse descendante
Conception de fonctions récursives
Données, types, abstraction et approche objet
Analyse de problèmes en vue dun traitement informatique
Mise en uvre des objets
Quelques objets génériques : listes et arbres
Compléments sur les structures de contrôle
Itération : boucles pour et tant-que
Langage : Java ou Python ou Ruby
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40
S 4 : Systèmes et réseaux
Numéro de lUE : INFO 40
Intitulé de l' U E : Systèmes et réseaux
Responsable(s) :Michel Le Borgne
Equipe(s) pédagogique(s) : IFSIC, Biologie Cellulaire
Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et Informatique
2) Parcours : 2ème Année
3) Semestre n° : 4
4) Objectifs :
Notions de base sur systèmes et réseaux pour permettre de gérer un petit réseau local, brancher une machine sur un réseau, installer un logiciel, écrire des programmes denchaînement de traitement faisant appel à plusieurs logiciels.
5) Prérequis :
Outils Informatiques , Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/
T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Systèmes (30h)
Introduction aux systèmes
Rôle dun système dexploitation
Unix et Windows NT
Mécanismes dexécution dun programme
Notions sur les processus (compris légers). Communication et synchronisation.
Eléments dadministration système
Réseaux (30h)
Eléments physiques dun réseau local
Notions sur les protocoles
Administration réseau
Sécurité
Langage : Shell ou Python/Perl pour TP, JAVA pour les threads
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40
S 5 : Bases de données et systèmes dinformation
Numéro de lUE : INFO 50
Intitulé de l' U E : Bases de données et systèmes dinformation
Responsable(s) : Michel Le Borgne
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire, IFSIC
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et Informatique
2) Parcours : 2ème ou 3ème Année
3) Semestre n° : 4 ou 5
4) Objectifs : Acquérir les techniques de base de la gestion de linformation
5) Prérequis :
Outils Informatiques, Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/
T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Bases de données : introduction au modèle relationnel
Tables et bases de données
Description logique et organisation physique
Algèbre relationnelle
SQL
Systèmes dinformation de laboratoires biologiques
Concepts de base
Méthodes de conception des systèmes dinformation
Modèles conceptuels de données
Liens avec les bases de données
Spécificité des données biologiques (LIMS)
Langage : SQL
Outil : PowerAMC,
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40
S 5 : Traitement du Signal et de lImage
Numéro de lUE : INFO 51
Intitulé de l' U E : Traitement du Signal et de lImage
Responsable(s) : M. Garreau, L. Senhadji
Equipe(s) pédagogique(s) : Biologie Cellulaire, LTSI (SPM)
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biologie mention Biologie et Informatique
2) Parcours : 3ème Année
3) Semestre n° : 5
4) Objectifs :
A partir de problèmes biologiques, acquérir des connaissances générales sur les méthodes,
en ciblant un sous-ensemble de techniques et en les appliquant à des exemples concrets
5) Prérequis :
Outils Informatiques S1 et Initiation à lAlgorithmique et à la Programmation S 3; Maths (avec bases complémentaires incluses dans ce cours) ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel60 Travail personnel60
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Techniques dacquisition de signaux et dImages en Biologie
(Signaux issus de lactivité musculaire ou nerveuse, Microscopies, Approches du type transcriptome et/ou protéome, Vectorisation
)
Position des problèmes biologiques en fonction des objets observés
Méthodes de représentation spatiale/temporelle et fréquentielle
(Transformée de Fourier, échantillonnage,
)
Méthodes de Traitement du Signal et de lImage :
. Filtrage
. Segmentation, Détection
. Caractérisation, Quantification et Classification
Langage : Matlab, voire autre.
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Algorithmique : Complexité et Optimisation
Numéro de lUE : INFO 70
Intitulé de l' U E : Algorithmique : Complexité et Optimisation
Responsable(s) : Michel Le Borgne
Equipe(s) pédagogique(s) : IFSIC
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) recherche de Biologie et Environnement, mention bio-informatique
2) Parcours : Première année du Master
3) Semestre n°7
4) Objectifs :
Se basant sur les premier acquis en algorithmique, cette Unité dEnseignement aborde les structures de données classiques à travers lalgorithmique sur les graphes. On abordera également lévaluation de la complexité des algorithmes, très importante en bio-informatique compte tenu de la taille des données. Enfin les grandes méthodes doptimisation des algorithmes seront abordées.
Ces objectifs constituent un prérequis pour aborder lalgorithmique sur les séquences.
5) Prérequis :
Bases de lalgorithmique : test, récursivité, itération, programmation objet.
Des connaissances de base sur les systèmes dexploitation UNIX au niveau utilisateur sont nécessaires pour les TP.
6) Contenu des enseignements:
CoursCours
T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel402060
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Graphes :
Définitions et représentation
Evaluation de la complexité des algorithmes
Différents types de parcours
Composantes connexes
Application aux arbres et automates
Méthodes de résolution de problèmes
Diviser pour régner et récursivité
Programmation dynamique
Algorithmes gloutons
Branch and bound et heuristiques
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40 (NB : 2x20 pour les TP)
_____________________________________________________________________
S 8 : Algorithmique des Séquences
Numéro de lUE : INFO 80
Intitulé de l' U E : ALGORITHMIQUE DES SEQUENCES
Responsable(s) : Jacques Nicolas
Equipe(s) pédagogique(s) : IFSIC
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master de Biologie et Environnement, mention bio-informatique
2) Parcours : Première année du Master de Biologie
3) Semestre n° 8
4) Objectifs :
Les données de séquences produites de manière massive en génomique exigent des structures de données et une algorithmique adaptée pour être traitées en temps raisonnable. En particulier, il est important de chercher à réaliser le maximum danalyses en temps et espace linéaire par rapport à la taille des séquences considérées. Un autre point fondamental pour contrôler la complexité des traitements est ladaptation et lapplication de techniques doptimisation génériques comme la programmation dynamique. Ce module propose dacquérir une maîtrise théorique et pratique des principaux concepts de ce domaine qui sintéresse à la recherche et la découverte de motifs communs plus ou moins complexes dans les séquences.
5) Prérequis :
Les pré requis en informatique pour linscription à ce module correspondent au module
Algorithmique: Complexité et Optimisation (ACO)
On utilisera des notions de complexité des algorithmes et dalgorithmique des graphes et quelques grandes méthodes de résolution de problèmes.
6) Contenu des enseignements:
Cours /T. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel402060 Travail personnel30151560
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
Théorie des langages:
Quelques notions sur les mots et les langages formels ;
La linguistique des séquences biologiques ;
Lanalyse syntaxique ;
Principaux motifs utilisés en biologie : le cas particulier des langages réguliers.
Méthodes de recherche exacte de motifs
Les méthodes utilisant une structure daccès au motif
Les méthodes utilisant une structure daccès à la séquence
Méthodes de recherche approchée de motifs et comparaison de séquences (suite du module de S7, Outils et Méthodes de Bio-informatique)
Algorithmes de recherche de motifs avec erreurs
Algorithmes dalignement de séquences
Validation des alignements
Méthodes de découverte de motifs
Construction de réseaux de Markov
Algorithmes combinatoires pour la découverte de motifs
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40 max (NB : 2x20 pour les TP)
S 8 : Bases de Données et Gestion de lInformation
Numéro de lUE : INFO 81
Intitulé de l' U.E : Bases de Données et Gestion de lInformation
Responsable(s) : Anita Burgun
Equipe(s) pédagogique(s) : Bio-informatique
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Master 1 (maîtrise) Biologie et Environnement mention Bio-informatique
2) Parcours : 1ère année du Master
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
Lobjectif de ce cours est de fournir aux étudiants une vue d'ensemble des architectures et des environnements de système de gestion de bases de données, et une compréhension des techniques de base de conception dune base de données. Le cours sera illustré par des expériences pratiques de bases de données relationnelles dans le domaine de la biologie moléculaire, tout en révélant les problèmes les plus cruciaux qui émergent lors de la structuration, de linterrogation et de lanalyse de telles données.
Ce module est une alternance de cours où sont introduits les concepts de base sur lorganisation des données dans une base de données, et de travaux pratiques qui concrétisent immédiatement les notions abordées.
5) Pré-requis :
Pré-requis en biologie moléculaire nécessaires pour une bonne expertise du domaine, et une étude plus aisée de lexistant.
Connaissance préalable dun SGBD relationnel et utilisation même rudimentaire du langage de requêtes SQL.
Licence de bio-informatique ou équivalent
6) Contenu des enseignements: (en heures équiv TD)
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel18h18h24h60Travail personnel30h30
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements
Le point sur la modélisation conceptuelle de données. (18h de cours)
Modèle de données
Historique
Modèle relationnel
Modèle à objet
Comparaison (avantages/inconvénients)
Conception de Bases de données (18h TD + 24h TP)
Modélisation et Construction dune base de données avec des considérations relatives aux performances,
Gestion et traitement des transactions,
Interrogation par lutilisation du langage de requête SQL, voire conception dapplications moyennant dautres langages (SQL plus, PL/SQL, Java et C++,
)
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 40
(UE de Gestion
S7 : Concepts de base en Marketing et Stratégie Marketing
Numéro de lUE : GEST 70
Intitulé de lUE : Concepts de base en Marketing et Stratégie Marketing
Responsable : Olivier Droulers
Equipe pédagogique : IUT département GEA
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 1er semestre
3) Semestre 7
4) Objectifs : :
Expliquer les origines du marketing
Appréhender les concepts de segmentation, cible, positionnement et de mix marketing
Comprendre le lien entre la stratégie et le mix marketing
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotalPrésentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Les acteurs constitutifs de loffre et de la demande
Lanalyse dun marché
Le diagnostic dune entreprise sur un marché
Les critères de segmentation dun marché
Le choix dun ou de plusieurs segments : létape de la définition de la cible
Le choix dun positionnement spécifique pour sadresser à la cible
8) Bibliographie
Kotler Philip et Dubois Bernard (2002), Marketing Management, 10ème édition, PubliUnion.
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE :
12) Capacité daccueil :
S7 : Droit et Entreprise
Numéro de lUE : GEST 71
Intitulé de lUE : Droit et Entreprise
Responsable : Armel Liger, Laurent Le Hen, Anne Joyeau
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 1er semestre
3) Semestre : 7
4) Objectifs :
Acquérir les bases théoriques juridiques.
Savoir bâtir un raisonnement juridique
Appréhender la fonction organisationnelle du droit des affaires à travers le contrat, lentreprise individuelle et les principales formes de sociétés
S'adapter aux évolutions législatives et jurisprudentielles.
Faire découvrir les relations juridiques entre employeurs et salariés.
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotalPrésentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
- Lenvironnement juridique et fiscal (6h)
- Le droit des Affaires (22h)
Contrats
Droit des sociétés
- Le droit du travail (8h)
Les sources du droit du travail
Le contrat de travail : sa conclusion, son déroulement, sa rupture
La représentation du personnel
8) Bibliographie
Cozian M., Précis de fiscalité des entreprises
Cozian M., Vialdier A. et Deboissy F., Droit des sociétés (15 éd.), Litec.
Edou E. (1997), Le droit au service de lentreprise, Economica.
Ray Jean Emmanuel (2001), Droit du travail, droit vivant, Editions Liaisons.
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE :
Cours avec remise dun polycopié
TD : exercices, études de cas.
12) Capacité daccueil :
S7 : Politiques de Produits et de Prix
Numéro de lUE : GEST 72
Intitulé de lUE : Politiques de Produits et de Prix
Responsable : Guy Basset
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 1er semestre
3) Semestre : 7
4) Objectifs : :
Analyser les différentes composantes matérielles et stratégiques dun produit
Comprendre la mise en uvre dune politique de produit
Assimiler les différentes pratiques de fixation des prix
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotalPrésentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
- La qualité du produit
- Le packaging
- La politique de marque
- Le cycle de vie du produit
- Le lancement du produit nouveau
- Le choix dune gamme de produits
- Les objectifs dune politique de prix
Les méthodes de fixation des prix
8) Bibliographie
Ouvrages
Botton Marcel (1992), Le nom de marque, Ediscience.
Devismes Philippe (2000), Le Packaging mode demploi, Dunod.
Faye Pierre (1989), Lancer un nouveau produit, Chotard.
Kapferer Jean-Noël (1998), Les marques, capital de l'entreprise (3ème ed.), Editions d'Organisation, Paris.
Kapferer Jean-Noël (2000), Re-marques - les marques à l'épreuve de la pratique, Editions d'Organisation, Paris.
Kapferer Jean-Noël et Gilles Laurent (1992), La sensibilité aux marques: marchés sans marques, marché à marques, Editions d'Organisation, Paris.
Revue :
La Revue des Marques
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
12) Capacité daccueil
S8 : Etudes de Marché
Numéro de lUE : GEST 80
Intitulé de lUE : Etudes de Marché
Responsable : Olivier Droulers et Maryvonne Dagnet*
Equipe pédagogique : IUT département GEA
* Cabinet Dagnet Consultants, Directrice
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 2ème semestre
3) Semestre : 8
4) Objectifs :
En suivant cet UE létudiant doit acquérir les concepts et la démarche lui permettant en seconde année de Master de réaliser une étude de marché réelle pour entreprise.
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Définition dune étude de marché
La recherche du commanditaire
Entretien avec le commanditaire
Rédaction du projet détudes
Réalisation de létude
Présentation des résultats et des recommandations
Suivi des actions et contrôle des réactions du marché
8) Bibliographie
Giannelloni Jean-Luc et Vernette Eric (2001), Etudes de marché (2ème ed.), Vuibert, Paris
Evrard Yves, Pras Bernard et Roux Elyette (1993), Market: études et recherches en marketing. (2ème ed.), Nathan Gestion, Paris,
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
Cours avec remise dun polycopié
TD : exercices, études de cas et encadrement dune étude sur le terrain.
12) Capacité daccueil
S8 : Comptabilité Générale et Comptabilité de Gestion
Numéro de lUE : GEST 81
Intitulé de lUE : Comptabilité Générale et Comptabilité de Gestion
Responsable : Chrystelle Bouguennec et Laure Quatreboeufs
Equipe pédagogique : IUT département GEA
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 2ème semestre
3) Semestre : 8
4) Objectifs :
Comptabilité générale
Connaître et comprendre les bases conceptuelles dun système dinformation comptable, et les méthodes de la comptabilité générale.
Comprendre les principaux documents comptables (bilan, compte de résultat), leur intérêt et leurs limites.
Etre en mesure de communiquer avec des spécialistes de la comptabilité.
Comptabilité de gestion :
Connaître et comprendre les différentes méthodes danalyse des coûts ; être en mesure de discuter les conclusions dune étude de coûts.
Pouvoir comprendre la place dun système de comptabilité de gestion dans le système dinformation de lentreprise, être capable de lutiliser et den cerner les limites.
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel181836Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Comptabilité générale (20h)
Notions fondamentales
Documents de synthèse (bilan, compte de résultat)
Organisation comptable
Comptabilité de gestion (16h)
Calcul et analyse de coûts de revient
Calcul et analyse de coûts partiels, seuil de rentabilité
8) Bibliographie
Alazard C. et Sépari S. (2000), Contrôle de Gestion, Dunod, Paris
Baranger P. et Mouton P. (1997), Comptabilité de Gestion, Hachette, Paris
Burlaud A. et Simon C. (2000), Comptabilité de Gestion Coûts/contrôle, Vuibert, Paris
Burlaud A., Poitrinal F.D. et Salustro E. (1998), Comptabilité et droit comptable, Lintelligence des comptes et leur cadre légal, Gualino
Grenier C. et Bonnebouche J. (1998), Système dinformation comptable Comptabilité générale, Foucher, Paris
Langlois G. et Friédérich M. (2000), Comptabilité générale, Foucher, Paris
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
Cours
TD : nombreux jeux de simulation : « La marée fraternelle », « Kitus », « Shadow Manager »
12) Capacité daccueil
S9 : Distribution et Achats
Numéro de lUE : GEST 90
Intitulé de lUE : Distribution et Achats
Responsable : André Fady
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 3er semestre
3) Semestre : 9
4) Objectifs :
Comprendre les fonctions économiques assurées par le commerce et les divers canaux de distribution
Analyser les critères de choix des circuits par les industriels et les relations producteurs - distributeurs
Aider à assurer la gestion commerciale des canaux
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Les fonctions de la distribution et les méthodes de vente
La longueur des circuits et le niveau de couverture des marchés
Les canaux non contrôlés contractuels et intégrés
Le choix des intermédiaires et leur gestion
Les relations producteurs - distributeurs, le trade marketing et le merchandising
8) Bibliographie
Cliquet Gérard, Fady André et Basset Guy (2002), Le management de la distribution, Dunod, Paris.
Fady André et Seret Michel (2000), Merchandising (5ème éd.), Vuibert, Paris.
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
Cours avec remise dun polycopié
TD : exercices, études de cas et encadrement dune étude sur le terrain
12) Capacité daccueil :
S9 : contrôle de Gestion et Finance
Numéro de lUE : GEST 91
Intitulé de lUE : Contrôle de Gestion et finance
Responsable : Christelle Bouguennec, Moulay Chaibddera, Laure Quatreboeufs
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 3er semestre
3) Semestre : 9
4) Objectifs :
Savoir utiliser les outils du contrôle de gestion (budgets, tableaux de bord, etc.)
Comprendre le fonctionnement dun système budgétaire et de la démarche prévisionnelle.
Sinterroger sur la notion de performance
Fournir les éléments et la démarche danalyse de la situation financière dune entreprise
Expliciter les avantages et les limites de lutilisation des critères financiers de choix des investissements
Susciter une planification des financements à court et moyen terme
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel181836Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Contrôle de Gestion (14h)
Mesure de la performance, tableaux de bord
Gestion budgétaire
Finance (22h)
Analyse des documents de synthèse (bilan, compte de résultat, tableau de financement)
Choix de linvestissement (VAN, TIR)
Choix des sources de financement
Plan de financement et de trésorerie
8) Bibliographie
Burlaud A. et Simon C. (2000), Comptabilité de Gestion Coûts/contrôle, Vuibert, Paris
Charreaux Gérard (1994), Finance dentreprise, Litec, Paris
Eglem Jean-Yves, Philipps André, Christian Raulet et Christiane Raulet (2000), Analyse comptable et financière (8ème éd.), Dunod, Paris.
Gervais Michel (2000), Contrôle de Gestion (7ème éd.), Economica, Paris
Piermay Michel, Hereil Olivier et Lazimi Alain (1998), Mathématiques financières (2ème éd.), Economica, Paris
Raulet Christian, Raulet Christiane et Gouget Christian (2000), Comptabilité analytique et contrôle de gestion, tome 1 et tome 2, Dunod, Paris
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
Cours
TD : exercices, études de cas dentreprises, utilisation du logiciel de jeux de simulation : « Shadow Manager »
12) Capacité daccueil
S9 : Conduite de projet managérial : realisation dune etude de marche
Numéro de lUE : GEST 92
Intitulé de lUE : Conduite de projet marketing
Responsable : Olivier Droulers et Maryvonne Dagnet
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Biologie, Environnement, Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 3ème semestre
Semestre : 9
Objectifs :
Lobjectif de ce module est de permettre aux étudiants de réaliser une véritable étude de marché pour une entreprise, une collectivité ou une association.
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel241236Travail personnel36
7) Programme des enseignements
Létudiant devra chercher un commanditaire, comprendre sa demande et valider cette première étape en rédigeant un projet détude.
Le projet détude accepté, il devra choisir et mettre en uvre une méthodologie lui permettant datteindre les objectifs demandés par le commanditaire.
Puis il présentera une rapport détude de marché qui fera lobjet dune présentation orale devant un jury comportant un membre de léquipe pédagogique et, dans la mesure du possible, un membre de lentreprise « cliente ».
8) Bibliographie
Giannelloni Jean-Luc et Vernette Eric (2001), Etudes de marché (2ème ed.), Vuibert, Paris
Evrard Yves, Pras Bernard et Roux Elyette (1993), Market: études et recherches en marketing. (2ème ed.), Nathan Gestion, Paris,
9) Coefficient
10) Statut
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
Chaque étude de marché sera réalisée par un groupe de 3 à 4 étudiants. Les cours permettront des rappels méthologiques (et une formation sur un logiciel spécialisé : sphinx) et les TD permettront un suivi personnalisé.
12) Capacité daccueil
S10 : stratégie de Communication
Numéro de lUE : GEST 100
Intitulé de lUE : Stratégie de Communication
Responsable : Olivier Droulers et Sophie Lacoste*
Equipe pédagogique : IUT département GEA
* Fédération Régionale de lAgriculture biologique (FRAB), Responsable communication
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 2ème semestre
3) Semestre : 10
4) Objectifs :
Etre capable de définir les objectifs de communication et destimer le budget de communication nécessaire à latteinte des objectifs
Savoir choisir et travailler avec une agence de communication
Savoir répartir les dépenses de communication (équilibre média / hors médias et choix des moyens médias / hors médias) de façon à obtenir le meilleur rapport efficacité / coût.
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotal (équivalent TD)Présentiel241236Travail personnel36
Crédit total de lUE : 4
7) Programme des enseignements
Les relations Entreprise - Agence
Les différentes fonctions dune agence de communication (stratégie commerciale, stratégie de création publicitaire, stratégie de diffusion)
Le choix des moyens (média et hors média)
Le choix des médias (phase délimination, phase dévaluation)
Le choix des supports (analyse dun support, analyse dune combinaison de supports)
Les moyens hors média
8) Bibliographie
Ouvrages
Caumont Daniel (2001), La publicité, Dunod, Paris
Dordor Xavier (1989), Lesprit Média, InterEditions, Paris.
Brochand Bernard et Lendrevie Jacques (2001), Le Publicitor (5ème ed.), Dalloz, Paris.
Revues :
Stratégie
CB News
9) Coefficient : 2
10) Statut : obligatoire
11) Modalités pédagogiques retenues pour lUE
12) Capacité daccueil
S10 : Strategie et Planification marketing
Numéro de lUE : GEST 101
Intitulé de lUE : Stratégie et planification marketing
Responsable : Philippe Robert
Equipe pédagogique : IGR
Diplôme dont lUE fait partie : Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Biologie et Gestion
Parcours : 4ème semestre
3) Semestre : 10
Crédit total de lUE : 4
4) Objectifs :
Acquérir les principaux concepts et méthodes d'aide au raisonnement stratégique.
Comprendre les différentes options stratégiques que peut suivre une entreprise.
Maîtriser les techniques de diagnostic stratégique
Comprendre les liens existant entre les options stratégiques et les questions dingénierie
5) Prérequis
Aucun
6) Contenu des enseignements
CoursTDTPProjetTotalPrésentiel2424Travail personnel24
7) Programme des enseignements
La démarche stratégique
Les étapes du raisonnement stratégique
Gestion stratégique vs gestion opérationnelle
L'identification des métiers de l'entreprise :
Analyse et diagnostic concurrentiels
Le diagnostic dattractivité
Le diagnostic de compétitivité
Les matrices de gestion d'un portefeuille d'activités.
Conception des manoeuvres stratégiques et pilotage stratégique
Les stratégies génériques : domination par les coûts, différenciation, focalisation.
Le choix des modes de développement : de la spécialisation à la diversification
Pilotage stratégique et planification.
8) Bibliographie
Allouche J.t Schmidt G., 1995, Les outils de la décision stratégique, Paris, La Découverte
Bloch A., 1999, L'intelligence économique, Paris, Economica, 1999
Desreumaux A., 1994, Stratégie, Paris, Dalloz. Helfer J.-P., Kalika M., Orsoni J., 1998, Management (stratégie et organisation), Paris, Vuibert
Pateyron E., 1998, La veille stratégique, Paris, Economica, 1998 Salmon R., 1997, Lintelligence compétitive, Paris, Economica
(UE de Langues
S2 : Langues vivantes etrangereS
Numéro de lUE : LANG 20 (anglais), 21 (espagnol), 22 (allemand)
Intitulé de l' U E : LV étrangère : anglais, espagnol ou allemand
Responsable(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
Equipe(s) pédagogique(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
S3 ET 4 : Langues vivantes etrangereS
Numéro de lUE : LANG LANG 30 (anglais), 31 (espagnol), 32 (allemand)
Intitulé de l' U E : LV étrangère : anglais, espagnol ou allemand
Responsable(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
Equipe(s) pédagogique(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
S5 et 6 : Langues vivantes etrangereS
Numéro de lUE : LANG 50 (anglais), 51 (espagnol), 52 (allemand)
Intitulé de l' U E : LV étrangère : anglais, espagnol ou allemand
Responsable(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
Equipe(s) pédagogique(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
L3 : Licence de Biologie Cellulaire, Moléculaire & Physiologie, Licence de Biologie des organismes, Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire, Licence de Biologie mention Biologie et Informatique, Licence Sciences de la Vie et de la Terre, Licence pluridisciplinaire
2) Parcours : 3ème année de la licence
3) Semestre n° : un semestre de présentiel & un semestre dauto-formation
4) Objectifs :
Apprendre à apprendre (accent mis sur travail méthodologique), mettre les compétences linguistiques au services des compétences transversales.
- développer compétences organisationnelles
- développer stratégies de compréhension orale
- développer compétences de communication orale
5) Prérequis :
Compétences enseignées en L1 & L2
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel48h*48hTravail personnel48h48h*24h de présentiel + 24h dauto-formation (créneau langue fixé à lannée)
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
2 approches de lapprentissage complémentaires : présentiel + auto-formation
TDs (Groupes de 24 maximum)
Activités variées
Travail en binômes & petits groupes
Expression orale (mises en situation)
Supports variés de vulgarisation scientifique et autres (presse, audio-vidéo, Internet, etc.)
Auto-formation (obligatoire)
Travail au Centre de Ressources des Langues (présence de documentalistes et locuteurs natifs)
Activités :
- entraînement à la compréhension orale (avec, entre autres, le Progiciel Studio-Elang)
- entretien avec locuteur natif
- recherches documentaires
- production de travaux écrits (CV, dossiers thématiques, etc.)
8) Bibliographie :
HYPERLINK http://www.scelva.univ-rennes1.fr www.scelva.univ-rennes1.fr
(bases de données grammaticales, liens presse, dictionnaires, Studio-Elang, etc.)
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
présentiel (24h) + guidage de lauto-formation (6h)
12) Capacité d'accueil : 24 étudiants par groupe
S7 ou S8 : Langues Vivantes Etrangères
Numéro de lUE : LANG 70 (anglais), 71 (espagnol), 72 (allemand)
Intitulé de l' U E : LV étrangère : anglais, espagnol ou allemand
Responsable(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
Equipe(s) pédagogique(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
M1 : filière recherche
Master de Sciences de la Vie et de lEnvironnement mention Biologie Cellulaire & Physiologie, mention Biologie des organismes, des Populations et des Ecosystèmes, mention Sciences végétales fondamentales, mention bio-informatique
Master de Biochimie et Biologie moléculaire,
2) Parcours :
3) Semestre n° : un semestre de présentiel & un semestre dauto-formation
4) Objectifs : Autonomie et compétences transversales
Mettre les compétences organisationnelles au service dactivités complexes impliquant compréhension et expression écrites et orales orales (savoir utiliser ses compétences linguistiques en situation).
5) Prérequis :
Compétences enseignées en L3
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel48h*48hTravail personnel48h48h*24h de présentiel + 24h dauto-formation (créneau langue fixé à lannée)
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
2 approches de lapprentissage complémentaires : présentiel + auto-formation
TDs (Groupes de 24 maximum)
- Travail en groupes de toutes tailles
- Activités complexes en sappuyant sur des supports multiples(prise en charge progressive de
lorganisation des activités par les étudiants)
- Expression et communication orales (échanges structurés en situation)
- Productions écrites
Auto-formation (obligatoire)
Travail au Centre de Ressources des Langues (présence de documentalistes et locuteurs natifs)
Activités :
- travail sur documents audio-vidéo & écrits (compréhension, synthèses, etc.)
- entretien avec locuteur natif
- recherches documentaires pour productions écrites qui gagnent en complexité
8) Bibliographie :
HYPERLINK http://www.scelva.univ-rennes1.fr www.scelva.univ-rennes1.fr
(bases de données grammaticales, liens presse, dictionnaires, Studio-Elang, etc.)
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
présentiel (24h) + guidage de lauto-formation (6h)
12) Capacité d'accueil : 24 étudiants par groupe
S9 et S10 : Langues vivantes étrangères
Numéro de lUE : LANG 90 (anglais), 91 (espagnol), 92 (allemand)
Intitulé de l' U E : LV étrangère : anglais, espagnol ou allemand
Responsable(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
Equipe(s) pédagogique(s) : Service Commun dEtude des Langues Vivantes Appliquées
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention biologie et gestion, mention Environnement spécialité Environnement et Droit et spécialité Vie et Environnement : Gestion intégrée des Bassins versants
2) Parcours : 2ème année des masters
3) Semestre n° : un semestre de présentiel & un semestre dauto-formation
4) Objectifs :
Travail sur projet en privilégiant les compétences transversales ; mettre ses compétences linguistiques au service des compétences transversales.
Présentations écrites et orales liées au monde de lentreprise
5) Prérequis :
Compétences enseignées en M1 (filière pro)
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel48h*48hTravail personnel48h48h*24h de présentiel + 24h dauto-formation (créneau langue fixé à lannée)
Crédit total de lUE :
7) Programme des enseignements :
2 approches de lapprentissage complémentaires : alternance de présentiel et dauto-formation
- Travail autour de la structuration de travaux écrits & présentations orales
- Préparation de réunions
- Perfectionnement des compétences linguistiques
- Possibilité de travail en collaboration avec des collègues scientifiques et/ou du monde
de lentreprise
8) Bibliographie :
HYPERLINK http://www.scelva.univ-rennes1.fr www.scelva.univ-rennes1.fr
(bases de données grammaticales, liens presse, dictionnaires, Studio-Elang, etc.)
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
présentiel (24h) + guidage de lauto-formation (6h)
12) Capacité d'accueil : 24 étudiants par groupe
((UE de Droit
S 1 : Droit communautaire II
Numéro de lUE :
Intitulé de l' U E : Droit communautaire II
Responsable(s) : Joël LEBULLENGER professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Daniel GADBIN, professeur et C. Dekcourt maître de conférences IODE-CEDRE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Maîtrise en Droit
Quatrième année semestre 8 master Sciences de la Vie et de la santé mention Droit et Environnement
2) Parcours : S 8 année 4 master droit et environnement
3) Semestre n° : 1
4) Objectifs :
Appréhender la politique agricole commune au sein de lUnion européenne et les politiques daménagement du territoire
5) Prérequis :
UE introduction au droit
UE Droit économique international et communautaire
UE Droit de lenvironnement
UE Institutions européennes
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3838Travail personnel1212
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 2 : Introduction au Droit
Numéro de lUE : DRT 20
Intitulé de l' U E : Introduction au Droit
Responsable(s) : Eric GHERARDI, maître de conférences
Equipe(s) pédagogique(s) : Marion DEL SOL et; Thierry HAMON, maîtres de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
DEUG Droit
Licence de Biologie mention Biologie des organismes
2) Parcours : licence, année 1, semestre 2
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs :
Découvrir le droit en tant que discipline ; appréhender le droit en tant que phénomène et technique, découvrir les sources du droit.
5) Prérequis :
Baccalauréat de préférence général
Connaissances historiques, philosophiques et sociologiques fin du cursus études secondaires
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2525Travail personnel1515
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
L'APPREHENSION DU PHENOMENE JURIDIQUE
L'IDENTIFICATION DE LA REGLE DE DROIT
LES FONDEMENTS DU DROIT
LA TECHNIQUE JURIDIQUE
LES GRANDS SYSTEMES DE DROIT CONTEMPORAINS
LE DROIT OBJECTIF
LES SOURCES DE LA REGLE DE DROIT
L'INTERPRETATION DE LA REGLE DE DROIT
8) Bibliographie :
AUBERT J.-L. :
"Introduction au droit et thèmes fondamentaux du droit civil"
Ed. A. Colin, coll. U Droit
BEAUDET Ch. :
"Introduction générale et historique à l'étude du droit"
Ed. C.P.U. (Centre de publications universitaires)
CABRILLAC R. :
"Introduction générale au droit"
Ed. Dalloz, coll. Cours
CHABAS F. :
"Leçons de droit civil. Introduction à l'étude du droit" (tome 1)
Ed. Montchrestien, coll. Leçons de droit civil
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 3 : Institutions administratives
Numéro de lUE : DRT 30
Intitulé de l' U E : Institutions administratives
Responsable(s) : E. GHERARDI, maître de conférences
Equipe(s) pédagogique(s) : Francis CHAUVIN, professeur ; Xavier VOLMERANGE,
C. DELCOURTmaîtres de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
DEUG Droit
Licence de Biologie mention Biologie des organismes
2) Parcours : S 3 année 2 licence Biologie des organismes
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs : Découvrir lorganisation administrative de la France.
5) Prérequis :
UE introduction au droit
Connaissances historiques, géographiques fin de cursus études secondaires
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2525Travail personnel1212
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
Ladministration dEtat (services centraux, services déconcentrés) ; ladministration décentralisée (fonctionnement et compétences du conseil régional, général et municipal).
8) Bibliographie :
F. CHAUVIN : Administration de lEtat, mémento Dalloz ; O. GOHIN, Institutions administratives, Montchrestien,
C. GUETTIER, Institutions administratives, cours Dalloz ;
J. MOREAU, Administration régionale départementale et municipale ;
H. OBERDOFF, Les institutions administratives, Cours Dalloz.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 3 : Institutions européennes
Numéro de lUE : DRT 31
Intitulé de l' U E : Institutions européennes
Responsable(s) : E. GHERARDI, maître de conférences
Equipe(s) pédagogique(s) : Joël LEBULLENGER, professeur ; Loïc MARION,
C. DELCOURTmaîtres de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
DEUG Droit
Licence de Biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : Année 2, semestre 3
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs :
5) Prérequis :
UE introduction au droit
Connaissances historiques, géographiques fin de cursus études secondaires
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2525Travail personnel1515
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements : Structuration institutionnelle du continent européen, structure institutionnelle de lUnion européenne (Les institutions décisionnelles et les institutions de contrôle).
8) Bibliographie : H. RENOUT, Institutions européennes, Cours de Paris ; J-L SAURON, Institutions européennes, Gualino éditeur ; J-C. GAUTRON, Droit européen ; C. HOUTEER, La construction européenne, Nathan Université
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 et 6 : Droit Administratif
Numéro de lUE : DRT
Intitulé de l' U E : Droit administratif
Responsable(s) :Marie-Laure MOQUET-ANGER, professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Marie-Laure MOQUET-ANGER, Jacques PETIT professeurs
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
DEUG Droit
Licence de Biologie mention Biologie des organismes
2) Parcours : Année 3 licence
3) Semestre n° : 5 et 6
4) Objectifs :
Découvrir la spécificité des règles qui organisent ladministration et gouvernent ses relations avec les usages à travers la jurisprudence, le droit des contrats et els principes de la repsonsabilité administrative.
5) Prérequis :
UE introduction au droit ou niveau équivalent
UE Relations européennes ou niveau équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel7232104Travail personnel3030
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 5 et 6 : Droit des Obligations
Numéro de lUE : DRT 50
Intitulé de l' U E : Droit des obligations
Responsable(s) :Marie-Laure MOQUET-ANGER, professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Sylvie HENNION-MOREAU, professeur ; Afif DAHER, maître de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
DEUG Droit
Licence de biologie mention Biologie des Organismes
2) Parcours : S 5 et 6 année 3 licence de Biologie mention biologie des organismes
3) Semestre n° : 5 et 6
4) Objectifs :
Découvrir la notion et le régime des obligations : des liens de droit pouvant exister entre les personnes. A travers essentiellement le Code civil et létude des mécanismes de formation et dexécution du droit des contrats et de la responsabilité civile.
5) Prérequis : UE introduction au droit
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel7232104Travail personnel3030
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 7 : Droit de lenvironnement
Numéro de lUE : DRT 70
Intitulé de l' U E : Droit de lenvironnement
Responsable(s) : Jean DHOMMEAUX, professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Véronique INSERGUET-BRISSET maître de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Maîtrise en Droit
Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Droit et Environnement
2) Parcours : S 7 année 1 master droit et environnement
3) Semestre n° : 7
4) Objectifs :
5) Prérequis :
UE introduction au droit
UE Droit administratif
UE Droit des obligations
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel37,560 ou 24Travail personnel1230 ou 12
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Droit économique international et communautaire
Numéro de lUE : DRT 80
Intitulé de l' U E : Droit économique international et communautaire I
Responsable(s) : Joël LEBULLENGER professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : IODE-CEDRE
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Maîtrise en Droit
Quatrième année semestre 8 master environnement et droit
2) Parcours : S 8 année 1 master environnement et droit
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
5) Prérequis :
UE introduction au droit
UE Droit administratif
UE Institutions européennes
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3838Travail personnel1515
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 8 : Droit rural
Numéro de lUE : DRT 81
Intitulé de l' U E : Droit rural
Responsable(s) : Anne KARM professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Véronique BARABE-BOUCHARD maître de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Maîtrise en Droit, Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Droit et Environnement
2) Parcours : S 8 année 4 master droit et environnement
3) Semestre n° : 8
4) Objectifs :
5) Prérequis :
UE introduction au droit
UE Droit administratif
UE Droit des obligations
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3838Travail personnel1212
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 9 : Droit de lurbanisme
Numéro de lUE : DRT 90
Intitulé de l' U E : Droit de lurbanisme
Responsable(s) : Jean DHOMMEAUX professeur
Equipe(s) pédagogique(s) : Jean-Paul MARTIN maître de conférences
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Maîtrise en Droit
Master professionnel Sciences de la Vie et de la Santé mention Droit et Environnement
2) Parcours : S 9 année 2 master droit et environnement
3) Semestre n° : 9/10
4) Objectifs :
5) Prérequis :
UE introduction au droit
UE Droit administratif
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel3838Travail personnel1212
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements :
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
((UE de Culture Générale
S 2 : Communication animale et humaine
Numéro de lUE : BIO 204
Intitulé de l' U E : Communication animale et humaine
Responsable(s) : Laurence HENRY
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : 1ière et/ou 2ième année de la licence de biologie (pour toutes les mentions) et de la licence de biochimie et de biologie moléculaire
2) Parcours : 1ière et/ou 2ième année
3) Semestre n° :S2
Objectifs :
Cette unité d'enseignements propose une approche éthologique de la communication chez l'animal et chez l'Homme. Nous aborderons entre autre les aspects de la communication verbale et non verbale humaine, le développement et l'origine du langage.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel16824Travail personnel12416
Crédit total de lUE : 2
Programme des enseignements :
Cours
Définitions
Les différents canaux de communication (2h)
La communication animale (8h)
La communication humaine (6h)
La communication verbale et non verbale Le développement du langage
L'origine du langage et des langues
TD
Les différents modes de communication chez les diverses espèces animales : analyse
de documents vidéo et de données expérimentales (2h30)
Analyse de la communication humaine : gestualité, gestion des distances interindividuelles (2h30)
Analyse d'articles sur la communication animale et humaine et exposés par les étudiants (3h).
Bibliographie :
Le langage : de l'animal aux origines du langage humain. J. - A. Rondal. Mardaga. 2000.
Les langues du monde. Dossier Pour la science. 1999.
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel SYMBOL 114 \f "Webdings" \s 12r
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Analyse d'articles et exposés par les étudiants
12) Capacité d'accueil : sans limite d'accueil
S 2 :Histoire de la biologie
Numéro de lUE : BIO 205
Intitulé de l' U E : Histoire de la biologie
Responsable(s) : C. BLOIS-HEULIN
Equipe(s) pédagogique(s) : éthologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Optionnel pour toutes les licences de biologie
2) Parcours : 1° année licence
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs :
Se repérer dans lhistoire de létude du monde vivant. Un accent particulier est mis sur les théories de l'évolution.
La biologie fut dabord médecine, pharmacie et histoire naturelle. Lidée même que le vivant en tant que tel puisse être objet de science napparaît quavec Lamarck, à la fin du XVIIIe siècle, inventeur du terme de biologie. La biologie se prête mal à une histoire linéaire. Elle est faite de nombreux courants parallèles et a connu des paradigmes multiples : Aristotélisme, Averroïsme, préformationnisme, fixisme, transformisme, darwinisme, théorie puis biologie cellulaire, génétique formelle puis génétique moléculaire, néodarwinisme
Lhistoire de ses tâtonnements et de ses controverses est riche et colorée. Des personnages hors du commun émaillent un cheminement hésitant, souvent austère. Lintensité de ses controverses en fait un excellent sujet dhistoire et de philosophie des sciences.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel20424Travail personnel16
Crédit total de lUE : 7 ou 2
7) Programme des enseignements :
1. les grandes étapes de l'histoire de la biologie: des hommes et des idées
De lantiquité à la Renaissance
..9h
Origine et définitions de la science
La biologie en Mésopotamie et en Egypte
Lapport de la civilisation Chinoise
Naturalistes et médecins de lantiquité gréco-romaine : Hippocrate, Galien, Pline
Le Moyen Age :
Le monde étrange de la scolastique : les quatre variantes de la ressemblance
Le rôle proéminent des naturalistes et médecins arabes : Avicenne, Averroes
La Renaissance :
Une histoire naturelle en retard philosophique sur son temps : Pierre Belon, Gesner, Aldrovandi, Albert le Grand
Les médecins et anatomistes redécouvrent lobservation : Léonard de Vinci, Vésale
les naturalistes explorateurs et la diversité du monde vivant
De Descartes à Buffon
..6h
La philosophie moderne commence avec Descartes, lhistoire naturelle moderne seulement avec Buffon
- Vers la théorie de lévolution
- description et classification (Linné, Tournefort)
analyse des fossiles (Ray, Owen)
Anatomie comparée (Cuvier, Geoffroy Saint- hilaire)
- Du transformisme (Lamark) au concept de sélection naturelle (Darwin)
La biologie contemporaine
..6h
Lunité de la vie : la théorie cellulaire
La génétique : De Gregor Mendel à la biologie moléculaire le néo-darwinisme
2. Controverses sur la conception de la place de l'homme dans la nature
.3h
8) Bibliographie :
Ouvrage :
Les sciences au Moyen-Age. Oct.2002. Dossier pour la science.
Histoire et philosophie des sciences. 2000. n°31. Hors-Série Sciences Humaines.
Homme/Animal : des frontières incertaines. 2000 n°108. Sciences Humaines.
Du scribe au savant. Les porteurs du savoir de l'antiquité à la révolution industrielle. 2000.Y. Gingra, P. Keating et C. Limoges. Puf, Science histoire et société.
Histoire de la biologie. 1989. E. Mayr. Fayard, le temps de sciences
Aux origines de lhumanité. 2001. Vol. 2 Le propre de lhomme. Fayard.
Sites internet liste non-exhaustive:
HYPERLINK "http://www.infoscience.fr/index.php3" http://www.infoscience.fr/index.php3
HYPERLINK "http://coll-ferry-montlucon.pays-allier.com/gdscient.htm" http://coll-ferry-montlucon.pays-allier.com/gdscient.htm
HYPERLINK "http://www.cegep-st-laurent.qc.ca/depar/physique/hisCope.htm" http://www.cegep-st-laurent.qc.ca/depar/physique/hisCope.htm
HYPERLINK "http://pst.chez.tiscali.fr/histoire.htm" http://pst.chez.tiscali.fr/histoire.htm
HYPERLINK "http://www.ulg.ac.be/omp/medicinale.html" http://www.ulg.ac.be/omp/medicinale.html
HYPERLINK "http://perso.wanadoo.fr/sos.philosophie/auteurs.htm" http://perso.wanadoo.fr/sos.philosophie/auteurs.htm
HYPERLINK "http://grenier2clio.free.fr/egypte/osiris.htm" http://grenier2clio.free.fr/egypte/osiris.htm
HYPERLINK "http://classes.bnf.fr/dossitsm/b-gesner.htm" http://classes.bnf.fr/dossitsm/b-gesner.htm
HYPERLINK "http://scienceworld.wolfram.com/biography/Al-Khwarizmi.html" http://scienceworld.wolfram.com/biography/Al-Khwarizmi.html
9) Coefficient : 1
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil :
S 2 : Initiation aux Métiers de lEnseignement 1
Numéro de lUE : BIO 206
Intitulé de l' U E : Initiation aux Métiers de lEnseignement 1
Responsable(s) : Roger Gautun
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
licences Sciences de la Vie et de la Terre, licence Pluridisciplinaire, licence de biologie et licence de biochimie et biologie moléculaire
2) Parcours : 1ème année des licences
3) Semestre n° 2
4) Objectifs :
Identifier et caractériser les différents métiers de lenseignement dans le système éducatif
Engager un processus de formation professionnalisante
Identifier les dimensions pédagogique et didactique dans les processus denseignement et dapprentissage
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel1266-24Travail personnel16
Crédit total de lUE : 2
7) Programme des enseignements:
Les CM porteront sur :
Léducation et le système éducatif français (2h)
Les métiers dans lenseignement
La formation dans les IUFM (2h)
Les professeurs des écoles (2h)
Les professeurs de lycée de lenseignement technologique (2h)
Les enseignants-cherhceurs (2h)
Histoire de lécole et du système éducatif (4h)
Les TD ont pour objectif dillustrer certains points précis à savoir :
Pédagogie et didactique
Les sciences de léducation
Les compétences des métiers de lenseignement et les stratégies de formation
Place et enjeu de lenseignement scientifique
Les TP :
Mise en place et encadrement dactivités scientifiques en milieu scolaire
Enquête auprès des professionnels
Ou
Travail dobservation à partir de séquences vidéo de situations denseignement
8) Bibliographie :
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
Alternance de cours, travaux personnels et de groupes
Témoignage sous forme de conférences par des professionnels de léducation
Accès à un cours en ligne
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S 5 : Initiation aux Métiers de lEnseignement 2
Numéro de lUE : BIO 524
Intitulé de l' U E : Initiation aux Métiers de lEnseignement 2
Responsable(s) : S. Barbu
Equipe(s) pédagogique(s) : Ethologie
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
obligatoire pour les licences Sciences de la Vie et de la Terre et Pluridisciplinaire mention biologie
2) Parcours : 3ème année des licences
3) Semestre n° 5
4) Objectifs :
Cette Unité dEnseignement doit permettre à létudiant (i) dacquérir des connaissances sur le système éducatif et sur la psychologie de lenfant et de ladolescent (ii) de se sensibiliser aux métiers de lenseignement auxquels il se destine par une expérience en établissement.
5) Prérequis : aucun
6) Contenu des enseignements:
CoursCours/T. D.*T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel2299-2060Travail personnel60* : les cours/TD sont organisés par groupe de 40 étudiants
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements:
Les CM porteront sur :
Lhistoire de la psychologie du développement et des connaissances de lenfant (2h)
Lenfant à lécole maternelle et primaire (6h)
Ladolescence (6h)
Les rythmes scolaires (2h)
Létude de lintelligence (2h)
Histoire de lécole et du système éducatif (4h)
Les TD ont pour objectif dillustrer certains points précis à savoir :
Le groupe classe et sa dynamique (2h)
Le développement intellectuel et les troubles de lapprentissage (2h)
Lévaluation psychologique des compétences cognitives (2h)
Histoire de lécole et du système éducatif : analyse de texte et exposés (3h)
Les TP sarticulent autour de la réalisation dun stage en établissement, visant à la préparation du stage (3h), à lexploitation des observations (3h), et à la présentation orale du stage (3h).
8) Bibliographie :
Tourette & Guidetti (1994). Introduction à la psychologie du développement. Du bébé à ladolescent. Ed. Armand Colin.
Dumas (1999). Psychopathologie de lenfant et de ladolescent. Ed De Boeck.
Lieury (2000). Introduction à la psychologie. Ed Dunod.
Nicolas (2001). Histoire de la Psychologie. Ed Dunod.
9) Coefficient : 3
10) Statut : obligatoire (
optionnel
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : sans limite daccueil
S2 : Arts culinaires 1
Numéro de lUE : BIO 208
Intitulé de l' U E : Arts culinaires 1
Responsable(s) :Georges Le Roux
Equipe(s) pédagogique(s) : Génie culinaire Lycée Hôtelier de Dinard
1) Diplôme(s) dont l'UE fait partie : Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Biologie mention Biologie cellulaire et Physiologie
2) Parcours : 1ère année des licences
3) Semestre n° : 2
4) Objectifs : Acquisition des connaissances basiques concernant le milieu de la restauration commerciale et les techniques culinaires :
locaux, matériels, postes de travail et outillage
les pratiques culinaires
étude des différents caloporteurs
réactions des nutriments à la chaleur
études pour la confection des potages, des sauces, des ufs
études des cuissons rapides et des cuissons longues
études des différentes pâtes sucrées
connaissance du marché de la restauration.
Lhistoire de la cuisine
5) Prérequis : néant
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel93948Travail personnel48
Crédit total de lUE :
Programme des enseignements :
Programme des travaux pratiques de cuisine
SemaineDateThèmesObjectifs117/1Approche Présentation
Des locaux, des matériels, des postes de travail
Des procédures dutilisation et des protocoles de nettoyage
Présentation de différents ingrédients et des vecteurs de chaleur224/1Taillages de basePratiques culinaires
Présentation des couteaux et utilisation
Réalisation de taille de base
Cuissons courtes de légume
Utilisation du vocabulaire culinaire de base331/1Les potages Les échanges
mise en évidence du rôle du sel
réalisations pratiques de différents potages
analyse des échanges lors de cuisson dans un liquide
taillage de base et cuisson avec recherche et application pour les soupes de bases47/2Les sauces de base Réalisation de sauce
explication de la démarche culinaire lors des réalisations de sauces
définition de sauces classiques
réalisation de sauces émulsionnée514/2Les cuissons courtesApproche gustative
les différentes réactions des nutriments à la chaleur
réalisation et analyse de tests organoleptiques
finition et mise au point de sauces courtes 621/2La pâtisserieLa pâtisserie en cuisine
les différentes pâtes de base
les utilisations possibles
réalisation pratique dentremet, présentation et critiques714/3Le marché français
Lhistoire de la cuisine
Le consommateur Le marché
limportance de la restauration dans notre culture française
lhistoire de la gastronomie de lantiquité à nos jours
Que sera le marché demain ?
les différentes attentes et réactions du consommateur français
loffre de la restauration française et ses typicités821/3Les ufsLes ovo produits
Le marché français et les différents produits disponibles
les différents critères de fraîcheur
les différents apprêts et cuissons à base duf928/3Les viandes
et les cuissons longuesLes cuissons longues
Approche des cuissons complexes et des phénomènes physico-chimiques recherchés
Définition des règles de base et procédures à suivre
Application avec différentes cuissons et morceaux de viande
réalisation de garnitures
présentation dassiettes et critiques104/4Les poissons Les produits de la pêche
Le marché français et les différents produits disponibles
les différents critères de fraîcheur
Les différentes actions préliminaires
Les sauces à base de poisson
Les cuissons
réalisation de garnitures
présentation dassiettes et critiques1111/4Les volaillesLutilisation des volailles
Le marché français et les différents produits disponibles
les différents critères de fraîcheur
les préparations préliminaires
les cuissons de base applicable aux volailles
réalisation de garnitures
présentation dassiettes et critiques1218/4EvaluationEvaluation sommative des acquis
Evaluation écrite sous forme de DS dune durée de 2 heures
Travaux pratiques de 3 heures avec Evaluation sommative des exercices imposés
présentation dassiettes et critiques
8) Bibliographie : Biochimie biologie alimentaire Lavoisier
Le guide culinaire Escoffier
Le grand Livre de la cuisine de Alain Ducasse
La cuisine de référence Michel Maincent
9) Coefficient : 1
10) Statut : obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
12) Capacité d'accueil : 24
S3 : Arts culinaires 2
Numéro de lUE : BIO 314
Intitulé de l' U E : Arts culinaires2
Responsable(s) : Georges Le Roux
Equipe(s) pédagogique(s) :Professeurs de génie culinaire du Lycée Hôtelier de Dinard
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Biologie mention Biologie cellulaire et Physiologie
2) Parcours : 2ème année des licences
3) Semestre n° : 3
4) Objectifs : Acquisition des bases culinaires, connaissance du marché de la restauration et démarche de créativité culinaire. Cet apprentissage est nécessaire pour une éventuelle poursuite détudes en licence professionnelle « arts culinaires industrialisés », ce module peut également orienter les étudiants pour une poursuite détudes vers lagroalimentaire.
5) Pré Requis :
Module « arts culinaires 1 » ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel154560 Travail personnel82260
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
ARTS CULINAIRES
Thème centraltechniques culinairesApproche thématiqueTravail personnelCours 1Approche globalePlanning annuel, rotation des travauxMise en place des documents, développements des différents thèmesrépartition des travaux à présenterCours 2Les fruits en cuisineSalés / Sucrés, aigre / doux, crus / cuitsÉléments de garniture d'accompagnement, associations diversesLa place des fruits dans l' alimentationCours 3Les pâtes et farinagesA partir de P.A.IAnalyse, contenu / contenant, tendances actuellesLes pâtes dans les hors d'uvre chaudsCours 4Les saucessauces courtes, sauces émulsionnées chaudes, sauces à base de vinElaboration de fiches de dégustation, analyse sensorielle à partir d'application(s) concrète(s)les tendances actuellesCours 5Les produits de la merCarpaccio de poisson, coquillages à l'orange, beignets, accras, poissons marinés, poissons crus et cuitsLa place des produits de la mer dans l'alimentationLes algues et dérivéesCours 6Les légumesFlans, mousses, gratins, granités, pudding, mini légumesformes commerciales, les légumes: évolution et perspective d'utilisationsLes légumes comme garniture d'accompagnement
8) Bibliographie : les cuisines du monde LANORE
La cuisine des terroirs RJ. COURTINE
Histoire de la cuisine et des cuisiniers NEIRINCK et POULAIN
9) Coefficient :
10) Statut :
obligatoire
optionnel (
11) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE. (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en Formation Continue) :
S4 : Arts culinaires 3
Numéro de lUE : BIO 412
Intitulé de l' U E : Arts culinaires 3
Responsable(s) :Georges Le Roux
Equipe(s) pédagogique(s) :Professeurs de génie culinaire du Lycée Hôtelier de Dinard
Diplôme(s) dont l'UE fait partie :
Licence de Biochimie et Biologie moléculaire, Licence de Biologie toutes mentions
2) Parcours : 2ème année des licences
3) Semestre n° : 4
4) Objectifs : Acquisition des bases culinaires, connaissance du marché de la restauration et démarche de créativité culinaire. Cet apprentissage est nécessaire pour une éventuelle poursuite détudes en licence professionnelle « arts culinaires industrialisés », ce module peut également orienter les étudiants pour une poursuite détudes vers lagroalimentaire.
5) Pré Requis :
Module « arts culinaires 1 et 2 » ou équivalent
6) Contenu des enseignements:
CoursT. D.T. P.ProjetStage de terrain, excursionsTOTALPrésentiel154560 Travail personnel82260
Crédit total de lUE : 7
7) Programme des enseignements :
DEUG
2e année : Introduction aux arts culinairesModule 1Thème centraltechniques culinairesApproche thématiqueTravail personnel
Cours 7Les salades composéesTechniques d'assemblage des différents gammes, association éléments crus et cuitsAnalyse de la mise en uvre de la présentation (couleur, forme, volume), compatibilité des saveurs et accords possiblesLa place des salades dans l' alimentation
Thème central
techniques culinaires
Approche thématique
Travail personnelCours 8Desserts 1gratin de fruits, mousses, salades, sorbets, granités, soufflésClassification, dénomination, tendances contemporainesLes fruits exotiques
Cours 9
Desserts 2Les crèmescomparaisons avec P.A.I, analyse sensorielle comparativeLe goût dans la société occidentale
Cours 10
La cuisine régionale 1La BretagneIdentité réelle et imaginaire, aliments dominants, UWXfghxy¢£¤½¾¿ÀÁÕÖïðñòó + , - . / \ ] v øôìôìà×É׸É×Éת×É×É×É×É×}É×É×É×lÉ×É×É× jqh FôUmHnHu jöh FôUmHnHu j{h FôUmHnHu *h FômHnHu jðð *h FômHnHu jh FôUmHnHujh FôUmHnHuh FômHnHu jðh FômHnHujh FôUh Fô
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