TP Modèles moléculaires
Contexte du sujet: Lors de cette séance de TP, on se propose de construire le
modèle éclaté de la molécule de butane et à partir de ce modèle de tenter de ...
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LES MOLECULES ET LEURS REPRESENTATION
Objectifs bac : Pratiquer une démarche expérimentale pour :
-réaliser un modèle moléculaire éclaté
-déterminer les différentes représentations dune molécule à partir de ce modèle
Contexte du sujet:
Lors de cette séance de TP, on se propose de construire le modèle éclaté de la molécule de butane et à partir de ce modèle de tenter de trouver les différentes représentations de cette molécule.
DOCUMENTS MIS A DISPOSITION DU CANDIDAT
Document n°1 : Notions sur les modèles compacts et les modèles éclatés
( Dans le modèle compact, les atomes sont représentés par des sphères (boules). Dans ce modèle, les sphères sont en contact les unes avec les autres. Ce modèle est plus proche de la réalité car il représente bien le volume occupé par la molécule. Cependant il ne permet pas de représenter les liaisons covalentes.
( Dans le modèle éclaté, les liaisons covalentes sont représentées par des tiges et le modèle permet également de rendre compte des angles entre les liaisons covalentes.
Données :
-Numéros atomiques de certains atomes : H (Z = 1) ; C (Z = 6) ; N (Z = 7) ; O (Z = 8)
Document n°2 : Matériel mis à votre disposition
Une boîte de modèles moléculaires
Document n°3 : Représentation de Cram dune molécule
Il sagit de représenter sur votre feuille (2 D) une molécule en 3D en tenant compte de sa géométrie.
Pour rendre compte de la géométrie dune molécule, les chimistes utilisent la représentation de Cram.
La représentation de Cram dune molécule obéit aux règles suivantes :
-Les liaisons situées dans le plan de la feuille sont dessinées en traits pleins :
-Les liaisons situées en avant du plan de la feuille sont dessinées en traits épaissis :
-Les liaisons en arrière du plan de la feuille sont dessinées en pointillés
Exemple : Représentation de la molécule de méthane
TRAVAIL A EFFECTUER
1. Mise en uvre du protocole proposé (3 min conseillées) (Compétence : Réaliser)
Construire le modèle moléculaire éclaté dune molécule possédant 4 atomes de carbone et 10 atomes dhydrogène.
Les atomes de carbone formant une chaîne linéaire.
Appeler le professeur pour vérifier votre construction (Appel n°1)
2. Exploitation des résultats obtenus (10 min conseillées) (Compétence : Valider)
2.1. Déterminer la formule brute de cette molécule.
2.2. Déterminer la formule développée de cette molécule.
2.3. En déduire la formule semi-développée de cette molécule.
2.4. Déterminer la représentation de Cram de cette molécule.
2.5. Trouver une autre façon dassembler les atomes et donner la formule demi-développée de cette nouvelle molécule.
Appeler le professeur pour vérifier vos réponses (Appel n°2)
3.Complément : Utilisation du logiciel chimie ou rasmol pour visualiser les molécules en 3D.
3.1. Visualiser à laide du logiciel « chime » la molécule déthane.
(Coup de pouce :
-Taper dans un moteur de recherche : « molécule de butane en pdB »
-Rechercher alors la molécule « butane-a-1.pdb »
-Faites un clic droit de la souris et sélectionner « ball and stick »
-Les atomes dhydrogène sont en blancs et les atomes en carbone en gris et les atomes doxygène en rouge.
Compétences expérimentales attenduesN.AE.C.AADomaine de compétences : Réaliser (Rea)Capacités et aptitudes attenduesObservables
Construire un modèle moléculaire-Construire le modèle moléculaire à partir des consignes données.Domaine de compétences : être autonome et faire preuve dinitiative (Auto)Travailler en autonomie-Suivre les consignes données
-Faire preuve dintuition
-Savoir télécharger un fichier de molécule en vu de la visualiser.Domaine de compétences : Valider (Val)Savoir représenter une formule développée.Savoir représenter une formule semi-développéeSavoir donner la représentation de Cram dune molécule
PROFESSEUR
DATE DU TP
.DATE DE DEPOT
PREPARATEUR
.JOUR DU TP
..SALLE
..HORAIRE
. BAC ELEVE (
.. binômes) Boules noires tétragonal (C)4Boules blanches (H)10Grandes tiges13Une pince (pour enlever les tiges)3Réservation de la salle informatique logiciel chime et Rasmol BAC PROF (Téléchargement du logiciel rasmol
Autre possibilité Cliquer sur : HYPERLINK "http://www.geneinfinity.org/rastop/"Site de GeneInfinity
Cliquer ensuite sur licône « rasmol »
-Cliquer ensuite sur HYPERLINK "http://www.rasmol.org/software/RasMol_2.7.5_Windows_Installer.exe"RasMol 2.7.5 Windows Installer
Explication sur les différents logiciels de visualisation 3D : HYPERLINK "http://didac.free.fr/pdb/" \l "1"http://didac.free.fr/pdb/#1
(Téléchargement du logiciel chime
-Taper dansun moteur de recherche : téléchargement du plug in chime
-Cliquer ensuite sur le premier site : chime INRP
-Cliquer ensuite sur HYPERLINK "http://www.inrp.fr/Acces/biogeo/model3d/chimdata/data/MDLChime26SP7.exe"En localHYPERLINK "http://www.inrp.fr/Acces/biogeo/model3d/chimdata/data/MDLChimeSP6.exe". Fichier ~3 Mo. Version 2.6 SP7. 6 novembre 2007
-Enregistrer alors dans le dossier que vous désirez.
-Installer alors chime
Lavantage de ce plug in par rapport à rasmol est la possibilité de visualiser les molécules à laide dun navigateur.
TP N°7 : CONTRCUTION DE MODELES MOLECULAIRE(CHIMIE)
Chapitre : Les molécules présentes les médicaments TP N°
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PAGE \* MERGEFORMAT 1
C
H
H
H
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Représentation de Cram
Modèle éclaté
